单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
3361 2024-08-08
Deletion of CHD8 in cerebellar granule neuron progenitors leads to severe cerebellar hypoplasia, ataxia, and psychiatric behavior in mice
2022-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过建立不同的条件性敲除小鼠模型,探讨CHD8在小脑发育中的作用及其与神经精神障碍的关系 首次全面调查CHD8在小脑中的功能,并揭示了CHD8突变与神经精神障碍之间的潜在联系 NA 探讨CHD8在小脑发育中的作用及其与神经精神障碍的关系 小鼠的小脑发育和神经精神行为 神经科学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序 NA RNA 不同条件性敲除小鼠模型
3362 2024-08-08
Dihydroartemisinin beneficially regulates splenic immune cell heterogeneity through the SOD3-JNK-AP-1 axis
2022-08, Science China. Life sciences
研究论文 本研究探讨了双氢青蒿素(DHA)通过SOD3-JNK-AP-1轴调节脾脏免疫细胞异质性的机制 首次揭示了DHA通过诱导SOD3表达和增加JNK及其下游转录因子AP-1的磷酸化,促进脾脏中有效调节T细胞和干扰素-γ细胞毒性CD8 T细胞的可逆扩张 NA 阐明双氢青蒿素调节脾脏免疫细胞异质性的潜在机制 小鼠脾脏免疫细胞 NA 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 NA RNA SOD3敲除小鼠
3363 2024-08-08
Update on preclinical and clinical efforts on ex-vivo expansion of hematopoietic stem and progenitor cells
2022-07-01, Current opinion in hematology IF:3.1Q2
研究论文 本文讨论了体外扩增造血干细胞(HSCs)和祖细胞(HPCs)的临床前和临床研究进展 单细胞RNA测序发现ADGRG1是体外扩增诱导线粒体氧化应激下功能性HSCs的可靠标记物 体外扩增可能克服HSCs稀有性的限制,但不损害干细胞特性 增强基于造血细胞移植疗法的临床效果 体外扩增的人类HSCs和HPCs NA 血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 多个临床试验中的患者
3364 2024-08-08
Transcriptomic Mapping of Human Parotid Gland at Single-Cell Resolution
2022-07, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用10× Genomics平台构建了人类腮腺的单细胞分辨率转录组图谱 首次报道了人类腮腺在单细胞分辨率的转录组特征,并通过比较分析揭示了腮腺与其他消化腺的特异性和相似性 NA 探索人类腮腺的细胞异质性和多样性,并揭示其在消化和免疫功能中的作用 人类腮腺的单细胞转录组 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
3365 2024-08-08
Gnas Loss Causes Chondrocyte Fate Conversion in Cranial Suture Formation
2022-07, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了Gα基因在维持小鼠新生颅骨发育中颅缝软骨细胞身份的作用,以及减少Hh信号传导作为非手术干预措施减少因Gα基因缺失导致的颅缝早闭症的可能性。 首次揭示了Gα基因缺失导致颅缝软骨细胞向成骨细胞命运转换,并引发了颅缝和囟门内的异位骨化,为颅缝早闭症的非手术治疗提供了新思路。 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证。 探讨Gα基因在颅缝形成中的作用及如何通过减少Hh信号传导来干预颅缝早闭症。 小鼠新生颅缝软骨细胞及颅骨发育。 NA 颅缝早闭症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠新生颅缝软骨细胞样本
3366 2024-08-08
Potential biomarkers in the fibrosis progression of nonalcoholic steatohepatitis (NASH)
2022-Jul, Journal of endocrinological investigation IF:3.9Q2
研究论文 本研究旨在探索与非酒精性脂肪性肝炎(NASH)纤维化进展相关的新基因 首次从单细胞角度探讨了与NASH纤维化相关的新基因,并分析了其在不同细胞群中的表达及其对纤维化的影响 NA 探索与NASH纤维化进展相关的新基因 NASH纤维化进展相关基因 数字病理学 肝病 RNA测序 加权基因共表达网络分析(WGCNA) RNA测序数据 涉及两个人类RNA测序数据集、两个小鼠单细胞RNA测序数据集和一个人类微阵列数据集
3367 2024-08-08
Functional, metabolic and transcriptional maturation of human pancreatic islets derived from stem cells
2022-07, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文研究了从干细胞衍生的胰腺胰岛细胞的功能、代谢和转录成熟过程 首次详细描述了干细胞衍生的胰岛细胞(SC-islets)的功能特性,并全面比较了它们与成人胰岛细胞的差异 NA 探讨干细胞衍生的胰腺胰岛细胞的成熟过程及其在糖尿病治疗中的应用潜力 干细胞衍生的胰腺胰岛细胞(SC-islets)及其功能、代谢和转录成熟过程 NA 糖尿病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 SC-islets在体外和植入小鼠体内6个月的样本
3368 2024-08-08
Role for Granulocyte Colony-Stimulating Factor in Neutrophilic Extramedullary Myelopoiesis in a Murine Model of Systemic Juvenile Idiopathic Arthritis
2022-07, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨了粒细胞集落刺激因子(G-CSF)在系统性幼年特发性关节炎(JIA)小鼠模型中的作用及其对中性粒细胞增多和髓外髓系生成的影响 首次展示了G-CSF在系统性JIA小鼠模型中对中性粒细胞增多和髓外髓系生成的作用,并评估了G-CSF受体阻断对这些过程的影响 研究主要集中在小鼠模型上,需要在人类患者中进一步验证 研究G-CSF在系统性JIA病理过程中的作用 系统性JIA小鼠模型中的中性粒细胞增多和髓外髓系生成 NA 幼年特发性关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA BALB/c小鼠和IFNγ-KO小鼠,以及系统性JIA患者
3369 2024-08-08
Transitional Anal Cells Mediate Colonic Re-epithelialization in Colitis
2022-06, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本文研究了在急性结肠炎中,肛门类似皮肤的细胞是否能介导结肠的重新上皮化 发现肛门过渡区细胞具有预加载的结肠分化程序,能在结肠炎后重建上皮结构 NA 探讨邻近器官的上皮细胞是否能在急性结肠炎中被激活以介导重新上皮化 肛门过渡区细胞在结肠炎中的作用 NA 炎症性肠病 3D成像、单细胞转录组学、生物物理建模 NA 细胞 转基因小鼠
3370 2024-08-08
Physically interacting beta-delta pairs in the regenerating pancreas revealed by single-cell sequencing
2022-06, Molecular metabolism IF:7.0Q1
research paper 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统地绘制了胰腺内分泌细胞在胰腺切除术后的细胞相互作用图谱 首次揭示了胰腺再生过程中β细胞和δ细胞之间的物理相互作用及其对压力保护的影响 NA 探索胰腺再生过程中邻近细胞间的通信机制 胰腺内分泌细胞,特别是β细胞和δ细胞 digital pathology NA single-cell RNA-sequencing NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
3371 2024-08-08
Comparative transcriptome analysis identifies important maternal molecules and associated biological pathways for pig and human mature oocytes
2022-Jun, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
研究论文 通过比较转录组分析,研究了猪和人类成熟卵母细胞中常见的和特有的母源分子及其相关的生物学过程 首次揭示了猪和人类成熟卵母细胞在分子水平上的差异,并识别了这些差异分子所涉及的信号通路 研究主要集中在体外成熟的卵母细胞,对体内成熟卵母细胞的研究较少 旨在通过比较转录组分析,识别猪和人类成熟卵母细胞中的共同和特有的母源分子及其相关的生物学过程 猪和人类成熟卵母细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 猪体内成熟卵母细胞11,147个,体外成熟卵母细胞11,997个;人类体外成熟卵母细胞14,491个
3372 2024-08-08
Ovarian cancer-specific dysregulated genes with prognostic significance: scRNA-Seq with bulk RNA-Seq data and experimental validation
2022-06, Annals of the New York Academy of Sciences IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-Seq)结合批量RNA测序(bulk RNA-Seq)分析,鉴定了卵巢癌组织中的高度变异基因,并探讨了肿瘤细胞异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在卵巢癌肿瘤微环境(TME)中的浸润情况 本研究首次结合scRNA-Seq和bulk RNA-Seq技术,鉴定了与M2型TAMs相关的四个基因(SLAMF7, GNAS, TBX2-AS1, 和 LYPD6),并验证了这些基因在卵巢癌预后中的作用 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术分析卵巢癌肿瘤细胞的异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的浸润情况 卵巢癌组织中的肿瘤细胞异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞的浸润情况 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),批量RNA测序(bulk RNA-Seq) NA RNA序列 具体样本数量未在摘要中提及
3373 2024-08-08
Genomic and Single-Cell Landscape Reveals Novel Drivers and Therapeutic Vulnerabilities of Transformed Cutaneous T-cell Lymphoma
2022-05-02, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究通过综合多组学方法,包括全外显子测序、单细胞RNA测序和免疫分析,揭示了转化性皮肤T细胞淋巴瘤的新驱动因素和治疗脆弱性。 首次提供了转化性皮肤T细胞淋巴瘤的全面基因组改变图谱,并识别出潜在的预后标志物和新的治疗靶点。 NA 揭示转化性皮肤T细胞淋巴瘤的基因组和单细胞层面的新驱动因素及治疗脆弱性。 56名转化性皮肤T细胞淋巴瘤患者的肿瘤生态系统。 数字病理学 皮肤T细胞淋巴瘤 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫分析 NA 基因组数据、单细胞数据、免疫数据 70个皮肤活检样本,16个单细胞皮肤活检样本
