单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3601 - 3620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3601 | 2024-08-08 |
Cyclic multiplex fluorescent immunohistochemistry and machine learning reveal distinct states of astrocytes and microglia in normal aging and Alzheimer's disease
2022-Feb-02, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02383-4
PMID:35109872
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研究论文 | 本文开发了一种循环多重荧光免疫组织化学方法，结合机器学习，对阿尔茨海默病（AD）患者死后人脑中的星形胶质细胞和微胶质细胞进行形态学定量表征，并分析它们与斑块和缠结的空间关系。 | 本文创新性地结合了循环多重荧光免疫组织化学和机器学习方法，揭示了星形胶质细胞和微胶质细胞的三种不同表型，并扩展了传统的“稳态与反应性”二分类。 | NA | 研究目的是深入理解胶质细胞反应的复杂性和异质性，并为转录组学研究提供信息。 | 研究对象是阿尔茨海默病患者死后人脑中的星形胶质细胞和微胶质细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 循环多重荧光免疫组织化学 | 卷积神经网络 | 图像 | 5172个ALDH1L1+星形胶质细胞和6226个IBA1+微胶质细胞 |
| 3602 | 2024-08-08 |
Time-resolved single-cell sequencing identifies multiple waves of mRNA decay during the mitosis-to-G1 phase transition
2022-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.71356
PMID:35103592
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研究论文 | 研究揭示了在人类细胞从有丝分裂到G1期过渡期间，通过广泛且时间控制的mRNA降解作为基因表达调控的额外机制 | 发现了在细胞周期中，mRNA降解作为基因表达调控的新机制，并识别了参与此过程的deadenylase CNOT1 | NA | 探讨细胞周期中基因表达调控的新机制 | 人类细胞中的mRNA降解及其在细胞周期中的作用 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | mRNA | 未具体说明样本数量 |
| 3603 | 2024-08-08 |
Diagnostic Evidence GAuge of Single cells (DEGAS): a flexible deep transfer learning framework for prioritizing cells in relation to disease
2022-02-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01012-2
PMID:35105355
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研究论文 | 提出了一种名为DEGAS的深度迁移学习框架，用于将疾病信息从患者转移到单个细胞 | DEGAS框架能够将疾病信息（称为“印象”）转移到单个细胞，使细胞与疾病属性如诊断、预后和治疗反应相关联 | NA | 开发一种新的深度迁移学习框架，用于优先考虑与疾病相关的细胞 | 单细胞和患者大量组织转录组数据 | 机器学习 | NA | 深度迁移学习 | 深度学习框架 | 转录组数据 | 使用模拟数据和来自胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病和多发性骨髓瘤的十个不同单细胞和患者大量组织转录组数据集 |
| 3604 | 2024-08-08 |
PD-1 blockade therapy promotes infiltration of tumor-attacking exhausted T cell clonotypes
2022-02-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110331
PMID:35108529
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了PD-1阻断疗法对肿瘤微环境中肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的影响，特别是对具有耗竭表型的T细胞克隆型的影响 | 首次展示了PD-1阻断疗法能够促进肿瘤微环境中非预存的肿瘤特异性T细胞克隆型的出现，这些克隆型主要来源于肿瘤引流淋巴结 | NA | 研究PD-1阻断疗法如何影响肿瘤微环境中的T细胞克隆型，特别是具有耗竭表型的T细胞 | 肿瘤微环境中的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和肿瘤特异性T细胞克隆型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 3605 | 2024-08-08 |
Diversity of satellite glia in sympathetic and sensory ganglia
2022-02-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110328
PMID:35108545
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序分析，识别了交感神经和感觉神经节中五种不同的卫星胶质细胞群体 | 首次揭示了交感神经和感觉神经节中卫星胶质细胞的分子多样性及其在免疫反应、早期基因反应和离子通道/细胞外基质相互作用中的富集情况 | NA | 探究交感神经和感觉神经节中卫星胶质细胞的分子多样性 | 交感神经和感觉神经节中的卫星胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3606 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals a low CD8+ T cell infiltrating state mediated by fibroblasts in recurrent renal cell carcinoma
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004206
PMID:35121646
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了复发性肾细胞癌中由成纤维细胞介导的低CD8+ T细胞浸润状态 | 首次在复发性肾细胞癌中应用单细胞转录组学技术，揭示了成纤维细胞通过Gal1抑制CD8+ T细胞的新机制 | NA | 探索复发性肾细胞癌与原发性肾细胞癌在肿瘤微环境和基因表达模式上的差异 | 复发性肾细胞癌和原发性肾细胞癌的肿瘤微环境及基因表达模式 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 32,073个细胞来自2个原发性肾细胞癌、2个复发性肾细胞癌和3个邻近正常肾样本，以及41对原发性肾细胞癌和复发性肾细胞癌样本作为验证队列 |
| 3607 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomic Analysis Reveals the Cellular Heterogeneity of Mesenchymal Stem Cells
2022-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.01.005
