单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 4052 篇文献,本页显示第 3401 - 3420 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
3401 2024-08-08
Corrigendum to 'single-cell transcriptomics of blood reveals a natural killer cell subset depletion in tuberculosis' [EBioMedicine 53 (2020) 102686]
2022-Mar, EBioMedicine IF:9.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3402 2024-08-08
Identification of a discrete subpopulation of spinal cord ependymal cells with neural stem cell properties
2022-03-01, Cell reports IF:7.5Q1
research paper 本文报道了脊髓室管膜细胞中存在一个具有神经干细胞特性的离散亚群,即室管膜A细胞(EpA细胞),并探讨了其在脊髓损伤后的自我更新和分化能力。 首次发现并鉴定了脊髓室管膜细胞中的一个功能异质性亚群EpA细胞,这些细胞在脊髓损伤后能转变为干细胞状态。 NA 研究脊髓室管膜细胞的异质性及其在脊髓损伤后的干细胞特性。 脊髓室管膜细胞及其亚群EpA细胞。 NA NA 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 8%的室管膜细胞和0.1%的脊髓节段中所有细胞
3403 2024-08-08
Bacteriocyte development is sexually differentiated in Bemesia tabaci
2022-03-01, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 研究揭示了白蝇Bemisia tabaci中细菌细胞发育的性别差异,发现母系遗传的细菌细胞在成年雌性中增殖而在成年雄性中退化 首次揭示了昆虫性别通过细胞和分子重塑影响细菌细胞发育的机制 NA 探究细菌细胞在白蝇中的性别特异性发育机制 白蝇Bemisia tabaci中的细菌细胞发育 NA NA 单细胞转录组学和免疫组织化学 NA 转录组数据 NA
3404 2024-08-08
Chromosome-scale and haplotype-resolved genome assembly of a tetraploid potato cultivar
2022-03, Nature genetics IF:31.7Q1
research paper 本文报道了基于高质量长读长序列、717个花粉单细胞测序和Hi-C数据,对四倍体马铃薯品种'Otava'的3.1 Gb染色体级别和单体型解析基因组组装 首次成功重建了四倍体马铃薯的四条单体型基因组,揭示了近期近交导致的基因组中约50%的同源相同区域,以及约20%的基因组结构重排 NA 解析四倍体马铃薯的基因组结构和功能组织,为基因组辅助育种提供支持 四倍体马铃薯品种'Otava'的基因组 基因组学 NA 高质量长读长序列、单细胞测序、Hi-C NA 基因组数据 717个花粉单细胞
3405 2024-08-08
Transcriptional kinetics and molecular functions of long noncoding RNAs
2022-03, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文通过等位基因敏感的单细胞RNA测序技术,研究了长非编码RNA(lncRNA)的转录动力学及其分子功能 首次展示了lncRNA相比mRNA具有更长的转录爆发间隔,并观察到由于较低频率的爆发导致lncRNA表达的细胞间变异性增加 NA 探索lncRNA的转录动力学及其在细胞周期进展和凋亡中的细胞状态特异性功能 长非编码RNA(lncRNA)及其转录动力学和分子功能 基因表达调控 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 异步生长的细胞
3406 2024-08-08
The SpliZ generalizes 'percent spliced in' to reveal regulated splicing at single-cell resolution
2022-03, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为splicing Z score(SpliZ)的无注释统计方法,用于检测单细胞RNA测序中的调控剪接 SpliZ方法能够揭示单细胞分辨率下的调控剪接,为单细胞水平上的剪接调控研究提供了新的工具 NA 开发一种新的统计方法来检测单细胞水平上的调控剪接 人类肺细胞 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 统计方法 RNA测序数据 数百个具有细胞类型特异性剪接模式的基因
3407 2024-08-08
Rod genesis driven by mafba in an nrl knockout zebrafish model with altered photoreceptor composition and progressive retinal degeneration
2022-03, PLoS genetics IF:4.0Q1
research paper 本研究通过CRISPR-Cas9技术生成了nrl敲除斑马鱼模型,观察到杆状细胞数量减少和绿色锥状细胞过度生长的表型,并发现mafba基因在nrl非依赖的杆状细胞发育中的新作用。 首次揭示了mafba基因在斑马鱼杆状细胞发育中的新功能,并提出了关于杆状和绿色锥状光感受器发育和调控机制的工作模型。 NA 探究nrl基因在斑马鱼光感受器发育和维持中的确切作用。 斑马鱼的视网膜光感受器发育和退化。 digital pathology NA CRISPR-Cas9, bulk and single-cell RNA sequencing NA RNA sequencing data 野生型和nrl敲除斑马鱼的视网膜细胞
3408 2024-08-08
Single-cell transcriptomic profiling unravels the adenoma-initiation role of protein tyrosine kinases during colorectal tumorigenesis
2022-02-28, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了54,788个来自匹配组织样本的细胞,揭示了蛋白酪氨酸激酶在结直肠肿瘤发生中的腺瘤起始作用。 首次在单细胞水平上定义了正常、良性及恶性阶段的上皮细胞分子特征,并验证了蛋白酪氨酸激酶BMX和HCK在腺瘤起始中的潜在作用。 NA 研究结直肠肿瘤发生过程中的腺瘤起始机制。 结直肠肿瘤发生过程中的细胞类型、转录特征及差异表达基因。 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 54,788个细胞样本,包括血液、正常组织、癌旁组织、息肉及结直肠癌组织
3409 2024-08-08
[Quantifying the state of cell differentiation based on the gene networks entropy]
2022-Feb-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
研究论文 本文提出了一种名为基因交互网络熵(GINE)的方法,用于量化细胞分化状态,以研究细胞动力学 GINE方法通过构建基于基因关联的细胞特异性网络并定义GINE,将不稳定的基因表达数据转换为相对稳定的GINE,避免了额外复杂性和不确定性,并一定程度上规避了掉落事件的影响 NA 探索单细胞无序化水平的动态信息,从而研究生物系统过程的动力学 头颈鳞状细胞癌和慢性髓性白血病的单细胞RNA测序数据 生物信息学 癌症 RNA测序 基因交互网络熵(GINE) 基因表达数据 两个单细胞RNA测序数据集
3410 2024-08-08
Unbiased visualization of single-cell genomic data with SCUBI
2022-01-24, Cell reports methods IF:4.3Q2
research paper 本文介绍了一种名为SCUBI的无偏见方法,用于可视化单细胞基因组数据的低维表示 SCUBI通过在非重叠方块内可视化细胞的聚合信息来解决第一个偏差,并通过可视化样本间细胞比例的差异来解决第二个偏差 NA 开发一种无偏见的方法来可视化单细胞基因组数据的低维表示 单细胞基因组数据的低维表示可视化 digital pathology NA RNA-seq NA image NA
3411 2024-08-08
Single-cell Transcriptomic Architecture Unraveling the Complexity of Tumor Heterogeneity in Distal Cholangiocarcinoma
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了远端胆管癌的细胞异质性和肿瘤微环境 首次通过单细胞转录组学揭示了远端胆管癌的细胞多样性和肿瘤微环境组成 NA 探索远端胆管癌的细胞多样性和肿瘤微环境,以揭示其进展机制 远端胆管癌及其邻近正常胆管样本 数字病理学 胆管癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 共测序了来自人类远端胆管癌及其邻近组织的49,717个单细胞
3412 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Characterizes the Molecular Heterogeneity of the Larval Zebrafish Optic Tectum
2022, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析了斑马鱼幼体视顶盖(OT)的转录组特征,识别了25种潜在的OT细胞群体 首次应用scRNA-seq技术深入探索斑马鱼幼体视顶盖的细胞异质性 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示斑马鱼幼体视顶盖的分子异质性 斑马鱼幼体视顶盖的细胞类型及其功能 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 13,320个细胞
3413 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Intra-Graft Population Heterogeneity in Acute Heart Allograft Rejection in Mouse
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠心脏移植模型中与急性排斥反应相关的移植物浸润细胞的细胞类型和状态 首次详细描述了移植物内细胞异质性,并鉴定了特定巨噬细胞和内皮细胞群体在排斥反应中的作用,以及提供了一个潜在的临床排斥反应预测生物标志物 NA 研究心脏移植排斥反应中移植物内细胞的异质性 小鼠心脏移植模型中的移植物浸润细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 21种不同的细胞群体
3414 2024-08-08
Investigating the Intercellular Communication Network of Immune Cell in Acute Respiratory Distress Syndrome with Sepsis
2022, Computational and mathematical methods in medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据构建了急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中免疫细胞的细胞间通信网络,并分析了其在脓毒症诱导的ARDS中的作用 本研究首次揭示了脓毒症诱导的ARDS中与趋化因子-趋化因子受体相关的独特细胞间信号,并探讨了其在巨噬细胞M1/M2极化中的关键作用 本研究仅基于有限的样本(三名脓毒症诱导的ARDS患者和四名仅脓毒症患者)进行分析,可能需要更多样本以验证结果的普遍性 阐明ARDS中免疫系统的复杂动态反应过程,并识别关键的细胞间通信和转录因子 急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中的免疫细胞及其细胞间通信网络 数字病理学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 三名脓毒症诱导的ARDS患者和四名仅脓毒症患者
3415 2024-08-08
Single-Cell Sequencing Technologies in Precision Oncology
2022, Advances in experimental medicine and biology
综述 本文综述了单细胞测序技术在精准肿瘤学中的应用现状和未来潜力 单细胞测序技术能够解析肿瘤内异质性和亚克隆细胞群体,实现靶向药物再利用,并进行多组学数据整合及单细胞分辨率的细胞信号评估 NA 探讨单细胞测序技术在精准肿瘤学中的应用 单细胞DNA和RNA测序技术及其数据分析工具 数字病理学 肿瘤学 单细胞测序 NA DNA和RNA数据 NA
3416 2024-08-08
Laser Capture Microdissection-Based mRNA Expression Microarrays and Single-Cell RNA Sequencing in Atherosclerosis Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了一种结合激光捕获显微切割(LCM)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的方法,以克服各自在动脉粥样硬化研究中的局限性 提出了一种结合LCM和scRNA-seq技术的方法,以充分利用两者的优势并避免各自的缺陷 scRNA-seq技术存在每个细胞转录本数量低和完全失去空间信息的局限性 旨在通过大规模基因表达分析方法,获取单个细胞在组织解剖结构中的转录特征信息 动脉粥样硬化斑块中的单细胞转录组 数字病理学 心血管疾病 激光捕获显微切割(LCM),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 每个阵列/少量RNA覆盖10-16,000个基因
3417 2024-08-08
Combined Single-Cell RNA and Single-Cell α/β T Cell Receptor Sequencing of the Arterial Wall in Atherosclerosis
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞α/β T细胞受体测序(scTCR-seq),研究了动脉粥样硬化中的T细胞免疫反应 首次在单细胞水平上同时分析了T细胞的转录组和TCR,为理解动脉粥样硬化中的T细胞免疫提供了新的视角 NA 探讨T细胞免疫在动脉粥样硬化进展中的作用,以及是否可以通过T细胞依赖的治疗策略来干预这一过程 动脉粥样硬化中的T细胞亚群及其免疫反应 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞α/β T细胞受体测序(scTCR-seq) NA RNA,TCR 涉及动脉粥样硬化中的三个重要组织的单细胞样本
3418 2024-08-08
Single-Cell Antibody Sequencing in Atherosclerosis Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了通过单细胞抗体测序(scAb-Seq)补充单细胞RNA测序(scRNA-seq)获得的转录组信息,特别是在免疫细胞中,这种方法的重要性在于mRNA与细胞表面表达之间的相关性很弱。 scAb-Seq技术利用商业化的抗体和抗体混合物,能够检测到多达200种抗体,通过三部分DNA序列同时检测抗体特异性DNA序列和cDNA的延伸。 NA 探讨单细胞抗体测序在动脉粥样硬化研究中的应用。 研究对象包括组织或血液细胞的表面蛋白表达。 数字病理学 心血管疾病 单细胞抗体测序(scAb-Seq) NA 序列数据 涉及多达200种抗体
3419 2024-08-08
Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1
2022-Jan, Gland surgery IF:1.5Q3
研究论文 本研究探讨了赖氨酰氧化酶(LOX)通过骨形态发生蛋白1(BMP1)促进间变性甲状腺癌(ATC)细胞增殖和转移的机制 本研究首次揭示了LOX和BMP1在ATC恶性进展中的作用,为ATC的治疗提供了新的潜在靶点 NA 研究LOX和BMP1在间变性甲状腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 间变性甲状腺癌细胞及其增殖和转移机制 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 微阵列分析 NA RNA序列数据 ATC组织和细胞系的数据
3420 2024-08-08
Identification of Rat Testicular Leydig Precursor Cells by Single-Cell-RNA-Sequence Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,识别了大鼠睾丸间质前体细胞,并探讨了其在成年睾丸中的特性与调控机制 研究揭示了间质细胞在成年睾丸中的再生机制,并提出了关于干细胞身份、增殖、分化及调控的新理论 NA 探讨大鼠睾丸间质干细胞在成年睾丸中的识别、特性及其调控机制 大鼠睾丸间质干细胞及其前体细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及多个间质细胞群
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