单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3041 - 3060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3041 | 2024-08-08 |
Transcriptional Regulation of Early T-Lymphocyte Development in Thymus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.884569
PMID:35432347
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综述 | 本文综述了过去十年中参与T细胞早期发育的转录调控因子，并探讨了这些因子在T细胞发育过程中的级联网络及未来可能的研究方向 | 使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）等先进技术，深入研究T细胞发育过程中的转录调控因子 | NA | 总结T细胞早期发育中的转录调控因子，并探讨未来的研究方向 | T细胞在胸腺中的早期发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | RNA | NA |
| 3042 | 2024-08-08 |
SLAMF8 Participates in Acute Renal Transplant Rejection via TLR4 Pathway on Pro-Inflammatory Macrophages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.846695
PMID:35432371
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研究论文 | 本研究通过分析急性肾移植排斥反应患者的微阵列数据，构建基因网络并识别与排斥反应相关的关键基因和信号通路 | 首次揭示了SLAMF8通过TLR4途径在促炎性巨噬细胞中参与急性肾移植排斥反应的机制 | NA | 探索急性肾移植排斥反应中的关键基因和信号通路，为治疗提供新的靶点 | 急性肾移植排斥反应患者和非急性排斥反应患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 微阵列分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 15名急性排斥反应患者和37名非急性排斥反应患者 |
| 3043 | 2024-08-08 |
Multiscale Transcriptomic Integration Reveals B-Cell Depletion and T-Cell Mistrafficking in Nasopharyngeal Carcinoma Progression
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.857137
PMID:35433690
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研究论文 | 本研究开发了一种新的计算框架，用于在鼻咽癌进展过程中进行多尺度转录组分析 | 提出了一个包含四个模块的计算框架，能够进行从单细胞、批量、微环境到队列尺度的转录组分析 | NA | 揭示鼻咽癌进展中的分子机制 | 鼻咽癌的转录组和免疫细胞变化 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 133个鼻咽癌或正常样本 |
| 3044 | 2024-08-08 |
A scRNA-seq Approach to Identifying Changes in Spermatogonial Stem Cell Gene Expression Following in vitro Culture
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.782996
PMID:35433696
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，研究了体外培养对小鼠未分化精原干细胞基因表达的影响 | 首次描述了体外培养的精原干细胞中泛素化蛋白的显著积累 | NA | 探索体外培养对未分化精原干细胞基因表达的影响及其与再生能力下降的关系 | 小鼠的未分化精原干细胞 | 数字病理学 | 人类不育症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自成年小鼠睾丸的未分化精原干细胞与经过10周体外培养的细胞进行比较 |
| 3045 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Immune Cells in Human Aortic Dissection Tissue Provides Insights Into Immune Cell Heterogeneity
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.791875
PMID:35433892
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类主动脉夹层组织中的免疫细胞异质性 | 首次全面描述了主动脉夹层组织中免疫细胞的异质性，特别是巨噬细胞和T细胞的作用 | NA | 揭示主动脉夹层中免疫细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 人类主动脉夹层组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 3046 | 2024-08-08 |
Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868685
PMID:35444665
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3047 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Heterogeneity of CD8+ T Cells and Novel Biomarker Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8256314
PMID:35449866
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞亚群的异质性，并发现了新的生物标志物基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性，并发现了与生存和预后密切相关的四个差异基因 | NA | 揭示肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性，并发现新的生物标志物基因 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE149614数据集和来自TCGA数据库的TCGA-LIHC数据集 |
| 3048 | 2024-08-08 |
The Role of RNA-Binding Protein HuR in Lung Cancer by RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.813268
PMID:35450220
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研究论文 | 本文通过RNA测序分析研究了RNA结合蛋白HuR在肺癌中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了A549 HuR敲降细胞中的基因、蛋白质、mRNA和lncRNA变化，并评估了HuR在肺癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用 | 研究样本量较小，仅包括十名肺癌患者和十名良性肺疾病患者 | 探讨HuR在肺癌中的作用及其对肿瘤促进基因mRNA稳定性的影响 | 肺癌细胞A549中的HuR表达及其对细胞增殖、迁移和侵袭的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 20名患者（10名肺癌患者和10名良性肺疾病患者） |
| 3049 | 2024-08-08 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Mesenchymal Stem/Stromal Cells Derived from Human Placenta
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.836887
PMID:35450295
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，对从人类足月胎盘中提取的间充质干细胞/基质细胞（PMSCs）进行了综合分析 | 首次提供了PMSCs转录组和表观基因组特征的综合视图，揭示了免疫调节潜能和增殖相关基因的潜在调控元件 | NA | 深入理解PMSCs的细胞异质性，并为基于PMSC亚群的细胞治疗提供基础生物学见解 | 从人类足月胎盘提取的间充质干细胞/基质细胞（PMSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和表观基因组数据 | 从人类足月胎盘提取的PMSCs |
| 3050 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Interaction of Injected ADSCs with Lung-Originated Cells in Mouse Pulmonary Fibrosis
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/9483166
PMID:35450342
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了脂肪源性间充质干细胞（ADSCs）与小鼠肺纤维化模型中肺源性细胞的相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了ADSCs与肺源性细胞的相互作用及其对肺细胞转录组的影响 | NA | 阐明ADSCs在肺纤维化治疗中的作用机制 | ADSCs与肺源性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用BLM诱导的小鼠肺纤维化模型和GFP标记的ADSCs进行实验 |
| 3051 | 2024-08-08 |
Macrophages in the kidney in health, injury and repair
2022, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2022.01.005
PMID:35461656
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在肾脏健康、损伤和修复中的作用 | 单细胞RNA测序揭示了先前未被重视的巨噬细胞表型谱，这些表型可能在损伤或修复中特异性地存在 | NA | 研究巨噬细胞在肾脏疾病中的作用及潜在的治疗策略 | 巨噬细胞在肾脏健康、损伤和修复中的角色 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3052 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and function of macrophages in the breast during homeostasis and cancer
2022, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2022.01.002
PMID:35461657
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综述 | 本文综述了近年来利用命运图谱、成像和单细胞RNA测序技术对乳腺巨噬细胞在稳态及乳腺癌发展中的起源、异质性和功能的最新研究进展 | 利用新兴技术如命运图谱、成像和单细胞RNA测序技术，深入解析了乳腺巨噬细胞的异质性和功能 | NA | 旨在全面回顾研究乳腺健康组织和乳腺癌中巨噬细胞异质性的最新进展 | 乳腺巨噬细胞在稳态及乳腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3053 | 2024-08-08 |
YY1 safeguard multidimensional epigenetic landscape associated with extended pluripotency
2022-11-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac230
PMID:35425987
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研究论文 | 本研究探讨了YY1在扩展多能干细胞（EPSCs）中的转录调控机制及其对表观遗传景观的影响 | 发现YY1在EPSCs中绑定到特定的开放染色质区域，其缺失导致基因表达模式更接近胚胎干细胞（ESCs），并触发一系列表观遗传交叉活动 | NA | 揭示YY1在扩展多能性相关的多维表观遗传交叉中的关键调节作用 | 扩展多能干细胞（EPSCs）和YY1蛋白 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3054 | 2024-08-08 |
Fibroblast-Secreted Phosphoprotein 1 Mediates Extracellular Matrix Deposition and Inhibits Smooth Muscle Cell Contractility in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm
2022-Oct, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-022-10239-8
PMID:35414038
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研究论文 | 本文研究了纤维母细胞分泌的磷蛋白1（Spp1）在马方综合征（MFS）胸主动脉瘤（TAA）中对细胞外基质（ECM）沉积和抑制平滑肌细胞收缩性的作用。 | 通过转录组测序和单细胞测序数据分析，发现了Spp1在MFS TAA中的增加，并探讨了其通过Itga8/Itgb1调节纤维母细胞和平滑肌细胞间通信的机制。 | NA | 探讨马方综合征胸主动脉瘤中细胞外基质稳态破坏的机制。 | 纤维母细胞分泌的磷蛋白1（Spp1）及其在马方综合征胸主动脉瘤中的作用。 | NA | 马方综合征 | 转录组测序，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Fbn1小鼠模型和MFS患者的样本 |
| 3055 | 2024-08-08 |
Glioblastoma scRNA-seq shows treatment-induced, immune-dependent increase in mesenchymal cancer cells and structural variants in distal neural stem cells
2022-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac085
PMID:35416251
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了新发和复发的胶质母细胞瘤及其邻近的侧脑室区，揭示了治疗诱导的免疫依赖性间质癌细胞增加和远端神经干细胞中的结构变异 | 发现了胶质母细胞瘤神经谱系的富集，免疫细胞和反应性星形胶质细胞在早期复发中的作用，以及远端神经干细胞中存在的染色体异常 | NA | 探究胶质母细胞瘤在治疗前后的细胞层次结构和肿瘤微环境的变化 | 新发和复发的胶质母细胞瘤及其邻近的侧脑室区 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3056 | 2024-08-08 |
The promising role of new molecular biomarkers in prostate cancer: from coding and non-coding genes to artificial intelligence approaches
2022-09, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-022-00537-2
PMID:35422101
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综述 | 本文综述了通过转录组学、基因组学和人工智能发现新的分子生物标志物的最新进展，旨在改善前列腺癌患者的临床管理 | 文章介绍了新的分子标志物如mRNAs、microRNAs、lncRNAs和重复序列的搜索变化，以及人工智能在分析和理解测序数据中的应用 | NA | 提供关于通过转录组学、基因组学和人工智能发现新的分子生物标志物的最新进展的概述 | 前列腺癌的新分子标志物及其在诊断、预后和治疗预测中的应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-Seq, 全基因组测序, 外显子测序, 空间转录组学 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
| 3057 | 2024-08-08 |
Uncoupling immune trajectories of response and adverse events from anti-PD-1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2022-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.03.039
PMID:35430299
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研究论文 | 本研究旨在解析接受抗PD-1免疫治疗的肝细胞癌患者中，免疫反应轨迹和免疫相关不良事件的机制 | 本研究识别了抗PD-1免疫检查点阻断治疗在肝细胞癌患者中的早期临床反应预测因子，并提供了这些免疫亚群在反应与毒性之间界面的免疫轨迹的机制见解 | NA | 解析肝细胞癌患者在接受抗PD-1免疫治疗时的免疫反应轨迹和免疫相关不良事件的机制 | 肝细胞癌患者在接受抗PD-1免疫治疗时的免疫反应和免疫相关不良事件 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 血液样本、肿瘤活检 | 60份血液样本，32名患者（新加坡队列），29名患者（韩国独立队列），20份肿瘤活检 |
| 3058 | 2024-08-08 |
Low-ratio somatic NLRC4 mutation causes late-onset autoinflammatory disease
2022-08, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-221708
PMID:35428651
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研究论文 | 本文研究了一例由NLRC4体细胞突变引起的晚发性自身炎症性疾病的遗传基础，并通过多种技术手段揭示了其发病机制。 | 首次报道了低比例的NLRC4体细胞突变导致晚发性自身炎症性疾病，并提出了针对gasdermin D的新治疗策略。 | NA | 探究晚发性自身炎症性疾病的遗传基础和发病机制。 | 一例表现为关节炎、反复发热和皮肤疹的晚发性自身炎症性疾病。 | 遗传学 | 自身炎症性疾病 | 全外显子/基因组测序、数字滴液PCR (ddPCR)、单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、细胞内细胞因子染色、定量PCR、免疫组织化学和西方墨点法 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 单个病例 |
| 3059 | 2024-08-08 |
MarcoPolo: a method to discover differentially expressed genes in single-cell RNA-seq data without depending on prior clustering
2022-07-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac216
PMID:35420135
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研究论文 | 本文提出了一种名为MarcoPolo的方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别差异表达基因，无需依赖先前的聚类 | MarcoPolo方法通过评估基因表达分布是否为双峰、是否存在相似表达模式以及表达细胞在低维空间中是否接近，独立于先前的聚类来识别信息性差异表达基因 | 标准分析流程中的聚类步骤可能导致不完美的聚类结果，进而影响后续步骤，特别是对于那些全局结构相似的细胞类型 | 开发一种不依赖于先前聚类的方法，以识别单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用带有FACS纯化细胞标签的真实数据集进行验证 |
| 3060 | 2024-08-08 |
Peripheral B-cell dysregulation is associated with relapse after long-term quiescence in patients with multiple sclerosis
2022-07, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12552
PMID:35416319
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了复发缓解型多发性硬化症（RRMS）患者在阿仑单抗治疗前后及复发期间的B细胞变化 | 首次详细描述了IgA和IgG B细胞在RRMS患者中的异常变化及其在疾病复发中的作用，并展示了阿仑单抗治疗后这些细胞的恢复情况 | 研究仅限于RRMS患者，且样本量未在摘要中明确提及，可能影响结果的普遍性 | 探讨B细胞在多发性硬化症复发中的作用及阿仑单抗治疗的影响 | 复发缓解型多发性硬化症患者的B细胞 | NA | 多发性硬化症 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |