单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3101 - 3120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3101 | 2024-08-08 |
Discovery of Novel Circulating Immune Complexes in Lupus Nephritis Using Immunoproteomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850015
PMID:35419005
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研究论文 | 本研究通过免疫蛋白质组学方法，发现并验证了系统性红斑狼疮肾炎（LN）中的新型循环免疫复合物（ICx）作为潜在生物标志物。 | 本研究首次通过蛋白质A/G磁珠或C1q包被板捕获LN血清中的ICx，并利用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）和单细胞RNA测序（scRNA Seq）数据库筛选出潜在的ICx标志物。 | NA | 发现系统性红斑狼疮肾炎（LN）中的新型循环免疫复合物（ICx）作为潜在生物标志物。 | 系统性红斑狼疮肾炎（LN）患者的血清样本。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS），单细胞RNA测序（scRNA Seq） | NA | 蛋白质 | 验证队列包括62名LN患者和21名健康对照（HC）。 |
| 3102 | 2024-08-08 |
Integrin α11β1 in tumor fibrosis: more than just another cancer-associated fibroblast biomarker?
2022-Dec, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-022-00673-3
PMID:35378690
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综述 | 本文综述了胶原蛋白结合整合素α11β1在癌症相关成纤维细胞（CAFs）中的作用，强调其在肿瘤微环境（TME）中调控胶原蛋白组装和基质重塑的核心角色。 | 提出α11β1不仅是另一个生物标志物，而且在TME中作为功能性胶原蛋白受体，对肿瘤生长和转移有重要影响。 | 需要在未来几年内验证这些转录组mRNA数据在蛋白质表达和组织分布水平上的有效性，并找到有用的蛋白质生物标志物试剂，以便在细胞水平上进行成纤维细胞分析。 | 重新评估整合素在癌症相关成纤维细胞中的作用，并探讨其在肿瘤生长和进展中的角色。 | 研究胶原蛋白结合整合素α11β1在癌症相关成纤维细胞中的作用及其对肿瘤微环境的影响。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类组织中的泛成纤维细胞系 |
| 3103 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Role of Pancreatic Secretome in COVID-19 Associated Multi-organ Dysfunctions
2022-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-022-00513-3
PMID:35394619
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了胰腺分泌蛋白在COVID-19相关多器官功能障碍中的作用 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染导致胰腺内分泌细胞表达谱向腺泡和导管细胞特异性表达谱转变，并发现多种上调的分泌蛋白与多器官疾病相关 | NA | 探究SARS-CoV-2感染引起的多器官功能障碍的机制 | 胰腺分泌蛋白在COVID-19相关多器官功能障碍中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 3104 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell type diversity of human prostate
2022-11, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.03.009
PMID:35395421
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析了四种人前列腺组织的细胞组成 | 首次鉴定出18种具有独特基因表达特征和特性的细胞类型，并发现其中一种上皮细胞群与免疫功能相关 | NA | 揭示人类前列腺中细胞类型的多样性及其在前列腺疾病和癌症发展中的作用 | 人类前列腺组织中的细胞类型及其在前列腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四种人前列腺组织 |
| 3105 | 2024-08-08 |
Decoding the annulus fibrosus cell atlas by scRNA-seq to develop an inducible composite hydrogel: A novel strategy for disc reconstruction
2022-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.01.040
PMID:35386822
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解码小鼠纤维环细胞图谱，并基于此开发了一种可诱导的复合水凝胶，用于纤维环重建 | 首次鉴定出一种新的纤维环细胞群体——类成纤维软骨细胞，这种细胞能合成I型和II型胶原蛋白，是纤维环重建的潜在功能细胞。此外，还开发了一种基于甲基丙烯酸化丝素蛋白和甲基丙烯酸化透明质酸的复合水凝胶，用于纤维环缺陷的重建 | NA | 研究纤维环细胞图谱，并开发一种新的纤维环重建策略 | 小鼠纤维环细胞及纤维环重建 | 数字病理学 | 脊椎疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠纤维环细胞 |
| 3106 | 2024-08-08 |
NFkB-signaling promotes glial reactivity and suppresses Müller glia-mediated neuron regeneration in the mammalian retina
2022-07, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24181
PMID:35388544
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研究论文 | 研究NFkB信号通路如何影响啮齿动物视网膜中胶质细胞对损伤的反应以及Müller胶质细胞向神经元的重编程 | 发现NFkB信号通路在损伤后在Müller胶质细胞中被激活，介导免疫细胞的积累，并抑制Müller胶质细胞的神经发生潜力 | NA | 识别调控Müller胶质细胞介导再生的细胞信号通路和基因调控网络 | Müller胶质细胞在哺乳动物视网膜中的神经元再生能力 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3107 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional diversity of neonatal umbilical cord blood immune cells reveals neonatal immune tolerance
2022-06-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.03.132
PMID:35381424
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）分析新生儿脐带血免疫细胞的转录多样性，揭示新生儿免疫耐受的机制 | 首次系统地分析了新生儿脐带血和成人外周血单个核细胞的组成和差异表达基因，为理解新生儿免疫耐受的潜在机制提供了宝贵资源 | NA | 探究新生儿免疫细胞与成人免疫细胞在基因表达调控上的差异，以及这些差异如何影响新生儿对感染的免疫反应 | 新生儿脐带血免疫细胞和成人外周血单个核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 新生儿脐带血核细胞和成人外周血单个核细胞 |
| 3108 | 2024-08-08 |
scGraph: a graph neural network-based approach to automatically identify cell types
2022-05-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac199
PMID:35394015
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研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络的自动细胞类型识别算法scGraph，利用基因相互作用关系提高细胞类型识别的性能 | scGraph通过图神经网络整合相互作用基因的信息，自动学习生物数据中的基因相互作用关系，并在细胞类型识别任务中优于八种比较方法 | NA | 开发一种新的算法用于从单细胞RNA测序数据中自动识别细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图神经网络 | 基因表达数据 | 数千个细胞 |
| 3109 | 2024-08-08 |
SPCS: a spatial and pattern combined smoothing method for spatial transcriptomic expression
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac116
PMID:35380614
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研究论文 | 本文介绍了一种新的双因素平滑技术——空间和模式组合平滑（SPCS），该技术利用k-最近邻（kNN）技术结合转录组和空间关系信息，以提高空间转录组表达数据的可解释性 | SPCS方法创新性地结合了转录组空间和模式信息，相较于传统的单因素平滑方法，能更有效地利用空间转录组数据 | NA | 开发一种新的平滑技术以提高空间转录组表达数据的可解释性 | 胰腺导管腺癌（PDAC）、背外侧前额叶皮层（DLPFC）和模拟的高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）数据集 | 空间转录组学 | 胰腺癌、卵巢癌 | 空间转录组学 | k-最近邻（kNN） | 转录组数据 | 多个空间转录组数据集 |
| 3110 | 2024-08-08 |
MTD: a unique pipeline for host and meta-transcriptome joint and integrative analyses of RNA-seq data
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac111
PMID:35380623
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研究论文 | 本文开发了一种名为MTD的软件管道，用于全面协同分析和关联单个样本中的宿主和元转录组，使用批量和单细胞RNA-seq数据 | MTD是首个能够系统性分析宿主-微生物相互作用，同时量化宿主和元转录组的工具，适用于组织和单细胞水平 | NA | 开发一种方便的工具，用于系统性分析宿主-微生物相互作用，同时量化宿主和元转录组 | 宿主和元转录组的联合和综合分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 单个样本 |
| 3111 | 2024-08-08 |
Parkinson's disease motor symptoms rescue by CRISPRa-reprogramming astrocytes into GABAergic neurons
2022-05-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202114797
PMID:35373464
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研究论文 | 本文通过CRISPRa技术将星形胶质细胞重编程为GABA能神经元，以缓解帕金森病的运动症状 | 开发了一种敲入小鼠模型，携带双dCas9转录激活系统，以及一种基于AAV的策略，携带intein-split-dCas9与激活剂结合，成功将纹状体星形胶质细胞重编程为GABA能神经元 | NA | 探索通过基因重编程技术治疗帕金森病的新策略 | 帕金森病的运动症状 | 神经科学 | 帕金森病 | CRISPRa, AAV | NA | 单细胞转录组 | 使用6-OHDA帕金森病模型小鼠进行实验 |
| 3112 | 2024-08-08 |
Uncompensated mitochondrial oxidative stress underlies heart failure in an iPSC-derived model of congenital heart disease
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.03.003
PMID:35395180
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研究论文 | 本研究使用诱导多能干细胞衍生的心肌细胞模型，探讨了先天性心脏病中的左心发育不良综合征（HLHS）早期心力衰竭的原因 | 首次揭示了HLHS中早期心力衰竭与线粒体氧化应激和内质网应激的关联，并展示了通过药物干预改善这些病理状态的可能性 | 研究主要基于细胞模型，尚未在临床上验证这些发现的有效性 | 探索先天性心脏病中早期心力衰竭的生物学机制，并评估潜在的治疗策略 | 先天性心脏病患者来源的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 来自HLHS患者和非早期心力衰竭患者的iPSC-CM |
| 3113 | 2024-08-08 |
Replicative history marks transcriptional and functional disparity in the CD8+ T cell memory pool
2022-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01171-9
PMID:35393592
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研究论文 | 本文通过开发一种名为DivisionRecorder的遗传追踪方法，研究了CD8+ T细胞记忆库中复制历史与转录和功能差异之间的关系。 | 首次证明了低度分裂的T细胞表现出与干细胞相关的基因表达丰富，处于相对静止状态，并且在激活后引发增殖回忆反应的能力更强。 | NA | 探讨复制历史与CD8记忆T细胞亚群形成之间的关系。 | CD8+ T细胞记忆库中的复制历史与转录和功能差异。 | 免疫学 | NA | 遗传追踪方法，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同CD8 T细胞群体 |
| 3114 | 2024-08-08 |
Human iPS cell-derived cartilaginous tissue spatially and functionally replaces nucleus pulposus
2022-05, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文展示了人诱导多能干细胞衍生的软骨组织（hiPS-Cart）能够空间上和功能上替代失去的髓核（NP），从而恢复椎间盘的功能 | 首次证明hiPS-Cart能够有效替代失去的NP，并防止椎间盘退化 | 植入后的hiPS-Cart细胞仅发展为软骨样NP细胞，未发展为脊索样NP细胞 | 研究hiPS-Cart在替代失去的NP和防止椎间盘退化中的作用 | 人诱导多能干细胞衍生的软骨组织（hiPS-Cart）及其在椎间盘中的应用 | 再生医学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 在裸鼠中进行了植入实验，具体样本数量未详细说明 |
| 3115 | 2024-08-08 |
Correction to 'STRIDE: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing'
2022-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac254
PMID:35390158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3116 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies a migratory keratinocyte subpopulation expressing THBS1 in epidermal wound healing
2022-Apr-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104130
PMID:35391830
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现并验证了在表皮伤口愈合过程中表达THBS1的迁移性角质形成细胞亚群。 | 首次发现LPA通过RHO/ROCK-SRF信号通路诱导表达THBS1的角质形成细胞亚群分化，并揭示了THBS1在角质形成细胞迁移中的作用。 | NA | 探究角质形成细胞分化及其在表皮伤口愈合中的作用机制。 | 人类角质形成细胞及小鼠伤口皮肤中的角质形成细胞亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类角质形成细胞和小鼠伤口皮肤样本 |
| 3117 | 2024-08-08 |
Single cell enhancer activity distinguishes GABAergic and cholinergic lineages in embryonic mouse basal ganglia
2022-04-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2108760119
PMID:35377797
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研究论文 | 本研究结合增强子标记和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，在胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中区分和描绘神经元谱系的特化过程 | 本研究展示了scRNA-seq与基于增强子的标记相结合，解析小鼠大脑发育中复杂的神经元特化路径的能力 | NA | 本研究旨在描绘和区分胚胎期小鼠基底神经节的神经元谱系特化过程 | 研究对象包括小鼠胚胎期的内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的神经元谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的多个神经元群体 |
| 3118 | 2024-08-08 |
Single-cell eQTL mapping identifies cell type-specific genetic control of autoimmune disease
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf3041
PMID:35389779
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞，识别了细胞类型特异性的cis-eQTL和trans-eQTL，并探讨了这些eQTL在自身免疫疾病中的作用 | 首次结合遗传流行病学与单细胞RNA测序技术，揭示了免疫系统中个体间变异的主要驱动因素 | NA | 研究细胞类型特异性的遗传调控对自身免疫疾病的影响 | 外周血单个核细胞的基因表达及其在自身免疫疾病中的作用 | 遗传学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞 |
| 3119 | 2024-08-08 |
Population genetics meets single-cell sequencing
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abq0426
PMID:35389792
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在理解人类疾病遗传基础中的应用 | 结合群体遗传学与单细胞测序技术，探索疾病的遗传机制 | NA | 研究单细胞测序技术在揭示人类疾病遗传基础中的作用 | 人类疾病的遗传基础 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 3120 | 2024-08-08 |
Intranasal delivery of a small-molecule ErbB inhibitor promotes recovery from acute and late-stage CNS inflammation
2022-04-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154824
PMID:35393953
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研究论文 | 研究通过鼻内递送小分子ErbB抑制剂afatinib，探讨其在急性及晚期中枢神经系统（CNS）炎症中的治疗效果 | 结合CNS单细胞转录组数据和小分子筛选，发现并验证了afatinib通过阻断ErbB信号通路，有效减轻炎症性星形胶质细胞极化并促进组织再生功能 | NA | 探索治疗急性及晚期CNS炎症的新疗法 | 多发性硬化症（MS）及其动物模型中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类原代星形胶质细胞 |