单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3061 - 3080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3061 | 2024-08-08 |
Rare and Common Variants in KIF15 Contribute to Genetic Risk of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202110-2439OC
PMID:35417304
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研究论文 | 本文通过基因负担分析、单核苷酸变异关联测试、KIF15功能研究及人类肺单细胞RNA测序数据分析，探讨了KIF15基因中的罕见和常见变异在特发性肺纤维化（IPF）遗传风险中的作用。 | 首次揭示了KIF15基因中的罕见有害变异和常见变异与IPF风险的相关性，并关联了细胞增殖的非端粒酶途径。 | NA | 旨在识别特发性肺纤维化及相关家族性肺纤维化中富集罕见有害变异的基因。 | KIF15基因及其在特发性肺纤维化中的作用。 | 遗传学 | 特发性肺纤维化 | 全外显子数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据、RNA序列数据 | 1,725例病例和23,509例对照组 |
| 3062 | 2024-08-08 |
Analyses of murine lymph node endothelial cell subsets using single-cell RNA sequencing and spectral flow cytometry
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101267
PMID:35403006
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研究论文 | 本文介绍了一种酶消化淋巴结、富集基质细胞、分离血内皮细胞（BECs）及处理BEC相关数据用于现代分析方法的逐步协议，包括光谱流式细胞术和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 采用单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析小鼠淋巴结内皮细胞亚群 | NA | 描述一种用于分析淋巴结血内皮细胞的实验协议 | 小鼠淋巴结内的血内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），光谱流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 3063 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unveils the Clonal and Transcriptional Landscape of Cutaneous T-Cell Lymphomas
2022-06-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-4437
PMID:35421230
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，揭示了皮肤T细胞淋巴瘤中的克隆性和转录组景观 | 首次在单细胞水平上直接评估了蕈样肉芽肿/塞扎里综合征患者样本中恶性T细胞克隆和反应性T淋巴细胞的转录组特征 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术，揭示皮肤T细胞淋巴瘤的克隆性和转录组特征，为个性化治疗提供新的潜在靶点 | 蕈样肉芽肿和塞扎里综合征患者的皮肤和血液样本中的CD3+淋巴细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个蕈样肉芽肿和塞扎里综合征患者的皮肤和血液样本 |
| 3064 | 2024-08-08 |
Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Local Microwave Ablation in Patients with Breast Cancer
2022-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202200033
PMID:35403824
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研究论文 | 本研究通过临床试验探讨微波消融（MWA）治疗早期乳腺癌的效果及其诱导的外周免疫反应 | 首次详细报道了微波消融治疗乳腺癌后诱导的免疫反应，包括NK细胞和CD8 T细胞的激活，以及B细胞和CD4 T细胞之间增强的相互作用 | 研究样本量较小，仅包括六名患者，可能影响结果的普遍性 | 确定微波消融治疗早期乳腺癌的效果及其对患者外周免疫系统的影响 | 早期乳腺癌患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 六名患者 |
| 3065 | 2024-08-08 |
More than Just a Monolayer: the Multifaceted Role of Endothelial Cells in the Pathophysiology of Atherosclerosis
2022-06, Current atherosclerosis reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11883-022-01023-9
PMID:35404040
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综述 | 本文综述了内皮细胞在动脉粥样硬化发病机制中的多重作用 | 通过使用单细胞测序、表观遗传学和细胞命运图谱等尖端技术，发现了新的调控机制和内皮细胞表型，挑战了传统的内皮细胞激活概念 | NA | 总结内皮细胞在动脉粥样硬化中的当前见解 | 内皮细胞在动脉粥样硬化的多重作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序, 表观遗传学, 细胞命运图谱 | NA | NA | NA |
| 3066 | 2024-08-08 |
Advances and applications of single-cell omics technologies in plant research
2022-06, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15772
PMID:35426954
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研究论文 | 本文介绍了单细胞组学技术在植物研究中的最新进展和应用，特别是单细胞基因组和转录组测序技术 | 本文通过基准研究突出了单细胞组学技术在植物生物学中的应用进展 | NA | 介绍单细胞组学技术在植物研究中的应用和未来发展 | 单细胞基因组和转录组测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | 数百万个细胞 |
| 3067 | 2024-08-08 |
Spectral clustering of single cells using Siamese nerual network combined with improved affinity matrix
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac113
PMID:35419595
