单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3421 - 3440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3421 | 2024-08-08 |
Discovery and Application of Postnatal Nucleus Pulposus Progenitors Essential for Intervertebral Disc Homeostasis and Degeneration
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202104888
PMID:35195356
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，鉴定了在小鼠和人类样本中表达urotensin II受体（UTS2R）的产后髓核前体细胞（ProNPs），并探讨了其在椎间盘稳态和退变中的作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了产后髓核前体细胞的存在及其在椎间盘退变中的作用，并提出了潜在的诊断和治疗靶点。 | NA | 探讨产后髓核前体细胞在椎间盘稳态和退变中的作用及其潜在的诊断和治疗价值。 | 小鼠和人类的产后髓核前体细胞及其在椎间盘退变中的作用。 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和人类样本 |
| 3422 | 2024-08-08 |
Neuropilin-1-Mediated SARS-CoV-2 Infection in Bone Marrow-Derived Macrophages Inhibits Osteoclast Differentiation
2022-05, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202200007
PMID:35195371
|
research paper | 研究SARS-CoV-2通过神经纤毛蛋白-1（NRP1）感染骨髓来源的巨噬细胞（BMMs）并抑制破骨细胞分化的情况 | 首次发现NRP1而非ACE2是SARS-CoV-2进入BMMs的关键受体，并揭示了SARS-CoV-2感染抑制BMMs向破骨细胞分化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类情况存在差异 | 探讨SARS-CoV-2在骨髓来源巨噬细胞中的感染机制及其对破骨细胞分化的影响 | SARS-CoV-2感染的骨髓来源巨噬细胞及其对破骨细胞分化的影响 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 使用野生型和beta株（B.1.351）病毒感染的小鼠模型 |
| 3423 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics in human skin research: available technologies, technical considerations and disease applications
2022-05, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14547
PMID:35196402
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序技术在人类皮肤研究中的可用技术、技术考虑因素及其在皮肤病学中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够以前所未有的分辨率解析人类疾病病理生理学，通过评估细胞间的变异，有助于识别稀有细胞群体并阐明细胞异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在皮肤病学中的应用 | 人类皮肤生物学及皮肤病 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3424 | 2024-08-08 |
Identification of new marker genes from plant single-cell RNA-seq data using interpretable machine learning methods
2022-05, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.18053
PMID:35211979
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为single-cell predictive marker (SPmarker)的机器学习流程，用于从拟南芥根部单细胞RNA测序数据中识别新型细胞类型标记基因 | 该方法采用可解释的机器学习模型来选择标记基因，与传统方法不同，能够识别出数百个之前未被发现的新标记基因，并在水稻单细胞集群中识别出更多的直系同源基因 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中识别新型细胞类型标记基因 | 拟南芥根部的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 可解释的机器学习模型 | RNA测序数据 | 涉及多个非拟南芥物种的根毛细胞 |
| 3425 | 2024-08-08 |
Ulcerative colitis is characterized by a plasmablast-skewed humoral response associated with disease activity
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01680-y
PMID:35190725
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、单细胞IgH基因测序和蛋白质水平验证，全面定义了溃疡性结肠炎（UC）相关肠道炎症期间B细胞的组成、转录和克隆型景观 | 发现了黏膜B细胞区室的主要扰动，包括幼稚B细胞和IgG浆细胞的扩张，以及从UC肠道炎症中分离出的自身反应性浆细胞克隆 | NA | 全面定义溃疡性结肠炎相关肠道炎症期间B细胞的景观 | 溃疡性结肠炎患者的B细胞 | NA | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 主要队列145例，验证队列1为664例，验证队列2为143例 |
| 3426 | 2024-08-08 |
PathogenTrack and Yeskit: tools for identifying intracellular pathogens from single-cell RNA-sequencing datasets as illustrated by application to COVID-19
2022-Apr, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-021-0915-9
PMID:35192147
|
研究论文 | 本文介绍了PathogenTrack和Yeskit两种工具，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞内病原体，并以COVID-19为例进行了应用展示 | PathogenTrack是首个能够在单细胞水平上识别细菌的工具，并且与现有的先进工具如Viral-Track相比具有竞争力 | NA | 开发和验证用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞内病原体的计算工具 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的SARS-CoV-2病毒和副溶血性嗜血杆菌 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个真实和模拟的单细胞RNA测序数据集 |