PMID:35123072
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析骨髓和脐带华通胶来源的61,296个间充质干细胞，揭示了五个不同的亚群及其发育轨迹 | 首次揭示了间充质干细胞的五个不同亚群及其从干细胞样活跃增殖细胞到多能祖细胞的分化路径，并发现了具有自我更新和免疫调节潜力的亚群 | NA | 揭示间充质干细胞的细胞异质性及其功能 | 间充质干细胞的亚群及其功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 61,296个间充质干细胞 |
| 3608 | 2024-08-08 |
Inter-tissue convergence of gene expression during ageing suggests age-related loss of tissue and cellular identity
2022-01-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.68048
PMID:35098922
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研究论文 | 研究分析了小鼠大脑皮层、肺、肝和肌肉在发育和衰老过程中的基因表达变化，发现衰老过程中基因表达出现逆转现象，导致不同组织间的基因表达趋向一致 | 首次提出并验证了衰老过程中不同组织基因表达趋向一致的现象，即DiCo（divergence followed by convergence） | NA | 探讨衰老过程中基因表达的变化及其对组织和细胞身份的影响 | 小鼠的大脑皮层、肺、肝和肌肉组织 | 基因表达 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16只小鼠 |
| 3609 | 2024-08-08 |
A Rapid Adaptable Method for Isolation of Endothelial Cells from Human Adipose Tissue
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_18
PMID:35099741
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research paper | 本文介绍了一种从人类脂肪组织中快速分离内皮细胞的可靠且灵活的方法 | 该方法可以用于各种分析，包括单细胞RNA测序、体外培养和下游应用 | NA | 研究旨在开发一种有效的方法来分离和研究脂肪组织中的内皮细胞 | 人类脂肪组织中的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 3610 | 2024-08-08 |
Isolation of Cardiac Endothelial Cells for Transcriptomic Analysis of the Zebrafish and Mouse Heart
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_23
PMID:35099746
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研究论文 | 本文描述了一种使用酶解和机械解离以及荧光激活细胞分选（FACS）从斑马鱼和老鼠心脏中分离高质量心脏内皮细胞的协议 | 该方法能够获得高活性和纯度的心脏内皮细胞，适用于下游转录分析应用 | NA | 研究心脏内皮细胞的转录组分析 | 斑马鱼和老鼠的心脏内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及幼体和成体斑马鱼心脏以及健康和缺血成年老鼠心脏的内皮细胞 |
| 3611 | 2024-08-08 |
CD73+ Epithelial Progenitor Cells That Contribute to Homeostasis and Renewal Are Depleted in Eosinophilic Esophagitis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.018
PMID:35108658
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研究论文 | 研究探讨了CD73+CD104+细胞在嗜酸性食管炎（EoE）中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | 首次研究了CD73+CD104+细胞在EoE中的生物学意义，并探讨了其在EoE上皮更新和稳态中的作用 | NA | 探讨CD73+CD104+细胞在EoE中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | CD73+CD104+细胞在EoE中的数量和功能 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 流式细胞术，免疫组织化学，定量逆转录聚合酶链反应，单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | NA | 细胞 | EoE和非EoE患者的食管活检样本，患者来源和永生化细胞系来源的食管类器官 |
| 3612 | 2024-08-08 |
CD4+ T cells in classical Hodgkin lymphoma express exhaustion associated transcription factors TOX and TOX2: Characterizing CD4+ T cells in Hodgkin lymphoma
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2033433
PMID:35111387
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和T细胞受体可变基因片段使用分析，比较了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）中CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞的特征 | 发现CD4+CD26- T细胞虽经历抗原暴露但未克隆扩增，表达与耗竭相关的转录因子TOX和TOX2，以及免疫检查点和趋化因子 | NA | 研究经典霍奇金淋巴瘤中CD4+ T细胞的特征及其与肿瘤细胞生存的关系 | 经典霍奇金淋巴瘤中的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 来自cHL淋巴结细胞悬液的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 |
| 3613 | 2024-08-08 |
Notch-Regulated c-Kit-Positive Liver Sinusoidal Endothelial Cells Contribute to Liver Zonation and Regeneration
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.019
PMID:35114417
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研究论文 | 本研究探讨了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生过程中的作用及其机制 | 首次鉴定并研究了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的具体作用及其通过Wnt2依赖性方式调节肝细胞再生的机制 | NA | 研究c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的作用及其机制 | c-kit阳性肝窦内皮细胞及其在肝再生中的作用 | NA | 肝病 | 定量逆转录聚合酶链反应, 免疫荧光染色, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用部分肝切除小鼠模型进行研究 |