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研究论文 | 本文提出了一种基于元学习的模型SiaClust，结合Siamese卷积神经网络和改进的谱聚类方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型检测 | SiaClust通过比较样本间的相似性来突出细胞类型间的差异，同时模糊细胞类型内的差异，更适合处理高维和不平衡的数据 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型检测的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 数据 | 使用九种不同物种和组织的单细胞RNA测序数据进行评估 |
| 3068 | 2024-08-08 |
TedSim: temporal dynamics simulation of single-cell RNA sequencing data and cell division history
2022-05-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac235
PMID:35412632
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研究论文 | 本文介绍了TedSim，一个模拟单细胞RNA测序数据和细胞分裂历史的时序动态模拟器 | TedSim能够同时生成每个单细胞的谱系条形码和基因表达数据，连接谱系追踪和轨迹推断两个问题 | 需要开发更好的整合基因表达和条形码数据的方法 | 研究细胞分化中的时序动态 | 单细胞RNA测序数据和细胞分裂历史 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3069 | 2024-08-08 |
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids for personalized congenital and idiopathic nephrotic syndrome modeling
2022-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200198
PMID:35417019
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研究论文 | 本研究利用人多能干细胞衍生的肾脏类器官模型，模拟先天性和特发性肾病综合征的病理过程 | 通过混合培养协议获得的类器官足细胞在单细胞RNA测序、超分辨率成像和电子显微镜下显示出与成人足细胞相似的特征，优于二维培养的足细胞 | NA | 研究先天性和特发性肾病综合征的病理机制 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序, 超分辨率成像, 电子显微镜 | NA | 类器官 | 从携带杂合NPHS2突变的患者细胞中培养的类器官 |
| 3070 | 2024-08-08 |
Suppressed COP9 signalosome 5 promotes hemocyte proliferation through Cyclin E in the early G1 phase to defend against bacterial infection in crab
2022-05, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101710RRRR
PMID:35429011
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研究论文 | 本研究报道了在中华绒螯蟹中，细菌感染诱导血细胞增殖，并通过抑制EsCsn5表达促进细胞周期早期G1阶段的Cyclin E表达，以增强免疫防御 | 首次揭示了EsCsn5在中华绒螯蟹血细胞增殖中的负调控作用，并通过调控Cyclin E的泛素化降解而非转录来影响细胞周期 | 研究主要集中在EsCsn5对血细胞增殖的影响，未涉及其他可能的免疫调控机制 | 探讨细菌感染下中华绒螯蟹血细胞增殖的分子机制 | 中华绒螯蟹的血细胞及EsCsn5和Cyclin E的表达调控 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及不同组织的中华绒螯蟹样本 |
| 3071 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq dataset and bulk RNA-seq dataset constructs a prognostic model for predicting survival in human glioblastoma
2022-05, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.2575
PMID:35429411
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据集和批量RNA测序数据集，构建了一个预测人类胶质母细胞瘤患者生存率的预后模型 | 该研究首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个更为精确的预后模型，能够更准确地反映肿瘤核心和周边区域的差异 | NA | 开发一个可靠的模型来预测新胶质母细胞瘤患者的生存概率 | 人类胶质母细胞瘤患者的生存率 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO Cox惩罚回归分析 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据集包含2128个差异表达基因，批量RNA测序数据集包含6461个差异表达基因 |
| 3072 | 2024-08-08 |
The macrophage: a key player in the pathophysiology of peripheral neuropathies
2022-Apr-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02454-6
PMID:35429971
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性的最新知识，特别关注了它们在周围神经系统中的作用及其与活性氧物种的相互作用。 | 利用命运图谱和单细胞转录组学等新技术，详细描述了组织驻留巨噬细胞在周围神经系统中的起源和命运，并深入理解了它们在周围神经病变中的功能。 | NA | 总结巨噬细胞在周围神经病变中的作用，并探讨针对特定巨噬细胞以减轻周围神经系统功能缺陷的潜在益处。 | 巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性，以及它们与活性氧物种的相互作用。 | NA | 周围神经病变 | 命运图谱、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 3073 | 2024-08-08 |
Sphingolipids control dermal fibroblast heterogeneity
2022-04-15, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abh1623
PMID:35420948
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研究论文 | 本文通过结合高分辨率质谱成像和单细胞转录组学技术，测量了人类真皮成纤维细胞的脂质组和转录组，探讨了脂质代谢途径的细胞间变异对皮肤结构组织中细胞状态建立的影响。 | 首次展示了鞘脂组成如何定义成纤维细胞亚群，并揭示了鞘脂代谢重塑驱动细胞状态转变的机制。 | NA | 研究细胞间脂质异质性对多细胞系统自组织的影响。 | 人类真皮成纤维细胞的脂质组和转录组。 | NA | NA | 高分辨率质谱成像，单细胞转录组学 | NA | 脂质组，转录组 | 个体人类真皮成纤维细胞 |
| 3074 | 2024-08-08 |
