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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3241 | 2024-08-08 |
Ciliated (FOXJ1+) Cells Display Reduced Ferritin Light Chain in the Airways of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Patients
2022-03-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11061031
PMID:35326483
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了特发性肺纤维化(IPF)患者和健康对照者的纤毛(FOXJ1+)细胞,发现IPF患者的纤毛细胞中铁蛋白轻链(FTL)下调 | 首次揭示了IPF患者纤毛细胞中铁蛋白轻链的下调,并提出这可能影响铁代谢 | 需要进一步的功能实验来验证铁蛋白轻链在IPF中的潜在作用 | 探究特发性肺纤维化患者纤毛细胞的功能变化及其机制 | 特发性肺纤维化患者的纤毛细胞和健康对照者的纤毛细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IPF患者和健康对照者的纤毛细胞 |
3242 | 2024-08-08 |
Applications of Single-Cell Sequencing Technology to the Enteric Nervous System
2022-03-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12030452
PMID:35327644
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肠神经系统中的应用 | 随着技术的发展和多组学技术的结合,单细胞测序技术在肠神经系统研究中的应用将变得更加普遍,并可能用于诊断测试和个性化治疗 | NA | 探讨单细胞测序技术在肠神经系统研究中的应用及其潜在的临床应用 | 肠神经系统的神经元和胶质细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | RNA表达、DNA序列、染色质结构、细胞表面抗原 | NA |
3243 | 2024-08-08 |
Cell Type-Specific Induction of Inflammation-Associated Genes in Crohn's Disease and Colorectal Cancer
2022-Mar-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063082
PMID:35328501
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了克罗恩病和结直肠癌中炎症相关基因在特定细胞类型中的诱导情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术,揭示了克罗恩病和结直肠癌中特定细胞类型对炎症相关基因的诱导作用 | 研究仅基于公开的单细胞RNA测序数据集,可能存在样本选择的偏差 | 识别与炎症性肠病相关的易感基因和细胞群体 | 克罗恩病和结直肠癌中的炎症相关基因及其在特定细胞类型中的表达 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的克罗恩病和结直肠癌单细胞RNA测序数据集 |
3244 | 2024-08-08 |
Glucose Metabolism and Aging of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2022-Mar-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063028
PMID:35328449
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研究论文 | 本文通过综合蛋白质组学和单细胞转录组学研究,探讨了人类造血干细胞和祖细胞(HSPC)衰老过程中的葡萄糖代谢变化 | 开发了一种根据葡萄糖摄取水平分离HSPC的方法,并发现高葡萄糖摄取子集与衰老相关的分子特征有关 | 缺乏特定的标记物来分离和收集衰老细胞,尤其是人类HSPC | 研究人类HSPC衰老过程中的分子变化 | 人类造血干细胞和祖细胞(HSPC) | NA | NA | 蛋白质组学,单细胞转录组学,基因集富集分析(GSEA) | NA | 蛋白质组学数据,转录组学数据 | NA |
3245 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics of Cancer Tissues
2022-Mar-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063042
PMID:35328458
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症组织分析中的应用及其与空间转录组学的结合 | 介绍了单细胞RNA测序技术与其他组学技术整合的新趋势,以及这种整合在肿瘤微环境研究中的应用前景 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用,以及如何通过这些技术提高对肿瘤微环境的理解 | 癌症组织及其细胞多样性和相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
3246 | 2024-08-08 |
Development and Regeneration of Muscle, Tendon, and Myotendinous Junctions in Striated Skeletal Muscle
2022-Mar-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063006
PMID:35328426
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研究论文 | 本文探讨了肌肉、肌腱及其连接处的发展和再生机制,特别是在老龄化人口中运动功能下降的背景下。 | 利用scRNA-seq技术揭示了肌纤维的存在,并提出成纤维细胞可能通过BMP依赖性方式转化为成肌细胞。 | 肌肉-肌腱-骨复合体的发展和再生机制尚未完全阐明,需要进一步研究。 | 研究肌肉、肌腱及其连接处的发展和再生机制,以及这些过程在运动功能维护中的作用。 | 肌肉、肌腱及其连接处的发展和再生机制。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
3247 | 2024-08-08 |
Spatial and single-cell transcriptome analysis reveals changes in gene expression in response to drug perturbation in rat kidney
2022-Feb-27, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsac007
PMID:35325072
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组分析,揭示了药物干扰下大鼠肾脏基因表达的变化,并构建了包含空间信息的大鼠肾细胞图谱 | 本研究首次结合空间和单细胞转录组分析,详细揭示了药物处理后大鼠肾脏中不同细胞类型的基因表达变化及其空间异质性 | NA | 探索药物干扰下大鼠肾脏基因表达的变化及其细胞和空间层面的机制 | 大鼠肾脏细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间和单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 大鼠肾脏样本 |
3248 | 2024-08-08 |
Development of a dynamic network biomarkers method and its application for detecting the tipping point of prior disease development
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.02.019
PMID:35317238
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综述 | 本文综述了动态网络生物标志物(DNB)方法的进展,该方法通过利用不同类型的转录组数据,能够识别与疾病进展关键时间点相关的表达特征的动态变化 | DNB方法能够识别癌症和其他疾病发展过程中潜在的生物标志物,这些标志物在正常和关键阶段之间表现出有限的分子谱变化 | NA | 探讨DNB方法在识别癌症和其他疾病发展过程中的应用,以及其在早期检测和干预中的潜力 | 癌症和其他疾病的发展过程 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | 动态网络生物标志物方法 | 转录组数据 | NA |
3249 | 2024-08-08 |
Analysis of transcribed sequences from young and mature zebrafish thrombocytes
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0264776
PMID:35320267
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和成熟斑马鱼血小板的转录序列,并比较了这两种细胞类型的转录组差异 | 首次进行了年轻和成熟斑马鱼血小板的比较转录组学研究,揭示了血小板成熟过程中的基因表达模式差异 | NA | 研究斑马鱼血小板功能和发育的机制,特别是血小板成熟过程中的基因表达差异 | 年轻和成熟斑马鱼血小板 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和成熟斑马鱼血小板中共表达9143个基因,其中年轻血小板特异表达397个基因,成熟血小板特异表达2153个基因 |
3250 | 2024-08-08 |
A regulator of G protein signaling 5 marked subpopulation of vascular smooth muscle cells is lost during vascular disease
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0265132
PMID:35320283
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了健康动脉中血管平滑肌细胞的亚群及其在血管重塑中的作用 | 首次揭示了表达G蛋白信号调节因子5的血管平滑肌细胞亚群在健康动脉中的存在及其在血管稳态中的作用 | NA | 探究血管平滑肌细胞亚群在健康动脉中的存在及其在血管疾病中的变化 | 血管平滑肌细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
3251 | 2024-08-08 |
TIGIT Blockade Exerts Synergistic Effects on Microwave Ablation Against Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.832230
PMID:35320940
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研究论文 | 本文研究了TIGIT阻断与微波消融(MWA)联合治疗结直肠癌(CRC)肝转移的效果。 | 首次证明了TIGIT阻断与MWA联合治疗在结直肠癌肝转移中的协同作用,并重塑了肿瘤微环境(TME)。 | NA | 探索TIGIT阻断与MWA联合治疗在结直肠癌肝转移中的治疗效果。 | 结直肠癌肝转移的小鼠模型。 | NA | 结直肠癌 | 微波消融(MWA)、流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
3252 | 2024-08-08 |
Inferring Cell-type-specific Genes of Lung Cancer Based on Deep Learning
2022, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习的方法,用于推断肺腺癌中特定细胞类型的基因表达 | 本文融合了图卷积网络(GCN)和卷积神经网络(CNN)来构建模型,以推断肺腺癌中8种细胞类型的特定基因 | 由于单细胞测序技术的不足,只能检测到一小部分基因表达 | 旨在充分探索不同细胞类型中所有基因的表达 | 肺腺癌中的特定细胞类型基因 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞测序技术 | GCN和CNN | 基因表达数据 | 大量细胞类型特异性基因的已知样本 |
3253 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of Refractory Celiac Disease Demonstrates Inter- and Intra-Patient Aberrant Cell Heterogeneity
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.03.005
PMID:35338007
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术探讨了难治性乳糜泻II型(RCDII)中异常细胞的异质性 | 采用高维单细胞技术揭示了RCDII中异常细胞的肿瘤间和肿瘤内异质性 | NA | 旨在通过单细胞技术表征RCDII中的固有和适应性免疫系统 | RCDII患者的肠道和血液样本 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名RCDII患者和6名健康对照者的样本 |
3254 | 2024-08-08 |
Are batch effects still relevant in the age of big data?
