单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3521 - 3540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3521 | 2024-08-08 |
Generation of a recessive dystrophic epidermolysis bullosa mouse model with patient-derived compound heterozygous mutations
2022-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-022-00735-5
PMID:35152273
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研究论文 | 本文通过CRISPR-based基因编辑技术i-GONAD，成功建立了携带患者来源的复合杂合突变的隐性营养不良型大疱性表皮松解症（RDEB）小鼠模型 | 首次成功建立了携带患者特异性复合杂合突变的RDEB小鼠模型，为研究RDEB的发病机制和治疗提供了新的工具 | NA | 建立一个可靠的RDEB小鼠模型，以研究其发病机制并开发治疗方法 | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症（RDEB）及其小鼠模型 | NA | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症 | CRISPR-based基因编辑技术 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序 | 包括c.5818delC和E2857X突变的小鼠 |
| 3522 | 2024-08-08 |
A Multicancer Malignant Pleural Effusion Diagnostic Test Using Hexokinase 2 and Single-Cell Sequencing
2022-05-18, Clinical chemistry
IF:7.1Q1
DOI:10.1093/clinchem/hvac003
PMID:35142335
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研究论文 | 本文报道了一种基于己糖激酶2（HK2）和单细胞测序的新型诊断方法（HK2-seq），用于多癌种恶性胸腔积液（MPE）的诊断 | HK2-seq方法利用HK2作为新的代谢功能相关标记物，通过检测多种癌症类型的胸腔积液中参与增加糖酵解的播散性肿瘤细胞，结合单细胞测序确认高糖酵解肿瘤细胞（hgTCs）的恶性程度，从而建立明确的MPE诊断 | NA | 开发一种新的诊断方法，用于提高多癌种恶性胸腔积液的诊断准确性 | 恶性胸腔积液及其相关肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 111名胸腔积液患者 |
| 3523 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of the prognostic and role in immune cell infiltration of MSR1 expression in lower-grade gliomas
2022-05, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.4603
PMID:35142109
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研究论文 | 本研究旨在验证巨噬细胞清道夫受体1（MSR1）在低级别胶质瘤（LGG）患者中的预后和免疫相关作用 | 首次全面分析了MSR1在低级别胶质瘤中的表达与预后及免疫细胞浸润的关系 | 研究数据来源于公共数据库，实验验证部分有限 | 验证MSR1在低级别胶质瘤患者中的预后价值和免疫相关作用 | 低级别胶质瘤（LGG）患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | 基因集富集分析（GSEA） | NA | 基因表达数据 | 数据来源于公共数据库，具体样本量未详细说明 |
| 3524 | 2024-08-08 |
MAX deficiency impairs human endometrial decidualization through down-regulating OSR2 in women with recurrent spontaneous abortion
2022-May, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-022-03579-z
PMID:35146559
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组化等技术，研究了MAX缺陷如何通过下调OSR2影响人类子宫内膜蜕膜化，进而导致习惯性流产 | 首次揭示了MAX通过直接调控OSR2的表达，影响子宫内膜蜕膜化和细胞增殖，从而导致习惯性流产的分子机制 | NA | 探讨习惯性流产中子宫内膜蜕膜化的分子机制 | 人类子宫内膜间质细胞和蜕膜组织 | NA | 习惯性流产 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化（IHC）、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）、RNA测序、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、切割目标并使用核酸酶释放测序（CUT&RUN-seq） | NA | RNA | 来自习惯性流产女性的蜕膜组织和子宫内膜间质细胞 |
| 3525 | 2024-08-08 |
An MRI radiomics approach to predict survival and tumour-infiltrating macrophages in gliomas
2022-04-29, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awab340
PMID:35136934
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研究论文 | 本研究构建了一个基于术前T2加权MRI的放射组学模型，用于预测胶质瘤患者的生存和肿瘤浸润巨噬细胞 | 开发了一个基于14个放射组学特征的预测模型，显示出高度稳健的预测能力，并关联了免疫反应，特别是肿瘤巨噬细胞浸润 | NA | 构建一个稳定且可验证的术前T2加权MRI放射组学模型，用于预测胶质瘤患者的生存 | 652名胶质瘤患者的术前T2加权MRI图像、RNA-seq和临床数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 放射组学 | 机器学习 | 图像 | 652名胶质瘤患者 |
| 3526 | 2024-08-08 |
Neuron-derived neuropeptide Y fine-tunes the splenic immune responses
2022-04-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.01.010
PMID:35139365
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研究论文 | 本文研究了神经系统和免疫系统之间的相互作用，特别是神经元衍生的神经肽Y（NPY）对脾脏免疫反应的精细调节作用 | 首次揭示了NPY在神经系统和免疫系统交叉对话中的古老语言作用，并探讨了其在调节感染期间的炎症风暴和自身免疫疾病中的潜在应用 | NA | 探讨神经肽Y在神经系统和免疫系统交叉对话中的作用及其在疾病治疗中的潜在应用 | 神经肽Y（NPY）及其在脾脏免疫反应中的作用 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | 涉及大鼠、果蝇模型以及人类自身免疫疾病患者和鼠模型实验 |
| 3527 | 2024-08-08 |
Optimal transport improves cell-cell similarity inference in single-cell omics data
2022-04-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac084
PMID:35157031
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研究论文 | 本文提出使用最优传输（OT）作为单细胞组学数据中细胞间相似性度量的方法 | 引入最优传输作为细胞间相似性度量，并通过熵正则化加速计算，以处理单细胞数据的高维度 | NA | 改进单细胞组学数据中细胞间相似性的推断和细胞聚类 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）和单细胞DNA甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 最优传输（OT） | NA | 单细胞组学数据 | 13个独立数据集，包括模拟数据、scRNA-seq、scATAC-seq和单细胞DNA甲基化数据 |
| 3528 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional analysis of human endothelial colony-forming cells from patients with low VWF levels
2022-04-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021010683
PMID:35143643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自低VWF水平患者的内皮集落形成细胞，以识别VWF水平的新调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别内皮集落形成细胞中VWF水平的新调节因子，并通过siRNA实验进一步验证 | NA | 旨在识别内皮集落形成细胞中VWF水平的新调节因子 | 来自低VWF水平患者和健康对照的内皮集落形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自低VWF水平患者和健康对照的内皮集落形成细胞，以及人脐静脉内皮细胞作为对照 |
| 3529 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals induction of distinct trained-immunity programs in human monocytes
2022-04-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147719
PMID:35133977
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类单核细胞在训练免疫诱导下的不同转录程序 | 首次探索了先天免疫细胞中训练免疫诱导的潜在异质性 | NA | 研究训练免疫在单核细胞中的转录程序及其在免疫介导疾病中的影响 | 人类单核细胞及其在不同诱导剂下的训练免疫反应 | NA | 溃疡性结肠炎、脓毒症、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个患者样本 |
| 3530 | 2024-08-08 |
Fusion prior gene network for high reliable single-cell gene regulatory network inference
2022-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105279
PMID:35134605
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研究论文 | 本文提出了一种名为FGRNAE的框架，用于提高单细胞基因调控网络推断的可靠性 | 利用随机游走重启算法和随机森林算法，结合共功能网络数据，提高了单细胞基因调控网络推断的准确性 | NA | 提高单细胞基因调控网络推断的准确性 | 单细胞基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因网络数据 | NA |
| 3531 | 2024-08-08 |
The atlas of ACE2 expression in fetal and adult human hearts reveals the potential mechanism of heart-injured patients infected with SARS-CoV-2
2022-04-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00169.2021
PMID:35138176
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研究论文 | 本研究深入分析了胎儿和成人心脏中单细胞表达谱，以探索SARS-CoV-2对心脏造成伤害的潜在机制 | 通过单细胞转录组分析，揭示了心脏发育不同阶段中ACE2表达水平的变化，并确认了其在SARS-CoV-2感染风险中的作用 | NA | 探索SARS-CoV-2通过ACE2感染心脏的潜在机制 | 胎儿和成人心脏中的ACE2表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 单细胞转录组数据 | 涉及胎儿和成人心脏样本 |
| 3532 | 2024-08-08 |
Uterine fluid microRNAs are dysregulated in women with recurrent implantation failure
2022-04-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac019
PMID:35147192
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研究论文 | 本研究探讨了反复植入失败（RIF）女性子宫液中microRNAs（miRNAs）的组成与健康生育女性之间的差异，并发现RIF女性的子宫液miRNAs组成与健康女性不同，这些失调的miRNAs与子宫内膜容受性和胚胎植入受损有关。 | 首次全面分析了具有生育能力健康女性和被诊断为RIF女性的接受期子宫液中总miRNAs的分布，为RIF的分子机制提供了新的见解，并可能对未来的生物标志物和临床治疗研究产生影响。 | 这是一项描述性研究，参与研究的人数有限。此外，识别出的差异丰富的miRNAs应在更大的研究队列中进行验证，并且RIF中预测的miRNA靶基因和富集途径需要在体外进一步确认和探索。 | 研究反复植入失败女性子宫液中miRNAs的组成与健康生育女性之间的差异。 | 反复植入失败女性和健康生育女性的子宫液中的miRNAs。 | NA | 生殖健康问题 | small RNA sequencing, quantitative real-time PCR (RT-PCR) | NA | miRNA | 健康生育女性17人，反复植入失败女性34人 |
| 3533 | 2024-08-08 |
Second Heart Field-Derived Cells Contribute to Angiotensin II-Mediated Ascending Aortopathies
