单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3341 - 3360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3341 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of popliteal lymphatic vessels and peripheral veins reveals altered lymphatic muscle and immune cell populations in the TNF-Tg arthritis model
2022-03-07, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-022-02730-z
PMID:35255954
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了肿瘤坏死因子转基因（TNF-Tg）小鼠和类风湿关节炎（RA）患者的腘淋巴管（PLVs）中的淋巴肌肉细胞（LMCs）和免疫细胞的转录组变化 | 首次揭示了TNF-Tg模型中淋巴肌肉细胞和免疫细胞的转录组变化，并发现了与细胞死亡、吞噬细胞招募和关节炎症相关的功能基因组学变化 | 研究主要集中在TNF-Tg小鼠模型，未来需要进一步研究这些转录组变化对PLV功能和关节稳态的具体影响 | 探讨TNF-Tg模型中淋巴肌肉细胞和免疫细胞的转录组变化及其在炎症性侵蚀性关节炎发病机制中的潜在作用 | TNF-Tg小鼠的腘淋巴管和外周静脉中的淋巴肌肉细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8879个细胞 |
| 3342 | 2024-08-08 |
Heterogeneity induced GZMA-F2R communication inefficient impairs antitumor immunotherapy of PD-1 mAb through JAK2/STAT1 signal suppression in hepatocellular carcinoma
2022-03-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04654-7
PMID:35256589
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，在肝细胞癌（HCC）组织及其邻近组织中发现了31个细胞簇，并探讨了肿瘤细胞与细胞毒性细胞之间的相互作用及其对PD-1单克隆抗体免疫治疗效果的影响。 | 首次揭示了GZMA与F2R在肿瘤细胞与细胞毒性细胞间的相互作用，以及这种相互作用通过JAK2/STAT1信号通路的激活对肿瘤抑制和T细胞介导的肿瘤细胞杀伤的影响。 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的临床试验验证GZMA-F2R相互作用对PD-1单克隆抗体治疗效果的实际影响。 | 探讨肿瘤异质性对肝细胞癌免疫治疗和靶向药物抵抗的影响，特别是GZMA-F2R相互作用对PD-1单克隆抗体治疗效果的影响。 | 肝细胞癌（HCC）患者及其肿瘤组织。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 31个细胞簇 |
| 3343 | 2024-08-08 |
Protoplast Dissociation and Transcriptome Analysis Provides Insights to Salt Stress Response in Cotton
2022-Mar-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23052845
PMID:35269989
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研究论文 | 本研究开发了一种基于棉花根尖原生质体分离的单细胞RNA测序方法，并利用该方法研究了盐胁迫对棉花基因表达谱及其动态变化的影响 | 首次开发了基于棉花根尖原生质体分离的单细胞RNA测序方法，并揭示了盐胁迫下棉花根部的基因表达调控网络 | NA | 阐明棉花对盐胁迫的分子机制，培育耐盐新品种 | 棉花在盐胁迫下的基因表达和调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3391和2826个差异表达基因在盐处理样本前后原生质体分离中被鉴定 |
| 3344 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Heterogeneous Circulating Tumor Cell Subsets in Breast Cancer
2022-Mar-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051314
PMID:35267622
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了乳腺癌中异质性的循环肿瘤细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了乳腺癌中的循环肿瘤细胞亚群 | NA | 探索乳腺癌患者中循环肿瘤细胞的异质性及其在转移过程中的作用 | 乳腺癌中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 3345 | 2024-08-08 |
Genomic and Epigenomic Landscape of Juvenile Myelomonocytic Leukemia
2022-Mar-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051335
PMID:35267643
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研究论文 | 本文探讨了幼年型粒单核细胞白血病（JMML）的基因组和表观基因组特征 | 本文首次详细描述了JMML的基因组和表观基因组景观，并提出了基于DNA甲基化状态的国际JMML分层共识 | 对于JMML的起源、细胞身份以及肿瘤内和患者间的异质性了解仍然有限 | 深入理解驱动JMML疾病的分子机制 | 幼年型粒单核细胞白血病（JMML） | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和表观基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 3346 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Analysis in β-Thalassemia Using an HBB Gene-Knockout Human Erythroid Progenitor Cell Model
2022-Mar-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23052807
PMID:35269949
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研究论文 | 本研究通过HBB基因敲除的人类红系祖细胞模型，进行了β-地中海贫血的多组学分析 | 发现HBB-KO细胞中 的上调并非由H3K4me3介导的遗传补偿反应引起，并揭示了氧化应激对细胞周期和增殖的影响 | NA | 深入理解β-地中海贫血的基因调控网络，并提供新的临床见解 | β-地中海贫血的分子机制 | 数字病理学 | 地中海贫血 | 多组学分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组和磷酸化模式数据 | HUDEP2细胞系的HBB基因双敲除细胞 |
| 3347 | 2024-08-08 |
Identification of the Regulators of Epidermis Development under Drought- and Salt-Stressed Conditions by Single-Cell RNA-Seq
2022-Mar-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23052759
PMID:35269904
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了干旱和盐胁迫条件下叶片表皮细胞中基因的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了干旱和盐胁迫下表皮细胞发育的调控机制 | 对信号通路在植物响应环境胁迫中的具体机制理解仍有限 | 探究植物在干旱和盐胁迫下表皮细胞发育的分子机制 | 叶片表皮铺装细胞和保卫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及叶片表皮铺装细胞和保卫细胞 |
| 3348 | 2024-08-08 |
Evolutionary insights into primate skeletal gene regulation using a comparative cell culture model
2022-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010073
PMID:35263340
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研究论文 | 本文通过比较细胞培养模型研究了灵长类骨骼基因调控的进化 | 首次使用人类和黑猩猩的诱导多能干细胞分化为间充质干细胞和成骨细胞，进行单细胞RNA测序，以研究跨物种的基因表达差异 | 研究仅限于体外模型，未涉及实际的骨骼组织 | 探索灵长类骨骼特征进化的遗传和环境影响因素 | 人类和黑猩猩的诱导多能干细胞及其分化细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 超过100,000个细胞，来自六个人类和六个黑猩猩的诱导多能干细胞系 |
| 3349 | 2024-08-08 |
Epithelial GPR35 protects from Citrobacter rodentium infection by preserving goblet cells and mucosal barrier integrity
2022-03, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00494-y
PMID:35264769
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研究论文 | 本研究探讨了上皮细胞中的GPR35在维持杯状细胞功能和肠道黏膜屏障完整性中的作用，特别是在抵御Citrobacter rodentium感染中的重要性。 | 首次揭示了上皮细胞中的GPR35在维持杯状细胞功能和肠道黏膜屏障中的关键作用，并通过scRNA-seq分析阐明了其信号传导机制。 | 研究主要在老鼠模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探讨GPR35在肠道上皮细胞中的作用及其对杯状细胞功能和肠道健康的影响。 | 上皮细胞中的GPR35及其在杯状细胞功能和肠道微生物群共生中的作用。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 老鼠模型中的上皮细胞和巨噬细胞 |
| 3350 | 2024-08-08 |
Generation and network analysis of an RNA-seq transcriptional atlas for the rat
2022-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac017
PMID:35265836
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研究论文 | 本文通过整合和下载7700个大鼠RNA-seq数据集，生成一个全面的大鼠转录组图谱，并进行基因共表达网络分析 | 该研究揭示了特定组织或细胞类型限制的转录本簇，并发现了与生物过程相关的转录本富集簇，其中一些是这些数据独有的 | NA | 生成一个全面的大鼠转录组图谱，并进行基因共表达网络分析 | 大鼠的转录组数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 基因共表达网络 | 转录组数据 | 7700个大鼠RNA-seq数据集，涵盖585种大鼠组织和细胞 |
| 3351 | 2024-08-08 |
A copula based topology preserving graph convolution network for clustering of single-cell RNA-seq data
2022-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009600
PMID:35271564
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研究论文 | 本文介绍了一种基于copula的拓扑保持图卷积网络（sc-CGconv），用于单细胞RNA-seq数据的聚类 | sc-CGconv能够在较小的样本量下识别同质聚类，能够模拟大量基因的表达共变性，通过copula相关性度量构建细胞-细胞图来保持细胞间的变异性，并在低维空间中提供拓扑保持的细胞嵌入 | NA | 开发一种新的方法用于单细胞RNA-seq数据的聚类 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 图卷积网络 | CNN | 文本 | 较小样本量 |
| 3352 | 2024-08-08 |
Alevin-fry unlocks rapid, accurate and memory-frugal quantification of single-cell RNA-seq data
2022-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01408-3
PMID:35277707
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research paper | 本文介绍了alevin-fry框架，用于快速、准确且节省内存地量化单细胞和单核RNA测序数据 | alevin-fry框架比其他准确量化方法更快且更节省内存，同时改善了其他轻量级工具的内存可扩展性和假阳性表达问题 | NA | 开发新的计算方法以准确高效地量化单细胞和单核RNA测序数据 | 单细胞和单核RNA测序数据 | RNA测序 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 3353 | 2024-08-08 |
Metastatic Tumor Cell-Specific FABP7 Promotes NSCLC Metastasis via Inhibiting β-Catenin Degradation
2022-02-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11050805
PMID:35269427
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，发现脂肪酸结合蛋白7（FABP7）在转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤细胞中特异性上调，并可能作为不良预后的标志物。实验研究表明，FABP7促进了NSCLC细胞的转移能力，并通过抑制β-catenin的降解来激活Wnt信号通路。 | 本研究首次揭示了FABP7作为转移性肿瘤细胞特异性的促转移基因，并通过FABP7介导的细胞质β-catenin降解障碍，揭示了Wnt信号过度激活的新调控机制。 | NA | 探讨非小细胞肺癌转移的细胞特异性机制和关键分子。 | 非小细胞肺癌（NSCLC）细胞中的脂肪酸结合蛋白7（FABP7）及其对转移能力的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 转移性非小细胞肺癌患者的肿瘤细胞 |
| 3354 | 2024-08-08 |
Quantifying the Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT) from Bench to Bedside
2022-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051138
PMID:35267444
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综述 | 本文综述了上皮-间质转化（EMT）及其逆转过程在乳腺癌和其他实体瘤转移中的重要性，并讨论了将EMT生物学知识从实验室转移到临床的进展 | 文章介绍了多种检测和量化肿瘤中EMT状态的方法，包括免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞测序和多重肿瘤映射 | 目前尚未常规进行EMT状态的定义，以确定患者预后或指导临床治疗决策 | 探讨如何将EMT生物学知识从实验室转移到临床，并开发用于检测和测量患者肿瘤中EMT状态的诊断工具 | 上皮-间质转化（EMT）及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 图像 | NA |
| 3355 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance and Therapeutic Target of CXC Chemokines in the Microenvironment of Lung Adenocarcinoma
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S352511
PMID:35250303
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研究论文 | 研究分析了CXC趋化因子在肺腺癌微环境中的异常表达及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次明确了CXC趋化因子家族在肺腺癌中的差异表达模式、预后价值及具体机制 | NA | 探讨CXC趋化因子在肺腺癌中的表达模式及其对患者预后的影响 | CXC趋化因子在肺腺癌微环境中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 转录组表达谱数据分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TIMER和TCGA的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 3356 | 2024-08-08 |
The Dynamic Change of Immune Responses Between Acute and Recurrence Stages of Rodent Malaria Infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.844975
PMID:35250958
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research paper | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了啮齿动物疟疾感染急性期与复发期之间免疫反应的动态变化 | 首次揭示了急性期与复发期疟疾感染中免疫细胞类型和功能的差异，特别是适应性免疫反应与先天免疫反应在控制复发中的互补作用 | NA | 探讨疟疾感染急性期与复发期之间不同的免疫反应机制 | 啮齿动物疟疾感染中的免疫细胞及其功能 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 未明确提及具体样本数量 |
| 3357 | 2024-08-08 |
Increased Expression of Tim-3 Is Associated With Depletion of NKT Cells In SARS-CoV-2 Infection
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.796682
PMID:35250975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了Tim-3在SARS-CoV-2感染中对NKT细胞消耗的影响及其机制 | 首次揭示了Tim-3表达上调在COVID-19进展阶段导致NKT细胞消耗和功能障碍的新机制 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染中NKT细胞消耗的机制及其与疾病严重程度和预后的关系 | COVID-19患者中的NKT细胞和Tim-3表达 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个大型COVID-19患者队列 |
| 3358 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Peripheral Immune Responses in Anti-Synthetase Syndrome-Associated Interstitial Lung Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.804034
PMID:35250976
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了抗合成酶综合征相关间质性肺病的外周免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术描绘了抗合成酶综合征相关间质性肺病患者外周血单个核细胞的高分辨率细胞景观 | 样本量较小，仅包括5名患者和3名健康对照 | 旨在通过研究外周免疫反应，理解抗合成酶综合征相关间质性肺病的病理机制 | 抗合成酶综合征相关间质性肺病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名抗合成酶综合征相关间质性肺病患者和3名健康对照 |
| 3359 | 2024-08-08 |
Deciphering Cell-Type-Specific Gene Expression Signatures of Cardiac Diseases Through Reconstruction of Bulk Transcriptomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.792774
PMID:35252172
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研究论文 | 本研究通过计算重建大量转录组数据，揭示了心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征 | 利用CIBERSORTx技术对大量转录组数据进行细胞类型特异性的计算重建，揭示了心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征和信号通路 | 由于技术困难，心脏组织中进行单细胞RNA测序的研究仍然较少 | 揭示心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征，促进对其病理生理机制的理解 | 心脏疾病中的细胞类型特异性基因表达和信号通路 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CIBERSORTx | 转录组数据 | 110个样本来自12项研究，涵盖四种常见心脏疾病小鼠模型 |
| 3360 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Metabolic and Clinical Features of a Highly Malignant Cell Subpopulation in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.798165
PMID:35252177
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组技术探索了胰腺导管腺癌（PDAC）中高度恶性细胞亚群的代谢和临床特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别出PDAC中高度恶性的肿瘤细胞亚群，并揭示了其增强的糖酵解代谢特征 | NA | 揭示胰腺导管腺癌中高度恶性细胞亚群的代谢和临床特征 | 胰腺导管腺癌中的高度恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |