单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3561 - 3580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3561 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis revealed a suppressive tumor immune microenvironment in EGFR mutant lung adenocarcinoma
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003534
PMID:35140113
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和多重免疫组织化学技术，分析了EGFR突变型肺腺癌的肿瘤免疫微环境特征 | 首次全面描述了EGFR突变型肺腺癌的肿瘤微环境特征，从细胞组成和功能角度深入理解其免疫景观 | 研究样本量有限，仅包括九个未经治疗和三个经过免疫治疗的样本 | 旨在描述EGFR突变型肺腺癌的特定肿瘤微环境，以更好地理解其免疫景观 | EGFR突变型和野生型肺腺癌的免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 九个未经治疗和三个经过免疫治疗的样本 |
| 3562 | 2024-08-08 |
ATG16L1 is a Potential Prognostic Biomarker and Immune Signature for Osteosarcoma: A Study Based on Bulk RNA and Single-Cell RNA-Sequencing
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S341879
PMID:35140506
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，探讨了自噬相关基因ATG16L1在骨肉瘤中的预后生物标志物和免疫特征的作用 | 首次通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了ATG16L1作为骨肉瘤的潜在预后生物标志物和免疫特征 | 研究仅基于GSE21257数据库和GSE152048数据集，可能需要更多样本和数据集来验证结果 | 探讨ATG16L1作为骨肉瘤预后生物标志物和免疫特征的潜力 | 骨肉瘤患者及其肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | LASSO回归分析和Cox回归分析 | RNA | 使用GSE21257数据库和GSE152048数据集进行分析 |
| 3563 | 2024-08-08 |
Mapk14 is a Prognostic Biomarker and Correlates with the Clinicopathological Features and Immune Infiltration of Colorectal Cancer
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.817800
PMID:35141222
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研究论文 | 本研究探讨了Mapk14在结直肠癌中的表达及其与临床病理特征和免疫浸润的关系 | 发现Mapk14可作为结直肠癌的新型预后生物标志物，并与免疫浸润和药物治疗相关 | NA | 研究Mapk14在结直肠癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | Mapk14的表达、甲基化水平及其与结直肠癌临床病理特征和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者数据 |
| 3564 | 2024-08-08 |
Development of an Inflammation-Related lncRNA-miRNA-mRNA Network Based on Competing Endogenous RNA in Breast Cancer at Single-Cell Resolution
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.839876
PMID:35145966
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研究论文 | 本研究旨在探讨炎症与长非编码RNA（lncRNA）之间的关系，并在乳腺癌中建立基于竞争性内源RNA（ceRNA）的炎症相关网络 | 首次在单细胞分辨率下构建了乳腺癌中的炎症相关ceRNA网络，并识别了潜在的关键lncRNA LRRC75A-AS1 | NA | 探索炎症与lncRNA在乳腺癌中的关系及机制 | 乳腺癌中的炎症相关lncRNA及其ceRNA网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 基于四项单细胞RNA测序研究的数据 |
| 3565 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis Reveals the Characteristics and Effects of SARS-CoV-2 Maternal-Fetal Transmission
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.813187
PMID:35154056
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研究论文 | 本文通过综合分析大规模转录组和单细胞测序数据，探讨了影响SARS-CoV-2母婴传播的关键因素及其特征和影响 | 研究揭示了胚胎发育阶段多个组织中ACE2和TMPRSS2的表达情况，以及这些因素在母婴传播中的潜在风险 | 研究主要集中在转录组和单细胞测序数据分析，未涉及临床病例的具体观察 | 探究SARS-CoV-2母婴传播的特征、影响及其分子机制 | SARS-CoV-2母婴传播的关键因素、特征和影响 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 3566 | 2024-08-08 |
Characterization of Pipefish Immune Cell Populations Through Single-Cell Transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.820152
PMID:35154138
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术首次对海龙科鱼类的免疫细胞群进行了表征 | 首次利用单细胞RNA测序技术对海龙科鱼类的免疫细胞群进行表征，揭示了其独特的免疫细胞亚群 | NA | 探索海龙科鱼类在进化过程中免疫系统的变化及其对免疫细胞群动态的影响 | 海龙科鱼类的免疫细胞群 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 从血液和头肾提取的单个细胞 |
| 3567 | 2024-08-08 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Data to Establish and Validate a Prognostic Model for Patients With Lung Adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.833797
PMID:35154287