2022-03-29, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨了第二心场（SHF）来源的细胞在血管紧张素II（AngII）介导的升主动脉病变中的作用 | 发现SHF来源的细胞通过LRP1和转化生长因子-β信号通路在维持血管完整性中起关键作用，并揭示了PAI1在AngII诱导的升主动脉病变中的重要作用 | NA | 确定SHF来源的细胞是否以及如何参与升主动脉病变 | 升主动脉病变患者和AngII注射小鼠的升主动脉 | 心血管疾病 | NA | 质谱辅助蛋白质组学和单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质和mRNA | 人类升主动脉瘤组织和AngII注射小鼠的升主动脉 |
| 3534 | 2024-08-08 |
Blue light responses in Cancer borealis stomatogastric ganglion neurons
2022-03-28, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.01.064
PMID:35148862
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研究论文 | 研究了蓝光对Cancer borealis螃蟹的口胃神经系统（STG）神经元活动的影响 | 首次发现并研究了STG神经元对蓝光的固有反应，并识别了潜在的介导分子cryptochrome | NA | 探索蓝光如何影响STG神经元的活动及其潜在机制 | Cancer borealis螃蟹的STG神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3535 | 2024-08-08 |
Evidence of islet CADM1-mediated immune cell interactions during human type 1 diabetes
2022-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153136
PMID:35133983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析免疫细胞群，揭示了CADM1介导的细胞间相互作用在人类1型糖尿病中的作用 | 首次揭示了CADM1在1型糖尿病中作为细胞间相互作用的关键分子，可能成为预防该病的新治疗靶点 | NA | 探讨CADM1在1型糖尿病中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 人类1型糖尿病患者的胰腺组织 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括1型糖尿病患者、自身抗体阳性个体及无糖尿病个体 |
| 3536 | 2024-08-08 |
JEBIN: analyzing gene co-expressions across multiple datasets by joint network embedding
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab603
PMID:35134135
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研究论文 | 本文提出了一种名为JEBIN的方法，通过联合嵌入多个二分网络来分析跨多个数据集的基因共表达关系 | JEBIN能够以非线性和全局相似性的方式推断基因共表达关联，并能在线性时间复杂度内整合具有不同分布的数据集 | NA | 旨在通过元分析多源数据有效解决从单一数据集推断稳定基因共表达关联的难题 | 基因共表达模式及其在肝细胞癌（HCC）中的应用 | 生物信息学 | 肝癌 | 联合嵌入 | 二分网络 | 转录组数据 | 涉及多个表达数据集，包括肝细胞癌及其邻近正常组织的数据，以及最新的肝细胞癌单细胞RNA-seq数据 |
| 3537 | 2024-08-08 |
scHFC: a hybrid fuzzy clustering method for single-cell RNA-seq data optimized by natural computation
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab588
PMID:35136924
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研究论文 | 本文提出了一种名为scHFC的混合模糊聚类方法，该方法通过自然计算优化，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | scHFC方法结合了模糊C均值（FCM）和Gath-Geva（GG）算法，并通过模拟退火算法和遗传算法进行优化，提高了聚类准确性和算法稳定性 | NA | 研究单细胞RNA测序数据的聚类方法，以提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模糊聚类 | 基因表达数据 | 17个单细胞RNA测序数据集 |
| 3538 | 2024-08-08 |
Improving bulk RNA-seq classification by transferring gene signature from single cells in acute myeloid leukemia
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac002
PMID:35136933
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研究论文 | 本文提出了一种名为scPAGE的新方法，用于开发单细胞基因对签名（scGPS），以改善急性髓系白血病（AML）中的批量RNA-seq分类 | scPAGE方法通过解决不同测序技术间的差异，成功将单细胞基因签名转移到批量数据中，提高了分类性能 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术提高批量RNA-seq数据的分类准确性 | 急性髓系白血病（AML）的单细胞和批量RNA-seq数据 | 基因组学 | 血液病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 3539 | 2024-08-08 |
Erratum: Monitoring CAR T cell generation with a CD8-targeted lentiviral vector by single-cell transcriptomics
2022-Mar-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2022.01.010
PMID:35141349
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3540 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of human corneal endothelium implicates lncRNA NEAT1 in Fuchs endothelial corneal dystrophy
2022-Mar-08, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2022.01.005
PMID:35141048
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序发现人类角膜内皮细胞的异质性，并揭示长非编码RNA NEAT1在Fuchs内皮角膜营养不良发展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了角膜内皮细胞的四个亚群，并发现NEAT1在Fuchs内皮角膜营养不良中的关键作用 | NA | 探讨Fuchs内皮角膜营养不良的发展机制 | 人类角膜内皮细胞和Fuchs内皮角膜营养不良 | NA | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康人类角膜和UVA诱导的小鼠Fuchs内皮角膜营养不良模型 |