2022-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2022.02.005
PMID:35282901
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研究论文 | 本文探讨了在大数据时代批次效应(BEs)的相关性及其在新技术如单细胞RNA测序中的挑战 | 讨论了批次效应在传统数据集与新数据环境中的模型差异,并介绍了新的测量和缓解批次效应的方法 | 文章未明确指出具体的局限性 | 探讨批次效应在大数据时代的重要性及其管理复杂性 | 批次效应及其在生物技术数据分析中的影响 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物技术数据 | NA |
3255 | 2024-08-08 |
Interrogation of RDEB Epidermal Allografts after BMT Reveals Coexpression of Collagen VII and Keratin 15 with Proinflammatory Immune Cells and Fibroblasts
2022-09, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.034
PMID:35304249
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研究论文 | 研究探讨了接受骨髓移植后的隐性营养不良性大疱性表皮松解症(RDEB)患者表皮同种异体移植后的细胞表型,发现表皮同种异体移植细胞共表达胶原蛋白VII和角蛋白15,并揭示了潜在的炎症和纤维化表型。 | 首次描述了RDEB皮肤中未在健康人皮肤中发现的一种肌成纤维细胞群体,并发现表达促纤维化基因POSTN的炎症性纤维细胞,这可能与RDEB中常见的致命并发症鳞状细胞癌的发展有关。 | NA | 旨在确定负责持久愈合和皮肤完整性的表皮同种异体移植细胞的表型。 | 隐性营养不良性大疱性表皮松解症(RDEB)患者的表皮同种异体移植细胞。 | NA | 隐性营养不良性大疱性表皮松解症 | 单细胞RNA测序 | NA | 皮肤活检样本的RNA数据 | NA |
3256 | 2024-08-08 |
Intratumoral heterogeneity of MYC drives medulloblastoma metastasis and angiogenesis
2022-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac068
PMID:35307743
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研究论文 | 本研究探讨了MYC驱动的髓母细胞瘤细胞与非MYC驱动的髓母细胞瘤细胞之间的克隆间交流,并评估了这种交流对肿瘤转移和血管生成的影响。 | 研究发现MYC驱动的细胞释放的乳酸脱氢酶A促进转移性播种和生长,而非MYC驱动的细胞分泌的dickkopf WNT信号通路抑制剂3促进肿瘤血管生成,通过药物和遗传抑制LDHA可以显著抑制肿瘤细胞迁移。 | NA | 研究MYC驱动的髓母细胞瘤细胞与非MYC驱动的髓母细胞瘤细胞之间的克隆间交流的相关性及其对肿瘤进展的影响。 | 髓母细胞瘤细胞的克隆间交流及其对肿瘤转移和血管生成的影响。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 荧光原位杂交、单细胞转录组学、免疫组织化学、非靶向蛋白质组学、质谱法代谢物定量、HUVECs管形成试验、体内原位实验 | NA | 细胞 | NA |
3257 | 2024-08-08 |
A mouse model of the LEAP study reveals a role for CTLA-4 in preventing peanut allergy induced by environmental peanut exposure
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.02.024
PMID:35288169
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研究论文 | 本文通过建立模拟LEAP研究的小鼠模型,研究了环境花生暴露引发的花生过敏中CTLA-4的作用 | 首次在小鼠模型中验证了CTLA-4在预防由环境花生暴露引起的花生过敏中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 开发小鼠模型以模拟LEAP研究并探究其观察结果的潜在机制 | BALB/c小鼠及其对花生产品的免疫反应 | NA | 花生过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 成年BALB/c小鼠 |
3258 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profile of mouse skin undergoing antigen-driven allergic inflammation recapitulates findings in atopic dermatitis skin lesions
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.03.002
PMID:35300986
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了经抗原驱动的过敏性炎症的小鼠皮肤,并与特应性皮炎皮肤病变中的发现进行了比较 | 揭示了小鼠皮肤中与特应性皮炎皮肤病变相似的基因表达特征,并发现了可能参与过敏性皮肤炎症的新通路 | NA | 研究小鼠皮肤在抗原驱动过敏性炎症中的单细胞基因表达特征,并与人类特应性皮炎皮肤病变进行比较 | 小鼠皮肤细胞在抗原驱动过敏性炎症中的基因表达 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠皮肤细胞样本 |
3259 | 2024-08-08 |
Differential effects on natural killer cell production by membrane-bound cytokine stimulations
2022-07, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28086
PMID:35297033
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研究论文 | 本研究通过开发表达膜结合细胞因子的重组K562饲养细胞系,比较了不同细胞因子对NK细胞扩增的影响 | 发现41BBL在促进NK细胞扩增方面起主导作用,且不引起细胞耗竭;通过单细胞测序识别了由不同细胞因子诱导的NK细胞的不同亚群 | 41BBL刺激降低了NK细胞的总体细胞毒性活性 | 探讨细胞因子信号通路在NK细胞扩增和分化中的不同作用,以改进NK细胞处理设计,提高生产效率和产品质量 | NK细胞的扩增和分化 | 细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及不同细胞因子刺激的NK细胞 |
3260 | 2024-08-08 |
Base-edited cynomolgus monkeys mimic core symptoms of STXBP1 encephalopathy
2022-06-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.03.001
PMID:35283272
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研究论文 | 本文通过碱基编辑技术在体外受精胚胎中引入STXBP1 (R292H)突变,生成携带该突变的食蟹猴模型,以模拟STXBP1脑病的关键症状。 | 首次通过碱基编辑技术成功生成模拟STXBP1脑病的食蟹猴模型,为研究该疾病的发病机制和治疗方法提供了新的动物模型。 | 文章未详细说明模型的长期效果和治疗应用的具体进展。 | 研究STXBP1脑病的发病机制和治疗方法。 | 食蟹猴模型及其在STXBP1脑病研究中的应用。 | NA | 神经系统疾病 | 碱基编辑技术 | NA | 单细胞测序数据 | 文章未明确提及具体的样本数量。 |