| 3427 | 2024-08-08 |
Clinically relevant orthotopic xenograft models of patient-derived glioblastoma in zebrafish
2022-04-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049109
PMID:35199829
|
研究论文 | 研究建立了斑马鱼来源的胶质母细胞瘤异种移植模型，用于预测个体胶质母细胞瘤细胞的颅内浸润倾向和药物反应 | 开发了一种新的斑马鱼异种移植模型（zPDOX），能够在20天内预测胶质母细胞瘤患者的长期结果，并评估颅内浸润倾向和个体药物敏感性 | NA | 旨在克服现有小鼠模型在技术上的限制，如从小组织样本中生成足够样本数量的困难和结果的长潜伏期 | 胶质母细胞瘤细胞的颅内浸润倾向和药物反应 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 异种移植模型 | 单细胞RNA序列数据 | 多样本来源的斑马鱼胶质母细胞瘤异种移植模型 |
| 3428 | 2024-08-08 |
Identification of novel regulators required for early development of vein pattern in the cotyledons by single-cell RNA-sequencing
2022-04, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15719
PMID:35218590
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了3天龄子叶中的14117个单细胞，以揭示子叶子叶脉早期发育的调控机制 | 发现了多个新的标记基因和子叶子叶脉的发育特征，并揭示了CYCLING DOF FACTOR 5 (CDF5)和REPRESSOR OF GA (RGA)在子叶子叶脉早期发育和功能中的潜在作用 | 子叶子叶脉早期发育的机制仍不完全清楚 | 全面表征3天龄子叶子叶脉的早期分化和发育 | 子叶子叶脉的细胞类型和新型标记基因 | 植物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14117个单细胞 |
| 3429 | 2024-08-08 |
Intratumoral plasma cells predict outcomes to PD-L1 blockade in non-small cell lung cancer
2022-03-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.02.002
PMID:35216676
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞RNA测序数据，探讨了B细胞和浆细胞在非小细胞肺癌患者接受PD-L1抑制剂治疗中的作用 | 发现B细胞和浆细胞的基因特征与PD-L1抑制剂治疗后的总生存期延长相关，且与CD8 T细胞信号独立 | NA | 研究B细胞和浆细胞在非小细胞肺癌患者接受PD-L1抑制剂治疗中的预测作用 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和治疗反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 891个非小细胞肺癌肿瘤样本 |
| 3430 | 2024-08-08 |
A global timing mechanism regulates cell-type-specific wiring programmes
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04418-5
PMID:35197627
|
研究论文 | 本文描述了通过类固醇激素（蜕皮激素）诱导的转录因子级联反应，在果蝇视觉系统神经元中调控细胞类型特异性连接程序的全球计时机制。 | 首次揭示了蜕皮激素途径如何通过单细胞测序调控共有的及细胞类型特异性目标基因表达，这些基因涉及突触成熟和细胞表面蛋白，从而影响神经连接的特异性。 | NA | 探讨神经回路组装中精确时空表达的细胞识别分子调控机制，特别是时间因素的确定。 | 果蝇视觉系统神经元中的蜕皮激素途径及其对神经连接特异性的调控。 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | 转录因子级联反应 | 基因表达数据 | 涉及果蝇视觉系统神经元 |
| 3431 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis uncovers the molecular and cellular characteristics of thin endometrium
2022-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101579R
PMID:35201635
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了薄型子宫内膜的分子和细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序构建了薄型子宫内膜的转录组图谱，并识别了七种细胞类型，揭示了薄型子宫内膜中细胞类型比例和差异表达基因的富集通路 | 研究样本仅来自一名薄型子宫内膜患者和一名对照志愿者，可能存在样本量不足的问题 | 揭示薄型子宫内膜影响子宫内膜容受性的可能机制 | 薄型子宫内膜患者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 18775个单个细胞 |
| 3432 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the new existence form of dermal papilla cells in the hair follicle regeneration of cashmere goats
2022-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110316
PMID:35202721
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了山羊毛囊再生过程中真皮乳头细胞的新存在形式及其在毛发生长和维护中的关键作用 | 首次通过单细胞测序技术揭示了山羊毛囊再生过程中真皮乳头细胞的四种中间细胞状态及其在毛发生长和维护中的具体功能 | NA | 探索人类脱发问题中真皮乳头干细胞分化的深层机制 | 山羊的毛囊再生过程及真皮乳头细胞的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3433 | 2024-08-08 |
Clonal relations in the mouse brain revealed by single-cell and spatial transcriptomics
2022-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01011-x
PMID:35210624
|
研究论文 | 本文通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑中早期前体细胞的克隆关系及其细胞表型 | 首次在体内使用条形码技术同时分析小鼠大脑中细胞表型和克隆关系，结合空间转录组学揭示了克隆相关细胞的迁移模式 | NA | 探究小鼠大脑中成熟细胞类型与前体细胞之间的谱系关系 | 小鼠大脑中的神经前体细胞及其克隆关系 | NA | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 数千个克隆 |
| 3434 | 2024-08-08 |
