单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3581 - 3600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3581 | 2024-08-08 |
Allopregnanolone suppresses glioblastoma survival through decreasing DPYSL3 and S100A11 expression
2022-05, The Journal of steroid biochemistry and molecular biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jsbmb.2022.106067
PMID:35114375
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研究论文 | 研究探讨了Allopregnanolone（allo）通过降低DPYSL3和S100A11表达来抑制胶质母细胞瘤（GBM）生存的效果 | 发现allo增强替莫唑胺（TMZ）抑制的细胞迁移和TMZ诱导的细胞凋亡，并通过iTRAQ定量蛋白质组学分析证实allo显著降低DPYSL3、S100A11和S100A4的水平 | NA | 旨在确定allo是否对GBM具有治疗效果 | 胶质母细胞瘤（GBM）细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 3582 | 2024-08-08 |
Identifying and antagonizing the interactions between layilin and glycosylated collagens
2022-04-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2022.01.003
PMID:35104453
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研究论文 | 本文研究了layilin与糖基化胶原蛋白之间的相互作用，并探索了通过抗体阻断这些相互作用的方法 | 利用钙离子依赖性揭示了layilin与多种糖基化胶原蛋白的相互作用，并通过差异噬菌体展示策略设计了能阻断这些相互作用的跨物种反应性抗体 | NA | 探索layilin在疾病中的作用及其与胶原蛋白相互作用的调节机制 | layilin与糖基化胶原蛋白的相互作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3583 | 2024-08-08 |
A rice single cell transcriptomic atlas defines the developmental trajectories of rice floret and inflorescence meristems
2022-04, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.18008
PMID:35118670
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研究论文 | 本文利用高通量单细胞RNA测序技术，分析了37,571个水稻花序细胞，构建了一个覆盖花序到小花转变的基因表达资源，并重建了小花和腋生分生组织（AMs）的分化轨迹。 | 本文首次提供了水稻花序早期发育的高分辨率单细胞转录组图谱，并鉴定了高度异质性年轻花序中的离散细胞类型和调控因子。 | NA | 研究水稻花序发育的分子机制，特别是花序到小花的转变过程。 | 水稻花序细胞及其在早期生殖发育中的分化轨迹。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37,571个水稻花序细胞 |
| 3584 | 2024-08-08 |
Vec2image: an explainable artificial intelligence model for the feature representation and classification of high-dimensional biological data by vector-to-image conversion
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab584
PMID:35106553
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研究论文 | 本文介绍了Vec2image模型，这是一个可解释的人工智能框架，通过向图像转换的方法来表示和分类高维生物数据 | Vec2image模型通过主成分坐标转换、深度残差神经网络和嵌入式k-最近邻表示在伪图像上进行特征工程、特征选择和分类器训练，提高了性能并提供了机制上的解释 | NA | 开发一个可解释的人工智能模型，用于高维生物数据的有效学习和分类 | 高维生物数据，特别是组织特异性单细胞数据和多个人胰岛scRNA-seq数据 | 机器学习 | 糖尿病 | scRNA-seq | CNN | 图像 | 多个人的胰岛scRNA-seq数据集 |
| 3585 | 2024-08-08 |
FlyPhoneDB: an integrated web-based resource for cell-cell communication prediction in Drosophila
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab235
PMID:35100387
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研究论文 | 本文介绍了FlyPhoneDB，一个用于预测果蝇细胞间通信的集成式网络资源 | FlyPhoneDB是首个针对果蝇的细胞间通信预测工具，通过计算交互分数来预测细胞间的配体-受体相互作用 | NA | 开发一个工具来预测果蝇中的细胞间通信 | 果蝇的细胞间通信 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 量化算法 | 转录组数据 | 成年果蝇的中肠、腹部和血液的单细胞RNA测序数据集 |
| 3586 | 2024-08-08 |
microRNA-252 and FoxO repress inflammaging by a dual inhibitory mechanism on Dawdle-mediated TGF-β pathway in Drosophila
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab234
PMID:35100390
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研究论文 | 本文通过使用果蝇研究了microRNA-252和FoxO通过双重抑制机制抑制Dawdle介导的TGF-β通路，从而抑制炎症老化 | 揭示了microRNA-252和FoxO通过合作抑制Dawdle，从而促进健康长寿的新机制 | NA | 研究内在信号通路如何引发衰老过程中的先天免疫基因 | 果蝇的microRNA目标组和先天免疫基因 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 年轻和年老的果蝇 |
| 3587 | 2024-08-08 |
How Single-Cell Technologies Have Provided New Insights Into Atherosclerosis
2022-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.315849
PMID:35109673
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综述 | 本文综述了单细胞技术如何为动脉粥样硬化的细胞组成和功能状态提供新的见解 | 单细胞技术揭示了动脉粥样硬化斑块组织的新细胞异质性，并更好地理解了动脉粥样硬化背景下的不同免疫功能状态 | NA | 探讨单细胞技术在动脉粥样硬化研究中的应用和发现 | 动脉粥样硬化斑块的细胞组成及其在饮食扰动或遗传操作下的响应 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、细胞转录组和表位索引测序、转座酶可及染色质高通量测序、飞行时间流式细胞术 | NA | 转录组、蛋白质组 | NA |
| 3588 | 2024-08-08 |
Mouse genomic and cellular annotations
2022-03, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-021-09936-7
PMID:35124726
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综述 | 本文综述了C57BL/6 J小鼠参考基因组的基因组和细胞注释的不同方面及其对小鼠遗传学研究的相关性 | 介绍了新的测序技术如3D基因组结构和单细胞测序在遗传研究中的应用 | NA | 总结小鼠参考基因组的基因组和细胞注释，并探讨其在小鼠遗传学研究中的相关性 | C57BL/6 J小鼠的基因组和细胞注释 | 基因组学 | NA | 3D基因组结构分析，单细胞测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 3589 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics uncovers an instructive T-cell receptor role in adult γδ T-cell lineage commitment
2022-03-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021110023
PMID:35128689
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研究论文 | 本研究利用缺乏LAT表达的小鼠模型，通过单细胞转录组学分析，探讨了γδ T细胞受体在成年γδ T细胞谱系承诺中的指导作用 | 发现即使在缺乏LAT的情况下，部分DN3 γδ细胞仍能进行活跃增殖并进展到DN4阶段，但未能激活与γδ T细胞谱系相关的转录程序，表明γδ TCR-LAT信号轴在未承诺的γδ T细胞谱系状态上构建，以完全指导成年γδ T细胞谱系特异性 | 研究仅限于缺乏LAT表达的小鼠模型，可能无法完全代表所有情况下的γδ T细胞发育 | 确定γδ T细胞受体在γδ T细胞谱系承诺中的作用 | 缺乏LAT表达的小鼠的DN3 γδ细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 0.3%的DN3细胞表达中等水平的γδ TCR，其中25%的LAT缺陷DN3 γδ细胞处于活跃增殖状态 |
| 3590 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the individual alteration of intestinal mucosal immunocytes in Dusp6 knockout mice
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103738
PMID:35128351
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了Dusp6敲除小鼠肠道黏膜免疫细胞的个体变化 | 首次通过scRNA-seq技术详细解析了Dusp6敲除小鼠肠道白细胞的个体组成和转录变化 | NA | 探索Dusp6敲除小鼠肠道白细胞的个体组成和转录变化 | Dusp6敲除小鼠的肠道白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 3591 | 2024-08-08 |
Mapping transcriptomic vector fields of single cells
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.045
PMID:35108499
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dynamo的分析框架，用于推断绝对RNA速度，重建连续向量场以预测细胞命运，并利用微分几何提取潜在的调控机制 | dynamo框架能够克服传统剪接型RNA速度分析的基本限制，实现对代谢标记的人类造血scRNA-seq数据准确的速度估计，并能预测基因扰动引起的细胞命运变化 | NA | 开发一种新的分析框架，以充分利用单细胞RNA测序数据，揭示细胞状态和转换的调控功能 | 单细胞RNA测序数据，特别是代谢标记的人类造血系统数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, RNA速度分析, 代谢标记 | 微分几何模型 | scRNA-seq数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3592 | 2024-08-08 |
Highly Sensitive and Specific Responses of Oyster Hemocytes to Copper Exposure: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Different Cell Populations
2022-02-15, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.1c07510
PMID:35107992
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）分析了牡蛎血细胞在铜暴露下的不同细胞群体的响应 | 首次揭示了牡蛎血细胞在铜暴露下的异质性响应，并提供了1900个群体特异性的铜响应基因 | NA | 研究牡蛎血细胞在铜暴露下的响应机制 | 牡蛎血细胞的不同细胞群体 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12个血细胞集群 |
| 3593 | 2024-08-08 |
Executioner caspases 3 and 7 are dispensable for intestinal epithelium turnover and homeostasis at steady state
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2024508119
PMID:35105800
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research paper | 本研究通过生成缺乏执行性半胱天冬酶-3和半胱天冬酶-7的肠上皮细胞特异性敲除小鼠，探讨了细胞凋亡在肠上皮细胞更新和稳态维持中的作用。 | 研究发现，在稳态条件下，细胞凋亡本身对于肠上皮细胞在肠绒毛顶端的更新并非必需，这一发现挑战了传统认为细胞凋亡对肠上皮细胞更新至关重要的观点。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨细胞凋亡在肠上皮细胞更新和稳态维持中的作用。 | 肠上皮细胞特异性敲除小鼠。 | NA | NA | 转录组和单细胞RNA测序分析。 | NA | 转录组和单细胞RNA数据。 | 未明确提及样本数量。 |
| 3594 | 2024-08-08 |
Convergent clonal selection of donor- and recipient-derived CMV-specific T cells in hematopoietic stem cell transplant patients
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2117031119
PMID:35105810
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研究论文 | 研究在非骨髓抑制性造血干细胞移植患者中，供体和受体来源的CMV特异性T细胞的克隆选择和竞争 | 首次在人类感染背景下评估T细胞竞争对CMV再激活的响应，并使用单细胞转录组学追踪供体和受体来源的T细胞克隆 | 研究仅限于特定的造血干细胞移植患者群体，且仅关注CMV再激活的情况 | 探讨T细胞竞争在人类CMV感染中的作用及其对T细胞响应的影响 | 非骨髓抑制性造血干细胞移植患者中的CMV特异性T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 90天的供体和受体来源的T细胞克隆数据 |
| 3595 | 2024-08-08 |
Epigenetic state determines inflammatory sensing in neuroblastoma
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102358119
PMID:35121657
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研究论文 | 研究探讨了神经母细胞瘤中炎症信号通路的响应情况，并发现表观遗传状态对炎症感知有决定性影响 | 发现神经母细胞瘤细胞系中表观遗传状态与对双链RNA的响应能力相关，为免疫治疗策略提供了新视角 | NA | 研究神经母细胞瘤中炎症信号通路及其与表观遗传状态的关系 | 神经母细胞瘤细胞系及其对炎症刺激的响应 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20种不同的神经母细胞瘤细胞系 |
| 3596 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of mouse uterus at the invasion phase of embryo implantation
2022-Feb-05, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00749-y
PMID:35123575
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研究论文 | 本研究利用小鼠作为动物模型，生成了一份单细胞转录组图谱，揭示了胚胎植入期小鼠子宫的23个不同细胞集群 | 首次在小鼠子宫胚胎植入期的入侵阶段生成单细胞转录组图谱，并揭示了多种细胞类型的差异表达变化 | NA | 探究胚胎植入的分子机制 | 小鼠子宫在胚胎植入期的细胞类型和分子机制 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 小鼠子宫在妊娠第6天的胚胎植入部位 |
| 3597 | 2024-08-08 |
CRISPR activation and interference screens decode stimulation responses in primary human T cells
2022-02-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj4008
PMID:35113687
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR激活（CRISPRa）和干扰（CRISPRi）筛选，在人原代T细胞中识别控制白细胞介素-2（IL-2）和干扰素-γ（IFN-γ）产生的基因网络 | 首次在人原代T细胞中进行全基因组CRISPRa和CRISPRi筛选，揭示了调控细胞因子产生的关键基因网络 | NA | 系统发现依赖刺激的细胞因子调控因子，以了解其在自身免疫、免疫缺陷和癌症中的作用 | 人原代T细胞中的细胞因子调控基因 | 免疫学 | 自身免疫病 | CRISPR激活（CRISPRa）和干扰（CRISPRi） | NA | 基因组数据 | 全基因组 |
| 3598 | 2024-08-08 |
Novel insights from a multiomics dissection of the Hayflick limit
2022-02-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.70283
PMID:35119359
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研究论文 | 本文通过多种组学技术重新研究了WI-38人肺成纤维细胞的复制性衰老过程 | 发现衰老状态的转变早期显现并逐渐增加，与核仁和核纤层相关域的DNA可及性全局增加相对应；揭示了衰老的WI-38细胞在基因表达上与肌成纤维细胞的相似性 | NA | 深入理解细胞复制性衰老的过程和机制 | WI-38人肺成纤维细胞的复制性衰老 | 生物学 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 代谢组学, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢数据, DNA可及性数据 | NA |
| 3599 | 2024-08-08 |
TNF antagonist sensitizes synovial fibroblasts to ferroptotic cell death in collagen-induced arthritis mouse models
2022-02-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27948-4
PMID:35115492
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研究论文 | 本研究利用胶原诱导的关节炎（CIA）小鼠模型，探讨了铁死亡诱导剂伊米他酮（IKE）和TNF拮抗剂依那西普联合使用对滑膜成纤维细胞铁死亡及关节炎进展的影响。 | 首次展示了TNF拮抗剂与铁死亡诱导剂联合使用在胶原诱导的关节炎小鼠模型中诱导滑膜成纤维细胞铁死亡并减缓关节炎进展的效果。 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证其疗效和安全性。 | 探索铁死亡在类风湿性关节炎治疗中的潜在应用。 | 滑膜成纤维细胞及胶原诱导的关节炎小鼠模型。 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 3600 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing reveals differentiation related genes with drawing implications in predicting prognosis and immunotherapy response in gliomas
2022-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-05686-x
PMID:35115572
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术识别与胶质瘤细胞分化相关的基因，用于预测患者的预后和免疫治疗反应 | 首次通过单细胞转录组学分析识别出胶质瘤细胞的三种分化状态及其相关基因，并构建了基于这些基因的预后模型和诺模图模型 | 研究仅限于胶质瘤患者，且样本量未具体说明，可能影响模型的泛化能力 | 旨在识别与胶质瘤细胞分化相关的基因，以预测患者的预后和免疫治疗反应 | 胶质瘤细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图模型 | RNA序列数据 | NA |