单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3221 - 3240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3221 | 2024-08-08 |
R code and downstream analysis objects for the scRNA-seq atlas of normal and tumorigenic human breast tissue
2022-03-23, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01236-2
PMID:35322042
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研究论文 | 本文提供了大规模单细胞RNA表达图谱的R代码和下游分析对象，涵盖正常、癌前和肿瘤状态的人类乳腺组织 | 提供了质量过滤阈值、下游处理的R数据对象、完整的细胞注释和R代码，以重现所有分析 | NA | 理解乳腺及其周围微环境在不同状态下的细胞多样性，以洞察乳腺癌的发展 | 人类乳腺组织的单细胞RNA表达图谱 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞表达数据 | 近430,000个细胞，来自55名患者的69个不同的手术组织样本 |
| 3222 | 2024-08-08 |
Adipose-derived mesenchymal stem cells may reduce intestinal epithelial damage in ulcerative colitis by communicating with macrophages and blocking inflammatory pathways: an analysis in silico
2022-03-22, Aging
DOI:10.18632/aging.203964
PMID:35315792
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析，探讨了脂肪间充质干细胞通过与巨噬细胞交流阻断炎症途径，从而减轻溃疡性结肠炎中的肠道上皮损伤的可能性 | 利用单细胞测序技术和生物信息学分析，揭示了脂肪间充质干细胞与巨噬细胞之间的交流机制，及其在溃疡性结肠炎中的潜在治疗作用 | 研究主要基于计算模拟和生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探讨脂肪间充质干细胞在溃疡性结肠炎中的作用机制 | 脂肪间充质干细胞、巨噬细胞和肠道上皮细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 18个溃疡性结肠炎样本和12个健康对照样本，以及来自3名健康女性捐赠者的脂肪间充质干细胞 |
| 3223 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing analysis reveals MYH9 promotes renal cell carcinoma development and sunitinib resistance via AKT signaling pathway
2022-Mar-22, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-00933-6
PMID:35318312
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了透明细胞肾细胞癌组织及其邻近正常组织的基因表达，发现MYH9通过AKT信号通路促进肾细胞癌发展和舒尼替尼耐药性 | 首次揭示MYH9通过AKT信号通路在肾细胞癌发展和舒尼替尼耐药性中的作用，并提出MYH9作为肾细胞癌的新治疗靶点和预后预测因子 | NA | 探讨MYH9在透明细胞肾细胞癌中的作用及其对舒尼替尼治疗反应的影响 | 透明细胞肾细胞癌组织及其邻近正常组织的单细胞基因表达 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类透明细胞肾细胞癌组织及其邻近正常组织的单细胞 |
| 3224 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies potential cells of origin of MYC rhabdoid tumors
2022-03-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29152-4
PMID:35318328
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，确定了MYC横纹肌肉瘤的潜在细胞起源，并验证了DNA去甲基化药物在治疗这种疾病中的临床相关性。 | 首次通过单细胞分析确定了SHH和MYC亚组的横纹肌肉瘤的细胞起源，并验证了胚胎原始生殖细胞作为MYC横纹肌肉瘤的起源细胞。 | NA | 揭示横纹肌肉瘤的细胞起源并探索DNA甲基转移酶抑制剂的临床应用。 | 横纹肌肉瘤的细胞起源及治疗策略。 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了多种基因工程小鼠模型进行研究。 |
| 3225 | 2024-08-08 |
A 3D transcriptomics atlas of the mouse nose sheds light on the anatomical logic of smell
2022-03-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110547
PMID:35320714
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，创建了小鼠嗅粘膜的3D基因表达图谱，揭示了气味受体基因在嗅粘膜中的空间分布规律 | 首次通过3D转录组学图谱展示了小鼠嗅粘膜中气味受体基因及其相关基因的空间分布，为嗅觉的分子结构和逻辑提供了新的见解 | NA | 解析小鼠嗅粘膜的分子结构，并探讨其与嗅觉感知机制的关系 | 小鼠嗅粘膜中的气味受体基因及其空间分布 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠嗅粘膜样本 |
| 3226 | 2024-08-08 |
ZFP541 maintains the repression of pre-pachytene transcriptional programs and promotes male meiosis progression
2022-03-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110540
PMID:35320728
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研究论文 | 本文报道了ZFP541在维持中期双线期后DNA双链断裂（DSB）形成的抑制中的不可或缺作用，并通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序数据分析，揭示了ZFP541在双线期精母细胞中作为转录调控因子的功能。 | 首次揭示了ZFP541在双线期精母细胞中通过绑定到前期双线期基因的启动子，维持其抑制状态，从而确保减数分裂进程的新机制。 | NA | 探讨ZFP541在男性减数分裂进程中的生物学意义及其调控机制。 | ZFP541在小鼠中的功能及其对减数分裂进程的影响。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | RNA，染色质 | 小鼠中的Zfp541基因缺失样本 |
| 3227 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscapes of the otic neuronal lineage at multiple early embryonic ages
2022-03-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110542
PMID:35320729
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了小鼠内耳组织在三个胚胎发育阶段（E9.5、E11.5和E13.5）的转录组特征 | 研究首次详细揭示了早期胚胎发育阶段内耳神经发生的分子机制，并提出了一个普遍的级联分化轨迹 | NA | 探讨早期胚胎发育阶段内耳神经发生的分子机制 | 小鼠内耳的神经元前体细胞和分化中的前庭神经元及螺旋神经节神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三个胚胎发育阶段的小鼠内耳组织样本 |
| 3228 | 2024-08-08 |
CAISC: A software to integrate copy number variations and single nucleotide mutations for genetic heterogeneity profiling and subclone detection by single-cell RNA sequencing
2022-Mar-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04625-x
PMID:35313800
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研究论文 | 开发了一种名为CAISC的R包软件，用于通过单细胞RNA测序数据整合拷贝数变异和单核苷酸变异，以研究肿瘤内异质性和检测亚克隆群 | CAISC软件首次实现了在同一细胞中整合拷贝数变异和单核苷酸变异数据，提高了亚克隆识别和分配的准确性 | NA | 开发一种能够整合拷贝数变异和单核苷酸变异数据的软件，以提高肿瘤内异质性和亚克隆检测的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的拷贝数变异和单核苷酸变异 | 生物信息学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因型矩阵 | 涉及模拟数据和四个真实数据集 |
| 3229 | 2024-08-08 |
scINSIGHT for interpreting single-cell gene expression from biologically heterogeneous data
2022-03-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02649-3
PMID:35313930
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研究论文 | 本文提出了一种名为scINSIGHT的方法，用于从来自多种生物条件的异质单细胞样本中解释单细胞基因表达模式 | scINSIGHT能够学习不同生物条件下共同的或特定的基因表达模式，并识别跨单细胞样本的细胞身份和过程 | NA | 开发一种适用于异质单细胞样本的集成分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3230 | 2024-08-08 |
Spatiotemporal reprogramming of differentiated cells underlies regeneration and neoplasia in the intestinal epithelium
2022-03-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29165-z
PMID:35314700
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研究论文 | 本文探讨了哺乳动物肠道上皮在不同细胞毒性损伤后的再生能力及其潜在机制 | 本文首次鉴定了细胞周期依赖性激酶抑制剂p57作为肠道隐窝中静止细胞群的特异性标记，并揭示了这些细胞在正常条件下作为肠内分泌/簇细胞前体，在损伤后分化并充当条件性干细胞支持再生的能力 | NA | 研究肠道上皮细胞在损伤后的再生机制及其在肿瘤形成中的作用 | 肠道上皮细胞及其在再生和肿瘤形成中的角色 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3231 | 2024-08-08 |
Inferring Time-Lagged Causality Using the Derivative of Single-Cell Expression
2022-Mar-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063348
PMID:35328768
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研究论文 | 本研究提出了一种名为CITL的方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断时间滞后的因果关系 | CITL方法通过评估基因表达水平的变化与当前表达水平之间的条件独立性，来推断时间滞后的因果关系 | NA | 开发一种新方法来推断单细胞RNA测序数据中的时间滞后因果关系 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在真实数据中推断出878对时间滞后的因果关系 |
| 3232 | 2024-08-08 |
Emerging Roles of Airway Epithelial Cells in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-03-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11061050
PMID:35326501
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化（IPF）中气道上皮细胞的结构、功能和细胞类型组成的改变，并探讨了气道上皮细胞在IPF发病机制中的重要作用 | 本文基于最新的临床、高分辨率成像、遗传学和单细胞RNA测序数据，全面概述了气道上皮细胞在IPF发病机制中的遗传和机制证据 | NA | 探讨气道上皮细胞在特发性肺纤维化发病机制中的作用，并提出潜在的治疗途径 | 特发性肺纤维化（IPF）中的气道上皮细胞 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3233 | 2024-08-08 |
Ciliated (FOXJ1+) Cells Display Reduced Ferritin Light Chain in the Airways of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Patients
2022-03-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11061031
PMID:35326483
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了特发性肺纤维化（IPF）患者和健康对照者的纤毛（FOXJ1+）细胞，发现IPF患者的纤毛细胞中铁蛋白轻链（FTL）下调 | 首次揭示了IPF患者纤毛细胞中铁蛋白轻链的下调，并提出这可能影响铁代谢 | 需要进一步的功能实验来验证铁蛋白轻链在IPF中的潜在作用 | 探究特发性肺纤维化患者纤毛细胞的功能变化及其机制 | 特发性肺纤维化患者的纤毛细胞和健康对照者的纤毛细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IPF患者和健康对照者的纤毛细胞 |
| 3234 | 2024-08-08 |
Applications of Single-Cell Sequencing Technology to the Enteric Nervous System
2022-03-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12030452
PMID:35327644
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肠神经系统中的应用 | 随着技术的发展和多组学技术的结合，单细胞测序技术在肠神经系统研究中的应用将变得更加普遍，并可能用于诊断测试和个性化治疗 | NA | 探讨单细胞测序技术在肠神经系统研究中的应用及其潜在的临床应用 | 肠神经系统的神经元和胶质细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | RNA表达、DNA序列、染色质结构、细胞表面抗原 | NA |
| 3235 | 2024-08-08 |
Cell Type-Specific Induction of Inflammation-Associated Genes in Crohn's Disease and Colorectal Cancer
2022-Mar-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063082
PMID:35328501
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了克罗恩病和结直肠癌中炎症相关基因在特定细胞类型中的诱导情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了克罗恩病和结直肠癌中特定细胞类型对炎症相关基因的诱导作用 | 研究仅基于公开的单细胞RNA测序数据集，可能存在样本选择的偏差 | 识别与炎症性肠病相关的易感基因和细胞群体 | 克罗恩病和结直肠癌中的炎症相关基因及其在特定细胞类型中的表达 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的克罗恩病和结直肠癌单细胞RNA测序数据集 |
| 3236 | 2024-08-08 |
Glucose Metabolism and Aging of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2022-Mar-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063028
PMID:35328449
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研究论文 | 本文通过综合蛋白质组学和单细胞转录组学研究，探讨了人类造血干细胞和祖细胞（HSPC）衰老过程中的葡萄糖代谢变化 | 开发了一种根据葡萄糖摄取水平分离HSPC的方法，并发现高葡萄糖摄取子集与衰老相关的分子特征有关 | 缺乏特定的标记物来分离和收集衰老细胞，尤其是人类HSPC | 研究人类HSPC衰老过程中的分子变化 | 人类造血干细胞和祖细胞（HSPC） | NA | NA | 蛋白质组学，单细胞转录组学，基因集富集分析（GSEA） | NA | 蛋白质组学数据，转录组学数据 | NA |
| 3237 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics of Cancer Tissues
2022-Mar-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063042
PMID:35328458
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症组织分析中的应用及其与空间转录组学的结合 | 介绍了单细胞RNA测序技术与其他组学技术整合的新趋势，以及这种整合在肿瘤微环境研究中的应用前景 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用，以及如何通过这些技术提高对肿瘤微环境的理解 | 癌症组织及其细胞多样性和相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3238 | 2024-08-08 |
Development and Regeneration of Muscle, Tendon, and Myotendinous Junctions in Striated Skeletal Muscle
2022-Mar-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23063006
PMID:35328426
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研究论文 | 本文探讨了肌肉、肌腱及其连接处的发展和再生机制，特别是在老龄化人口中运动功能下降的背景下。 | 利用scRNA-seq技术揭示了肌纤维的存在，并提出成纤维细胞可能通过BMP依赖性方式转化为成肌细胞。 | 肌肉-肌腱-骨复合体的发展和再生机制尚未完全阐明，需要进一步研究。 | 研究肌肉、肌腱及其连接处的发展和再生机制，以及这些过程在运动功能维护中的作用。 | 肌肉、肌腱及其连接处的发展和再生机制。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3239 | 2024-08-08 |
Spatial and single-cell transcriptome analysis reveals changes in gene expression in response to drug perturbation in rat kidney
2022-Feb-27, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsac007
PMID:35325072
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组分析，揭示了药物干扰下大鼠肾脏基因表达的变化，并构建了包含空间信息的大鼠肾细胞图谱 | 本研究首次结合空间和单细胞转录组分析，详细揭示了药物处理后大鼠肾脏中不同细胞类型的基因表达变化及其空间异质性 | NA | 探索药物干扰下大鼠肾脏基因表达的变化及其细胞和空间层面的机制 | 大鼠肾脏细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间和单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 大鼠肾脏样本 |
| 3240 | 2024-08-08 |
Development of a dynamic network biomarkers method and its application for detecting the tipping point of prior disease development
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.02.019
PMID:35317238
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综述 | 本文综述了动态网络生物标志物（DNB）方法的进展，该方法通过利用不同类型的转录组数据，能够识别与疾病进展关键时间点相关的表达特征的动态变化 | DNB方法能够识别癌症和其他疾病发展过程中潜在的生物标志物，这些标志物在正常和关键阶段之间表现出有限的分子谱变化 | NA | 探讨DNB方法在识别癌症和其他疾病发展过程中的应用，以及其在早期检测和干预中的潜力 | 癌症和其他疾病的发展过程 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | 动态网络生物标志物方法 | 转录组数据 | NA |