单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3321 - 3340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3321 | 2024-08-08 |
Recent advances in the developmental origin of neuroblastoma: an overview
2022-Mar-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02281-w
PMID:35277192
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综述 | 本文综述了神经母细胞瘤（NB）的发育起源及其复杂的表观遗传景观的最新进展 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了参与正常发育和NB癌变的神经嵴细胞后代，并发现了NB特异性调控回路，为设计针对NB遗传和表观遗传决定因素的创新疗法提供了新视角 | NA | 探讨神经母细胞瘤的发育起源及其表观遗传调控机制，以设计新的靶向治疗策略 | 神经母细胞瘤及其发育起源和表观遗传调控机制 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，染色质免疫沉淀测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3322 | 2024-08-08 |
Distinct outcomes, ABL1 mutation profile, and transcriptome features between p190 and p210 transcripts in adult Philadelphia-positive acute lymphoblastic leukemia in the TKI era
2022-Mar-11, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-022-00265-2
PMID:35277197
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研究论文 | 本研究探讨了在酪氨酸激酶抑制剂时代，费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病（Ph+ ALL）患者中p190和p210转录本的临床特征、治疗结果、ABL1突变谱和转录组特征的差异 | 首次系统研究了Ph+ ALL患者中p190和p210转录本的差异信号传导和治疗结果，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了两种转录本的转录组特征 | 研究样本量相对较小，且仅包括成人患者 | 探究Ph+ ALL患者中p190和p210转录本的临床特征、治疗结果、ABL1突变谱和转录组特征的差异 | 305名接受化疗加酪氨酸激酶抑制剂治疗的Ph+ ALL成年患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 305名患者 |
| 3323 | 2024-08-08 |
Fully-automated and ultra-fast cell-type identification using specific marker combinations from single-cell transcriptomic data
2022-03-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28803-w
PMID:35273156
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研究论文 | 本文开发了一种名为ScType的计算平台，用于基于scRNA-seq数据和细胞标记数据库实现全自动和超快速的细胞类型识别 | ScType平台能够提供无偏见且准确的细胞类型注释，确保正负标记基因在细胞簇和细胞类型中的特异性，并能区分健康和恶性细胞群体 | NA | 开发一种全自动和超快速的细胞类型识别方法 | 人类和小鼠组织的scRNA-seq数据 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | scRNA-seq数据 | 六个scRNA-seq数据集 |
| 3324 | 2024-08-08 |
A comprehensive temporal patterning gene network in Drosophila medulla neuroblasts revealed by single-cell RNA sequencing
2022-03-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28915-3
PMID:35273186
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了果蝇大脑神经母细胞中的全面时间模式基因网络 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了一系列先前未知的时间转录因子（TTFs），并实验验证了它们在时间模式和神经元特化中的作用 | NA | 揭示果蝇神经母细胞中时间模式基因网络的完整性和调控机制 | 果蝇大脑神经母细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 所有年龄段的果蝇大脑神经母细胞 |
| 3325 | 2024-08-08 |
Myoepithelial progenitors as founder cells of hyperplastic human breast lesions upon PIK3CA transformation
2022-03-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03161-x
PMID:35273332
|
研究论文 | 研究评估了人类乳腺中的肌上皮（MEP）前体细胞在PIK3CA致癌转化中的作用 | 通过单细胞RNA测序和多色成像技术，揭示了终端导管是具有导管MEP标记的细胞的最丰富来源，并提出了一个模型，其中空间分布的MEP前体细胞作为双相乳腺病变的发起细胞 | NA | 评估肌上皮前体细胞在PIK3CA致癌转化中的作用及其对乳腺病变的影响 | 人类乳腺中的肌上皮前体细胞及其在PIK3CA转化后的表现 | 数字病理学 | 乳腺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及多种标记的细胞样本 |
| 3326 | 2024-08-08 |
Selective pressure of endocrine therapy activates the integrated stress response through NFκB signaling in a subpopulation of ER positive breast cancer cells
2022-03-09, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-022-01515-1
PMID:35264224
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研究论文 | 本文研究了内分泌治疗对ER阳性乳腺癌细胞中NFκB信号通路和整合应激反应的影响 | 首次揭示了内分泌治疗通过NFκB信号激活整合应激反应，促进ER阳性乳腺癌细胞中NFκB阳性细胞群的生存和扩展 | 需要进一步研究如何针对NFκB和ISR信号的细胞群进行有效治疗 | 探讨乳腺癌细胞在内分泌治疗压力下的生存机制，以改善患者预后 | ER阳性乳腺癌细胞中的NFκB信号通路和整合应激反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序和生物信息学方法 | NA | RNA | 涉及乳腺癌细胞系和患者来源的模型 |
| 3327 | 2024-08-08 |
Uncovering the molecular identity of cardiosphere-derived cells (CDCs) by single-cell RNA sequencing
2022-03-08, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-022-00913-y
PMID:35258704
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究心脏来源细胞（CDCs）的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了CDCs的分子身份，并发现CXCL6作为CDCs的新特异性标记物 | 研究主要集中在体外实验和分子层面，未涉及CDCs在体内的长期效果和临床应用 | 探索心脏来源细胞（CDCs）的分子身份及其在疾病治疗中的潜在作用 | 心脏来源细胞（CDCs）及其与心脏非肌细胞和非造血细胞的比较 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNAseq） | NA | RNA序列数据 | 包括婴儿和成人的CDCs样本 |
| 3328 | 2024-08-08 |
Data mining of bulk and single-cell RNA sequencing introduces OBI1-AS1 as an astrocyte marker with possible role in glioma recurrence and progression
2022-03-08, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-022-01260-4
PMID:35260196
|
研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序数据挖掘，揭示了OBI1-AS1作为星形胶质细胞标记物在胶质瘤复发和进展中的潜在作用 | 首次发现OBI1-AS1作为星形胶质细胞的高度特异性标记物，并探讨了其在胶质瘤进展中的分子机制 | NA | 探索胶质瘤中差异表达的长非编码RNA（LncRNA），以揭示胶质瘤进展的分子机制 | OBI1-AS1在胶质瘤中的表达及其作为星形胶质细胞标记物的潜在作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序, ChIP-Seq, Hi-C, 甲基化测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 3329 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of the myometrium in human parturition
2022-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153921
PMID:35260533
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对人类分娩期间子宫肌层的细胞类型特异性转录组活动进行了全面研究 | 首次建立了人类子宫肌层的单细胞图谱，揭示了分娩过程中不同细胞类型的转录组活动变化 | NA | 探究人类分娩期间子宫肌层细胞的基础生物学过程 | 人类子宫肌层在自然分娩期间的细胞类型及其转录组活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 包括平滑肌细胞、单核细胞/巨噬细胞、基质细胞和内皮细胞等多种细胞类型 |
| 3330 | 2024-08-08 |
MQuad enables clonal substructure discovery using single cell mitochondrial variants
2022-03-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28845-0
PMID:35260582
|
research paper | 本文介绍了一种名为MQuad的开源计算工具，用于在单细胞RNA或DNA测序数据中准确识别克隆相关的线粒体DNA变异，并提供完整的克隆性推断分析套件。 | MQuad工具在识别线粒体变异方面具有高灵敏度和特异性，显著优于现有方法，并能广泛适用于不同的单细胞测序协议，补充单核苷酸和拷贝数变异以提取更精细的克隆分辨率。 | NA | 开发一种能够准确识别单细胞测序数据中线粒体DNA变异的计算工具，并进行克隆性推断。 | 单细胞RNA、DNA或ATAC测序数据中的线粒体DNA变异。 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing, single-cell DNA sequencing, ATAC sequencing | NA | sequencing data | 多种模拟和实验单细胞测序数据 |
| 3331 | 2024-08-08 |
Efficient prediction of a spatial transcriptomics profile better characterizes breast cancer tissue sections without costly experimentation
2022-03-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-07685-4
PMID:35260632
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research paper | 本文展示了一种深度学习模型DeepSpaCE，能够预测未测量区域和组织中的空间基因表达，从而增强生物学家对组织学解释的理解 | 开发了DeepSpaCE模型，能够使用未标记的组织学图像进行半监督学习，提高了连续组织切片中的插补准确性，适用于小样本量 | NA | 开发一种高效的方法来预测空间转录组学特征，以更好地表征乳腺癌组织切片，无需昂贵的实验 | 乳腺癌组织切片的空间转录组学特征 | digital pathology | breast cancer | spatial transcriptomics | Deep learning model | image | 连续的人类乳腺癌组织切片 |
| 3332 | 2024-08-08 |
A high-resolution view of intra-tumoral B cell immunity
2022-03-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.02.009
PMID:35263565
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研究论文 | 本文利用空间转录组学技术研究肿瘤内三级淋巴结构中的B细胞免疫 | 首次详细描述了B细胞在肿瘤内三级淋巴结构中的扩展、成熟为浆细胞、迁移路径及其产生的IgG抗体对癌细胞的作用 | NA | 探讨肿瘤内B细胞免疫的详细机制 | 肿瘤内三级淋巴结构中的B细胞 | 免疫学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3333 | 2024-08-08 |
TraSig: inferring cell-cell interactions from pseudotime ordering of scRNA-Seq data
2022-03-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02629-7
PMID:35255944
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TraSig的计算方法，用于利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据的动态信息改进细胞间相互作用的推断 | TraSig方法能够识别具有相似轨迹的重要配体-受体对，并用于评分相互作用的细胞集群，相较于先前的方法提供了更独特的预测 | NA | 改进scRNA-Seq研究中细胞间相互作用的推断 | scRNA-Seq数据中的细胞间相互作用 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个scRNA-Seq数据集 |
| 3334 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of popliteal lymphatic vessels and peripheral veins reveals altered lymphatic muscle and immune cell populations in the TNF-Tg arthritis model
2022-03-07, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-022-02730-z
PMID:35255954
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了肿瘤坏死因子转基因（TNF-Tg）小鼠和类风湿关节炎（RA）患者的腘淋巴管（PLVs）中的淋巴肌肉细胞（LMCs）和免疫细胞的转录组变化 | 首次揭示了TNF-Tg模型中淋巴肌肉细胞和免疫细胞的转录组变化，并发现了与细胞死亡、吞噬细胞招募和关节炎症相关的功能基因组学变化 | 研究主要集中在TNF-Tg小鼠模型，未来需要进一步研究这些转录组变化对PLV功能和关节稳态的具体影响 | 探讨TNF-Tg模型中淋巴肌肉细胞和免疫细胞的转录组变化及其在炎症性侵蚀性关节炎发病机制中的潜在作用 | TNF-Tg小鼠的腘淋巴管和外周静脉中的淋巴肌肉细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8879个细胞 |
| 3335 | 2024-08-08 |
Heterogeneity induced GZMA-F2R communication inefficient impairs antitumor immunotherapy of PD-1 mAb through JAK2/STAT1 signal suppression in hepatocellular carcinoma
2022-03-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04654-7
PMID:35256589
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，在肝细胞癌（HCC）组织及其邻近组织中发现了31个细胞簇，并探讨了肿瘤细胞与细胞毒性细胞之间的相互作用及其对PD-1单克隆抗体免疫治疗效果的影响。 | 首次揭示了GZMA与F2R在肿瘤细胞与细胞毒性细胞间的相互作用，以及这种相互作用通过JAK2/STAT1信号通路的激活对肿瘤抑制和T细胞介导的肿瘤细胞杀伤的影响。 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的临床试验验证GZMA-F2R相互作用对PD-1单克隆抗体治疗效果的实际影响。 | 探讨肿瘤异质性对肝细胞癌免疫治疗和靶向药物抵抗的影响，特别是GZMA-F2R相互作用对PD-1单克隆抗体治疗效果的影响。 | 肝细胞癌（HCC）患者及其肿瘤组织。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 31个细胞簇 |
| 3336 | 2024-08-08 |
Protoplast Dissociation and Transcriptome Analysis Provides Insights to Salt Stress Response in Cotton
2022-Mar-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23052845
PMID:35269989
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研究论文 | 本研究开发了一种基于棉花根尖原生质体分离的单细胞RNA测序方法，并利用该方法研究了盐胁迫对棉花基因表达谱及其动态变化的影响 | 首次开发了基于棉花根尖原生质体分离的单细胞RNA测序方法，并揭示了盐胁迫下棉花根部的基因表达调控网络 | NA | 阐明棉花对盐胁迫的分子机制，培育耐盐新品种 | 棉花在盐胁迫下的基因表达和调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3391和2826个差异表达基因在盐处理样本前后原生质体分离中被鉴定 |
| 3337 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Heterogeneous Circulating Tumor Cell Subsets in Breast Cancer
2022-Mar-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051314
PMID:35267622
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了乳腺癌中异质性的循环肿瘤细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了乳腺癌中的循环肿瘤细胞亚群 | NA | 探索乳腺癌患者中循环肿瘤细胞的异质性及其在转移过程中的作用 | 乳腺癌中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 3338 | 2024-08-08 |
Genomic and Epigenomic Landscape of Juvenile Myelomonocytic Leukemia
2022-Mar-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051335
PMID:35267643
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研究论文 | 本文探讨了幼年型粒单核细胞白血病（JMML）的基因组和表观基因组特征 | 本文首次详细描述了JMML的基因组和表观基因组景观，并提出了基于DNA甲基化状态的国际JMML分层共识 | 对于JMML的起源、细胞身份以及肿瘤内和患者间的异质性了解仍然有限 | 深入理解驱动JMML疾病的分子机制 | 幼年型粒单核细胞白血病（JMML） | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和表观基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 3339 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Analysis in β-Thalassemia Using an HBB Gene-Knockout Human Erythroid Progenitor Cell Model
2022-Mar-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23052807
PMID:35269949
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研究论文 | 本研究通过HBB基因敲除的人类红系祖细胞模型，进行了β-地中海贫血的多组学分析 | 发现HBB-KO细胞中 的上调并非由H3K4me3介导的遗传补偿反应引起，并揭示了氧化应激对细胞周期和增殖的影响 | NA | 深入理解β-地中海贫血的基因调控网络，并提供新的临床见解 | β-地中海贫血的分子机制 | 数字病理学 | 地中海贫血 | 多组学分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组和磷酸化模式数据 | HUDEP2细胞系的HBB基因双敲除细胞 |
| 3340 | 2024-08-08 |
Identification of the Regulators of Epidermis Development under Drought- and Salt-Stressed Conditions by Single-Cell RNA-Seq
2022-Mar-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23052759
PMID:35269904
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了干旱和盐胁迫条件下叶片表皮细胞中基因的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了干旱和盐胁迫下表皮细胞发育的调控机制 | 对信号通路在植物响应环境胁迫中的具体机制理解仍有限 | 探究植物在干旱和盐胁迫下表皮细胞发育的分子机制 | 叶片表皮铺装细胞和保卫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及叶片表皮铺装细胞和保卫细胞 |