Organoids from human tooth showing epithelial stemness phenotype and differentiation potential
2022-Feb-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04183-8
PMID:35217915
|
研究论文 | 本文首次从人类牙齿中开发出一种上皮类器官模型，展示了牙齿上皮干细胞特性及分化潜力 | 开发了首个从人类牙齿中提取的上皮类器官模型，揭示了与小鼠相似的新型干细胞特征，并展示了与牙髓干细胞的相互作用 | NA | 探索人类牙齿上皮干细胞的生物学特性和功能及其与牙髓的相互作用 | 人类牙齿上皮干细胞及其生物学特性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | 类器官模型 | 细胞 | 从未萌出的智齿中分离的牙囊组织 |
| 3435 | 2024-08-08 |
Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer
2022-02-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm1831
PMID:35196078
|
研究论文 | 本文通过纵向单细胞RNA测序分析，揭示了转移性卵巢癌中化疗诱导的压力促进的化学抗性 | 开发了一种新的分析方法PRIMUS，用于去除患者特异性信号，并发现了化疗期间压力相关细胞状态的持续增加 | NA | 旨在表征高级别浆液性卵巢癌中的化疗抗性过程 | 化疗前后采集的组织样本及其单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 化疗前后采集的多个组织样本 |
| 3436 | 2024-08-08 |
Signature-scoring methods developed for bulk samples are not adequate for cancer single-cell RNA sequencing data
2022-02-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.71994
PMID:35212622
|
研究论文 | 本文通过比较五种基因表达签名评分方法在单细胞RNA测序数据中的表现，发现基于批量样本的方法在单细胞数据分析中存在偏差 | 本文开发了一种新的方法JASMINE，并展示了单细胞数据分析中应谨慎使用基于批量样本的方法 | 本文仅以癌症为例，未涵盖所有类型的单细胞RNA测序数据 | 评估和比较不同基因表达签名评分方法在单细胞RNA测序数据中的适用性 | 五种基因表达签名评分方法在单细胞RNA测序数据中的表现 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3437 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of skin immune cells reveals an Angptl4-ifi20b axis that regulates monocyte differentiation during wound healing
2022-02-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04638-7
PMID:35210411
|
研究论文 | 本文通过流式细胞术和单细胞RNA测序研究了Angptl4在伤口愈合中对免疫细胞的影响，揭示了Angptl4-ifi20b轴调控单核细胞分化的机制 | 发现了Angptl4通过调节ifi202b表达来调控单核细胞向巨噬细胞的分化，进而影响伤口愈合过程中的炎症反应 | NA | 探究Angptl4在伤口愈合中对免疫细胞响应的具体作用 | 皮肤免疫细胞在伤口愈合过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | Angptl4和Angptl4小鼠的切除伤口样本 |
| 3438 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of human subventricular zone progenitors identifies SFRP1 as a target to re-activate progenitors
2022-02-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28626-9
PMID:35210419
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，从老年人的侧脑室下区分离出CD271前体细胞，揭示了这些前体细胞的身份为晚期少突胶质细胞前体细胞，并发现Wnt通路拮抗剂SFRP1可能是促进这些前体细胞静止状态的信号。 | 本研究首次识别出老年人的侧脑室下区前体细胞为晚期少突胶质细胞前体细胞，并发现SFRP1可能是维持这些前体细胞静止状态的关键因素。 | NA | 探索成人侧脑室下区前体细胞的静止状态机制及潜在的激活靶点。 | 老年人的侧脑室下区前体细胞。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3439 | 2024-08-08 |
Hydrop enables droplet-based single-cell ATAC-seq and single-cell RNA-seq using dissolvable hydrogel beads
2022-02-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73971
PMID:35195064
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为HyDrop的灵活且开源的液滴微流控平台，该平台能够进行基于液滴的单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq，使用可溶解的水凝胶珠 | HyDrop平台通过使用可溶解的水凝胶珠，显著提高了基于液滴的单细胞测序技术的通量和灵敏度，并且成本较低 | NA | 开发一种新的微流控平台，以提高单细胞测序技术的规模、降低成本，并为更专业的多组学检测铺平道路 | 单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq技术 | 生物技术 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 在小鼠大脑皮质样本中，使用HyDrop-ATAC生成了7996个高质量的单细胞染色质可及性数据，使用HyDrop-RNA生成了9508个单细胞转录组数据 |
| 3440 | 2024-08-08 |
Survival Genie, a web platform for survival analysis across pediatric and adult cancers
2022-02-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-06841-0
PMID:35197510
|
研究论文 | 开发了一个名为Survival Genie的网络工具，用于在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和其他分子输入上进行生存分析 | Survival Genie是首个能够基于通路、基因集和基因比率进行分析，并评估细胞类型富集与癌症生存之间关联的生物信息学在线工具 | NA | 开发一个全面的工具，用于关联基因集、通路、细胞富集和单细胞特征与临床结果，以辅助开发下一代预后和治疗生物标志物 | 单细胞RNA测序数据和其他分子输入，包括基因集、基因比率、肿瘤浸润免疫细胞比例、基因表达谱分数和肿瘤突变负担 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含来自11个不同癌症项目的27种不同恶性肿瘤的53个数据集 |