| 3614 | 2024-08-08 |
Functional New Transcription Factors (TFs) Associated with Cervical Cancer
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8381559
PMID:35126951
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研究论文 | 本研究旨在发现与宫颈癌发生相关的新转录因子（TFs） | 揭示了EMX2作为宫颈癌中的肿瘤抑制因子，并发现PDZRN3可能是EMX2在宫颈癌中的潜在靶点 | NA | 发现与宫颈癌发生相关的新转录因子 | 宫颈癌中的转录因子及其潜在靶点 | NA | 宫颈癌 | RNA-seq, 微阵列, 实时PCR | NA | 基因表达数据 | 10个宫颈癌数据集 |
| 3615 | 2024-08-08 |
Allosteric inhibition reveals SHP2-mediated tumor immunosuppression in colon cancer by single-cell transcriptomics
2022-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2021.08.006
PMID:35127377
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术探讨了SHP2在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用 | 首次揭示了SHP2通过调节STING-TBK1-IRF3介导的I型干扰素信号通路在肿瘤微环境中发挥免疫抑制作用 | 研究仅基于小鼠MC38异种移植模型，可能与人类结直肠癌存在差异 | 探讨SHP2在结直肠癌中的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌中的SHP2及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠MC38异种移植模型中的肿瘤微环境细胞 |
| 3616 | 2024-08-08 |
Haploinsufficiency of PSMD12 Causes Proteasome Dysfunction and Subclinical Autoinflammation
2022-06, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42070
PMID:35080150
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研究论文 | 本研究探讨了由PSMD12半合子不足引起的新型蛋白酶体相关自身炎症综合征（PRAAS）的致病机制 | 首次发现PSMD12半合子不足导致的炎症标志物及神经发育障碍，扩展了PRAAS的基因型和表型谱 | NA | 研究PSMD12半合子不足引起的新型PRAAS的致病机制 | 家族成员的皮肤疹、先天性葡萄膜炎和发育迟缓 | NA | 自身炎症性疾病 | 全外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2个家族成员 |
| 3617 | 2024-08-08 |
Systems-level analysis of transcriptome reorganization during liver regeneration
2022-05-11, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d1mo00382h
PMID:35072185
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研究论文 | 本研究通过网络推断和数学建模方法分析了肝脏再生过程中大量RNA测序时间序列数据，揭示了代谢、RNA剪接和细胞周期在肝脏再生中的整体协调作用 | 本研究通过构建动态调控网络和数学模型，揭示了HNF4A作为关键转录激活因子在肝脏再生中的作用，以及其在调控肝脏再生启动和终止中的双稳态失活机制 | NA | 理解肝脏在损伤或切除后平衡肝脏功能和增殖需求的调控机制 | 肝脏再生过程中的转录组重组织 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 数学模型 | RNA测序数据 | 两组三分之二部分肝切除（PHx）后的肝脏样本 |
| 3618 | 2024-08-08 |
In Vitro Matured Human Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Form Grafts With Enhanced Structure and Function in Injured Hearts
2022-05-03, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究通过在聚二甲基硅氧烷（PDMS）衬里的滚瓶中培养，实现了人多能干细胞衍生的心肌细胞（hPSC-CMs）的大规模成熟制造，并证明了这些细胞移植后在受损心脏中形成具有增强结构和功能的移植物 | 首次提供了证据表明，移植更成熟的心肌细胞在体内产生更好的结果 | 文章未明确提及现有研究的局限性 | 探索人多能干细胞衍生的心肌细胞在心脏再生中的应用潜力，并通过改进培养方法提高其成熟度和移植效果 | 人多能干细胞衍生的心肌细胞（hPSC-CMs）及其在心脏再生中的应用 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 免疫细胞化学、超微结构分析、荧光钙成像、批量和单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 使用了一个转基因的人多能干细胞系，生成了超过1×10^8个成熟hPSC-CMs |
| 3619 | 2024-08-08 |
Liver stromal cells restrict macrophage maturation and stromal IL-6 limits the differentiation of cirrhosis-linked macrophages
2022-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.12.036
PMID:35074474
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研究论文 | 本研究探讨了人肝星状细胞如何影响髓系细胞的特性，并利用星状-髓系共培养系统研究了这些相互作用在肝硬化背景下的应用。 | 发现肝星状细胞通过减少CD14+细胞亚群的频率和影响巨噬细胞的分化，限制了巨噬细胞的成熟，并揭示了IL-6在肝星状细胞限制CD9+巨噬细胞分化中的作用。 | NA | 研究人肝星状细胞如何影响髓系细胞的特性，并理解星状-髓系共培养系统在肝硬化研究中的应用。 | 人肝星状细胞和髓系细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 非肝硬化组织样本7例，肝硬化组织样本5例 |
| 3620 | 2024-08-08 |
Prostate luminal progenitor cells: from mouse to human, from health to disease
2022-04, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-021-00561-2
PMID:35079142
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综述 | 本文综述了前列腺腔内祖细胞的研究进展，从鼠类到人类，从健康到疾病 | 近年来，单细胞转录组学的兴起使得对鼠类和人类前列腺腔内祖细胞的全面分析成为可能 | NA | 探讨前列腺腔内祖细胞在前列腺病理生理中的作用及其对雄激素剥夺疗法的抵抗性 | 前列腺腔内祖细胞 | NA | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |