单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3381 - 3400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3381 | 2024-08-08 |
Single cell study of cellular diversity and mutual communication in chronic heart failure and drug repositioning
2022-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110322
PMID:35219850
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性心力衰竭小鼠模型中非心肌细胞的细胞多样性和相互通信，并探索了潜在的治疗药物 | 首次详细描述了慢性心力衰竭中非心肌细胞的细胞景观，并利用CMap技术识别了潜在的新型抗心衰药物 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证 | 揭示慢性心力衰竭中非心肌细胞的细胞多样性和相互通信机制，并探索新的治疗策略 | 慢性心力衰竭小鼠模型中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 3382 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cell types heterogenicity of human discoid lateral meniscus cells
2022-05, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30704
PMID:35220586
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了盘状外侧半月板细胞的细胞类型异质性 | 首次比较了盘状和正常半月板之间的基因表达和细胞异质性，并发现了两个新的特定于盘状半月板的细胞群 | NA | 旨在识别盘状半月板中的特定细胞群及其标记基因，为盘状半月板的治疗和病因提供理论基础 | 盘状外侧半月板细胞和骨关节炎外侧半月板细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 九个细胞群，包括七个经验定义的细胞群和两个新的特定于盘状半月板的细胞群 |
| 3383 | 2024-08-08 |
Pharmacological Perturbation of Mechanical Contractility Enables Robust Transdifferentiation of Human Fibroblasts into Neurons
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202104682
PMID:35240008
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研究论文 | 本文报道了一种通过靶向细胞骨架并暴露于谱系指定环境来将成纤维细胞转化为神经元的强效方法 | 本文首次通过单一分子抑制肌动蛋白收缩来破坏细胞骨架，促进细胞软化和YAP/TAZ的核外输出，诱导神经元样状态 | NA | 研究细胞命运转换和再生医学 | 人包皮成纤维细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3384 | 2024-08-08 |
Spatial and transcriptional heterogeneity of pancreatic beta cell neogenesis revealed by a time-resolved reporter system
2022-May, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-022-05662-0
PMID:35243521
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研究论文 | 本文通过时间分辨报告系统研究了胰腺β细胞新生过程中的空间和转录异质性 | 首次揭示了β细胞新生过程中空间和转录异质性的新特征 | NA | 探究胰腺β细胞新生过程中的空间和转录异质性 | 胰腺β细胞新生过程中的空间和转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类胚胎干细胞衍生的β样细胞 |
| 3385 | 2024-08-08 |
Phitest for analyzing the homogeneity of single-cell populations
2022-04-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac130
PMID:35238346
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研究论文 | 本文提出了一种名为Phitest的生物信息学工具，用于分析单细胞群体的同质性 | Phitest能够区分同质和异质的细胞群体，为单细胞聚类分析提供了一种客观和自动化的优化方法 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析质量评估 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体同质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 3386 | 2024-08-08 |
The composition, function, and regulation of adipose stem and progenitor cells
2022-04, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.02.014
PMID:35240306
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综述 | 本文综述了脂肪干细胞和前体细胞（ASPCs）的组成、功能及其调控机制 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析揭示了ASPCs在鼠和人类脂肪组织中的不同亚型，提供了对ASPCs细胞复杂性的新见解 | ASPCs的分子异质性和功能多样性仍了解不足 | 总结ASPCs群体的当前知识，包括其标记物、功能和调控机制 | 脂肪干细胞和前体细胞（ASPCs）及其在脂肪组织中的作用 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及鼠和人类脂肪组织 |
| 3387 | 2024-08-08 |
Dissecting the cellular landscape and transcriptome network in viral myocarditis by single-cell RNA sequencing
2022-Mar-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103865
PMID:35243228
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康和病毒性心肌炎小鼠心脏细胞的细胞景观和转录组网络 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了病毒性心肌炎中不同细胞类型（如髓系细胞、T细胞和成纤维细胞）的转录组特征及其在疾病发展中的作用 | NA | 解析病毒性心肌炎中细胞景观和转录组网络的复杂性 | 健康和病毒性心肌炎小鼠的心脏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和病毒性心肌炎小鼠的心脏细胞样本 |
