单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 3041 - 3060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3041 | 2024-08-08 |
Technique integration of single-cell RNA sequencing with spatially resolved transcriptomics in the tumor microenvironment
2022-Apr-19, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-022-02580-4
PMID:35440049
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序与空间转录组学在肿瘤微环境中的整合应用 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，以充分利用两者的优势，深入探索复杂的组织结构和相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序与空间转录组学整合方法在肿瘤微环境中的应用，特别是在细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 肿瘤微环境中的细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3042 | 2024-08-08 |
Metacell-2: a divide-and-conquer metacell algorithm for scalable scRNA-seq analysis
2022-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02667-1
PMID:35440087
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研究论文 | 介绍了一种名为Metacell-2的递归分治算法，用于高效地将任何大小的单细胞RNA测序数据集分解成称为metacells的小而紧密的细胞群 | Metacell-2算法提高了异常细胞检测和稀有细胞类型识别的能力 | NA | 开发一种可扩展的单细胞RNA测序分析方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分治算法 | 基因表达数据 | 涉及人类骨髓细胞图谱和鼠胚胎数据 |
| 3043 | 2024-08-08 |
Endothelial progenitor cells stimulate neonatal lung angiogenesis through FOXF1-mediated activation of BMP9/ACVRL1 signaling
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29746-y
PMID:35440116
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研究论文 | 本文研究了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成的分子机制 | 首次揭示了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成和肺泡化的机制 | NA | 探究内皮祖细胞在新生肺血管生成中的作用及其分子机制 | 内皮祖细胞、FOXF1、BMP9、ACVRL1 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Foxf1突变小鼠和ACDMPV患者的肺组织 |
| 3044 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of diffuse large B cell lymphoma
2022-04-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110713
PMID:35443163
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本的94,324个细胞的转录组，揭示了恶性细胞中的73个基因表达程序和复杂的细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤的高度异质性和复杂的肿瘤微环境，特别是发现了B细胞淋巴瘤中恶性细胞与T细胞间的CD70-CD27共刺激相互作用 | NA | 深入理解B细胞淋巴瘤的发病机制，并为设计靶向免疫治疗策略提供新思路 | 弥漫大B细胞淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 94,324个细胞来自17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本 |
| 3045 | 2024-08-08 |
Correction to: Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2022-Apr-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01564-2
PMID:35436930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3046 | 2024-08-08 |
Identification of Transcription Factors Regulating SARS-CoV-2 Tropism Factor Expression by Inferring Cell-Type-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Human Lungs
2022-04-17, Viruses
DOI:10.3390/v14040837
PMID:35458567
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研究论文 | 本研究通过计算方法识别调控SARS-CoV-2趋向性因子的转录因子，并构建了人类肺部细胞类型的特定转录调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序数据构建了健康捐赠者和COVID-19患者的SARS-CoV-2趋向性因子的转录调控网络，并分析了转录因子在健康和感染网络中的差异调控作用 | NA | 研究SARS-CoV-2在人类肺部细胞中的趋向性因子表达的转录调控机制 | SARS-CoV-2趋向性因子的转录调控网络 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康捐赠者和COVID-19患者的肺部细胞 |
| 3047 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing: Ariadne's Thread in the Maze of Acute Myeloid Leukemia
2022-Apr-15, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics12040996
PMID:35454044
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病（AML）研究中的应用，揭示了其对AML克隆结构和突变历史的洞察 | 单细胞技术提供了AML克隆结构的新见解，揭示了从诊断、治疗到复发的突变历史 | NA | 探讨单细胞技术在急性髓系白血病研究中的应用及其对疾病理解和治疗的影响 | 急性髓系白血病（AML）及其克隆结构和突变历史 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观遗传和蛋白质组数据 | NA |
| 3048 | 2024-08-08 |
G-Protein Subunit Gamma 4 as a Potential Biomarker for Predicting the Response of Chemotherapy and Immunotherapy in Bladder Cancer
2022-04-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13040693
PMID:35456499
|
研究论文 | 本文探讨了GNG4在膀胱癌中的表达及其作为预测化疗和免疫治疗反应的潜在生物标志物的作用 | 首次研究GNG4在膀胱癌中的作用及其作为指导化疗或免疫治疗标志物的潜力 | NA | 研究GNG4在膀胱癌治疗反应预测中的潜在作用 | GNG4在膀胱癌中的表达及其与免疫细胞浸润和基因突变的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 七个膀胱癌队列 |
| 3049 | 2024-08-08 |
Deciphering Cardiac Biology and Disease by Single-Cell Transcriptomic Profiling
2022-04-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040566
PMID:35454155
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术，全面描述了心脏中细胞的多样性和动态变化 | 通过识别细胞异质性、构建调控网络、构建谱系轨迹和绘制细胞间对话，深化了对心脏的理解 | NA | 介绍心脏前体细胞及其在胚胎发育中的转录调控，强调心脏健康与疾病中的细胞异质性和细胞亚型功能 | 心脏细胞的多样性和动态变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数百至数百万个单细胞 |
| 3050 | 2024-08-08 |
Novel Techniques and Future Perspective for Investigating Critical-Size Bone Defects
2022-Apr-11, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering9040171
PMID:35447731
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综述 | 本文综述了研究关键尺寸骨缺损的当前动物模型和四种新颖分析技术 | 介绍了四种新技术：质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Luminex试剂，用于增强细胞分析、组织特异性成像、转录组详细分析和蛋白质分泌组全面分析 | 未具体提及 | 开发侵入性较小但同样有效的治疗选项，以促进骨桥接 | 关键尺寸骨缺损的愈合过程 | NA | 骨科疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Luminex试剂 | NA | 细胞、组织、转录组、蛋白质 | 未具体提及 |
| 3051 | 2024-08-08 |
Laser Microdissection for Species-Agnostic Single-Tissue Applications
2022-03-31, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63666
PMID:35435919
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研究论文 | 本文优化了激光显微切割技术（LMD），用于在不破坏细胞或不需要物种特异性工具包的情况下，隔离单个线虫尾部尖端，以研究雄性尾部尖端形态发生过程中的基因表达 | LMD技术允许在不需要细胞破坏或物种特异性工具包的情况下隔离动物的一部分，因此适用于任何物种 | 限制包括切割出感兴趣的组织的能力和样本大小 | 研究不同物种中特定组织发育的转录组是保守还是不同的 | 线虫尾部尖端的基因表达 | NA | NA | 激光显微切割（LMD） | NA | 单细胞RNA测序 | 每种条件下至少需要70个尾部尖端以达到80%的统计功效 |
| 3052 | 2024-08-08 |
Cellular Distribution of Brain Aquaporins and Their Contribution to Cerebrospinal Fluid Homeostasis and Hydrocephalus
2022-03-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040530
PMID:35454119
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研究论文 | 本文分析了小鼠大脑中四种最丰富的水通道蛋白（AQP1、AQP4、AQP9和AQP11）的表达，并探讨了它们对脑积水的影响 | 研究首次结合单细胞RNA测序数据与qPCR、western blot和免疫组织化学方法，详细描述了水通道蛋白在中枢神经系统中的分布 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步在人类中验证相关发现 | 探讨水通道蛋白在脑脊液稳态和脑积水中的作用 | 小鼠大脑中的水通道蛋白表达及其对脑积水的影响 | 神经科学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠大脑样本 |
| 3053 | 2024-08-08 |
Endothelial Dysfunction in the Pathogenesis of Abdominal Aortic Aneurysm
2022-03-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040509
PMID:35454098
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综述 | 本文综述了腹主动脉瘤（AAA）发病机制中内皮细胞功能障碍的作用 | 利用单细胞RNA测序揭示了动脉瘤组织中内皮细胞的异质性亚群 | NA | 提高对腹主动脉瘤发病机制的理解，并可能开发针对内皮细胞的治疗方法 | 腹主动脉瘤中的内皮细胞功能障碍及其分子和细胞机制 | NA | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3054 | 2024-08-08 |
Transcriptional Regulation of Early T-Lymphocyte Development in Thymus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.884569
PMID:35432347
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综述 | 本文综述了过去十年中参与T细胞早期发育的转录调控因子，并探讨了这些因子在T细胞发育过程中的级联网络及未来可能的研究方向 | 使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）等先进技术，深入研究T细胞发育过程中的转录调控因子 | NA | 总结T细胞早期发育中的转录调控因子，并探讨未来的研究方向 | T细胞在胸腺中的早期发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | RNA | NA |
| 3055 | 2024-08-08 |
SLAMF8 Participates in Acute Renal Transplant Rejection via TLR4 Pathway on Pro-Inflammatory Macrophages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.846695
PMID:35432371
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研究论文 | 本研究通过分析急性肾移植排斥反应患者的微阵列数据，构建基因网络并识别与排斥反应相关的关键基因和信号通路 | 首次揭示了SLAMF8通过TLR4途径在促炎性巨噬细胞中参与急性肾移植排斥反应的机制 | NA | 探索急性肾移植排斥反应中的关键基因和信号通路，为治疗提供新的靶点 | 急性肾移植排斥反应患者和非急性排斥反应患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 微阵列分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 15名急性排斥反应患者和37名非急性排斥反应患者 |
| 3056 | 2024-08-08 |
Multiscale Transcriptomic Integration Reveals B-Cell Depletion and T-Cell Mistrafficking in Nasopharyngeal Carcinoma Progression
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.857137
PMID:35433690
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研究论文 | 本研究开发了一种新的计算框架，用于在鼻咽癌进展过程中进行多尺度转录组分析 | 提出了一个包含四个模块的计算框架，能够进行从单细胞、批量、微环境到队列尺度的转录组分析 | NA | 揭示鼻咽癌进展中的分子机制 | 鼻咽癌的转录组和免疫细胞变化 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 133个鼻咽癌或正常样本 |
| 3057 | 2024-08-08 |
A scRNA-seq Approach to Identifying Changes in Spermatogonial Stem Cell Gene Expression Following in vitro Culture
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.782996
PMID:35433696
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，研究了体外培养对小鼠未分化精原干细胞基因表达的影响 | 首次描述了体外培养的精原干细胞中泛素化蛋白的显著积累 | NA | 探索体外培养对未分化精原干细胞基因表达的影响及其与再生能力下降的关系 | 小鼠的未分化精原干细胞 | 数字病理学 | 人类不育症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自成年小鼠睾丸的未分化精原干细胞与经过10周体外培养的细胞进行比较 |
| 3058 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Immune Cells in Human Aortic Dissection Tissue Provides Insights Into Immune Cell Heterogeneity
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.791875
PMID:35433892
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类主动脉夹层组织中的免疫细胞异质性 | 首次全面描述了主动脉夹层组织中免疫细胞的异质性，特别是巨噬细胞和T细胞的作用 | NA | 揭示主动脉夹层中免疫细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 人类主动脉夹层组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 3059 | 2024-08-08 |
Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868685
PMID:35444665
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3060 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Heterogeneity of CD8+ T Cells and Novel Biomarker Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8256314
PMID:35449866
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞亚群的异质性，并发现了新的生物标志物基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性，并发现了与生存和预后密切相关的四个差异基因 | NA | 揭示肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性，并发现新的生物标志物基因 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE149614数据集和来自TCGA数据库的TCGA-LIHC数据集 |