单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3201 - 3220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3201 | 2024-08-08 |
Pseudo-Temporal Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Reveals Trans-Differentiation Potential of Greater Epithelial Ridge Cells Into Hair Cells During Postnatal Development of Cochlea in Rats
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.832813
PMID:35370544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了大鼠耳蜗基底膜在P1、P7和P14时期的基因表达图谱，揭示了耳蜗发育过程中大上皮嵴细胞向毛细胞的转分化潜力 | 首次通过单细胞轨迹分析揭示了大上皮嵴细胞的不同亚型在出生后能转分化为内毛细胞和外毛细胞 | NA | 阐明大上皮嵴细胞亚型向毛细胞转分化的关键调控基因和信号通路机制 | 大鼠耳蜗中的大上皮嵴细胞和毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠耳蜗基底膜在P1、P7和P14时期的细胞样本 |
| 3202 | 2024-08-08 |
Comparison of Lung-Homing Receptor Expression and Activation Profiles on NK Cell and T Cell Subsets in COVID-19 and Influenza
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.834862
PMID:35371005
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研究论文 | 本文比较了COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞亚群的肺归巢受体表达和激活特征 | 首次详细比较了COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞的肺归巢受体表达和激活特征 | NA | 研究COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞的肺归巢受体表达和激活特征 | COVID-19和流感患者的NK细胞和T细胞亚群 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 28色流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | NA |
| 3203 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Pediatric Coeliac Disease Patients Suggests Potential Pre-Seroconversion Markers
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.843086
PMID:35371081
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了儿童乳糜泻患者外周血单个核细胞的基因表达，以寻找潜在的早期诊断标志物 | 首次利用单细胞RNA测序技术在乳糜泻患者中识别出疾病发生前和发生时的基因和通路变化，为早期诊断提供了新的潜在标志物 | 研究样本量较小，且仅限于儿童乳糜泻患者，结果的普遍性和适用性有待进一步验证 | 寻找乳糜泻的早期诊断标志物，以预防广泛的绒毛萎缩和严重症状及并发症 | 儿童乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11名儿童乳糜泻患者和10名匹配的对照个体的外周血单个核细胞样本 |
| 3204 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and transcriptomic profiles during intrahepatic cholangiocarcinoma initiation and progression
2022-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32483
PMID:35340039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了肝内胆管癌（ICC）在不同阶段的转录组特征，揭示了细胞异质性和关键调节因子在ICC起始和进展中的作用 | 首次揭示了锌指蛋白Zmiz1和Ybx1作为核心转录因子在应激反应和ICC增殖亚型中的作用，并证实了纤维母细胞-内皮细胞相互作用促进ICC发展的机制 | NA | 旨在揭示肝内胆管癌的起源、细胞异质性和关键调节因子在ICC起始和进展中的作用 | 肝内胆管癌（ICC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了AKT/Notch细胞内域诱导的小鼠ICC组织样本，包括早期、中期和晚期阶段 |
| 3205 | 2024-08-08 |
Endothelial OCT4 is atheroprotective by preventing metabolic and phenotypic dysfunction
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac036
PMID:35325071
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研究论文 | 本文探讨了OCT4在血管内皮细胞中的保护作用及其机制 | 首次证明了OCT4在血管内皮细胞中具有保护性的代谢功能，并揭示了OCT4/ABCG2轴在维持内皮细胞代谢稳态中的作用 | NA | 研究OCT4在血管内皮细胞中的功能及其对动脉粥样硬化的影响 | 血管内皮细胞中的OCT4 | NA | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3206 | 2024-08-08 |
Spatial charting of single-cell transcriptomes in tissues
2022-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01233-1
PMID:35314812
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研究论文 | 本文开发了一种名为CellTrek的计算方法，结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，实现单细胞的空间映射 | CellTrek通过共同嵌入和度量学习方法，将单细胞转录组数据与空间信息相结合，实现了单细胞的空间映射 | NA | 开发一种能够结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的方法，以实现单细胞的空间映射 | 小鼠大脑和肾脏组织，以及两个原位导管癌组织 | 生物信息学 | 原位导管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 共同嵌入和度量学习 | 转录组数据 | 两个原位导管癌组织 |
| 3207 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of mouse lung reveal inflammatory memory neutrophils in allergic asthma
2022-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15286
PMID:35315082
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3208 | 2024-08-08 |
Gene expression changes following chronic antipsychotic exposure in single cells from mouse striatum
2022-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01509-7
PMID:35322200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了慢性抗精神病药物暴露对小鼠纹状体中单个细胞基因表达的影响 | 首次直接比较了抗精神病药物诱导的差异表达基因与精神分裂症相关基因的重叠，并强调了单细胞RNA测序在揭示抗精神病药物作用机制和与精神病基因组研究联系中的重要性 | NA | 探讨慢性抗精神病药物暴露对小鼠纹状体中单个细胞基因表达的影响，并比较这些差异表达基因与精神分裂症相关基因的重叠 | 小鼠纹状体中的单个细胞 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性C57BL/6J小鼠纹状体样本，分为接受典型抗精神病药物（氟哌啶醇）、非典型抗精神病药物（奥氮平）或安慰剂处理组 |
| 3209 | 2024-08-08 |
TWO-SIGMA-G: a new competitive gene set testing framework for scRNA-seq data accounting for inter-gene and cell-cell correlation
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac084
PMID:35325048
|
研究论文 | 本文提出了一个新的竞争性基因集测试框架TWO-SIGMA-G，用于处理scRNA-seq数据中的基因间和细胞间相关性 | TWO-SIGMA-G采用基于先前发布的TWO-SIGMA的混合效应回归模型，能够灵活处理复杂实验设计，考虑生物重复间的相关性，并适应scRNA-seq数据的分布，以提高统计推断的准确性。此外，TWO-SIGMA-G还采用了一种新颖的方法来调整基因集级别的基因间相关性（IGC），以控制集级别的假阳性率 | NA | 开发一种新的竞争性基因集测试框架，以提高scRNA-seq数据分析的准确性和效率 | scRNA-seq数据中的基因集测试 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 混合效应回归模型 | 基因表达数据 | 涉及两个数据集，分别用于分析HIV相关干扰素通路在小鼠异种移植模型和人类阿尔茨海默病进展相关通路 |
| 3210 | 2024-08-08 |
Key benefits of dexamethasone and antibody treatment in COVID-19 hamster models revealed by single-cell transcriptomics
2022-05-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.03.014
PMID:35339689
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析了地塞米松和抗SARS-CoV-2抗体在COVID-19仓鼠模型中的治疗效果 | 揭示了地塞米松和抗SARS-CoV-2抗体联合治疗在减少肺部病毒负担和抑制炎症反应中的协同效应 | 研究仅限于仓鼠模型，可能需要进一步的人体试验验证 | 更好地理解地塞米松和抗SARS-CoV-2抗体对COVID-19感染和宿主反应的影响 | COVID-19仓鼠模型中的肺部免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了两个COVID-19仓鼠模型 |
| 3211 | 2024-08-08 |
Genetic mosaicism in the human brain: from lineage tracing to neuropsychiatric disorders
2022-05, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-022-00572-x
PMID:35322263
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综述 | 本文综述了遗传嵌合现象在人脑中的研究进展，及其对神经发育和神经精神疾病的潜在影响 | 利用下一代和单细胞测序技术研究正常组织中的遗传嵌合现象，揭示了前所未有的克隆结构和生理学见解 | NA | 探讨遗传嵌合现象在人脑发育和疾病中的作用 | 人脑中的遗传嵌合现象及其对神经发育和神经精神疾病的影响 | NA | 自闭症谱系障碍 | 下一代测序技术，单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3212 | 2024-08-08 |
Kidney Decellularized Extracellular Matrix Enhanced the Vascularization and Maturation of Human Kidney Organoids
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202103526
PMID:35322595
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研究论文 | 本研究使用肾脏去细胞化细胞外基质（dECM）水凝胶培养由人多能干细胞（hPSCs）衍生的肾脏类器官，这些类器官具有广泛的血管网络和自身的内皮细胞 | 本研究首次报道了使用肾脏dECM水凝胶培养的肾脏类器官具有更成熟的肾小球发育模式，并且与人类肾脏的相似度更高 | NA | 研究旨在提高肾脏类器官的血管化和成熟度，以应用于疾病模型和再生医学 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 再生医学 | 肾脏疾病 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞转录组 | 使用α-半乳糖苷酶A（GLA）敲除的hPSCs生成的肾脏类器官 |
| 3213 | 2024-08-08 |
Correlation Imputation for Single-Cell RNA-seq
2022-05, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0403
PMID:35325552
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序数据中的相关性填补方法 | 提出了针对单细胞RNA测序数据的相关性填补技术 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据的完整性和分析准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3214 | 2024-08-08 |
Rapid identification of tumor-reactive T-cell receptors by RNA preamplification-based single-cell sequencing
2022-05, Journal of immunological methods
IF:1.6Q4
DOI:10.1016/j.jim.2022.113260
PMID:35331733
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研究论文 | 本研究通过在单细胞TCR测序中加入基于RNA的预扩增步骤，提出了一种快速且成本效益高的肿瘤反应性T细胞受体识别方法 | 本研究引入了一种基于RNA的预扩增步骤，减少了多重PCR扩增的轮次，并且cDNA产物来源于整个基因组的mRNA，而非仅基于多重引物的DNA预扩增的TCR mRNA | NA | 开发一种快速且成本效益高的测序策略，用于实体肿瘤的TCR-T疗法 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）中的肿瘤反应性T细胞受体（TCRs） | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | RNA | NA |
| 3215 | 2024-08-08 |
ARCANE-ROG: Algorithm for reconstruction of cancer evolution from single-cell data using robust graph learning
2022-05, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2022.104055
PMID:35337943
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研究论文 | 本文提出了一种基于鲁棒图学习的单细胞数据癌症进化重建算法ARCANE-ROG | ARCANE-ROG方法通过联合去噪和数据插补框架以及最小生成树算法，提高了从单细胞数据中推断克隆进化的性能 | NA | 旨在从单细胞数据中推断肿瘤细胞的克隆进化，以改善癌症患者的治疗反应和生存率 | 单细胞数据中的肿瘤细胞克隆进化 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序技术 | 图学习 | 单细胞数据 | 使用了模拟数据集和五个真实数据集进行验证 |
| 3216 | 2024-08-08 |
pRB-Depleted Pluripotent Stem Cell Retinal Organoids Recapitulate Cell State Transitions of Retinoblastoma Development and Suggest an Important Role for pRB in Retinal Cell Differentiation
2022-04-29, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szac008
PMID:35325233
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研究论文 | 本文通过建立两种疾病模型，研究了视网膜母细胞瘤（Rb）发展过程中的细胞状态转变，并探讨了pRB在视网膜细胞分化中的重要作用。 | 本文首次使用pRB耗竭的人胚胎干细胞系和患者特异性诱导多能干细胞系建立视网膜类器官模型，揭示了pRB在视网膜细胞分化中的关键作用，并发现了Rb样簇和新的细胞标记物。 | NA | 研究视网膜母细胞瘤发展过程中的细胞状态转变及其机制。 | 视网膜母细胞瘤的细胞状态转变和pRB在视网膜细胞分化中的作用。 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了pRB耗竭的人胚胎干细胞系和患者特异性诱导多能干细胞系。 |
| 3217 | 2024-08-08 |
One-step induction of photoreceptor-like cells from human iPSCs by delivering transcription factors
2022-Apr-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103987
PMID:35330684
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研究论文 | 本文开发了一种新方法，通过引入转录因子CRX和NEUROD1，从人类诱导多能干细胞（iPSCs）中一步诱导生成类似光感受器的细胞（iPRCs） | 该方法简化了光感受器细胞的分化过程，从多步骤减少到一步，并成功生成了表达光感受器标记的iPRCs | NA | 开发一种简化的方法来生成光感受器细胞，以促进相关研究和疾病模型及药物发现的应用 | 人类诱导多能干细胞（iPSCs）和光感受器细胞（PRCs） | 干细胞研究 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3218 | 2024-08-08 |
Coupling of angiogenesis and odontogenesis orchestrates tooth mineralization in mice
2022-04-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211789
PMID:35319724
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研究论文 | 本文通过建立一种成像技术，以单细胞分辨率可视化小鼠牙齿血管的三维结构，并结合单细胞RNA测序，揭示了血管生成与牙生成在牙齿矿化过程中的耦合机制。 | 本文首次鉴定了一种独特的内皮细胞亚型——牙周尖端样内皮细胞，这些细胞在牙生成过程中表现出高度的血管生成活性和可塑性，并通过代谢组学分析证实了这些血管在牙生成中的磷酸盐输送作用。 | NA | 揭示血管生成与牙生成在牙齿矿化过程中的耦合机制。 | 小鼠牙齿的血管结构及其在牙生成中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 单细胞水平 |
| 3219 | 2024-08-08 |
Markers of rejection of a lung allograft: state of the art
2022-04, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.2217/bmm-2021-1013
PMID:35315284
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综述 | 本文综述了用于发现肺移植排斥标志物的新兴和现有技术，包括表观遗传修饰和单细胞RNA测序 | 介绍了利用新技术如表观遗传修饰和单细胞RNA测序来发现新的生物标志物 | NA | 探讨早期诊断或预测慢性肺同种异体移植物功能障碍（CLAD）的生物标志物研究现状 | 肺移植排斥的生物标志物 | NA | 肺移植 | 表观遗传修饰、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3220 | 2024-08-08 |
New insights into Human Hematopoietic Stem and Progenitor Cells via Single-Cell Omics
2022-04, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-022-10330-2
PMID:35318612
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术深入研究了人类造血干细胞和祖细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序和多组学技术揭示了人类造血干细胞和祖细胞在发育过程中的不同分化路径，并发现了新的细胞群体 | NA | 探索造血干细胞和祖细胞在单细胞层面的广泛临床应用潜力 | 人类造血干细胞和祖细胞及其在疾病发展中的作用 | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序，多组学技术 | NA | 单细胞数据 | NA |