单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3281 - 3300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3281 | 2024-08-08 |
CBX3 is associated with metastasis and glutathione/glycosphingolipid metabolism in colon adenocarcinoma
2022-Feb, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-22-97
PMID:35284119
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研究论文 | 本研究探讨了CBX3在结肠腺癌转移中的作用及其与谷胱甘肽/糖神经鞘脂代谢的关系 | 揭示了CBX3在结肠腺癌转移中的高表达及其通过调节CCT6A、LSM5和GGCT等基因参与谷胱甘肽代谢的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序和TCGA数据库中的数据，可能需要更多临床样本验证 | 识别与结肠腺癌转移相关的关键基因失调，为发现潜在治疗靶点提供新策略 | 结肠腺癌的转移机制及CBX3的作用 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 17,469个肿瘤细胞来自23个样本，以及TCGA数据库中的326个结肠腺癌样本 |
| 3282 | 2024-08-08 |
Molecular Characteristics and Distribution of Adult Human Corneal Immune Cell Types
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798346
PMID:35280984
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成人角膜缘免疫细胞的分子特征和分布 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了角膜缘免疫细胞的转录组图谱 | 仅使用了三名健康捐赠者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 探究成人角膜缘免疫细胞的分子特征及其在免疫反应中的作用 | 成人角膜缘的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 804个从三名健康捐赠者角膜缘纯化的造血细胞 |
| 3283 | 2024-08-08 |
Identification of Distinct Immune Cell Subsets Associated With Asymptomatic Infection, Disease Severity, and Viral Persistence in COVID-19 Patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.812514
PMID:35281000
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研究论文 | 通过scRNA-seq技术结合深度分析独特的细胞表面标记物和差异表达基因，研究了COVID-19患者中与无症状感染、疾病严重程度和病毒持续性相关的76种不同细胞亚群 | 揭示了特定免疫细胞亚群与COVID-19不同临床表现之间的关系，并识别了与疾病严重程度和病毒持续性相关的细胞类型 | NA | 探究SARS-CoV-2感染中的细胞介导保护性和致病性免疫反应 | COVID-19患者的PBMC样本中的免疫细胞亚群 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 76种不同的细胞亚群 |
| 3284 | 2024-08-08 |
Hemocyte Clusters Defined by scRNA-Seq in Bombyx mori: In Silico Analysis of Predicted Marker Genes and Implications for Potential Functional Roles
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.852702
PMID:35281044
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术分析了家蚕血细胞中的13个不同细胞簇，并讨论了这些细胞簇的标记基因及其潜在功能 | 采用scRNA-seq技术对家蚕血细胞进行高分辨率分析，揭示了血细胞亚型的分子复杂性和高度专业化功能 | 研究仅限于家蚕血细胞，尚未扩展到其他昆虫 | 通过scRNA-seq技术深入研究家蚕血细胞的亚型及其功能 | 家蚕血细胞及其亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 13个不同细胞簇的家蚕血细胞 |
| 3285 | 2024-08-08 |
A Systematic Evaluation of Supervised Machine Learning Algorithms for Cell Phenotype Classification Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.836798
PMID:35281805
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研究论文 | 本研究系统评估了13种流行的监督机器学习算法在不同大小的单细胞RNA测序数据集上进行细胞表型分类的性能 | 首次系统性地研究了不同大小的单细胞RNA测序数据集上监督机器学习算法的性能 | 集成算法并未显示出比单个机器学习方法显著的优势 | 评估监督机器学习算法在单细胞RNA测序数据上进行细胞表型分类的性能 | 13种流行的监督机器学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | ElasticNet, NaiveBayes, XGBoost, 线性判别分析 | 单细胞RNA测序数据 | 多种不同大小的真实和模拟数据集 |
| 3286 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Novel Genes Regulated by Hypoxia in the Lung Vasculature
2022, Journal of vascular research
IF:1.8Q3
DOI:10.1159/000522340
PMID:35294950
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，比较了暴露于低氧环境28天的野生型小鼠与正常氧环境对照小鼠的肺部细胞，以及缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞，揭示了低氧对肺血管基因表达和细胞表型的影响 | 研究发现低氧促进了肺部免疫和内皮细胞类型的细胞数量变化，激活了先天免疫途径，并在血管细胞中导致特定的基因表达变化 | 研究发现缺乏Notch3基因的小鼠与野生型对照小鼠在肺部细胞中的差异有限 | 研究低氧暴露对基因表达和细胞表型的影响 | 肺血管细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型小鼠和缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞 |
| 3287 | 2024-08-08 |
FAT10 is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Infiltrates in Skin Cutaneous Melanoma
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.805887
PMID:35300113
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研究论文 | 本研究探讨了FAT10在皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）中的表达及其与患者预后和肿瘤免疫浸润的关系 | 首次系统分析了FAT10在SKCM中的表达及其与肿瘤免疫浸润和患者预后的关联 | NA | 研究FAT10作为SKCM的预后生物标志物及其与免疫浸润的相关性 | FAT10在SKCM中的表达及其对患者预后和肿瘤免疫浸润的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Cancer Genome Atlas和Genotype-Tissue Expression数据进行泛癌分析，具体样本数量未详细说明 |
| 3288 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Heterogeneity of Mouse Mammary Gland Fibroblasts With Distinct Functions, Estrogen Responses, Differentiation Processes, and Crosstalks With Epithelium
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.850568
PMID:35300413
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了两种主要类型的小鼠乳腺成纤维细胞，并探讨了它们的功能特性、定位以及与雌激素的反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其与上皮细胞的相互作用 | 研究主要集中在小鼠乳腺成纤维细胞，未涉及其他细胞类型或更广泛的生物学背景 | 揭示小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其在乳腺组织中的功能和相互作用 | 小鼠乳腺成纤维细胞及其与上皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个小鼠乳腺成纤维细胞群体及公开数据集 |
| 3289 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Splicing Features of Adult Neural Stem Cells in the Subventricular Zone
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.822934
PMID:35300421
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了成年小鼠侧脑室下区神经干细胞的剪接特征 | 本研究发现单细胞RNA测序在揭示稀有剪接异构体方面优于群体水平的批量RNA测序，并揭示了静息干细胞、激活干细胞和神经母细胞中剪接变异体的高度异质性 | NA | 旨在深入理解神经发生区域重要细胞类型的单细胞剪接特征 | 成年小鼠侧脑室下区的神经干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28个单细胞 |
| 3290 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of the Chinese Tongue Sole (Cynoglossus semilaevis) Ovary Reveals Transcriptional Programs of Oogenesis in Fish
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.828124
PMID:35300429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了中国舌鳎卵巢中不同卵泡细胞类别的分子特征，揭示了鱼类卵子发生的转录程序。 | 首次揭示了中国舌鳎卵巢中卵子发生的细胞类型特异性机制，并发现了鱼类卵泡壁的细胞组成及关键转录因子。 | NA | 探索鱼类卵子发生的分子机制及其在鱼类繁殖和脊椎动物生殖系统进化中的作用。 | 中国舌鳎卵巢中的卵泡细胞及其分子特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 成年中国舌鳎卵巢中的多个卵泡细胞类别 |
| 3291 | 2024-08-08 |
Abnormal Changes of Monocyte Subsets in Patients With Sjögren's Syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864920
PMID:35309355
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了干燥综合征患者与对照组单核细胞亚群的转录组变化，并探索了与疾病发展相关的主要功能通路 | 发现了一种新的单核细胞亚群，该亚群在干燥综合征患者中表达增加，并确定了TNFSF10高表达单核细胞作为干燥综合征发病机制中的潜在关键因素 | NA | 研究干燥综合征患者中单核细胞亚群的变化及其转录组变化 | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 |
| 3292 | 2024-08-08 |
Construction and Validation of a Ferroptosis-Related Prognostic Signature for Melanoma Based on Single-Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.818457
PMID:35309911
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，构建并验证了一个与铁死亡相关的黑色素瘤预后标志物 | 首次发现并验证了与铁死亡相关的基因标志物在黑色素瘤预后中的重要性 | NA | 探索铁死亡相关基因与黑色素瘤患者预后的关联 | 黑色素瘤患者及铁死亡相关基因 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | COX比例风险回归分析 | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤细胞系和正常人表皮黑素细胞 |
| 3293 | 2024-08-08 |
Landscape of T Cells in NK-AML(M4/M5) Revealed by Single-Cell Sequencing
2022-10, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5A0721-396RR
PMID:35258858
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体（TCR）测序，揭示了正常核型急性髓系白血病（NK-AML）M4/M5亚型患者骨髓中T细胞的景观 | 首次通过单细胞测序技术详细描述了NK-AML患者中T细胞的基因表达特征和发育轨迹，特别是黏膜相关不变T细胞（MAITs）的优先富集和克隆扩增 | 研究样本仅包括5名NK-AML患者和1名正常供体，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 深入理解NK-AML患者的肿瘤浸润T细胞，为免疫治疗和改善患者预后提供依据 | NK-AML（M4/M5）患者的骨髓细胞及其T细胞 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体（TCR）测序 | NA | 基因表达数据，TCR数据 | 5名NK-AML（M4/M5）患者和1名正常供体 |
| 3294 | 2024-08-08 |
Effects of Immune Cells on Intestinal Stem Cells: Prospects for Therapeutic Targets
2022-10, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-022-10347-7
PMID:35279803
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综述 | 本文综述了免疫细胞对肠道干细胞（ISCs）的影响及其在免疫介导疾病治疗中的潜在应用 | 探讨了免疫细胞通过调节ISCs的凋亡或存活来影响肠道上皮完整性的机制，并提出了基于ISCs开发新型有效治疗策略的可能性 | NA | 探讨免疫细胞对肠道干细胞的影响及其在治疗免疫介导疾病中的潜在应用 | 肠道干细胞（ISCs）和免疫细胞 | NA | 炎症性肠病和移植物抗宿主病 | 肠道类器官培养系统和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3295 | 2024-08-08 |
Circulating immune cell landscape in patients who had mild ischaemic stroke
2022-08, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2021-001224
PMID:35264400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了轻度缺血性中风患者外周血单个核细胞（PBMCs）的转录组变化 | 首次基于转录组分析展示了轻度缺血性中风患者NK细胞数量增加和新单核细胞亚群的存在 | NA | 研究轻度缺血性中风后外周免疫反应的动态变化，以辅助诊断和潜在治疗开发 | 轻度缺血性中风患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名急性缺血性中风患者和9名种族、年龄、性别匹配的控制组 |
| 3296 | 2024-08-08 |
Transcriptional switch of hepatocytes initiates macrophage recruitment and T-cell suppression in endotoxemia
2022-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.02.028
PMID:35276271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了在败血症中，肝脏细胞群及其相互通信在免疫防御调节中的关键作用 | 发现了促炎性肝细胞亚群，并阐明了其在败血症中通过CCL2-CCR2相互作用招募巨噬细胞的关键作用 | NA | 探究肝脏细胞在急性系统性感染中的免疫防御调节作用 | 健康和败血症小鼠的单个肝细胞 | NA | 败血症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19,795个单个肝细胞 |
| 3297 | 2024-08-08 |
Kidney Development: Recent Insights from Technological Advances
2022-07-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00041.2021
PMID:35253460
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研究论文 | 本文探讨了新技术如单细胞转录组学和增强成像模式在理解胚胎肾脏发育复杂过程中的应用 | 引入单细胞转录组学和增强成像技术以深入研究肾脏发育 | NA | 探索肾脏发育的复杂过程 | 肾脏及其发育过程 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 3298 | 2024-08-08 |
Identification of immunosuppressive factors in retinoblastoma cell secretomes and aqueous humor from patients
2022-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5893
PMID:35254670
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研究论文 | 研究视网膜母细胞瘤微环境中的免疫抑制因子，分析肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用 | 首次在视网膜母细胞瘤中鉴定出高水平的免疫抑制因子EMMPRIN和MIF，并证实这些因子在肿瘤微环境中的作用 | 研究主要集中在细胞和分子水平，临床应用的直接证据有限 | 探讨视网膜母细胞瘤中的免疫抑制机制及其临床意义 | 视网膜母细胞瘤细胞的分泌物和患者房水中免疫抑制因子的鉴定 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 免疫组化分析，单细胞转录组分析，免疫测定 | NA | 组织样本，细胞培养，房水 | 23名患者样本，11种视网膜母细胞瘤细胞模型，超过20名视网膜母细胞瘤患者的房水样本 |
| 3299 | 2024-08-08 |
The single-cell transcriptional landscape of lung carcinoid tumors
2022-06-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33995
PMID:35262195
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了肺类癌肿瘤的细胞组成和单细胞基因表达谱 | 首次全面揭示了肺类癌肿瘤的细胞组成和单细胞基因表达特征，展示了其非炎症性和血管丰富的肿瘤微环境特性 | 仅使用了三个肺类癌肿瘤样本和正常肺组织进行研究，样本量较小 | 研究肺类癌肿瘤的细胞组成和单细胞基因表达特征 | 肺类癌肿瘤及其微环境中的细胞 | 数字病理学 | 肺类癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个肺类癌肿瘤样本和正常肺组织 |
| 3300 | 2024-08-08 |
Visualizing Cluster-specific Genes from Single-cell Transcriptomics Data Using Association Plots
2022-06-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167525
PMID:35271868
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方法——关联图（Association Plots），用于可视化单细胞转录组数据中的特定基因簇 | 提出了一种新的可视化方法——关联图，用于展示单细胞数据中特定基因簇的特征 | NA | 开发一种新的可视化工具，用于分析和展示单细胞转录组数据中的基因簇 | 单细胞转录组数据中的基因簇 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 使用了两组示例数据集，包括外周血单个核细胞数据和人类胎儿基因表达细胞图谱数据 |