| 3388 | 2024-08-08 |
Tertiary lymphoid structure and decreased CD8+ T cell infiltration in minimally invasive adenocarcinoma
2022-Mar-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103883
PMID:35243243
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了58对微小浸润性腺癌（MIA）肿瘤及其配对正常组织的肿瘤微环境（TME）特征 | 首次详细描述了早期肺腺癌的肿瘤微环境，特别是MIA肿瘤中三级淋巴结构（TLS）的形成及其对CD8+ T细胞浸润的影响 | 研究样本量有限，且仅限于早期肺腺癌患者 | 研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征及其对免疫反应的影响 | 微小浸润性腺癌（MIA）肿瘤及其配对正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 58对MIA肿瘤及其配对正常组织 |
| 3389 | 2024-08-08 |
Horizontal mtDNA transfer between cells is common during mouse development
2022-Mar-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103901
PMID:35243258
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研究论文 | 本文展示了在非亲缘关系的细胞间发生横向线粒体DNA（mtDNA）转移的现象及其程度 | 首次证明了横向mtDNA转移在成年嵌合鼠的多种组织和器官中的普遍性，并提出这可能是一种补偿受损线粒体功能的机制 | 尚未确定mtDNA供体细胞和转移机制 | 探讨横向mtDNA转移的现象及其在基因治疗中的潜在应用 | 成年嵌合鼠的多种组织和器官中的细胞 | 遗传学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 包含不同mtDNA单倍型的成年嵌合鼠的多种组织和器官中的细胞 |
| 3390 | 2024-08-08 |
scGR-seq: Integrated analysis of glycan and RNA in single cells
2022-03-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101179
PMID:35243371
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞中糖类和RNA联合分析的方法scGR-seq | scGR-seq结合了基于DNA条形码的凝集素糖类分析和单细胞转录组分析，用于揭示多细胞系统中糖类的细胞异质性 | NA | 开发一种新的技术用于单细胞中糖类和RNA的联合分析 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)和hiPSC衍生的神经前体细胞(NPCs) | NA | NA | scGR-seq | NA | 糖类和RNA数据 | 使用人诱导多能干细胞和其衍生的神经前体细胞进行实验 |
| 3391 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals PDGFRα+ stromal cell subpopulations that promote proacinar cell differentiation in embryonic salivary gland organoids
2022-03-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200167
PMID:35224622
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PDGFRα+基质细胞亚群在胚胎唾液腺类器官中促进前腺泡细胞分化的作用 | 首次识别出表达Fgf2和Fgf10的Pdgfra+基质细胞亚群，并阐明了其在促进前腺泡细胞分化中的作用机制 | 研究主要集中在胚胎唾液腺类器官，未涉及其他器官或成年唾液腺的具体应用 | 探讨基质细胞在器官发育中对上皮祖细胞分化的调控机制 | 胚胎唾液腺类器官中的基质细胞和上皮祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个基质细胞亚群和上皮祖细胞 |
| 3392 | 2024-08-08 |
Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer
2022-03-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.02.001
PMID:35231421
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法，探讨了肾细胞癌（RCC）中三级淋巴结构（TLS）内B细胞反应的性质 | 首次详细描述了TLS在肾细胞癌中促进B细胞成熟和抗体产生的过程，并揭示了其与免疫治疗反应的关联 | NA | 研究TLS在肾细胞癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 肾细胞癌中的三级淋巴结构（TLS）及其内的B细胞反应 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3393 | 2024-08-08 |
BRN2 as a key gene drives the early primate telencephalon development
2022-Mar-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl7263
PMID:35245119
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研究论文 | 本文研究了BRN2基因在早期灵长类大脑皮层发育中的关键作用 | 发现了BRN2基因在灵长类大脑扩张中的新机制功能 | NA | 探讨保守基因在灵长类大脑扩张中的作用 | BRN2基因及其在灵长类大脑发育中的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及猕猴样本 |
| 3394 | 2024-08-08 |
Landscape of adenosine-to-inosine RNA recoding across human tissues
2022-03-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28841-4
PMID:35246538
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研究论文 | 本文介绍了一种新的检测方法，分析了9125个GTEx RNA-seq样本，生成了一个高度准确的包含1517个编码区域内编辑位点及其在人类组织中编辑水平的图谱。 | 提出了一种新的检测方法，能够系统地发现人类和其他哺乳动物中的RNA重编码位点。 | NA | 揭示人类组织中RNA重编码的全貌，并探讨其在人类生理和疾病中的作用。 | 人类组织中的RNA重编码位点及其编辑水平。 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列 | 9125个GTEx RNA-seq样本 |
| 3395 | 2024-08-08 |
The clinicopathological characteristics, prognosis and immune microenvironment mapping in MSI-H/MMR-D endometrial carcinomas
2022-Mar-03, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-022-00466-5
PMID:35239036
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研究论文 | 研究了MSI-H/MMR-D子宫内膜癌的临床病理特征、预后及其与免疫微环境的关系 | 通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了MMR-D子宫内膜癌组织中的免疫景观，并探讨了免疫亚群在MSI子宫内膜癌中的作用 | NA | 探讨MSI亚型在子宫内膜癌中的预后价值及其与免疫环境的相关性 | MSI-H/MMR-D子宫内膜癌患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据和临床数据 | 78个POLE样本，123个MSI样本，299个其他EC样本，以及3371个细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 3396 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatially resolved analysis uncovers cell heterogeneity of breast cancer
2022-03-03, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-022-01236-0
PMID:35241110
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研究论文 | 本研究结合单核RNA测序（snRNA-seq）和基于微阵列的空间转录组学（ST）技术，分析了乳腺癌组织中的细胞异质性和空间分布 | 首次将单细胞和空间转录组学技术结合，揭示了乳腺癌细胞的亚型及其空间组织结构 | NA | 揭示乳腺癌细胞的异质性和复杂细胞结构对疾病进展和治疗反应的影响 | 乳腺癌组织中的细胞亚型及其空间分布 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序（snRNA-seq），基于微阵列的空间转录组学（ST） | NA | RNA序列 | 大型乳腺癌RNA-seq队列 |
| 3397 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics links malignant T cells to the tumor immune landscape in cutaneous T cell lymphoma
2022-03-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28799-3
PMID:35241665
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析和全外显子测序技术，解析了皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的肿瘤内和病变间的异质性，并提出了一种多步骤的肿瘤演化模型 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了CTCL中恶性T细胞的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | NA | 旨在深入理解皮肤T细胞淋巴瘤的本质，并为未来的精准医疗提供基础 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的恶性T细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA分析，全外显子测序 | NA | 转录组数据 | 19个皮肤病变样本来自15名CTCL患者 |
| 3398 | 2024-08-08 |
Guidelines for bioinformatics of single-cell sequencing data analysis in Alzheimer's disease: review, recommendation, implementation and application
2022-03-02, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00517-z
PMID:35236372
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综述 | 本文系统回顾了用于分析单细胞测序数据并应用于阿尔茨海默病（AD）的生物信息学方法，并提供了具体的分析方向和研究设计指南 | 本文实现了推荐的每个主要分析方向的工作流程，并将其应用于AD中的大规模单核RNA测序（snRNA-seq）数据集 | 本文未明确提及具体的局限性 | 提供单细胞测序数据分析的全面回顾，并为AD及其他疾病或生物系统的单细胞水平研究提供有价值的资源 | 单细胞测序数据分析方法及其在阿尔茨海默病中的应用 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 大规模单核RNA测序（snRNA-seq）数据集 |
| 3399 | 2024-08-08 |
Integrated analysis on transcriptome and behaviors defines HTT repeat-dependent network modules in Huntington's disease
2022-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2021.05.004
PMID:35224162
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研究论文 | 本研究通过综合分析转录组和行为学数据，揭示了亨廷顿病中HTT重复依赖的网络模块 | 首次进行了与CAG重复扩展相关的表型特征与基因型的综合分析，并发现了与行为特征显著相关的基因共表达组 | NA | 揭示亨廷顿病中与CAG重复长度相关的行为特征和基因表达模式 | 亨廷顿病的CAG重复扩展敲入小鼠的转录组和行为学特征 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和microRNA数据 | 445个mRNA样本和445个microRNA样本，以及396个PhenoCube行为和111个NeuroCube行为 |
| 3400 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of motoneurons identifies regulators of synaptic wiring in Drosophila embryos
2022-03, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202110255
PMID:35225419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、成像和遗传学方法，研究了果蝇胚胎中的运动神经元，揭示了同源域转录因子和下游免疫球蛋白域蛋白在细胞特异性连接中的重要作用 | 首次展示了细胞特异性组合的同源域转录因子和免疫球蛋白域蛋白在运动神经元与目标肌肉连接中的功能作用 | 研究主要集中在果蝇胚胎中的运动神经元，可能不适用于其他物种或发育阶段 | 探究神经元电路结构的遗传决定机制 | 果蝇胚胎中的运动神经元及其与目标肌肉的连接 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个运动神经元细胞 |