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建并验证了肺腺癌的预后模型 | 利用单细胞RNA测序技术，能够检测肿瘤细胞中的精确细胞和分子变化，这是传统RNA测序无法做到的 | NA | 构建肺腺癌的预后模型 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 非负矩阵分解算法, Cox回归分析 | RNA测序数据 | 四个样本的单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA和GEO数据库的批量RNA测序数据 |
| 3568 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA landscape of the osteoimmunology microenvironment in periodontitis
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.65694
PMID:35154475
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了牙周炎中骨免疫微环境的分子成分和细胞组成的复杂性 | 首次在单细胞水平上全面揭示了牙周炎中骨免疫微环境的细胞类型和分子通路，特别是纤维母细胞和间充质干细胞在牙周炎中的变化 | NA | 探索牙周炎中骨免疫微环境的单细胞RNA图谱及其在牙周骨再生中的作用 | 健康对照组、严重慢性牙周炎患者及接受初步牙周治疗后的患者 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | UMAP | RNA | 共51248个单细胞，来自健康对照组（4例）、严重慢性牙周炎患者（5例）及初步牙周治疗后1个月内的患者（3例） |
| 3569 | 2024-08-08 |
A decade of molecular cell atlases
2022-08, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.01.004
PMID:35105475
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评论 | 本文讨论了利用单细胞转录组测序技术创建细胞图谱的历史和技术创新 | 介绍了单细胞转录组测序技术在创建细胞图谱方面的进展 | NA | 探讨细胞图谱的发展及其对理解细胞类型多样性的贡献 | 细胞类型的分子特征 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3570 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Keloids: Highlights on Fibrovascular Interactions in Keloid Pathogenesis
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.017
PMID:35123990
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，分析了瘢痕疙瘩组织及其正常皮肤对照样本，揭示了瘢痕疙瘩发病机制中的纤维血管相互作用。 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描绘了瘢痕疙瘩的细胞图谱，并发现了纤维细胞与内皮细胞之间的显著相互作用。 | 研究仅限于瘢痕疙瘩组织样本，未涉及其他类型的皮肤病变，可能限制了结果的普遍性。 | 探究瘢痕疙瘩的病理生理机制，特别是纤维细胞与内皮细胞在瘢痕疙瘩形成中的相互作用。 | 瘢痕疙瘩组织及其正常皮肤对照样本，以及患者匹配的瘢痕疙瘩和正常成熟瘢痕。 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3571 | 2024-08-08 |
SLRRSC: Single-Cell Type Recognition Method Based on Similarity and Graph Regularization Constraints
2022-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2022.3148286
PMID:35120014
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研究论文 | 本文提出了一种基于相似性和图正则化约束的单细胞类型识别方法SLRRSC，用于解决scRNA-seq数据中细胞类型识别的挑战 | 引入基于流形的图正则化和相似性约束到低秩表示方法中，以保留数据的局部几何结构并提高全局结构的学习能力 | NA | 开发一种新的子空间聚类算法，以更有效地从大量细胞混合物中识别细胞类型 | scRNA-seq数据中的单细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 低秩表示模型 | SLRRSC算法 | scRNA-seq数据 | 模拟数据和真实单细胞数据集 |
| 3572 | 2024-08-08 |
Temporal modelling using single-cell transcriptomics
2022-06, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-021-00444-7
PMID:35102309
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学进行时间序列分析的方法，重点讨论了时间序列单细胞RNA测序（scRNA-seq）的分析和建模问题 | 单细胞转录组学方法革新了我们对多个生物过程和系统的研究能力，包括发育、分化、响应程序和疾病进展 | 时间序列单细胞RNA测序提出了新的分析和建模问题，如确定何时以及如何深入地分析细胞、连接不同时间点的细胞、学习连续轨迹以及整合批量和单细胞数据以重建动态网络模型 | 探讨时间序列单细胞RNA测序的分析和建模方法 | 单细胞转录组学数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 3573 | 2024-08-08 |
Signatures of malignant cells and novel therapeutic targets revealed by single-cell sequencing in lung adenocarcinoma
2022-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.4547
PMID:35102706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析肺腺癌中的恶性细胞特异性基因，探索诊断和治疗标志物 | 发现了369个在单个恶性细胞中特异性表达的基因，其中70个编码分泌或膜结合蛋白的基因在肿瘤生物学中的细胞间通讯中发挥作用 | 需要进一步验证这些基因在更多类型的肿瘤中的作用 | 探索肺腺癌中单细胞转录组数据中的恶性细胞特异性基因，以发现新的诊断和治疗标志物 | 肺腺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型 | 转录组数据 | 22,491个肿瘤细胞和181,666个正常细胞 |
| 3574 | 2024-08-08 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals cellular heterogeneity and immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2022-06, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13190
PMID:35124891
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研究论文 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了肝细胞癌中的细胞异质性和免疫浸润 | 首次通过非负矩阵分解（NMF）聚类进行共识分子亚型分析，并结合单细胞数据识别转录因子BATF及其在免疫抑制中的作用 | NA | 解析肝细胞癌中的肿瘤间和肿瘤内异质性，并探讨其对免疫抑制微环境的影响 | 肝细胞癌（HCC）的肿瘤异质性和免疫抑制微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF） | RNA | 来自癌症基因组图谱（TCGA）的肝细胞癌肿瘤样本被分为三个亚型（S1, S2, S3），以及单细胞数据集中的S3-like亚型（CS3） |
| 3575 | 2024-08-08 |
Innate lymphoid cell characterization in the rat and their correlation to gut commensal microbes
2022-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202149639
PMID:35099074
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研究论文 | 本文深入研究了大鼠的先天淋巴细胞（ILCs），并探讨了它们与肠道共生微生物的关系 | 首次详细描述了大鼠ILCs的特征，并发现了与ILCs频率相关的特定细菌类群 | NA | 研究大鼠ILCs的特征及其与肠道微生物的关联 | 大鼠的先天淋巴细胞及其与肠道共生微生物的关系 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及脾脏和肝脏细胞的单细胞转录组数据 |
| 3576 | 2024-08-08 |
Allopregnanolone suppresses glioblastoma survival through decreasing DPYSL3 and S100A11 expression
2022-05, The Journal of steroid biochemistry and molecular biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jsbmb.2022.106067
PMID:35114375
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研究论文 | 研究探讨了Allopregnanolone（allo）通过降低DPYSL3和S100A11表达来抑制胶质母细胞瘤（GBM）生存的效果 | 发现allo增强替莫唑胺（TMZ）抑制的细胞迁移和TMZ诱导的细胞凋亡，并通过iTRAQ定量蛋白质组学分析证实allo显著降低DPYSL3、S100A11和S100A4的水平 | NA | 旨在确定allo是否对GBM具有治疗效果 | 胶质母细胞瘤（GBM）细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 3577 | 2024-08-08 |
Identifying and antagonizing the interactions between layilin and glycosylated collagens
2022-04-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2022.01.003
PMID:35104453
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研究论文 | 本文研究了layilin与糖基化胶原蛋白之间的相互作用，并探索了通过抗体阻断这些相互作用的方法 | 利用钙离子依赖性揭示了layilin与多种糖基化胶原蛋白的相互作用，并通过差异噬菌体展示策略设计了能阻断这些相互作用的跨物种反应性抗体 | NA | 探索layilin在疾病中的作用及其与胶原蛋白相互作用的调节机制 | layilin与糖基化胶原蛋白的相互作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3578 | 2024-08-08 |
A rice single cell transcriptomic atlas defines the developmental trajectories of rice floret and inflorescence meristems
2022-04, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.18008
PMID:35118670
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研究论文 | 本文利用高通量单细胞RNA测序技术，分析了37,571个水稻花序细胞，构建了一个覆盖花序到小花转变的基因表达资源，并重建了小花和腋生分生组织（AMs）的分化轨迹。 | 本文首次提供了水稻花序早期发育的高分辨率单细胞转录组图谱，并鉴定了高度异质性年轻花序中的离散细胞类型和调控因子。 | NA | 研究水稻花序发育的分子机制，特别是花序到小花的转变过程。 | 水稻花序细胞及其在早期生殖发育中的分化轨迹。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37,571个水稻花序细胞 |
| 3579 | 2024-08-08 |
Vec2image: an explainable artificial intelligence model for the feature representation and classification of high-dimensional biological data by vector-to-image conversion
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab584
PMID:35106553
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研究论文 | 本文介绍了Vec2image模型，这是一个可解释的人工智能框架，通过向图像转换的方法来表示和分类高维生物数据 | Vec2image模型通过主成分坐标转换、深度残差神经网络和嵌入式k-最近邻表示在伪图像上进行特征工程、特征选择和分类器训练，提高了性能并提供了机制上的解释 | NA | 开发一个可解释的人工智能模型，用于高维生物数据的有效学习和分类 | 高维生物数据，特别是组织特异性单细胞数据和多个人胰岛scRNA-seq数据 | 机器学习 | 糖尿病 | scRNA-seq | CNN | 图像 | 多个人的胰岛scRNA-seq数据集 |
| 3580 | 2024-08-08 |
FlyPhoneDB: an integrated web-based resource for cell-cell communication prediction in Drosophila
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab235
PMID:35100387
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研究论文 | 本文介绍了FlyPhoneDB，一个用于预测果蝇细胞间通信的集成式网络资源 | FlyPhoneDB是首个针对果蝇的细胞间通信预测工具，通过计算交互分数来预测细胞间的配体-受体相互作用 | NA | 开发一个工具来预测果蝇中的细胞间通信 | 果蝇的细胞间通信 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 量化算法 | 转录组数据 | 成年果蝇的中肠、腹部和血液的单细胞RNA测序数据集 |