单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3581 - 3600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3581 | 2024-08-08 |
microRNA-252 and FoxO repress inflammaging by a dual inhibitory mechanism on Dawdle-mediated TGF-β pathway in Drosophila
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab234
PMID:35100390
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研究论文 | 本文通过使用果蝇研究了microRNA-252和FoxO通过双重抑制机制抑制Dawdle介导的TGF-β通路，从而抑制炎症老化 | 揭示了microRNA-252和FoxO通过合作抑制Dawdle，从而促进健康长寿的新机制 | NA | 研究内在信号通路如何引发衰老过程中的先天免疫基因 | 果蝇的microRNA目标组和先天免疫基因 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 年轻和年老的果蝇 |
| 3582 | 2024-08-08 |
How Single-Cell Technologies Have Provided New Insights Into Atherosclerosis
2022-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.315849
PMID:35109673
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综述 | 本文综述了单细胞技术如何为动脉粥样硬化的细胞组成和功能状态提供新的见解 | 单细胞技术揭示了动脉粥样硬化斑块组织的新细胞异质性，并更好地理解了动脉粥样硬化背景下的不同免疫功能状态 | NA | 探讨单细胞技术在动脉粥样硬化研究中的应用和发现 | 动脉粥样硬化斑块的细胞组成及其在饮食扰动或遗传操作下的响应 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、细胞转录组和表位索引测序、转座酶可及染色质高通量测序、飞行时间流式细胞术 | NA | 转录组、蛋白质组 | NA |
| 3583 | 2024-08-08 |
Mouse genomic and cellular annotations
2022-03, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-021-09936-7
PMID:35124726
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综述 | 本文综述了C57BL/6 J小鼠参考基因组的基因组和细胞注释的不同方面及其对小鼠遗传学研究的相关性 | 介绍了新的测序技术如3D基因组结构和单细胞测序在遗传研究中的应用 | NA | 总结小鼠参考基因组的基因组和细胞注释，并探讨其在小鼠遗传学研究中的相关性 | C57BL/6 J小鼠的基因组和细胞注释 | 基因组学 | NA | 3D基因组结构分析，单细胞测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 3584 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics uncovers an instructive T-cell receptor role in adult γδ T-cell lineage commitment
2022-03-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021110023
PMID:35128689
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研究论文 | 本研究利用缺乏LAT表达的小鼠模型，通过单细胞转录组学分析，探讨了γδ T细胞受体在成年γδ T细胞谱系承诺中的指导作用 | 发现即使在缺乏LAT的情况下，部分DN3 γδ细胞仍能进行活跃增殖并进展到DN4阶段，但未能激活与γδ T细胞谱系相关的转录程序，表明γδ TCR-LAT信号轴在未承诺的γδ T细胞谱系状态上构建，以完全指导成年γδ T细胞谱系特异性 | 研究仅限于缺乏LAT表达的小鼠模型，可能无法完全代表所有情况下的γδ T细胞发育 | 确定γδ T细胞受体在γδ T细胞谱系承诺中的作用 | 缺乏LAT表达的小鼠的DN3 γδ细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 0.3%的DN3细胞表达中等水平的γδ TCR，其中25%的LAT缺陷DN3 γδ细胞处于活跃增殖状态 |
| 3585 | 2024-08-08 |
Correlation between circulating innate lymphoid cell precursors and thymic function
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103732
PMID:35118353
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研究论文 | 本文探讨了循环中的先天淋巴细胞前体与胸腺功能之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序分析显示野生型而非无胸腺裸鼠血液中存在大量ILC前体，并发现这些前体细胞在不同组织环境中分化为多种ILC亚群 | NA | 研究胸腺在维持不同外周组织中ILC池平衡中的作用 | 先天淋巴细胞前体及其在不同组织环境中的分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3586 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the individual alteration of intestinal mucosal immunocytes in Dusp6 knockout mice
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103738
PMID:35128351
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了Dusp6敲除小鼠肠道黏膜免疫细胞的个体变化 | 首次通过scRNA-seq技术详细解析了Dusp6敲除小鼠肠道白细胞的个体组成和转录变化 | NA | 探索Dusp6敲除小鼠肠道白细胞的个体组成和转录变化 | Dusp6敲除小鼠的肠道白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 3587 | 2024-08-08 |
Mapping transcriptomic vector fields of single cells
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.045
PMID:35108499
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dynamo的分析框架，用于推断绝对RNA速度，重建连续向量场以预测细胞命运，并利用微分几何提取潜在的调控机制 | dynamo框架能够克服传统剪接型RNA速度分析的基本限制，实现对代谢标记的人类造血scRNA-seq数据准确的速度估计，并能预测基因扰动引起的细胞命运变化 | NA | 开发一种新的分析框架，以充分利用单细胞RNA测序数据，揭示细胞状态和转换的调控功能 | 单细胞RNA测序数据，特别是代谢标记的人类造血系统数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, RNA速度分析, 代谢标记 | 微分几何模型 | scRNA-seq数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3588 | 2024-08-08 |
Highly Sensitive and Specific Responses of Oyster Hemocytes to Copper Exposure: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Different Cell Populations
2022-02-15, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.1c07510
PMID:35107992
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）分析了牡蛎血细胞在铜暴露下的不同细胞群体的响应 | 首次揭示了牡蛎血细胞在铜暴露下的异质性响应，并提供了1900个群体特异性的铜响应基因 | NA | 研究牡蛎血细胞在铜暴露下的响应机制 | 牡蛎血细胞的不同细胞群体 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12个血细胞集群 |
| 3589 | 2024-08-08 |
Executioner caspases 3 and 7 are dispensable for intestinal epithelium turnover and homeostasis at steady state
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2024508119
PMID:35105800
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research paper | 本研究通过生成缺乏执行性半胱天冬酶-3和半胱天冬酶-7的肠上皮细胞特异性敲除小鼠，探讨了细胞凋亡在肠上皮细胞更新和稳态维持中的作用。 | 研究发现，在稳态条件下，细胞凋亡本身对于肠上皮细胞在肠绒毛顶端的更新并非必需，这一发现挑战了传统认为细胞凋亡对肠上皮细胞更新至关重要的观点。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨细胞凋亡在肠上皮细胞更新和稳态维持中的作用。 | 肠上皮细胞特异性敲除小鼠。 | NA | NA | 转录组和单细胞RNA测序分析。 | NA | 转录组和单细胞RNA数据。 | 未明确提及样本数量。 |
| 3590 | 2024-08-08 |
Convergent clonal selection of donor- and recipient-derived CMV-specific T cells in hematopoietic stem cell transplant patients
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2117031119
PMID:35105810
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研究论文 | 研究在非骨髓抑制性造血干细胞移植患者中，供体和受体来源的CMV特异性T细胞的克隆选择和竞争 | 首次在人类感染背景下评估T细胞竞争对CMV再激活的响应，并使用单细胞转录组学追踪供体和受体来源的T细胞克隆 | 研究仅限于特定的造血干细胞移植患者群体，且仅关注CMV再激活的情况 | 探讨T细胞竞争在人类CMV感染中的作用及其对T细胞响应的影响 | 非骨髓抑制性造血干细胞移植患者中的CMV特异性T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 90天的供体和受体来源的T细胞克隆数据 |
| 3591 | 2024-08-08 |
Epigenetic state determines inflammatory sensing in neuroblastoma
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102358119
PMID:35121657
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研究论文 | 研究探讨了神经母细胞瘤中炎症信号通路的响应情况，并发现表观遗传状态对炎症感知有决定性影响 | 发现神经母细胞瘤细胞系中表观遗传状态与对双链RNA的响应能力相关，为免疫治疗策略提供了新视角 | NA | 研究神经母细胞瘤中炎症信号通路及其与表观遗传状态的关系 | 神经母细胞瘤细胞系及其对炎症刺激的响应 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20种不同的神经母细胞瘤细胞系 |
| 3592 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of mouse uterus at the invasion phase of embryo implantation
2022-Feb-05, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00749-y
PMID:35123575
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研究论文 | 本研究利用小鼠作为动物模型，生成了一份单细胞转录组图谱，揭示了胚胎植入期小鼠子宫的23个不同细胞集群 | 首次在小鼠子宫胚胎植入期的入侵阶段生成单细胞转录组图谱，并揭示了多种细胞类型的差异表达变化 | NA | 探究胚胎植入的分子机制 | 小鼠子宫在胚胎植入期的细胞类型和分子机制 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 小鼠子宫在妊娠第6天的胚胎植入部位 |
| 3593 | 2024-08-08 |
CRISPR activation and interference screens decode stimulation responses in primary human T cells
2022-02-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj4008
PMID:35113687
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR激活（CRISPRa）和干扰（CRISPRi）筛选，在人原代T细胞中识别控制白细胞介素-2（IL-2）和干扰素-γ（IFN-γ）产生的基因网络 | 首次在人原代T细胞中进行全基因组CRISPRa和CRISPRi筛选，揭示了调控细胞因子产生的关键基因网络 | NA | 系统发现依赖刺激的细胞因子调控因子，以了解其在自身免疫、免疫缺陷和癌症中的作用 | 人原代T细胞中的细胞因子调控基因 | 免疫学 | 自身免疫病 | CRISPR激活（CRISPRa）和干扰（CRISPRi） | NA | 基因组数据 | 全基因组 |
| 3594 | 2024-08-08 |
Novel insights from a multiomics dissection of the Hayflick limit
2022-02-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.70283
PMID:35119359
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研究论文 | 本文通过多种组学技术重新研究了WI-38人肺成纤维细胞的复制性衰老过程 | 发现衰老状态的转变早期显现并逐渐增加，与核仁和核纤层相关域的DNA可及性全局增加相对应；揭示了衰老的WI-38细胞在基因表达上与肌成纤维细胞的相似性 | NA | 深入理解细胞复制性衰老的过程和机制 | WI-38人肺成纤维细胞的复制性衰老 | 生物学 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 代谢组学, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢数据, DNA可及性数据 | NA |
| 3595 | 2024-08-08 |
TNF antagonist sensitizes synovial fibroblasts to ferroptotic cell death in collagen-induced arthritis mouse models
2022-02-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27948-4
PMID:35115492
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研究论文 | 本研究利用胶原诱导的关节炎（CIA）小鼠模型，探讨了铁死亡诱导剂伊米他酮（IKE）和TNF拮抗剂依那西普联合使用对滑膜成纤维细胞铁死亡及关节炎进展的影响。 | 首次展示了TNF拮抗剂与铁死亡诱导剂联合使用在胶原诱导的关节炎小鼠模型中诱导滑膜成纤维细胞铁死亡并减缓关节炎进展的效果。 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证其疗效和安全性。 | 探索铁死亡在类风湿性关节炎治疗中的潜在应用。 | 滑膜成纤维细胞及胶原诱导的关节炎小鼠模型。 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 3596 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing reveals differentiation related genes with drawing implications in predicting prognosis and immunotherapy response in gliomas
2022-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-05686-x
PMID:35115572
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术识别与胶质瘤细胞分化相关的基因，用于预测患者的预后和免疫治疗反应 | 首次通过单细胞转录组学分析识别出胶质瘤细胞的三种分化状态及其相关基因，并构建了基于这些基因的预后模型和诺模图模型 | 研究仅限于胶质瘤患者，且样本量未具体说明，可能影响模型的泛化能力 | 旨在识别与胶质瘤细胞分化相关的基因，以预测患者的预后和免疫治疗反应 | 胶质瘤细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图模型 | RNA序列数据 | NA |
| 3597 | 2024-08-08 |
Lung cancer scRNA-seq and lipidomics reveal aberrant lipid metabolism for early-stage diagnosis
2022-02-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abk2756
PMID:35108060
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和脂质组学分析，揭示了早期肺癌中脂质代谢的异常，并开发了一种基于液相色谱-质谱法的检测方法，用于早期肺癌的诊断。 | 本文首次结合单细胞RNA测序和脂质组学技术，识别出与早期肺癌诊断相关的关键脂质标志物，并开发了一种高灵敏度和特异性的检测方法。 | NA | 开发一种新的血液检测方法，用于早期肺癌的诊断和大规模高风险人群的筛查。 | 早期肺癌患者的脂质代谢异常及其在诊断中的应用。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、脂质组学、液相色谱-质谱法 | 支持向量机算法 | RNA序列、脂质组数据、质谱数据 | 探索性队列311名参与者，独立验证队列1036名参与者，前瞻性临床队列109名参与者 |
| 3598 | 2024-08-08 |
NF-κB perturbation reveals unique immunomodulatory functions in Prx1+ fibroblasts that promote development of atopic dermatitis
2022-02-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj0324
PMID:35108061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了Prx1+成纤维细胞在NF-κB通路扰动下对特应性皮炎发展的独特免疫调节作用 | 发现Prx1+成纤维细胞在NF-κB通路扰动下能诱导皮肤炎症，这一发现为特应性皮炎的病理机制提供了新的见解 | 研究主要基于小鼠模型和人类特应性皮炎皮肤样本，未来需在更广泛的人群中验证这些发现 | 探讨NF-κB通路在特应性皮炎发展中的作用及其潜在的免疫调节机制 | Prx1+成纤维细胞在NF-κB通路扰动下的免疫调节功能 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | RNA测序数据 | 包括小鼠模型和人类特应性皮炎皮肤样本 |
| 3599 | 2024-08-08 |
Prdm6 controls heart development by regulating neural crest cell differentiation and migration
2022-02-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156046
PMID:35108221
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研究论文 | 本文通过转录组分析和遗传命运图谱方法，揭示了Prdm6作为表观遗传修饰因子在调控心脏神经嵴细胞（CNCCs）分化和迁移中的关键作用 | 首次识别Prdm6作为调控CNCCs命运的决定因子，并揭示其通过调节CNCCs特异性基因网络影响心脏发育 | 研究主要基于转基因小鼠模型，可能需要进一步在其他模型或人类样本中验证 | 探讨Prdm6在心脏神经嵴细胞分化和迁移中的分子机制及其在先天性心脏病治疗中的潜在应用 | Prdm6基因在心脏神经嵴细胞分化和迁移中的作用及其调控的基因网络 | NA | 先天性心脏病 | 转录组分析, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 转基因小鼠样本 |
| 3600 | 2024-08-08 |
Spatial maps of hepatocellular carcinoma transcriptomes highlight an unexplored landscape of heterogeneity and a novel gene signature for survival
2022-Feb-02, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02430-9
PMID:35109839
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了肝细胞癌肿瘤及其邻近非肿瘤组织的基因表达异质性，并构建了一个新的6基因标志物模型用于肝细胞癌的预后预测 | 本研究首次利用空间转录组学技术揭示了肝细胞癌的基因表达异质性，并构建了一个新的6基因标志物模型，为肝细胞癌的预后预测提供了新的工具 | 本研究主要依赖于空间转录组学技术，可能存在技术本身的局限性；此外，研究结果需要在更大规模和更多样化的患者群体中进行验证 | 揭示肝细胞癌的基因表达异质性，并开发新的预后预测工具 | 肝细胞癌肿瘤及其邻近非肿瘤组织的基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 近10,820个组织区域 |