单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3181 - 3200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3181 | 2024-08-08 |
Metabolic Landscape of Bronchoalveolar Lavage Fluid in Coronavirus Disease 2019 at Single Cell Resolution
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.829760
PMID:35350779
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研究论文 | 本文通过重新分析单细胞RNA测序数据中的代谢相关基因谱，描绘了冠状病毒病2019患者支气管肺泡灌洗液免疫细胞的代谢景观，并阐明了可能导致COVID-19进展和细胞因子风暴的代谢重塑机制 | 本文首次揭示了COVID-19患者免疫细胞中增强的糖酵解是最重要的共同代谢特征，并识别了CCL2 T细胞、高SPP1表达的2组巨噬细胞和髓样树突状细胞是感染肺组织产生细胞因子风暴的主要贡献者 | NA | 阐明COVID-19患者免疫细胞的代谢特征及其在疾病进展和细胞因子风暴中的作用 | 冠状病毒病2019患者的支气管肺泡灌洗液免疫细胞 | 数字病理学 | 冠状病毒病2019 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3182 | 2024-08-08 |
Molecular Characterization of Differentiated-Resistance MSC Subclones by Single-Cell Transcriptomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.699144
PMID:35356283
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了间充质干细胞（MSCs）中分化抵抗亚克隆的分子特征及其在肿瘤发生中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了分化抵抗的间充质干细胞（DR-MSCs）与肿瘤启动细胞的相似性，并探讨了YAP1信号通路在其中的作用 | NA | 探讨间充质干细胞中分化抵抗亚克隆的分子机制及其在肿瘤发生中的作用 | 间充质干细胞（MSCs）的分化抵抗亚克隆 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 56个临床队列 |
| 3183 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed a 3-Gene Panel Predicted the Diagnosis and Prognosis of Thyroid Papillary Carcinoma and Associated With Tumor Immune Microenvironment
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.862313
PMID:35359404
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）筛选甲状腺乳头状癌（PTC）的预后相关基因，并基于TCGA-THCA数据构建诊断和预后模型，评估肿瘤免疫微环境与预后模型的关联。 | 本研究首次通过scRNA-seq技术筛选出与PTC预后相关的三个基因（FN1, CLU, ANXA1），并构建了基于这些基因的诊断和预后模型，同时探讨了肿瘤免疫微环境与预后模型的关联。 | 本研究主要基于公共数据库和TCGA-THCA数据进行分析，需要进一步的临床验证来证实模型的准确性和实用性。 | 筛选甲状腺乳头状癌的预后相关基因，构建诊断和预后模型，并评估肿瘤免疫微环境与预后模型的关联。 | 甲状腺乳头状癌（PTC）及其免疫微环境。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 20例肿瘤组织及相邻正常组织 |
| 3184 | 2024-08-08 |
Chicken Peripheral Blood Mononuclear Cells Response to Avian Leukosis Virus Subgroup J Infection Assessed by Single-Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.800618
PMID:35359721
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了感染禽白血病病毒J亚群的鸡外周血单个核细胞的反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了鸡外周血单个核细胞在禽白血病病毒J亚群感染后的细胞亚群及其分子和细胞特征 | NA | 旨在确定鸡外周血单个核细胞的亚群及其在禽白血病病毒J亚群感染后的特定分子和细胞特征 | 鸡外周血单个核细胞在禽白血病病毒J亚群感染后的反应 | 数字病理学 | 禽病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 感染和未感染禽白血病病毒J亚群的鸡的外周血单个核细胞 |
| 3185 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis Highlights the Immunosuppressive Role of TREM2+ Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.848367
PMID:35359989
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研究论文 | 本研究系统分析了人类肝细胞癌组织中的单细胞转录组，发现TREM2主要由肿瘤组织中富集的脂质相关巨噬细胞亚群表达，并探讨了其在肝细胞癌中的免疫抑制作用。 | 首次系统揭示了TREM2在肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用，并阐明了其与不良临床预后的关联。 | 研究主要基于单细胞转录组分析和免疫组化，未来需更多体内外实验验证TREM2 LAM-like细胞的具体功能和机制。 | 探讨TREM2信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对患者预后的影响。 | 肝细胞癌组织中的TREM2+巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个肝细胞癌患者组织的单细胞转录组数据 |
| 3186 | 2024-08-08 |
Dietary Fiber as a Counterbalance to Age-Related Microglial Cell Dysfunction
2022, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2022.835824
PMID:35360677
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研究论文 | 研究通过增加饮食纤维来预防或逆转与年龄相关的微胶质细胞功能障碍 | 首次探讨了饮食纤维中的菊粉对老年小鼠微胶质细胞功能的影响，并通过单细胞RNA测序和基因表达分析验证了其效果 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨饮食纤维对年龄相关微胶质细胞功能障碍的影响 | 成年和老年小鼠的微胶质细胞 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 成年和老年小鼠各若干只 |
| 3187 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Integration Analysis Reveals the Correlation Between Mesenchymal Stromal Cells and Fibroblasts
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.798331
PMID:35360851
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了间充质干细胞与成纤维细胞之间的相关性 | 首次通过单细胞转录组测序数据整合分析，揭示了间充质干细胞与成纤维细胞之间的细胞亚群差异及其分子机制 | 研究仅限于人类脐带和包皮间充质干细胞以及骨髓和脂肪间充质干细胞的数据，可能需要更多样本类型以验证结果的普适性 | 探究间充质干细胞与成纤维细胞之间的细胞亚群差异及其分子机制 | 人类脐带和包皮间充质干细胞以及骨髓和脂肪间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类脐带和包皮间充质干细胞以及骨髓和脂肪间充质干细胞的单细胞转录组数据 |
| 3188 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory in Liver Cirrhosis Predicts Hepatocellular Carcinoma Prognosis and Reveals Potential Biomarkers for Progression of Liver Cirrhosis to Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.858905
PMID:35360852
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研究论文 | 本研究利用单细胞分化轨迹分析探讨了肝硬化与肝细胞癌的相关性，并揭示了潜在的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析肝硬化细胞分化轨迹，预测肝细胞癌的预后，并构建了基于CD34和RAMP3的预后风险评分签名。 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚和数据异质性。 | 探索肝硬化进展为肝细胞癌的分子机制，并寻找潜在的预后生物标志物。 | 肝硬化和肝细胞癌的单细胞RNA测序数据及临床数据。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）和The Cancer Genome Atlas（TCGA）的肝硬化和肝细胞癌样本数据。 |
| 3189 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptome Sequencing of Zebrafish Testis Revealed Novel Spermatogenesis Marker Genes and Stronger Leydig-Germ Cell Paracrine Interactions
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.851719
PMID:35360857
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了斑马鱼睾丸中的14,315个单细胞，揭示了新的精子发生标记基因及Leydig细胞与生殖细胞间的强旁分泌相互作用 | 首次在斑马鱼中应用单细胞RNA测序技术研究睾丸细胞组成及其基因调控，并发现了数千个细胞类型特异性新标记基因 | NA | 研究斑马鱼精子发生过程及其在人类不孕研究中的应用潜力 | 斑马鱼睾丸中的单细胞及其转录组 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 14,315个来自成年雄性斑马鱼睾丸的单细胞 |
| 3190 | 2024-08-08 |
Identification of Prognosis Biomarkers for High-Grade Serous Ovarian Cancer Based on Stemness
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.861954
PMID:35360863
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA、UCSC Xena和GEO的批量RNA-Seq样本及单细胞RNA-Seq数据，识别高级别浆液性卵巢癌的干细胞标志物和生存相关标志物 | 采用新的分析流程结合批量RNA-Seq样本、mRNA表达型干细胞指数和单细胞数据，识别出171个关键基因和一种重要的癌症干细胞亚群 | NA | 探索卵巢癌中的干细胞群体并提供潜在的治疗建议 | 高级别浆液性卵巢癌 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 来自TCGA、UCSC Xena和GEO的癌症样本 |
| 3191 | 2024-08-08 |
A Multi-Omics Pan-Cancer Analysis of 4EBP1 in Cancer Prognosis and Cancer-Associated Fibroblasts Infiltration
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.845751
PMID:35360872
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了4EBP1 mRNA、4EBP1蛋白及其磷酸化形式在泛癌中的预后价值及其与癌症相关成纤维细胞（CAFs）浸润的关系 | 首次系统分析了4EBP1及其磷酸化形式在泛癌中的表达与预后关系，并探讨了其与CAFs浸润的关联 | 研究主要基于TCGA数据库，可能存在样本选择偏倚；实验验证仅通过免疫组化染色进行，未进行更深入的功能验证 | 探究4EBP1在泛癌中的预后价值及其与CAFs浸润的关系 | 4EBP1 mRNA、4EBP1蛋白及其磷酸化形式在多种癌症中的表达与预后 | 数字病理学 | 泛癌 | 多组学分析、单细胞测序、免疫组化染色 | NA | mRNA、蛋白 | 基于TCGA项目的多种癌症样本 |
| 3192 | 2024-08-08 |
Lactobacillus paracasei BD5115-Derived 2-Hydroxy-3-Methylbutyric Acid Promotes Intestinal Epithelial Cells Proliferation by Upregulating the MYC Signaling Pathway
2022, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2022.799053
PMID:35369066
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研究论文 | 本研究从人乳样本中分离出一株乳酸菌BD5115，并通过高脂饮食的小鼠模型证实其代谢物2-羟基-3-甲基丁酸促进肠道上皮细胞增殖，揭示了MAFF/MBP1相互作用介导的MYC信号通路调控机制。 | 本研究不仅筛选出一株能促进肠道上皮细胞增殖的菌株，还发现了一条新的信号通路，即MAFF/MBP1相互作用调控基因表达。 | 许多关于益生菌和益生元的研究仍局限于观察人体队列和动物表型，其分子机制有待进一步探索。 | 探索益生菌代谢物对健康的分子调控机制。 | 乳酸菌BD5115的代谢物及其对肠道上皮细胞增殖的影响。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 3193 | 2024-08-08 |
Pseudo-Temporal Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Reveals Trans-Differentiation Potential of Greater Epithelial Ridge Cells Into Hair Cells During Postnatal Development of Cochlea in Rats
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.832813
PMID:35370544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了大鼠耳蜗基底膜在P1、P7和P14时期的基因表达图谱，揭示了耳蜗发育过程中大上皮嵴细胞向毛细胞的转分化潜力 | 首次通过单细胞轨迹分析揭示了大上皮嵴细胞的不同亚型在出生后能转分化为内毛细胞和外毛细胞 | NA | 阐明大上皮嵴细胞亚型向毛细胞转分化的关键调控基因和信号通路机制 | 大鼠耳蜗中的大上皮嵴细胞和毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠耳蜗基底膜在P1、P7和P14时期的细胞样本 |
| 3194 | 2024-08-08 |
Comparison of Lung-Homing Receptor Expression and Activation Profiles on NK Cell and T Cell Subsets in COVID-19 and Influenza
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.834862
PMID:35371005
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研究论文 | 本文比较了COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞亚群的肺归巢受体表达和激活特征 | 首次详细比较了COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞的肺归巢受体表达和激活特征 | NA | 研究COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞的肺归巢受体表达和激活特征 | COVID-19和流感患者的NK细胞和T细胞亚群 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 28色流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | NA |
| 3195 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Pediatric Coeliac Disease Patients Suggests Potential Pre-Seroconversion Markers
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.843086
PMID:35371081
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了儿童乳糜泻患者外周血单个核细胞的基因表达，以寻找潜在的早期诊断标志物 | 首次利用单细胞RNA测序技术在乳糜泻患者中识别出疾病发生前和发生时的基因和通路变化，为早期诊断提供了新的潜在标志物 | 研究样本量较小，且仅限于儿童乳糜泻患者，结果的普遍性和适用性有待进一步验证 | 寻找乳糜泻的早期诊断标志物，以预防广泛的绒毛萎缩和严重症状及并发症 | 儿童乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11名儿童乳糜泻患者和10名匹配的对照个体的外周血单个核细胞样本 |
| 3196 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and transcriptomic profiles during intrahepatic cholangiocarcinoma initiation and progression
2022-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32483
PMID:35340039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了肝内胆管癌（ICC）在不同阶段的转录组特征，揭示了细胞异质性和关键调节因子在ICC起始和进展中的作用 | 首次揭示了锌指蛋白Zmiz1和Ybx1作为核心转录因子在应激反应和ICC增殖亚型中的作用，并证实了纤维母细胞-内皮细胞相互作用促进ICC发展的机制 | NA | 旨在揭示肝内胆管癌的起源、细胞异质性和关键调节因子在ICC起始和进展中的作用 | 肝内胆管癌（ICC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了AKT/Notch细胞内域诱导的小鼠ICC组织样本，包括早期、中期和晚期阶段 |
| 3197 | 2024-08-08 |
Endothelial OCT4 is atheroprotective by preventing metabolic and phenotypic dysfunction
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac036
PMID:35325071
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研究论文 | 本文探讨了OCT4在血管内皮细胞中的保护作用及其机制 | 首次证明了OCT4在血管内皮细胞中具有保护性的代谢功能，并揭示了OCT4/ABCG2轴在维持内皮细胞代谢稳态中的作用 | NA | 研究OCT4在血管内皮细胞中的功能及其对动脉粥样硬化的影响 | 血管内皮细胞中的OCT4 | NA | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3198 | 2024-08-08 |
Spatial charting of single-cell transcriptomes in tissues
2022-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01233-1
PMID:35314812
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研究论文 | 本文开发了一种名为CellTrek的计算方法，结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，实现单细胞的空间映射 | CellTrek通过共同嵌入和度量学习方法，将单细胞转录组数据与空间信息相结合，实现了单细胞的空间映射 | NA | 开发一种能够结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的方法，以实现单细胞的空间映射 | 小鼠大脑和肾脏组织，以及两个原位导管癌组织 | 生物信息学 | 原位导管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 共同嵌入和度量学习 | 转录组数据 | 两个原位导管癌组织 |
| 3199 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of mouse lung reveal inflammatory memory neutrophils in allergic asthma
2022-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15286
PMID:35315082
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3200 | 2024-08-08 |
Gene expression changes following chronic antipsychotic exposure in single cells from mouse striatum
2022-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01509-7
PMID:35322200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了慢性抗精神病药物暴露对小鼠纹状体中单个细胞基因表达的影响 | 首次直接比较了抗精神病药物诱导的差异表达基因与精神分裂症相关基因的重叠，并强调了单细胞RNA测序在揭示抗精神病药物作用机制和与精神病基因组研究联系中的重要性 | NA | 探讨慢性抗精神病药物暴露对小鼠纹状体中单个细胞基因表达的影响，并比较这些差异表达基因与精神分裂症相关基因的重叠 | 小鼠纹状体中的单个细胞 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性C57BL/6J小鼠纹状体样本，分为接受典型抗精神病药物（氟哌啶醇）、非典型抗精神病药物（奥氮平）或安慰剂处理组 |