3374 2024-08-08
Single cell study of cellular diversity and mutual communication in chronic heart failure and drug repositioning
2022-05, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性心力衰竭小鼠模型中非心肌细胞的细胞多样性和相互通信,并探索了潜在的治疗药物 首次详细描述了慢性心力衰竭中非心肌细胞的细胞景观,并利用CMap技术识别了潜在的新型抗心衰药物 研究主要集中在小鼠模型上,未来需要进一步在人类样本中验证 揭示慢性心力衰竭中非心肌细胞的细胞多样性和相互通信机制,并探索新的治疗策略 慢性心力衰竭小鼠模型中的非心肌细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠模型
3375 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals the cell types heterogenicity of human discoid lateral meniscus cells
2022-05, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了盘状外侧半月板细胞的细胞类型异质性 首次比较了盘状和正常半月板之间的基因表达和细胞异质性,并发现了两个新的特定于盘状半月板的细胞群 NA 旨在识别盘状半月板中的特定细胞群及其标记基因,为盘状半月板的治疗和病因提供理论基础 盘状外侧半月板细胞和骨关节炎外侧半月板细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 九个细胞群,包括七个经验定义的细胞群和两个新的特定于盘状半月板的细胞群
3376 2024-08-08
Pharmacological Perturbation of Mechanical Contractility Enables Robust Transdifferentiation of Human Fibroblasts into Neurons
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文报道了一种通过靶向细胞骨架并暴露于谱系指定环境来将成纤维细胞转化为神经元的强效方法 本文首次通过单一分子抑制肌动蛋白收缩来破坏细胞骨架,促进细胞软化和YAP/TAZ的核外输出,诱导神经元样状态 NA 研究细胞命运转换和再生医学 人包皮成纤维细胞 再生医学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
3377 2024-08-08
Spatial and transcriptional heterogeneity of pancreatic beta cell neogenesis revealed by a time-resolved reporter system
2022-May, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本文通过时间分辨报告系统研究了胰腺β细胞新生过程中的空间和转录异质性 首次揭示了β细胞新生过程中空间和转录异质性的新特征 NA 探究胰腺β细胞新生过程中的空间和转录异质性 胰腺β细胞新生过程中的空间和转录特征 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠和人类胚胎干细胞衍生的β样细胞
3378 2024-08-08
Phitest for analyzing the homogeneity of single-cell populations
2022-04-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为Phitest的生物信息学工具,用于分析单细胞群体的同质性 Phitest能够区分同质和异质的细胞群体,为单细胞聚类分析提供了一种客观和自动化的优化方法 NA 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析质量评估 单细胞RNA测序数据中的细胞群体同质性 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA
3379 2024-08-08
The composition, function, and regulation of adipose stem and progenitor cells
2022-04, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
综述 本文综述了脂肪干细胞和前体细胞(ASPCs)的组成、功能及其调控机制 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析揭示了ASPCs在鼠和人类脂肪组织中的不同亚型,提供了对ASPCs细胞复杂性的新见解 ASPCs的分子异质性和功能多样性仍了解不足 总结ASPCs群体的当前知识,包括其标记物、功能和调控机制 脂肪干细胞和前体细胞(ASPCs)及其在脂肪组织中的作用 NA 代谢性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 涉及鼠和人类脂肪组织
3380 2024-08-08
Dissecting the cellular landscape and transcriptome network in viral myocarditis by single-cell RNA sequencing
2022-Mar-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康和病毒性心肌炎小鼠心脏细胞的细胞景观和转录组网络 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了病毒性心肌炎中不同细胞类型(如髓系细胞、T细胞和成纤维细胞)的转录组特征及其在疾病发展中的作用 NA 解析病毒性心肌炎中细胞景观和转录组网络的复杂性 健康和病毒性心肌炎小鼠的心脏细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 健康和病毒性心肌炎小鼠的心脏细胞样本
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