单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3281 - 3300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3281 | 2024-08-08 |
Osteoclasts differential-related prognostic biomarker for osteosarcoma based on single cell, bulk cell and gene expression datasets
2022-Mar-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-09380-z
PMID:35300639
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研究论文 | 本研究分析了骨肉瘤中破骨细胞的分化状态及其预后意义，基于scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，识别了与破骨细胞分化相关的预后生物标志物，并开发了风险评分模型和临床适用的诺模图。 | 首次综合利用单细胞和批量细胞RNA测序数据，识别了破骨细胞分化相关的预后基因，并开发了风险评分模型和诺模图，为骨肉瘤的预后预测提供了新的工具。 | NA | 研究骨肉瘤中破骨细胞分化的预后意义，并开发相关的预后生物标志物和预测模型。 | 骨肉瘤中的破骨细胞分化状态及其预后生物标志物。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 661个破骨细胞分化相关基因 |
| 3282 | 2024-08-08 |
Homeostatic serum IgE is secreted by plasma cells in the thymus and enhances mast cell survival
2022-03-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29032-x
PMID:35301301
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研究论文 | 本文揭示了在稳态条件下，胸腺中的浆细胞分泌血清IgE并增强肥大细胞存活的现象 | 首次阐明了胸腺中浆细胞分泌IgE的来源及其发育过程，并展示了这些IgE如何调节肥大细胞的稳态 | NA | 研究稳态条件下IgE的来源及其对肥大细胞稳态的影响 | 胸腺中的浆细胞及其分泌的IgE | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3283 | 2024-08-08 |
Circulating Immune Bioenergetic, Metabolic, and Genetic Signatures Predict Melanoma Patients' Response to Anti-PD-1 Immune Checkpoint Blockade
2022-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3114
PMID:35284940
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研究论文 | 本文研究了循环免疫细胞的生物能量学和代谢组学特征，以及单细胞RNA测序结果，以预测黑色素瘤患者对PD-1免疫检查点抑制剂的反应 | 首次揭示了响应者和非响应者在治疗前的代谢特征差异，并通过单细胞RNA测序技术发现了与代谢变化相关的转录调控基因 | NA | 寻找预测黑色素瘤患者对PD-1免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | 黑色素瘤患者在接受PD-1免疫检查点抑制剂治疗前的循环免疫细胞和血浆代谢物 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物数据 | 多个黑色素瘤患者样本 |
| 3284 | 2024-08-08 |
Comprehensive evaluation of deconvolution methods for human brain gene expression
2022-03-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28655-4
PMID:35292647
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研究论文 | 本文对人类脑部基因表达数据的反卷积方法进行了全面评估 | 通过比较人类脑部、胰腺和心脏的数据，评估了八种反卷积方法和九种细胞类型标记的准确性 | NA | 评估人类脑部转录组数据的反卷积方法 | 人类脑部转录组数据的反卷积方法及其细胞组成估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 近2000个人类脑部样本 |
| 3285 | 2024-08-08 |
Targeting CD96 overcomes PD-1 blockade resistance by enhancing CD8+ TIL function in cervical cancer
2022-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003667
PMID:35288463
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研究论文 | 本文研究通过靶向CD96克服宫颈癌中PD-1阻断抵抗，增强CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能 | 发现CD96和PD-1共同负向调控CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能，CD96阻断与PD-1阻断联合使用有望治疗宫颈癌 | NA | 探索通过靶向CD96增强PD-1阻断疗法在宫颈癌治疗中的效果 | 宫颈癌患者、CD8+肿瘤浸润淋巴细胞、CD96表达 | 免疫学 | 宫颈癌 | 流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据 | 来自宫颈癌患者的血液样本、肿瘤标本及肿瘤周围组织 |
| 3286 | 2024-08-08 |
Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01018-x
PMID:35288709
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研究论文 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集，重建了小鼠胚胎发育过程中的细胞轨迹 | 构建了一个有向无环图（TOME），用于系统地提名转录因子作为每种细胞类型分化的候选调控因子，并识别跨脊椎动物进化的细胞类型同源性 | NA | 全面描绘哺乳动物体内发育的主要细胞轨迹 | 小鼠胚胎发育过程中的细胞轨迹 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 有向无环图（TOME） | RNA | 约150,000个核，来自胚胎第8.5天（E8.5）的胚胎 |
| 3287 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01262-w
PMID:35296821
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3288 | 2024-08-08 |
A multidimensional coding architecture of the vagal interoceptive system
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04515-5
PMID:35296859
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研究论文 | 本文展示了迷走感觉神经元（VSNs）如何通过多维编码架构来编码内脏器官、组织层和刺激模式这三个内感受信号的关键特征 | 首次揭示了VSNs通过多维编码架构来编码内感受信号的多个关键特征，包括内脏器官、组织层和刺激模式 | NA | 探讨迷走感觉神经元如何编码内感受信号的关键特征 | 迷走感觉神经元（VSNs）及其在内感受信号编码中的作用 | NA | NA | 多重投影条形码、钙成像引导的空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 来自小鼠七个主要器官的VSNs |
| 3289 | 2024-08-08 |
CBX3 is associated with metastasis and glutathione/glycosphingolipid metabolism in colon adenocarcinoma
2022-Feb, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-22-97
PMID:35284119
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研究论文 | 本研究探讨了CBX3在结肠腺癌转移中的作用及其与谷胱甘肽/糖神经鞘脂代谢的关系 | 揭示了CBX3在结肠腺癌转移中的高表达及其通过调节CCT6A、LSM5和GGCT等基因参与谷胱甘肽代谢的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序和TCGA数据库中的数据，可能需要更多临床样本验证 | 识别与结肠腺癌转移相关的关键基因失调，为发现潜在治疗靶点提供新策略 | 结肠腺癌的转移机制及CBX3的作用 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 17,469个肿瘤细胞来自23个样本，以及TCGA数据库中的326个结肠腺癌样本 |
| 3290 | 2024-08-08 |
Molecular Characteristics and Distribution of Adult Human Corneal Immune Cell Types
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798346
PMID:35280984
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成人角膜缘免疫细胞的分子特征和分布 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了角膜缘免疫细胞的转录组图谱 | 仅使用了三名健康捐赠者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 探究成人角膜缘免疫细胞的分子特征及其在免疫反应中的作用 | 成人角膜缘的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 804个从三名健康捐赠者角膜缘纯化的造血细胞 |
| 3291 | 2024-08-08 |
Identification of Distinct Immune Cell Subsets Associated With Asymptomatic Infection, Disease Severity, and Viral Persistence in COVID-19 Patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.812514
PMID:35281000
|
研究论文 | 通过scRNA-seq技术结合深度分析独特的细胞表面标记物和差异表达基因，研究了COVID-19患者中与无症状感染、疾病严重程度和病毒持续性相关的76种不同细胞亚群 | 揭示了特定免疫细胞亚群与COVID-19不同临床表现之间的关系，并识别了与疾病严重程度和病毒持续性相关的细胞类型 | NA | 探究SARS-CoV-2感染中的细胞介导保护性和致病性免疫反应 | COVID-19患者的PBMC样本中的免疫细胞亚群 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 76种不同的细胞亚群 |
| 3292 | 2024-08-08 |
Hemocyte Clusters Defined by scRNA-Seq in Bombyx mori: In Silico Analysis of Predicted Marker Genes and Implications for Potential Functional Roles
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.852702
PMID:35281044
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术分析了家蚕血细胞中的13个不同细胞簇，并讨论了这些细胞簇的标记基因及其潜在功能 | 采用scRNA-seq技术对家蚕血细胞进行高分辨率分析，揭示了血细胞亚型的分子复杂性和高度专业化功能 | 研究仅限于家蚕血细胞，尚未扩展到其他昆虫 | 通过scRNA-seq技术深入研究家蚕血细胞的亚型及其功能 | 家蚕血细胞及其亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 13个不同细胞簇的家蚕血细胞 |
| 3293 | 2024-08-08 |
A Systematic Evaluation of Supervised Machine Learning Algorithms for Cell Phenotype Classification Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.836798
PMID:35281805
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研究论文 | 本研究系统评估了13种流行的监督机器学习算法在不同大小的单细胞RNA测序数据集上进行细胞表型分类的性能 | 首次系统性地研究了不同大小的单细胞RNA测序数据集上监督机器学习算法的性能 | 集成算法并未显示出比单个机器学习方法显著的优势 | 评估监督机器学习算法在单细胞RNA测序数据上进行细胞表型分类的性能 | 13种流行的监督机器学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | ElasticNet, NaiveBayes, XGBoost, 线性判别分析 | 单细胞RNA测序数据 | 多种不同大小的真实和模拟数据集 |
| 3294 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Novel Genes Regulated by Hypoxia in the Lung Vasculature
2022, Journal of vascular research
IF:1.8Q3
DOI:10.1159/000522340
PMID:35294950
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，比较了暴露于低氧环境28天的野生型小鼠与正常氧环境对照小鼠的肺部细胞，以及缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞，揭示了低氧对肺血管基因表达和细胞表型的影响 | 研究发现低氧促进了肺部免疫和内皮细胞类型的细胞数量变化，激活了先天免疫途径，并在血管细胞中导致特定的基因表达变化 | 研究发现缺乏Notch3基因的小鼠与野生型对照小鼠在肺部细胞中的差异有限 | 研究低氧暴露对基因表达和细胞表型的影响 | 肺血管细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型小鼠和缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞 |
| 3295 | 2024-08-08 |
FAT10 is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Infiltrates in Skin Cutaneous Melanoma
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.805887
PMID:35300113
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研究论文 | 本研究探讨了FAT10在皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）中的表达及其与患者预后和肿瘤免疫浸润的关系 | 首次系统分析了FAT10在SKCM中的表达及其与肿瘤免疫浸润和患者预后的关联 | NA | 研究FAT10作为SKCM的预后生物标志物及其与免疫浸润的相关性 | FAT10在SKCM中的表达及其对患者预后和肿瘤免疫浸润的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Cancer Genome Atlas和Genotype-Tissue Expression数据进行泛癌分析，具体样本数量未详细说明 |
| 3296 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Heterogeneity of Mouse Mammary Gland Fibroblasts With Distinct Functions, Estrogen Responses, Differentiation Processes, and Crosstalks With Epithelium
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.850568
PMID:35300413
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了两种主要类型的小鼠乳腺成纤维细胞，并探讨了它们的功能特性、定位以及与雌激素的反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其与上皮细胞的相互作用 | 研究主要集中在小鼠乳腺成纤维细胞，未涉及其他细胞类型或更广泛的生物学背景 | 揭示小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其在乳腺组织中的功能和相互作用 | 小鼠乳腺成纤维细胞及其与上皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个小鼠乳腺成纤维细胞群体及公开数据集 |
| 3297 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Splicing Features of Adult Neural Stem Cells in the Subventricular Zone
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.822934
PMID:35300421
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了成年小鼠侧脑室下区神经干细胞的剪接特征 | 本研究发现单细胞RNA测序在揭示稀有剪接异构体方面优于群体水平的批量RNA测序，并揭示了静息干细胞、激活干细胞和神经母细胞中剪接变异体的高度异质性 | NA | 旨在深入理解神经发生区域重要细胞类型的单细胞剪接特征 | 成年小鼠侧脑室下区的神经干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28个单细胞 |
| 3298 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of the Chinese Tongue Sole (Cynoglossus semilaevis) Ovary Reveals Transcriptional Programs of Oogenesis in Fish
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.828124
PMID:35300429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了中国舌鳎卵巢中不同卵泡细胞类别的分子特征，揭示了鱼类卵子发生的转录程序。 | 首次揭示了中国舌鳎卵巢中卵子发生的细胞类型特异性机制，并发现了鱼类卵泡壁的细胞组成及关键转录因子。 | NA | 探索鱼类卵子发生的分子机制及其在鱼类繁殖和脊椎动物生殖系统进化中的作用。 | 中国舌鳎卵巢中的卵泡细胞及其分子特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 成年中国舌鳎卵巢中的多个卵泡细胞类别 |
| 3299 | 2024-08-08 |
Abnormal Changes of Monocyte Subsets in Patients With Sjögren's Syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864920
PMID:35309355
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了干燥综合征患者与对照组单核细胞亚群的转录组变化，并探索了与疾病发展相关的主要功能通路 | 发现了一种新的单核细胞亚群，该亚群在干燥综合征患者中表达增加，并确定了TNFSF10高表达单核细胞作为干燥综合征发病机制中的潜在关键因素 | NA | 研究干燥综合征患者中单核细胞亚群的变化及其转录组变化 | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 |
| 3300 | 2024-08-08 |
Construction and Validation of a Ferroptosis-Related Prognostic Signature for Melanoma Based on Single-Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.818457
PMID:35309911
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，构建并验证了一个与铁死亡相关的黑色素瘤预后标志物 | 首次发现并验证了与铁死亡相关的基因标志物在黑色素瘤预后中的重要性 | NA | 探索铁死亡相关基因与黑色素瘤患者预后的关联 | 黑色素瘤患者及铁死亡相关基因 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | COX比例风险回归分析 | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤细胞系和正常人表皮黑素细胞 |