单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3261 - 3280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3261 | 2024-08-08 |
Krüppel-like factors in bone biology
2022-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2022.110308
PMID:35301064
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综述 | 本文综述了Krüppel样因子（KLF）家族在骨骼发育中的多种功能，包括其在干细胞维持和分化、细胞凋亡及细胞周期中的作用 | 本文填补了关于KLF家族在骨骼发育中作用的综述空白，并探讨了其在不同动物模型中的基因型-表型相关性 | NA | 旨在全面总结KLF家族在骨骼发育中的重要性及其通过不同信号通路的功能 | KLF家族在骨骼发育中的作用及其在软骨细胞和成骨细胞发育中的表观遗传调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用公开的小鼠后肢单细胞RNA测序数据 |
| 3262 | 2024-08-08 |
Linking the genotypes and phenotypes of cancer cells in heterogenous populations via real-time optical tagging and image analysis
2022-05, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00853-x
PMID:35301448
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研究论文 | 本文展示了一种定制的光学显微镜系统，结合快速自动图像分析和可见光激活染料，实现了对大型异质细胞群中特定功能细胞动态的筛选和选择性光标记，进而通过单细胞RNA测序技术，功能性注释了多种癌细胞的转录组特征，并识别了驱动侵袭性迁移和间质样形态的关键基因和通路。 | 本文创新性地结合了光学标记和单细胞RNA测序技术，无需依赖分子生物标志物，即可对稀有细胞亚群进行富集，并揭示功能表型背后的分子机制。 | NA | 旨在将癌细胞的基因型与表型联系起来，特别是在时间变化的表型变化方面，以揭示驱动肿瘤细胞亚群生长的分子机制。 | 研究对象包括MCF10A细胞、MDA-MB-231细胞和患者来源的头颈鳞状细胞癌。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 涉及多种癌细胞类型和患者来源的细胞样本 |
| 3263 | 2024-08-08 |
Understanding initiation and progression of hepatocellular carcinoma through single cell sequencing
2022-05, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2022.188720
PMID:35304295
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨肝细胞癌的发病机制、微环境及免疫逃逸 | 提供了对肿瘤微环境、癌症干细胞、循环肿瘤细胞及免疫细胞亚群的深入理解 | 讨论了单细胞RNA测序技术现有的局限性和改进方向 | 旨在通过单细胞RNA测序技术深化对肝细胞癌的理解，以推动个性化精准治疗 | 肝细胞癌的发病机制、微环境及免疫逃逸 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 3264 | 2024-08-08 |
Functional single-cell sequencing links dynamic phenotypes to their genotypes
2022-05, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00877-3
PMID:35304585
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3265 | 2024-08-08 |
A Bayesian method to cluster single-cell RNA sequencing data using copy number alterations
2022-04-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac143
PMID:35298589
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CONGAS的贝叶斯概率方法，用于通过独立测序的批量DNA和单细胞RNA测量来分阶段处理单细胞RNA测序数据，并识别具有亚克隆CNAs的单细胞集群及其RNA表达差异 | CONGAS方法利用批量DNA测序数据构建统计先验，无需正常参考，并借助GPU后端和变分推断实现快速扩展 | NA | 开发一种新方法来定义从测序分析中得出的癌症亚克隆的精确组成，并探索复杂的CNAs与其对癌症表型的影响之间的映射 | 单细胞RNA测序数据中的亚克隆CNAs和RNA表达差异 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯概率模型 | DNA和RNA数据 | 使用模拟数据和真实数据进行测试，包括来自10×和Smart-Seq测序的肿瘤数据 |
| 3266 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals distinct effector profiles of infiltrating T cells in lupus skin and kidney
2022-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156341
PMID:35290245
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，揭示了狼疮皮肤和肾脏中浸润T细胞的不同效应器特征。 | 首次在单细胞水平上详细分析了狼疮皮肤中T和NK细胞的转录组，并进行了跨组织的比较。 | NA | 研究狼疮皮肤和肾脏中浸润T细胞的表型和功能。 | 狼疮皮肤和肾脏中的T和NK细胞。 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自狼疮皮肤病变和非病变皮肤活检的T和NK细胞 |
| 3267 | 2024-08-08 |
The transcription factor Fli1 restricts the formation of memory precursor NK cells during viral infection
2022-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01150-0
PMID:35288713
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了转录因子Fli1在病毒感染期间限制记忆前体NK细胞形成中的作用 | 首次揭示了Fli1通过调控早期效应NK细胞的适应性，限制记忆前体NK细胞的形成 | NA | 探究NK细胞形成记忆细胞的分子机制 | 自然杀伤（NK）细胞及其在病毒感染后的记忆形成 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠细胞巨化病毒感染的小鼠样本 |
| 3268 | 2024-08-08 |
Cytochrome P450 26A1 regulates the clusters and killing activity of NK cells during the peri-implantation period
2022-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17269
PMID:35297206
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研究论文 | 本研究探讨了细胞色素P450 26A1（CYP26A1）在胚胎着床期对自然杀伤（NK）细胞亚群及其杀伤活性的影响 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）发现了子宫内四种NK细胞亚群，并揭示了CYP26A1敲降对这些亚群表达和杀伤活性的影响 | NA | 研究CYP26A1对NK细胞亚群及其杀伤活性的影响 | CYP26A1和NK细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 3269 | 2024-08-08 |
Hepatic stellate cells in physiology and pathology
2022-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP281061
PMID:35307840
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综述 | 本文综述了肝星状细胞（HSCs）在正常肝脏生理和病理过程中的多种关键功能 | 近期单细胞RNA测序研究证实了HSC激活涉及多种表型改变，并识别出独特的HSC群体 | NA | 强调HSCs的多种功能，并简述有助于深入研究HSCs在肝脏生理和病理中作用的最新遗传工具 | 肝星状细胞（HSCs） | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3270 | 2024-08-08 |
Ten-Eleven Translocation Ablation Impairs Cardiac Differentiation of Mouse Embryonic Stem Cells
2022-03-31, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxab017
PMID:35296897
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术生成单、双、三重Tet缺陷的小鼠胚胎干细胞（mESCs），并研究其向心肌祖细胞的分化 | 首次揭示了Tet1和Tet2缺失对mESC向心肌祖细胞分化的显著影响，并通过单细胞RNA测序分析了其机制 | NA | 探讨Ten-eleven Translocation（TET）双加氧酶介导的DNA甲基化氧化在调节胚胎干细胞分化中的作用 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs）及其向心肌祖细胞的分化 | 细胞生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单、双、三重Tet缺陷的小鼠胚胎干细胞（mESCs） |
| 3271 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals MYC targeting gene MAD2L1 is associated with prostate cancer bone metastasis tumor dormancy
2022-Mar-19, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-022-00991-z
PMID:35305591
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了MYC靶向基因MAD2L1与前列腺癌骨转移肿瘤休眠机制的关联 | 首次揭示了MYC靶向基因MAD2L1在前列腺癌骨转移肿瘤休眠机制中的潜在作用 | 研究仅基于小鼠模型和TCGA数据库中的数据，可能需要进一步的人体临床验证 | 研究前列腺癌骨转移中肿瘤细胞休眠的机制，以期为治疗和预防复发提供新策略 | 前列腺癌骨转移中的肿瘤细胞休眠机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq表达数据 | 378个差异表达基因，其中293个显著上调，85个显著下调 |
| 3272 | 2024-08-08 |
Allergic airway recall responses require IL-9 from resident memory CD4+ T cells
2022-03-18, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abg9296
PMID:35302861
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研究论文 | 本研究使用慢性过敏原暴露后无过敏原休息期的鼠模型，探讨了分泌IL-9的CD4 T细胞在过敏性气道回忆反应中的作用 | 首次明确指出IL-9分泌细胞具有驻留记忆T细胞表型，并且在过敏原回忆反应中起关键作用 | 研究仅限于鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨长期记忆细胞在过敏性气道回忆反应中的作用 | 分泌IL-9的CD4 T细胞及其在过敏性气道炎症中的作用 | NA | 哮喘 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 细胞 | 鼠模型 |
| 3273 | 2024-08-08 |
Osteoclasts differential-related prognostic biomarker for osteosarcoma based on single cell, bulk cell and gene expression datasets
2022-Mar-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-09380-z
PMID:35300639
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研究论文 | 本研究分析了骨肉瘤中破骨细胞的分化状态及其预后意义，基于scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，识别了与破骨细胞分化相关的预后生物标志物，并开发了风险评分模型和临床适用的诺模图。 | 首次综合利用单细胞和批量细胞RNA测序数据，识别了破骨细胞分化相关的预后基因，并开发了风险评分模型和诺模图，为骨肉瘤的预后预测提供了新的工具。 | NA | 研究骨肉瘤中破骨细胞分化的预后意义，并开发相关的预后生物标志物和预测模型。 | 骨肉瘤中的破骨细胞分化状态及其预后生物标志物。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 661个破骨细胞分化相关基因 |
| 3274 | 2024-08-08 |
Homeostatic serum IgE is secreted by plasma cells in the thymus and enhances mast cell survival
2022-03-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29032-x
PMID:35301301
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研究论文 | 本文揭示了在稳态条件下，胸腺中的浆细胞分泌血清IgE并增强肥大细胞存活的现象 | 首次阐明了胸腺中浆细胞分泌IgE的来源及其发育过程，并展示了这些IgE如何调节肥大细胞的稳态 | NA | 研究稳态条件下IgE的来源及其对肥大细胞稳态的影响 | 胸腺中的浆细胞及其分泌的IgE | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3275 | 2024-08-08 |
Circulating Immune Bioenergetic, Metabolic, and Genetic Signatures Predict Melanoma Patients' Response to Anti-PD-1 Immune Checkpoint Blockade
2022-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3114
PMID:35284940
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研究论文 | 本文研究了循环免疫细胞的生物能量学和代谢组学特征，以及单细胞RNA测序结果，以预测黑色素瘤患者对PD-1免疫检查点抑制剂的反应 | 首次揭示了响应者和非响应者在治疗前的代谢特征差异，并通过单细胞RNA测序技术发现了与代谢变化相关的转录调控基因 | NA | 寻找预测黑色素瘤患者对PD-1免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | 黑色素瘤患者在接受PD-1免疫检查点抑制剂治疗前的循环免疫细胞和血浆代谢物 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物数据 | 多个黑色素瘤患者样本 |
| 3276 | 2024-08-08 |
Comprehensive evaluation of deconvolution methods for human brain gene expression
2022-03-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28655-4
PMID:35292647
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研究论文 | 本文对人类脑部基因表达数据的反卷积方法进行了全面评估 | 通过比较人类脑部、胰腺和心脏的数据，评估了八种反卷积方法和九种细胞类型标记的准确性 | NA | 评估人类脑部转录组数据的反卷积方法 | 人类脑部转录组数据的反卷积方法及其细胞组成估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 近2000个人类脑部样本 |
| 3277 | 2024-08-08 |
Targeting CD96 overcomes PD-1 blockade resistance by enhancing CD8+ TIL function in cervical cancer
2022-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003667
PMID:35288463
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研究论文 | 本文研究通过靶向CD96克服宫颈癌中PD-1阻断抵抗，增强CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能 | 发现CD96和PD-1共同负向调控CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能，CD96阻断与PD-1阻断联合使用有望治疗宫颈癌 | NA | 探索通过靶向CD96增强PD-1阻断疗法在宫颈癌治疗中的效果 | 宫颈癌患者、CD8+肿瘤浸润淋巴细胞、CD96表达 | 免疫学 | 宫颈癌 | 流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据 | 来自宫颈癌患者的血液样本、肿瘤标本及肿瘤周围组织 |
| 3278 | 2024-08-08 |
Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01018-x
PMID:35288709
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研究论文 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集，重建了小鼠胚胎发育过程中的细胞轨迹 | 构建了一个有向无环图（TOME），用于系统地提名转录因子作为每种细胞类型分化的候选调控因子，并识别跨脊椎动物进化的细胞类型同源性 | NA | 全面描绘哺乳动物体内发育的主要细胞轨迹 | 小鼠胚胎发育过程中的细胞轨迹 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 有向无环图（TOME） | RNA | 约150,000个核，来自胚胎第8.5天（E8.5）的胚胎 |
| 3279 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01262-w
PMID:35296821
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3280 | 2024-08-08 |
A multidimensional coding architecture of the vagal interoceptive system
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04515-5
PMID:35296859
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研究论文 | 本文展示了迷走感觉神经元（VSNs）如何通过多维编码架构来编码内脏器官、组织层和刺激模式这三个内感受信号的关键特征 | 首次揭示了VSNs通过多维编码架构来编码内感受信号的多个关键特征，包括内脏器官、组织层和刺激模式 | NA | 探讨迷走感觉神经元如何编码内感受信号的关键特征 | 迷走感觉神经元（VSNs）及其在内感受信号编码中的作用 | NA | NA | 多重投影条形码、钙成像引导的空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 来自小鼠七个主要器官的VSNs |