单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3261 - 3280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3261 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq identification of four differentially expressed survival-related genes by a TARGET: Osteosarcoma database analysis
2022-06, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221080131
PMID:35285281
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了骨肉瘤数据库中的数据，识别了四种与生存相关的差异表达基因 | 揭示了骨肉瘤细胞的异质性和细胞类型依赖的差异表达基因，这些基因可能作为骨肉瘤的治疗靶点 | NA | 识别骨肉瘤中特异表达的关键差异表达基因，并探讨其在治疗中的潜在应用 | 骨肉瘤细胞及其差异表达基因 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自骨肉瘤肿瘤组织的九种不同细胞群体 |
| 3262 | 2024-08-08 |
Mapping the human kidney using single-cell genomics
2022-06, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-022-00553-4
PMID:35301441
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研究论文 | 本文利用单细胞基因组学和空间技术，深入研究了人类肾脏的细胞组成和时空相互作用，特别是在胎儿肾脏发育、健康成人肾脏细胞异质性以及肾脏疾病中的应用。 | 文章通过单细胞技术揭示了急性肾损伤、肾小球疾病和肾细胞癌中特定细胞类型的深入特征，为开发新的治疗和预后生物标志物提供了潜在可能。 | NA | 旨在通过单细胞基因组学技术，绘制人类肾脏的细胞图谱，以更好地理解发育中、健康和疾病状态下肾脏的细胞过程和相互作用。 | 人类肾脏的细胞组成、时空相互作用以及在肾脏疾病中的应用。 | 基因组学 | 肾脏疾病 | 单细胞技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3263 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mast cells in eosinophilic esophagitis reveals heterogeneity, local proliferation, and activation that persists in remission
2022-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.02.025
PMID:35304158
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对嗜酸性食管炎患者食管中的肥大细胞进行了全面的分子和空间特征分析 | 首次揭示了嗜酸性食管炎患者食管中肥大细胞的异质性、局部增殖和激活状态，即使在疾病缓解期也保持激活状态 | NA | 旨在对嗜酸性食管炎患者食管中的肥大细胞进行全面的分子和空间特征分析 | 嗜酸性食管炎患者食管中的肥大细胞 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | 39,562个单个食管细胞，其中约5%为肥大细胞 |
| 3264 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq identified the metabolic reprogramming of human colonic immune cells in different locations and disease states
2022-05-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.03.034
PMID:35303685
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了人类结肠不同区域和疾病状态下免疫细胞的代谢重编程机制 | 揭示了结肠不同区域和疾病状态下免疫细胞的代谢重编程模式，并提供了通过免疫代谢调节治疗溃疡性结肠炎的新见解 | NA | 研究人类结肠不同区域和疾病状态下免疫细胞的免疫代谢机制 | 人类结肠的免疫细胞，特别是巨噬细胞、CD8 T细胞和IgA浆细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3265 | 2024-08-08 |
Learning deep features and topological structure of cells for clustering of scRNA-sequencing data
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac068
PMID:35302164
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研究论文 | 提出了一种新的深度学习子空间聚类算法（scGDC），用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型聚类，该算法同时学习细胞的深度特征和拓扑结构 | scGDC通过引入自表示层扩展自编码器以提取细胞的深度特征，并学习细胞的亲和图，提供了一种更全面的方法来表征细胞类型的结构。此外，scGDC利用生成对抗学习将不同类型的细胞投影到不同的子空间，以更好地区分稀有细胞类型 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的噪声、高维度和极端稀疏性问题，提高算法的性能和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 自编码器，生成对抗网络 | 基因转录组数据 | 15个单细胞RNA测序数据集，细胞数量从56到63,103不等 |
| 3266 | 2024-08-08 |
The XRN1-regulated RNA helicase activity of YTHDC2 ensures mouse fertility independently of m6A recognition
2022-05-05, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.02.034
PMID:35305312
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研究论文 | 本文研究了YTHDC2蛋白在鼠类生殖中的作用，发现其RNA解旋酶活性而非m6A识别功能对维持鼠类生育能力至关重要。 | 首次揭示了YTHDC2的RNA解旋酶活性在哺乳动物生育中的关键作用，并发现其与XRN1酶的相互作用增强了这一活性。 | NA | 探讨YTHDC2蛋白在哺乳动物生殖中的分子功能及其对生育能力的影响。 | YTHDC2蛋白及其在鼠类生殖中的作用。 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | RNA | 涉及鼠类和斑马鱼的生殖细胞。 |
| 3267 | 2024-08-08 |
Human cerebral organoids reveal progenitor pathology in EML1-linked cortical malformation
2022-05-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202154027
PMID:35289477
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研究论文 | 本研究利用源自患者和基因编辑诱导多能干细胞的大脑类器官，探讨了由echinoderm microtubule-associated protein-like 1 (EML1)基因突变引起的复杂皮质发育畸形相关的病理生理变化。 | 首次使用大脑类器官模型来研究EML1突变引起的皮质发育畸形，揭示了异常神经祖细胞的起源及其分子机制。 | NA | 深入理解EML1突变引起的皮质发育畸形的分子基础。 | EML1突变对大脑皮质发育的影响及其病理生理机制。 | 数字病理学 | 皮质发育畸形 | 单细胞RNA测序 | 大脑类器官 | 细胞 | 源自患者和基因编辑诱导多能干细胞的大脑类器官 |
| 3268 | 2024-08-08 |
Osteocytes in bone aging: Advances, challenges, and future perspectives
2022-05, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2022.101608
PMID:35283289
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综述 | 本文综述了骨细胞在骨老化中的作用，包括其形态变化、分子机制以及在年龄相关骨丢失和骨质量下降中的作用 | 利用先进的RNA测序技术分析骨细胞转录组，识别了与骨老化相关的基因和信号通路，并探讨了单细胞RNA测序技术在骨细胞研究中的应用前景 | 骨细胞的详细分子机制仍不清楚 | 总结骨老化和骨细胞的特征，探讨骨细胞在年龄相关骨丢失中的机制，并提供研究骨细胞转录组面临的挑战及可能的解决方案 | 骨细胞及其在骨老化中的作用 | NA | 骨质疏松症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3269 | 2024-08-08 |
Krüppel-like factors in bone biology
2022-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2022.110308
PMID:35301064
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综述 | 本文综述了Krüppel样因子（KLF）家族在骨骼发育中的多种功能，包括其在干细胞维持和分化、细胞凋亡及细胞周期中的作用 | 本文填补了关于KLF家族在骨骼发育中作用的综述空白，并探讨了其在不同动物模型中的基因型-表型相关性 | NA | 旨在全面总结KLF家族在骨骼发育中的重要性及其通过不同信号通路的功能 | KLF家族在骨骼发育中的作用及其在软骨细胞和成骨细胞发育中的表观遗传调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用公开的小鼠后肢单细胞RNA测序数据 |
| 3270 | 2024-08-08 |
Linking the genotypes and phenotypes of cancer cells in heterogenous populations via real-time optical tagging and image analysis
2022-05, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00853-x
PMID:35301448
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研究论文 | 本文展示了一种定制的光学显微镜系统，结合快速自动图像分析和可见光激活染料，实现了对大型异质细胞群中特定功能细胞动态的筛选和选择性光标记，进而通过单细胞RNA测序技术，功能性注释了多种癌细胞的转录组特征，并识别了驱动侵袭性迁移和间质样形态的关键基因和通路。 | 本文创新性地结合了光学标记和单细胞RNA测序技术，无需依赖分子生物标志物，即可对稀有细胞亚群进行富集，并揭示功能表型背后的分子机制。 | NA | 旨在将癌细胞的基因型与表型联系起来，特别是在时间变化的表型变化方面，以揭示驱动肿瘤细胞亚群生长的分子机制。 | 研究对象包括MCF10A细胞、MDA-MB-231细胞和患者来源的头颈鳞状细胞癌。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 涉及多种癌细胞类型和患者来源的细胞样本 |
| 3271 | 2024-08-08 |
Understanding initiation and progression of hepatocellular carcinoma through single cell sequencing
2022-05, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2022.188720
PMID:35304295
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨肝细胞癌的发病机制、微环境及免疫逃逸 | 提供了对肿瘤微环境、癌症干细胞、循环肿瘤细胞及免疫细胞亚群的深入理解 | 讨论了单细胞RNA测序技术现有的局限性和改进方向 | 旨在通过单细胞RNA测序技术深化对肝细胞癌的理解，以推动个性化精准治疗 | 肝细胞癌的发病机制、微环境及免疫逃逸 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 3272 | 2024-08-08 |
Functional single-cell sequencing links dynamic phenotypes to their genotypes
2022-05, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00877-3
PMID:35304585
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3273 | 2024-08-08 |
A Bayesian method to cluster single-cell RNA sequencing data using copy number alterations
2022-04-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac143
PMID:35298589
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CONGAS的贝叶斯概率方法，用于通过独立测序的批量DNA和单细胞RNA测量来分阶段处理单细胞RNA测序数据，并识别具有亚克隆CNAs的单细胞集群及其RNA表达差异 | CONGAS方法利用批量DNA测序数据构建统计先验，无需正常参考，并借助GPU后端和变分推断实现快速扩展 | NA | 开发一种新方法来定义从测序分析中得出的癌症亚克隆的精确组成，并探索复杂的CNAs与其对癌症表型的影响之间的映射 | 单细胞RNA测序数据中的亚克隆CNAs和RNA表达差异 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯概率模型 | DNA和RNA数据 | 使用模拟数据和真实数据进行测试，包括来自10×和Smart-Seq测序的肿瘤数据 |
| 3274 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals distinct effector profiles of infiltrating T cells in lupus skin and kidney
2022-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156341
PMID:35290245
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，揭示了狼疮皮肤和肾脏中浸润T细胞的不同效应器特征。 | 首次在单细胞水平上详细分析了狼疮皮肤中T和NK细胞的转录组，并进行了跨组织的比较。 | NA | 研究狼疮皮肤和肾脏中浸润T细胞的表型和功能。 | 狼疮皮肤和肾脏中的T和NK细胞。 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自狼疮皮肤病变和非病变皮肤活检的T和NK细胞 |
| 3275 | 2024-08-08 |
The transcription factor Fli1 restricts the formation of memory precursor NK cells during viral infection
2022-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01150-0
PMID:35288713
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了转录因子Fli1在病毒感染期间限制记忆前体NK细胞形成中的作用 | 首次揭示了Fli1通过调控早期效应NK细胞的适应性，限制记忆前体NK细胞的形成 | NA | 探究NK细胞形成记忆细胞的分子机制 | 自然杀伤（NK）细胞及其在病毒感染后的记忆形成 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠细胞巨化病毒感染的小鼠样本 |
| 3276 | 2024-08-08 |
Cytochrome P450 26A1 regulates the clusters and killing activity of NK cells during the peri-implantation period
2022-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17269
PMID:35297206
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研究论文 | 本研究探讨了细胞色素P450 26A1（CYP26A1）在胚胎着床期对自然杀伤（NK）细胞亚群及其杀伤活性的影响 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）发现了子宫内四种NK细胞亚群，并揭示了CYP26A1敲降对这些亚群表达和杀伤活性的影响 | NA | 研究CYP26A1对NK细胞亚群及其杀伤活性的影响 | CYP26A1和NK细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 3277 | 2024-08-08 |
Hepatic stellate cells in physiology and pathology
2022-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP281061
PMID:35307840
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综述 | 本文综述了肝星状细胞（HSCs）在正常肝脏生理和病理过程中的多种关键功能 | 近期单细胞RNA测序研究证实了HSC激活涉及多种表型改变，并识别出独特的HSC群体 | NA | 强调HSCs的多种功能，并简述有助于深入研究HSCs在肝脏生理和病理中作用的最新遗传工具 | 肝星状细胞（HSCs） | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3278 | 2024-08-08 |
Ten-Eleven Translocation Ablation Impairs Cardiac Differentiation of Mouse Embryonic Stem Cells
2022-03-31, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxab017
PMID:35296897
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术生成单、双、三重Tet缺陷的小鼠胚胎干细胞（mESCs），并研究其向心肌祖细胞的分化 | 首次揭示了Tet1和Tet2缺失对mESC向心肌祖细胞分化的显著影响，并通过单细胞RNA测序分析了其机制 | NA | 探讨Ten-eleven Translocation（TET）双加氧酶介导的DNA甲基化氧化在调节胚胎干细胞分化中的作用 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs）及其向心肌祖细胞的分化 | 细胞生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单、双、三重Tet缺陷的小鼠胚胎干细胞（mESCs） |
| 3279 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals MYC targeting gene MAD2L1 is associated with prostate cancer bone metastasis tumor dormancy
2022-Mar-19, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-022-00991-z
PMID:35305591
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了MYC靶向基因MAD2L1与前列腺癌骨转移肿瘤休眠机制的关联 | 首次揭示了MYC靶向基因MAD2L1在前列腺癌骨转移肿瘤休眠机制中的潜在作用 | 研究仅基于小鼠模型和TCGA数据库中的数据，可能需要进一步的人体临床验证 | 研究前列腺癌骨转移中肿瘤细胞休眠的机制，以期为治疗和预防复发提供新策略 | 前列腺癌骨转移中的肿瘤细胞休眠机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq表达数据 | 378个差异表达基因，其中293个显著上调，85个显著下调 |
| 3280 | 2024-08-08 |
Allergic airway recall responses require IL-9 from resident memory CD4+ T cells
2022-03-18, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abg9296
PMID:35302861
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研究论文 | 本研究使用慢性过敏原暴露后无过敏原休息期的鼠模型，探讨了分泌IL-9的CD4 T细胞在过敏性气道回忆反应中的作用 | 首次明确指出IL-9分泌细胞具有驻留记忆T细胞表型，并且在过敏原回忆反应中起关键作用 | 研究仅限于鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨长期记忆细胞在过敏性气道回忆反应中的作用 | 分泌IL-9的CD4 T细胞及其在过敏性气道炎症中的作用 | NA | 哮喘 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 细胞 | 鼠模型 |