Redefining inflammatory macrophage phenotypes across stages and tissues by single-cell transcriptomics
2022-04-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abo4652
PMID:35427177
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据重新定义炎症性巨噬细胞在不同阶段和组织中的表型 | 利用单细胞转录组技术揭示了单核细胞衍生巨噬细胞的主要激活路径，为炎症性组织巨噬细胞提供了一个框架 | NA | 研究炎症性巨噬细胞在不同阶段和组织中的表型 | 单核细胞衍生巨噬细胞及其在炎症组织中的激活路径 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3075 | 2024-08-08 |
Interactive single-cell data analysis using Cellar
2022-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29744-0
PMID:35422041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cellar的软件工具，用于支持单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | Cellar提供交互式支持，能够统一分配细胞类型，并适用于不同的平台和数据类型 | NA | 开发一种软件工具，以改进跨大型联盟、平台和模式的细胞类型分配能力 | 单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，空间蛋白质组学 | NA | 单细胞数据，空间数据 | 多个HuBMAP数据集 |
| 3076 | 2024-08-08 |
Tissue-resident CD8+ T cells drive compartmentalized and chronic autoimmune damage against CNS neurons
2022-04-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl6157
PMID:35417189
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研究论文 | 研究探讨了中枢神经系统（CNS）自身免疫疾病的慢性机制，特别是组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用 | 发现了在CNS疾病中，组织驻留的CD8 T细胞通过特定的分化程序，维持局部神经炎症和渐进性神经元损失，这一过程依赖于CD4 T细胞 | NA | 揭示组织驻留CD8 T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用及其机制 | 组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用 | 免疫学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、高维度流式细胞术、组织病理学 | NA | 细胞 | 使用了人类自身免疫性脑炎和鼠模型中的样本 |
| 3077 | 2024-08-08 |
Generation of resolving memory neutrophils through pharmacological training with 4-PBA or genetic deletion of TRAM
2022-04-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04809-6
PMID:35418110
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，发现了一类具有促炎症消退特性的中性粒细胞亚群，并探讨了通过药物4-PBA或遗传删除TRAM分子来训练中性粒细胞进入消退状态的机制。 | 首次发现4-PBA能够有效训练中性粒细胞进入消退状态，并增强其吞噬和杀菌功能，同时揭示了这一过程的分子机制。 | NA | 研究中性粒细胞在促进炎症消退中的作用及其潜在的治疗应用。 | 中性粒细胞及其在炎症消退中的作用。 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3078 | 2024-08-08 |
Distinct phases of adult microglia proliferation: a Myc-mediated early phase and a Tnfaip3-mediated late phase
2022-Apr-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00377-3
PMID:35411038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，揭示了在小鼠脊髓中由坐骨神经损伤诱导的两种不同阶段的微胶质细胞增殖，每种阶段具有不同的基因表达谱 | 首次阐明了成年微胶质细胞增殖的两个不同阶段，分别由Myc和Tnfaip3介导，并揭示了这两个阶段之间的相互作用 | NA | 探讨成年微胶质细胞增殖的机制及其在神经疾病中的作用 | 微胶质细胞在小鼠脊髓中的增殖过程 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脊髓样本 |
| 3079 | 2024-08-08 |
An immune subtype-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing analysis
2022-04-12, Aging
DOI:10.18632/aging.204012
PMID:35413690
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析，将肝细胞癌分为免疫细胞和非免疫细胞亚型，并构建了一个与免疫亚型相关的肝细胞癌预后标志物模型 | 通过单细胞测序分析，发现了两种亚型中的差异表达基因，并利用这些基因构建了一个新的肝细胞癌预后模型 | NA | 探索肝细胞癌的免疫微环境，并构建一个准确的预后评估模型 | 肝细胞癌的免疫亚型及其预后标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的GSE146115数据集 |
| 3080 | 2024-08-08 |
Semantic clustering analysis of E3-ubiquitin ligases in gastrointestinal tract defines genes ontology clusters with tissue expression patterns
2022-Apr-12, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-022-02265-2
PMID:35413796
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研究论文 | 本研究使用语义双聚类技术分析小鼠胃肠道中E3泛素连接酶及其相关基因的表达谱，揭示了基因本体簇及其组织表达模式 | 本研究采用优化的语义聚类协议，揭示了胃肠道特异性泛素连接酶及其相关基因的表达谱中的可读性和独特模式，扩展了我们对这些基因本体关系的认识 | NA | 研究旨在通过语义聚类分析改进和扩展泛素连接酶的功能分类 | 小鼠胃肠道中的E3泛素连接酶及其相关基因 | NA | NA | 语义双聚类技术，主成分分析（PCA），均匀流形近似和投影技术（UMAP） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |