单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3501 - 3520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3501 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Uncovers Osteoblast Factor Growth Differentiation Factor 10 as Mediator of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotypic Modulation Associated with Plaque Rupture in Human Carotid Artery Disease
2022-Feb-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23031796
PMID:35163719
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了生长分化因子10（GDF10）在血管平滑肌细胞（VSMCs）表型转换中的作用，特别是在与颈动脉疾病相关的斑块破裂中的作用。 | 首次揭示了GDF10在VSMCs表型转换中的作用，特别是在颈动脉疾病中的作用。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨GDF10在VSMCs表型转换中的作用及其对颈动脉疾病的影响。 | 血管平滑肌细胞（VSMCs）和生长分化因子10（GDF10）。 | 数字病理学 | 颈动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自Apolipoprotein E-deficient（Apoe）小鼠的CD45细胞，分别来自正常胆固醇饮食（NCD）和高胆固醇饮食（HCD）的动脉粥样硬化主动脉。 |
| 3502 | 2024-08-08 |
Regulatory network-based imputation of dropouts in single-cell RNA sequencing data
2022-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009849
PMID:35176023
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研究论文 | 本文提出了一种基于转录调控网络的单细胞RNA测序数据中丢失值（'dropout imputation'）的计算预测方法 | 该方法利用外部独立的基因表达数据学习的转录调控网络，提高了dropout imputation的性能，并展示了不同基因对不同imputation方法的适应性 | 部分基因的细胞间变异无法通过测试的方法充分imputed，这些情况下基因表达水平最好由所有细胞的平均表达来预测 | 研究如何通过计算方法预测单细胞RNA测序数据中的丢失值 | 单细胞RNA测序数据中的丢失值 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种人类单细胞RNA测序数据集 |
| 3503 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogenic dysregulation of previously unrecognised chondral stem/progenitor cells in children with microtia
2022-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.702
PMID:35184397
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3504 | 2024-08-08 |
Deciphering the Complex Molecular Pathogenesis of Myotonic Dystrophy Type 1 through Omics Studies
2022-Jan-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23031441
PMID:35163365
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研究论文 | 本文通过组学研究揭示了肌强直性营养不良1型（DM1）复杂的分子发病机制 | 采用了单细胞测序和人工智能等创新技术 | NA | 提高对肌强直性营养不良1型（DM1）的理解 | 肌强直性营养不良1型（DM1）的分子发病机制 | NA | 肌肉疾病 | 组学技术 | NA | 基因和微RNA表达、选择性剪接、3'多聚腺苷酸化、CpG甲基化和蛋白质水平等数据 | 使用来自患者和动物模型的组织样本和细胞系 |
| 3505 | 2024-08-08 |
Intersecting single-cell transcriptomics and genome-wide association studies identifies crucial cell populations and candidate genes for atherosclerosis
2022-Jan, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeab043
PMID:35174364
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组学和全基因组关联研究，识别了与动脉粥样硬化相关的重要细胞群和候选基因 | 本文创新性地将遗传数据与单细胞RNA测序数据相结合，以识别特定细胞亚群中的动脉粥样硬化相关候选基因 | 研究主要集中在动脉粥样硬化斑块的细胞类型，可能忽略了其他组织中的相关细胞类型 | 旨在通过结合遗传学和转录组学数据，揭示动脉粥样硬化的生物学机制并识别潜在的药物靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的细胞类型及其相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46个与动脉粥样硬化和心血管疾病、风险因素及其他特征相关的样本 |
| 3506 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic and Epigenetic Analyses of Mouse Mammary Development Starting with the Embryo
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2193-6_3
PMID:35175591
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和ATAC-seq技术研究小鼠乳腺发育的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和ATAC-seq技术详细解析小鼠乳腺发育过程中的关键调控因子和信号传导途径 | NA | 揭示正常乳腺发育过程中的分子事件和信号传导途径 | 小鼠胚胎乳腺的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | RNA, DNA | 小鼠胚胎中的少量细胞 |
| 3507 | 2024-08-08 |
Isolating and cryopreserving pig skin cells for single-cell RNA sequencing study
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263869
PMID:35176067
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研究论文 | 本文报道了一种从猪皮肤组织中分离和冷冻保存单细胞用于单细胞RNA测序的稳健方法 | 首次详细描述了使用单细胞RNA测序技术研究猪皮肤的方法，并展示了该方法的有效性 | NA | 开发一种有效的方法来分离和冷冻保存猪皮肤单细胞，以便进行单细胞RNA测序研究 | 猪皮肤单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞 | 未具体说明数量 |
| 3508 | 2024-08-08 |
A Proximal-to-Distal Survey of Healthy Adult Human Small Intestine and Colon Epithelium by Single-Cell Transcriptomics
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.007
PMID:35176508
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，对健康成人小肠和大肠上皮细胞进行了详细的组织功能分析 | 首次全面覆盖了十二指肠、空肠、回肠以及升结肠、横结肠和降结肠的单细胞转录组学研究，揭示了人与小鼠肠道上皮细胞的重要差异 | 研究样本仅来自3名器官捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 探索健康成人小肠和大肠上皮细胞的组织功能和细胞特性 | 健康成人小肠和大肠的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 12,590个单个上皮细胞来自3名独立处理的器官捐赠者 |
| 3509 | 2024-08-08 |
Contributions of Immune Cells and Stromal Cells to the Pathogenesis of Systemic Sclerosis: Recent Insights
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.826839
PMID:35185577
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综述 | 本文综述了系统性硬化症（SSc）中免疫细胞和间质细胞的作用，重点讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示的新亚型及其在SSc发病机制中的潜在角色 | 利用单细胞RNA测序技术深入研究了SSc中细胞亚群的转录组学和异质性 | NA | 总结当前关于SSc患者中免疫细胞和间质细胞的知识，并探讨其在SSc发病机制中的潜在作用 | 系统性硬化症（SSc）中的免疫细胞和间质细胞 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 3510 | 2024-08-08 |
Calcium Signaling Is Impaired in PTEN-Deficient T Cell Acute Lymphoblastic Leukemia
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.797244
PMID:35185889
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研究论文 | 研究探讨了PTEN缺失的T细胞急性淋巴母细胞白血病中钙信号传导的功能性相互作用 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学分析，揭示了PTEN缺失的胸腺细胞中钙信号通路活性的降低，并构建了数学模型来解释这一现象 | 研究仅限于PTEN缺失的胸腺细胞，未探讨其他可能影响钙信号传导的因素 | 研究PTEN缺失对T细胞急性淋巴母细胞白血病中钙信号传导的影响 | PTEN缺失和PTEN充足的胸腺细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | RNA | PTEN缺失和PTEN充足的胸腺细胞样本 |
| 3511 | 2024-08-08 |
S100A12 as Biomarker of Disease Severity and Prognosis in Patients With Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.810338
PMID:35185901
|
研究论文 | 本研究探讨了S100A12作为特发性肺纤维化（IPF）患者疾病严重程度和预后标志物的潜在作用 | 首次在肺组织和支气管肺泡灌洗液中研究S100A12的表达与IPF的相关性，并使用单细胞RNA测序分析其作用 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚 | 探究S100A12在IPF中的表达及其作为疾病严重程度和预后标志物的有效性 | 特发性肺纤维化患者 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3512 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Facilitates Elucidation of HIV Immunopathogenesis: A Review of Current Literature
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.828860
PMID:35185920
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示HIV免疫发病机制中的应用及其在HIV研究中的最新发现 | 单细胞测序技术被认为是探索HIV免疫发病机制的有用工具，能够揭示细胞形成和分化的关键过程、重要的造血途径以及预测免疫功能的调控基因网络 | NA | 旨在阐明HIV相关疾病的精确免疫发病机制，并识别可能的预防和治疗靶点 | HIV感染及其免疫发病机制 | NA | HIV | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 3513 | 2024-08-08 |
CCR2+ Macrophages Promote Orthodontic Tooth Movement and Alveolar Bone Remodeling
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.835986
PMID:35185928
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术研究了正畸牙齿移动和牙槽骨重塑过程中巨噬细胞的转录组异质性 | 首次揭示了机械力诱导的巨噬细胞功能转变及其在牙槽骨重塑中的关键作用 | NA | 探讨巨噬细胞在正畸牙齿移动和牙槽骨重塑中的作用及其分子机制 | 巨噬细胞及其在牙槽骨重塑中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未明确提及 |
| 3514 | 2024-08-08 |
DecOT: Bulk Deconvolution With Optimal Transport Loss Using a Single-Cell Reference
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.825896
PMID:35186040
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为DecOT的批量去卷积方法，使用Wasserstein距离作为损失函数，并利用单细胞RNA测序数据作为参考，从批量组织RNA测序数据中表征细胞类型组成 | DecOT方法能够利用基因空间的额外信息，并通过集成框架整合来自多个个体参考的去卷积结果，以减轻个体/批次效应 | NA | 开发一种成本效益高的计算去卷积方法，以表征批量组织的细胞类型组成 | 批量组织RNA测序数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四个不同的单细胞数据集和真实的胰腺胰岛批量样本 |
| 3515 | 2024-08-08 |
Identification of Synovial Fibroblast-Associated Neuropeptide Genes and m6A Factors in Rheumatoid Arthritis Using Single-Cell Analysis and Machine Learning
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/5114697
PMID:35186167
|
研究论文 | 本研究利用单细胞分析和机器学习技术，探讨了神经肽和m6A在类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞的致病过程中的作用 | 首次通过单细胞分析和机器学习技术，识别了与滑膜成纤维细胞相关的神经肽基因和m6A因子，揭示了它们在类风湿性关节炎中的重要调控功能 | NA | 探究神经肽和N6-甲基腺苷（m6A）在滑膜成纤维细胞致病过程中的作用 | 滑膜成纤维细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3516 | 2024-08-08 |
The Neuronal Transcription Factor Creb3l1 Potential Upregulates Ntrk2 in the Hypertensive Microenvironment to Promote Vascular Smooth Muscle Cell-Neuron Interaction and Prevent Neurons from Ferroptosis: A Bioinformatic Research of scRNA-seq Data
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/8339759
PMID:35186168
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了高血压微环境中神经元转录因子Creb3l1上调Ntrk2以促进血管平滑肌细胞与神经元相互作用并防止神经元发生铁死亡的机制。 | 首次揭示了高血压微环境中Creb3l1通过上调Ntrk2促进血管平滑肌细胞与神经元相互作用，从而可能防止神经元铁死亡的新机制。 | 研究仅基于小鼠动脉细胞的单细胞RNA测序数据，未来需在更多物种和细胞类型中验证这些发现。 | 探讨高血压与铁死亡之间的关联，并研究神经肽表达变化在高血压微环境中导致铁死亡的机制。 | 高血压微环境中血管平滑肌细胞与神经元的相互作用及其对神经元铁死亡的影响。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 分析了来自SHR组和WKY组的24387个小鼠动脉细胞 |
| 3517 | 2024-08-08 |
Dissecting the mechanism of cytokine release induced by T-cell engagers highlights the contribution of neutrophils
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2039432
PMID:35186442
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞结合剂诱导细胞因子释放的生物机制，并强调了中性粒细胞的贡献 | 首次证明了中性粒细胞在T细胞结合剂介导的细胞因子释放中的作用，并通过单细胞RNA测序进行了验证 | NA | 研究T细胞结合剂治疗癌症时诱导的细胞因子释放综合征的机制，并探索预防措施 | T细胞结合剂、细胞因子释放综合征、中性粒细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了四种不同的T细胞双特异性抗体进行实验 |
| 3518 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA Sequencing Reveals Critical Functions of Mkx in Periodontal Ligament Homeostasis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.795441
PMID:35186919
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了转录因子Mkx在牙周韧带稳态中的关键作用 | 首次揭示了Mkx在牙周韧带细胞群中的精确和关键功能 | NA | 旨在阐明Mkx缺乏对牙周韧带细胞异质性和基因表达差异的影响 | 牙周韧带细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Mkx敲除大鼠的牙周韧带组织 |
| 3519 | 2024-08-08 |
Deciphering Cell-Cell Communication in Abdominal Aortic Aneurysm From Single-Cell RNA Transcriptomic Data
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.831789
PMID:35187133
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据，揭示了腹主动脉瘤中的细胞间通信网络 | 首次基于单细胞转录组学分析了腹主动脉瘤中的细胞间通信网络，并预测了共同改变的信号通路 | NA | 揭示腹主动脉瘤中的细胞间通信机制 | 腹主动脉瘤中的细胞间通信 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的多个实验模型 |
| 3520 | 2024-08-08 |
Highly Regional Genes: graph-based gene selection for single-cell RNA-seq data
2022-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.01.004
PMID:35144027
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研究论文 | 提出了一种名为HRG的新特征选择方法，用于在单细胞RNA-seq数据中选择显示区域表达模式的基因 | HRG方法通过模仿人类在细胞二维可视化中的标记选择，能够找到具有区域表达模式的基因，提高了准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种新的基因选择方法，以提高单细胞RNA-seq数据分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |