单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3541 - 3560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3541 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals time- and sex-specific responses of mouse spinal cord microglia to peripheral nerve injury and links ApoE to chronic pain
2022-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28473-8
PMID:35149686
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠脊髓微胶质细胞在外周神经损伤后的时间性和性别特异性反应，并发现ApoE与慢性疼痛之间的关联。 | 首次展示了外周神经损伤后，小鼠脊髓微胶质细胞中性别特异性的炎症亚型生成，并揭示了ApoE在慢性疼痛中的作用。 | NA | 探究外周神经损伤后脊髓微胶质细胞的动态变化及其与慢性疼痛的关系。 | 小鼠和人类的脊髓微胶质细胞。 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的脊髓微胶质细胞样本。 |
| 3542 | 2024-08-08 |
Three-dimensional spatial transcriptomics uncovers cell type localizations in the human rheumatoid arthritis synovium
2022-02-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03050-3
PMID:35149753
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研究论文 | 本研究利用三维空间转录组学技术，探索了人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位 | 首次采用空间转录组学技术，对慢性滑膜炎症部位的局部组织相互作用进行研究，结合形态特征和高通量空间解析转录组学，提供更高的统计能力和更深入的疾病严重程度及治疗特定反应的监测 | NA | 研究类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位及其在组织中的相互作用 | 人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型及其定位 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学 | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 3543 | 2024-08-08 |
Deciphering spatial genomic heterogeneity at a single cell resolution in multiple myeloma
2022-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28266-z
PMID:35145077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤患者骨髓和溶骨性病变区域的恶性浆细胞，揭示了空间基因组异质性。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了多发性骨髓瘤中恶性浆细胞在溶骨性病变区域和骨髓中的基因表达差异。 | 研究样本仅来自10名患者，可能不足以全面代表所有多发性骨髓瘤患者的情况。 | 旨在深入理解多发性骨髓瘤导致的骨破坏疾病的机制。 | 研究对象为多发性骨髓瘤患者的恶性浆细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 148,630个浆细胞来自10名患者的24个不同位置 |
| 3544 | 2024-08-08 |
SM-Omics is an automated platform for high-throughput spatial multi-omics
2022-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28445-y
PMID:35145087
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SM-Omics的全自动高通量空间多组学平台，该平台结合空间转录组学和基于抗体的蛋白质检测 | SM-Omics平台使用DNA条形码抗体、免疫荧光或其组合，实现了空间转录组学和空间抗体基多重蛋白质检测的规模化和结合 | NA | 推进空间转录组学在大规模应用中的应用 | 小鼠大脑、脾脏和结直肠癌模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 序列数据 | 最多可处理64个原位空间反应或96个测序准备库 |
| 3545 | 2024-08-08 |
Homeostatic interferon-lambda response to bacterial microbiota stimulates preemptive antiviral defense within discrete pockets of intestinal epithelium
2022-02-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74072
PMID:35137688
|
研究论文 | 研究揭示了细菌微生物群如何通过刺激肠道上皮细胞中的干扰素-λ反应，促进肠道局部区域的抗病毒防御 | 首次发现细菌微生物群在稳态下刺激肠道上皮细胞中的干扰素刺激基因表达，并集中在成熟的上皮细胞中，从而预先激活抗病毒防御 | NA | 探讨细菌微生物群如何通过干扰素-λ反应在肠道上皮细胞中激活抗病毒防御 | 肠道上皮细胞和细菌微生物群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定病原体免费的小鼠和人类样本 |
| 3546 | 2024-08-08 |
UINMF performs mosaic integration of single-cell multi-omic datasets using nonnegative matrix factorization
2022-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28431-4
PMID:35140223
|
研究论文 | 本文提出了一种非负矩阵分解算法UINMF，用于整合包含共享和非共享特征的单细胞多组学数据集 | 引入了一个额外的元基因矩阵，使得非共享特征能够影响分解过程，从而提高了数据整合的准确性 | 先前的计算整合方法要求输入矩阵在基因或细胞数量上共享相同数量，因此只能使用共享特征 | 解决单细胞多组学数据集整合中的挑战，特别是包含共享和非共享特征的数据集 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、SNARE-seq和跨物种数据集 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞多组学数据 | 涉及多种类型的单细胞数据集 |
| 3547 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies an Il1rn+/Trem1+ macrophage subpopulation as a cellular target for mitigating the progression of thoracic aortic aneurysm and dissection
2022-Feb-08, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00362-2
PMID:35132073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了胸主动脉瘤和夹层（TAAD）在小鼠模型中的细胞和分子变化，并识别出Il1rn+/Trem1+巨噬细胞亚群作为治疗TAAD的潜在靶点 | 首次在单细胞分辨率下全面分析TAAD发展过程中的细胞和分子变化，并发现抑制Il1rn/Trem1巨噬细胞亚群可以显著降低TAAD和主动脉破裂的发生率 | NA | 深入理解胸主动脉瘤和夹层（TAAD）发病过程中的调控变化，为医疗治疗开发提供依据 | 胸主动脉瘤和夹层（TAAD）的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的胸主动脉细胞，包括早期到晚期疾病阶段的三个时间点 |
| 3548 | 2024-08-08 |
Cardiac macrophages regulate isoproterenol-induced Takotsubo-like cardiomyopathy
2022-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156236
PMID:35132957
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研究论文 | 本文研究了心脏巨噬细胞在异丙肾上腺素诱导的类似Tako-Tsubo心肌病中的调节作用 | 首次揭示了巨噬细胞在Tako-Tsubo综合征发病机制中的关键作用，并提出了针对巨噬细胞的治疗策略 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床研究来验证这些发现 | 探索Tako-Tsubo综合征的分子基础及其潜在的治疗方法 | 心脏巨噬细胞在Tako-Tsubo心肌病中的功能和作用机制 | 心血管疾病 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠模型进行实验 |
| 3549 | 2024-08-08 |
Elucidating minimal residual disease of paediatric B-cell acute lymphoblastic leukaemia by single-cell analysis
2022-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00814-7
PMID:35145224
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）在诊断、残留和复发阶段的动力学变化 | 结合单细胞RNA测序和B细胞受体测序，揭示了残留疾病中白血病细胞的复杂变化和耐药机制 | NA | 探究儿童B-ALL在化疗后残留疾病的生物学特性和耐药机制 | 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病的残留疾病 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 161,986个单细胞 |
| 3550 | 2024-08-08 |
The threat of programmed DNA damage to neuronal genome integrity and plasticity
2022-02, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-01001-y
PMID:35145299
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研究论文 | 本文探讨了程序性DNA损伤对神经元基因组完整性和可塑性的威胁 | 本文提出了神经元中存在高水平的程序性DNA断裂，这些断裂可能源于神经元发育、分化和维持过程中的生理性DNA代谢过程 | 程序性DNA断裂在正常神经生理和疾病中的作用仍相对未被探索 | 探索神经元中DNA修复的范式，保护基因组免受程序性基因断裂的错误影响 | 神经元基因组的完整性和可塑性 | NA | 神经退行性疾病 | bulk和单细胞测序分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3551 | 2024-08-08 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis-Hope for the Future
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.12.002
PMID:35155850
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3552 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 leverages airway epithelial protective mechanism for viral infection
2022-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.01.29.478335
PMID:35132420
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了SARS-CoV-2在人源化模型中早期感染的动态过程，揭示了病毒如何触发支气管上皮细胞系统的关键机制 | 发现SARS-CoV-2病毒通过优先感染纤毛细胞前体，引发感染的正反馈循环，并可能利用潜在的有益组织修复机制 | NA | 阐明SARS-CoV-2病毒感染支气管上皮细胞的早期动态过程及其机制 | SARS-CoV-2病毒在支气管上皮细胞中的感染机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 3553 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing: Current Applications in Precision Onco-Genomics and Cancer Therapeutics
2022-Jan-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14030657
PMID:35158925
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在精准肿瘤基因组学和癌症治疗中的应用 | 单细胞测序技术能够在基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组水平上评估细胞，为理解肿瘤生物学和优化治疗策略提供了新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在临床研究和治疗中的应用潜力 | 单细胞测序技术在不同分子水平上的应用及其在肿瘤研究和治疗中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
| 3554 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals a Crosstalk between Hyaluronan Receptor LYVE-1-Expressing Macrophages and Vascular Smooth Muscle Cells
2022-01-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11030411
PMID:35159221
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了透明质酸受体LYVE-1表达的巨噬细胞与血管平滑肌细胞之间的相互作用 | 首次发现LYVE-1 res-like巨噬细胞在超胆固醇血症条件下促进血管平滑肌细胞向成骨细胞/软骨细胞样细胞的表型调节 | 研究主要基于小鼠模型和人体动脉粥样硬化斑块样本，可能需要更多临床数据验证 | 探讨动脉粥样硬化中巨噬细胞的作用及其与血管平滑肌细胞的相互作用 | 动脉粥样硬化中的CD45白细胞、LYVE-1表达的res-like巨噬细胞及血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括正常胆固醇饮食和高中胆固醇饮食的apoE缺陷小鼠，以及来自颈动脉疾病患者的动脉粥样硬化斑块样本 |
| 3555 | 2024-08-08 |
Inflammation, Fibrosis and Cancer: Mechanisms, Therapeutic Options and Challenges
2022-Jan-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14030552
PMID:35158821
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综述 | 本文深入分析了不受控制的炎症、纤维化和癌症之间的关系和区别，并强调了开发新型治疗这些疾病疗法的挑战和机遇 | 探讨了药物输送系统、联合治疗以及组织靶向和/或途径选择性策略的整合如何克服当前治疗慢性炎症疾病和癌症的挑战 | NA | 探讨治疗和/或管理慢性炎症疾病和癌症的新疗法 | 不受控制的炎症、纤维化和癌症 | NA | 慢性炎症疾病和癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3556 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Omics Network Model of Cell Crosstalk during the Formation of Primordial Follicles
2022-01-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11030332
PMID:35159142
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研究论文 | 本文开发了一种计算模型，用于描述单个基因如何编程和重构胎儿生殖细胞（FGCs）和体细胞之间的细胞间对话，以及基因调控网络如何介导信号通路，功能性地连接这两种细胞类型。 | 本文首次利用单细胞RNA测序数据，识别了之前未被发现的卵泡发育机制，并揭示了基因在FGC和体细胞网络中的相互作用。 | NA | 研究胎儿生殖细胞在原始卵泡形成过程中的细胞间交互作用的分子机制。 | 胎儿生殖细胞（FGCs）和体细胞的交互作用及其在卵泡发育中的作用。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络模型 | RNA-seq数据 | 人类女性胚胎的单细胞RNA测序数据 |
| 3557 | 2024-08-08 |
Isolation of Murine Myeloid Progenitor Populations by CD34/CD150 Surface Markers
2022-01-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11030350
PMID:35159159
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研究论文 | 本研究通过使用CD34/CD150表面标记物，改进了小鼠骨髓中髓系祖细胞群的分离方法 | 提出使用CD150替代FcγR作为表面标记物，以实现更好的亚群分离 | NA | 改进髓系祖细胞群的分离方法，提高亚群分离的准确性和可重复性 | 小鼠骨髓中的髓系祖细胞 | NA | NA | 流式细胞术(FACS) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 3558 | 2024-08-08 |
Untapped Neuroimaging Tools for Neuro-Oncology: Connectomics and Spatial Transcriptomics
2022-Jan-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14030464
PMID:35158732
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研究论文 | 本文探讨了神经影像学在神经肿瘤学中的应用，特别是通过连接组学和空间转录组学的方法 | 介绍了通过标准化分析将结构脑MRI转化为个体形态差异的平均脑，以及使用功能和结构模板进行连接组学分析和最近可用的空间转录组学模板 | 标准化分析在神经肿瘤学研究中使用不常见，且其广泛的应用潜力尚未充分探索 | 提供一个在肿瘤学中进行标准化分析的框架，并强调其局限性 | 神经影像学在神经肿瘤学中的应用，特别是连接组学和空间转录组学 | 神经影像学 | 神经肿瘤 | 磁共振成像（MRI） | NA | 图像 | 未具体说明样本数量 |
| 3559 | 2024-08-08 |
SCANNER: a web platform for annotation, visualization and sharing of single cell RNA-seq data
2022-01-17, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baab086
PMID:35134150
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研究论文 | 开发了一个名为SCANNER的网络平台，用于单细胞RNA测序数据的注释、可视化和共享 | SCANNER平台无需特殊软件或大量编程技能，易于使用，并配备了实时数据库进行安全的数据管理 | NA | 为科学界提供一个公共网络资源，用于协作方式下的单细胞RNA测序数据共享和分析 | 单细胞RNA测序数据，包括19种癌症、COVID-19以及健康样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 数据库包含19种癌症、COVID-19以及健康样本，如吸烟者和非吸烟者的肺部样本、人脑细胞和外周血单核细胞(PBMC) |
| 3560 | 2024-08-08 |
Integrative Multiomics Evaluation of IIDH1 Metabolic Enzyme as a Candidate Oncogene That is Correlated with Poor Prognosis and Immune Infiltration in Prostate Adenocarcinoma
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/9854788
PMID:35132321
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研究论文 | 本研究探讨了IDH1基因在前列腺腺癌中的表达及其与患者预后和免疫细胞浸润的关系 | 首次在前列腺腺癌中研究IDH1基因的临床相关性及其在免疫反应中的表达 | NA | 评估IDH1作为前列腺腺癌预后生物标志物的潜力 | IDH1基因在前列腺腺癌中的表达及其与患者生存和免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 前列腺腺癌组织与正常组织样本 |