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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3361 | 2024-08-08 |
Progress of Single-Cell RNA Sequencing Technology in Myocardial Infarction Research
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.768834
PMID:35252379
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在心肌梗死研究中的进展 | 利用单细胞转录组测序技术探索单细胞多样性,全面阐明心肌梗死的自然史和分子机制 | NA | 理解心肌梗死后心脏重塑和修复过程中细胞变化,发现新的潜在治疗靶点 | 心肌梗死后心脏中的心肌细胞、免疫细胞、成纤维细胞、内皮细胞等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
3362 | 2024-08-08 |
Identification of Significant Modules and Targets of Xian-Lian-Jie-Du Decoction Based on the Analysis of Transcriptomics, Proteomics and Single-Cell Transcriptomics in Colorectal Tumor
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S344861
PMID:35256851
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研究论文 | 本研究通过转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学分析,探讨了仙莲解毒汤在治疗溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的作用机制 | 首次通过多组学分析揭示了仙莲解毒汤在抑制结直肠肿瘤发生发展中的具体机制,并识别了关键的mRNA和蛋白质模块以及潜在的治疗靶点 | 研究主要基于AOM/DSS小鼠模型,未来需在临床试验中验证这些发现 | 探讨仙莲解毒汤在治疗溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的作用机制 | 仙莲解毒汤及其主要成分对AOM/DSS小鼠模型的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 高通量测序技术 | NA | 转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据 | 使用AOM/DSS小鼠模型进行实验 |
3363 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Comparison of Bladder Cancer Reveals Its Ecosystem
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.818147
PMID:35265520
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了膀胱癌不同临床样本的转录组,揭示了肿瘤生态系统的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了膀胱癌不同阶段的肿瘤微环境特征,并发现了与疾病进展相关的生物标志物 | 研究样本数量有限,需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探索膀胱癌的生物学行为及其在不同临床状态下的肿瘤微环境 | 膀胱癌及其相关病理状态的单细胞转录组 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 26,792个细胞转录组来自三个患者的四个不同等级临床样本 |
3364 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Nucleus Pulposus Reveals Chondrocyte Differentiation and Regulation in Intervertebral Disc Degeneration
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.824771
PMID:35265617
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了椎间盘退变过程中髓核细胞的发育路径和调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了髓核细胞在椎间盘退变过程中的三种细胞谱系家族和七种软骨细胞亚型,并定义了软骨细胞谱系家族的两个发育路径 | NA | 探索椎间盘退变过程中髓核细胞的发育和调控机制 | 髓核细胞在椎间盘退变中的发育路径和调控机制 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个髓核样本,包括正常、轻度退变和重度退变 |
3365 | 2024-08-08 |
IL-11 Is Elevated and Drives the Profibrotic Phenotype Transition of Orbital Fibroblasts in Thyroid-Associated Ophthalmopathy
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.846106
PMID:35273577
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-11(IL-11)在甲状腺相关眼病(TAO)中对眼眶成纤维细胞纤维化表型转变的作用 | 首次揭示了IL-11在TAO患者中的表达模式及其与病理纤维化的机制联系,并证明了IL-11通过诱导肌成纤维细胞分化标记物的表达介导纤维化表型转变 | NA | 研究IL-11在TAO中的表达及其与病理纤维化的关系 | TAO患者的血清和眼眶结缔组织中的IL-11水平及其与疾病活动的关系 | NA | 甲状腺相关眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TAO患者的血清和眼眶结缔组织样本 |
3366 | 2024-08-08 |
Spatially Annotated Single Cell Sequencing for Unraveling Intratumor Heterogeneity
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.829509
PMID:35273957
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研究论文 | 本文介绍了一种基于功能性单细胞测序(FUNseq)技术的新型空间注释单细胞测序方法,用于在单细胞分辨率下空间分析肿瘤细胞,揭示肿瘤内异质性。 | 该方法结合了单细胞RNA测序(scRNA-seq)的深度和空间转录组学方法的空间分布信息,实现了对肿瘤细胞的空间注释和深度特征分析。 | NA | 研究目的是通过空间注释单细胞测序技术揭示肿瘤内异质性的机制。 | 研究对象是肿瘤细胞及其在二维上皮细胞团中的空间分布和行为。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 研究中分析了位于2D上皮细胞团不同距离的细胞,具体样本数量未详细说明。 |
3367 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of human CD127+ innate lymphoid cells reveals diverse immune phenotypes in hepatocellular carcinoma
2022-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32444
PMID:35243668
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人肝细胞癌(HCC)患者中的CD127+先天淋巴细胞(ILCs),揭示了ILCs在HCC中的免疫表型多样性及其与疾病预后的关联 | 首次报道了B细胞在ILC2细胞炎症分化中的新功能,以及B细胞衍生的ICOSL信号通过增加IL-13产生加剧炎症的作用 | NA | 探讨先天淋巴细胞在肝细胞癌中的免疫表型特征及其与疾病预后的关系 | 人肝细胞癌患者的CD127+先天淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3433个ILCs |
3368 | 2024-08-08 |
Deletion of CHD8 in cerebellar granule neuron progenitors leads to severe cerebellar hypoplasia, ataxia, and psychiatric behavior in mice
2022-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.02.011
PMID:35231638
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研究论文 | 本研究通过建立不同的条件性敲除小鼠模型,探讨CHD8在小脑发育中的作用及其与神经精神障碍的关系 | 首次全面调查CHD8在小脑中的功能,并揭示了CHD8突变与神经精神障碍之间的潜在联系 | NA | 探讨CHD8在小脑发育中的作用及其与神经精神障碍的关系 | 小鼠的小脑发育和神经精神行为 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同条件性敲除小鼠模型 |
3369 | 2024-08-08 |
Dihydroartemisinin beneficially regulates splenic immune cell heterogeneity through the SOD3-JNK-AP-1 axis
2022-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2061-7
PMID:35226255
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研究论文 | 本研究探讨了双氢青蒿素(DHA)通过SOD3-JNK-AP-1轴调节脾脏免疫细胞异质性的机制 | 首次揭示了DHA通过诱导SOD3表达和增加JNK及其下游转录因子AP-1的磷酸化,促进脾脏中有效调节T细胞和干扰素-γ细胞毒性CD8 T细胞的可逆扩张 | NA | 阐明双氢青蒿素调节脾脏免疫细胞异质性的潜在机制 | 小鼠脾脏免疫细胞 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | SOD3敲除小鼠 |
3370 | 2024-08-08 |
Update on preclinical and clinical efforts on ex-vivo expansion of hematopoietic stem and progenitor cells
2022-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000714
PMID:35220322
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研究论文 | 本文讨论了体外扩增造血干细胞(HSCs)和祖细胞(HPCs)的临床前和临床研究进展 | 单细胞RNA测序发现ADGRG1是体外扩增诱导线粒体氧化应激下功能性HSCs的可靠标记物 | 体外扩增可能克服HSCs稀有性的限制,但不损害干细胞特性 | 增强基于造血细胞移植疗法的临床效果 | 体外扩增的人类HSCs和HPCs | NA | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个临床试验中的患者 |
3371 | 2024-08-08 |
Transcriptomic Mapping of Human Parotid Gland at Single-Cell Resolution
2022-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221076069
PMID:35220796
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研究论文 | 本研究利用10× Genomics平台构建了人类腮腺的单细胞分辨率转录组图谱 | 首次报道了人类腮腺在单细胞分辨率的转录组特征,并通过比较分析揭示了腮腺与其他消化腺的特异性和相似性 | NA | 探索人类腮腺的细胞异质性和多样性,并揭示其在消化和免疫功能中的作用 | 人类腮腺的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
3372 | 2024-08-08 |
Gnas Loss Causes Chondrocyte Fate Conversion in Cranial Suture Formation
2022-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221075215
PMID:35220829
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研究论文 | 研究探讨了Gα基因在维持小鼠新生颅骨发育中颅缝软骨细胞身份的作用,以及减少Hh信号传导作为非手术干预措施减少因Gα基因缺失导致的颅缝早闭症的可能性。 | 首次揭示了Gα基因缺失导致颅缝软骨细胞向成骨细胞命运转换,并引发了颅缝和囟门内的异位骨化,为颅缝早闭症的非手术治疗提供了新思路。 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证。 | 探讨Gα基因在颅缝形成中的作用及如何通过减少Hh信号传导来干预颅缝早闭症。 | 小鼠新生颅缝软骨细胞及颅骨发育。 | NA | 颅缝早闭症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠新生颅缝软骨细胞样本 |
3373 | 2024-08-08 |
Potential biomarkers in the fibrosis progression of nonalcoholic steatohepatitis (NASH)
2022-Jul, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-022-01773-y
PMID:35226336
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研究论文 | 本研究旨在探索与非酒精性脂肪性肝炎(NASH)纤维化进展相关的新基因 | 首次从单细胞角度探讨了与NASH纤维化相关的新基因,并分析了其在不同细胞群中的表达及其对纤维化的影响 | NA | 探索与NASH纤维化进展相关的新基因 | NASH纤维化进展相关基因 | 数字病理学 | 肝病 | RNA测序 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | RNA测序数据 | 涉及两个人类RNA测序数据集、两个小鼠单细胞RNA测序数据集和一个人类微阵列数据集 |
3374 | 2024-08-08 |
Functional, metabolic and transcriptional maturation of human pancreatic islets derived from stem cells
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01219-z
PMID:35241836
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研究论文 | 本文研究了从干细胞衍生的胰腺胰岛细胞的功能、代谢和转录成熟过程 | 首次详细描述了干细胞衍生的胰岛细胞(SC-islets)的功能特性,并全面比较了它们与成人胰岛细胞的差异 | NA | 探讨干细胞衍生的胰腺胰岛细胞的成熟过程及其在糖尿病治疗中的应用潜力 | 干细胞衍生的胰腺胰岛细胞(SC-islets)及其功能、代谢和转录成熟过程 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | SC-islets在体外和植入小鼠体内6个月的样本 |
3375 | 2024-08-08 |
Role for Granulocyte Colony-Stimulating Factor in Neutrophilic Extramedullary Myelopoiesis in a Murine Model of Systemic Juvenile Idiopathic Arthritis
2022-07, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42104
PMID:35243819
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研究论文 | 本研究探讨了粒细胞集落刺激因子(G-CSF)在系统性幼年特发性关节炎(JIA)小鼠模型中的作用及其对中性粒细胞增多和髓外髓系生成的影响 | 首次展示了G-CSF在系统性JIA小鼠模型中对中性粒细胞增多和髓外髓系生成的作用,并评估了G-CSF受体阻断对这些过程的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上,需要在人类患者中进一步验证 | 研究G-CSF在系统性JIA病理过程中的作用 | 系统性JIA小鼠模型中的中性粒细胞增多和髓外髓系生成 | NA | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | BALB/c小鼠和IFNγ-KO小鼠,以及系统性JIA患者 |
3376 | 2024-08-08 |
Transitional Anal Cells Mediate Colonic Re-epithelialization in Colitis
2022-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.02.031
PMID:35227778
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研究论文 | 本文研究了在急性结肠炎中,肛门类似皮肤的细胞是否能介导结肠的重新上皮化 | 发现肛门过渡区细胞具有预加载的结肠分化程序,能在结肠炎后重建上皮结构 | NA | 探讨邻近器官的上皮细胞是否能在急性结肠炎中被激活以介导重新上皮化 | 肛门过渡区细胞在结肠炎中的作用 | NA | 炎症性肠病 | 3D成像、单细胞转录组学、生物物理建模 | NA | 细胞 | 转基因小鼠 |
3377 | 2024-08-08 |
Physically interacting beta-delta pairs in the regenerating pancreas revealed by single-cell sequencing
2022-06, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2022.101467
PMID:35240340
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统地绘制了胰腺内分泌细胞在胰腺切除术后的细胞相互作用图谱 | 首次揭示了胰腺再生过程中β细胞和δ细胞之间的物理相互作用及其对压力保护的影响 | NA | 探索胰腺再生过程中邻近细胞间的通信机制 | 胰腺内分泌细胞,特别是β细胞和δ细胞 | digital pathology | NA | single-cell RNA-sequencing | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
3378 | 2024-08-08 |
Comparative transcriptome analysis identifies important maternal molecules and associated biological pathways for pig and human mature oocytes
2022-Jun, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14105
PMID:35244301
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研究论文 | 通过比较转录组分析,研究了猪和人类成熟卵母细胞中常见的和特有的母源分子及其相关的生物学过程 | 首次揭示了猪和人类成熟卵母细胞在分子水平上的差异,并识别了这些差异分子所涉及的信号通路 | 研究主要集中在体外成熟的卵母细胞,对体内成熟卵母细胞的研究较少 | 旨在通过比较转录组分析,识别猪和人类成熟卵母细胞中的共同和特有的母源分子及其相关的生物学过程 | 猪和人类成熟卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 猪体内成熟卵母细胞11,147个,体外成熟卵母细胞11,997个;人类体外成熟卵母细胞14,491个 |
3379 | 2024-08-08 |
Ovarian cancer-specific dysregulated genes with prognostic significance: scRNA-Seq with bulk RNA-Seq data and experimental validation
2022-06, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.14748
PMID:35247207
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-Seq)结合批量RNA测序(bulk RNA-Seq)分析,鉴定了卵巢癌组织中的高度变异基因,并探讨了肿瘤细胞异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在卵巢癌肿瘤微环境(TME)中的浸润情况 | 本研究首次结合scRNA-Seq和bulk RNA-Seq技术,鉴定了与M2型TAMs相关的四个基因(SLAMF7, GNAS, TBX2-AS1, 和 LYPD6),并验证了这些基因在卵巢癌预后中的作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术分析卵巢癌肿瘤细胞的异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的浸润情况 | 卵巢癌组织中的肿瘤细胞异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞的浸润情况 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),批量RNA测序(bulk RNA-Seq) | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
3380 | 2024-08-08 |
Genomic and Single-Cell Landscape Reveals Novel Drivers and Therapeutic Vulnerabilities of Transformed Cutaneous T-cell Lymphoma
2022-05-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-1207
PMID:35247891
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研究论文 | 本研究通过综合多组学方法,包括全外显子测序、单细胞RNA测序和免疫分析,揭示了转化性皮肤T细胞淋巴瘤的新驱动因素和治疗脆弱性。 | 首次提供了转化性皮肤T细胞淋巴瘤的全面基因组改变图谱,并识别出潜在的预后标志物和新的治疗靶点。 | NA | 揭示转化性皮肤T细胞淋巴瘤的基因组和单细胞层面的新驱动因素及治疗脆弱性。 | 56名转化性皮肤T细胞淋巴瘤患者的肿瘤生态系统。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫分析 | NA | 基因组数据、单细胞数据、免疫数据 | 70个皮肤活检样本,16个单细胞皮肤活检样本 |