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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3021 | 2024-08-08 |
Multilayered omics reveal sex- and depot-dependent adipose progenitor cell heterogeneity
2022-05-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2022.03.012
PMID:35447091
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研究论文 | 本文采用多层组学方法,分析了不同性别和部位的脂肪前体细胞异质性 | 首次全面定义了脂肪前体细胞异质性的分子基础,并结合蛋白质组学和转录组学数据,提供了深入的见解 | NA | 揭示脂肪前体细胞异质性的分子机制 | 成年白色脂肪组织中的间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱法 | NA | 蛋白质、基因表达数据 | 从雄性和雌性小鼠的腹股沟和盆腔白色脂肪组织中采集的八种不同基质细胞群体 |
3022 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: Museum of spatial transcriptomics
2022-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01494-3
PMID:35440782
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3023 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Technology Revealed the Pivotal Role of Fibroblast Heterogeneity in Angiotensin II-Induced Abdominal Aortic Aneurysms
2022-May, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1089/dna.2021.0923
PMID:35451888
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了纤维母细胞异质性在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的关键作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了纤维母细胞在腹主动脉瘤发展中的重要作用,包括免疫调节和细胞外基质代谢平衡 | NA | 旨在基于单细胞RNA测序技术,揭示血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤在小鼠中的细胞异质性、分子改变和功能转变 | 小鼠的腹主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过27,000个细胞 |
3024 | 2024-08-08 |
Virus-related collapsing glomerulopathy, a common mechanism of injury?
2022-05, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.02.009
PMID:35461615
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研究论文 | 本文利用空间转录组技术研究了与HIV感染或SARS-CoV-2相关的塌陷性肾小球病,发现尽管形态相似,但可能具有不同的分子特征 | 首次应用空间转录组技术研究塌陷性肾小球病,揭示了可能存在的不同分子特征 | 由于组织样本不足,传统的转录组研究面临挑战 | 探讨塌陷性肾小球病是否存在共同的损伤机制 | 与HIV感染或SARS-CoV-2相关的塌陷性肾小球病患者 | NA | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
3025 | 2024-08-08 |
ZNF117 regulates glioblastoma stem cell differentiation towards oligodendroglial lineage
2022-04-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29884-3
PMID:35459228
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研究论文 | 研究探讨了ZNF117基因在调控胶质母细胞瘤干细胞向少突胶质细胞系分化的作用 | 首次发现ZNF117是调控胶质母细胞瘤干细胞向少突胶质细胞系分化的关键基因,并展示了CRISPR/Cas9基因编辑纳米颗粒在靶向治疗中的应用潜力 | NA | 旨在发现和验证调控胶质母细胞瘤干细胞分化的基因,以改善胶质母细胞瘤的治疗 | 胶质母细胞瘤干细胞及其分化 | NA | 脑瘤 | RNAi筛选,单细胞RNA测序 | NA | 图像,RNA序列 | NA |
3026 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies Mcl-1 as a target for senolytic therapy in cancer
2022-04-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29824-1
PMID:35449130
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,发现衰老肿瘤细胞依赖抗凋亡基因Mcl-1生存,并探讨了针对Mcl-1的衰老疗法在癌症治疗中的潜力 | 首次揭示衰老肿瘤细胞通过上调Mcl-1基因来逃避凋亡,并验证了Mcl-1抑制剂S63845在消除衰老肿瘤细胞和转移中的有效性 | NA | 探讨衰老肿瘤细胞的生存机制及其在癌症治疗中的应用 | 衰老肿瘤细胞及其在癌症治疗中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
3027 | 2024-08-08 |
One Cell At a Time (OCAT): a unified framework to integrate and analyze single-cell RNA-seq data
2022-04-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02659-1
PMID:35443717
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研究论文 | 提出了一种名为OCAT的机器学习方法,用于高效整合多个大规模单细胞RNA测序数据集 | OCAT方法通过稀疏编码单细胞基因表达,无需选择高变异基因或显式批次效应校正,即可整合来自多个来源的数据 | NA | 开发一种新的方法来高效整合和分析大规模单细胞RNA测序数据集 | 单细胞RNA测序数据集的整合与分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | OCAT | 基因表达数据 | 多个大规模数据集 |
3028 | 2024-08-08 |
Technique integration of single-cell RNA sequencing with spatially resolved transcriptomics in the tumor microenvironment
2022-Apr-19, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-022-02580-4
PMID:35440049
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序与空间转录组学在肿瘤微环境中的整合应用 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,以充分利用两者的优势,深入探索复杂的组织结构和相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序与空间转录组学整合方法在肿瘤微环境中的应用,特别是在细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 肿瘤微环境中的细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
3029 | 2024-08-08 |
Metacell-2: a divide-and-conquer metacell algorithm for scalable scRNA-seq analysis
2022-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02667-1
PMID:35440087
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研究论文 | 介绍了一种名为Metacell-2的递归分治算法,用于高效地将任何大小的单细胞RNA测序数据集分解成称为metacells的小而紧密的细胞群 | Metacell-2算法提高了异常细胞检测和稀有细胞类型识别的能力 | NA | 开发一种可扩展的单细胞RNA测序分析方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分治算法 | 基因表达数据 | 涉及人类骨髓细胞图谱和鼠胚胎数据 |
3030 | 2024-08-08 |
Endothelial progenitor cells stimulate neonatal lung angiogenesis through FOXF1-mediated activation of BMP9/ACVRL1 signaling
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29746-y
PMID:35440116
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研究论文 | 本文研究了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成的分子机制 | 首次揭示了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成和肺泡化的机制 | NA | 探究内皮祖细胞在新生肺血管生成中的作用及其分子机制 | 内皮祖细胞、FOXF1、BMP9、ACVRL1 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Foxf1突变小鼠和ACDMPV患者的肺组织 |
3031 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of diffuse large B cell lymphoma
2022-04-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110713
PMID:35443163
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本的94,324个细胞的转录组,揭示了恶性细胞中的73个基因表达程序和复杂的细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤的高度异质性和复杂的肿瘤微环境,特别是发现了B细胞淋巴瘤中恶性细胞与T细胞间的CD70-CD27共刺激相互作用 | NA | 深入理解B细胞淋巴瘤的发病机制,并为设计靶向免疫治疗策略提供新思路 | 弥漫大B细胞淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 94,324个细胞来自17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本 |
3032 | 2024-08-08 |
Correction to: Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2022-Apr-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01564-2
PMID:35436930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3033 | 2024-08-08 |
Identification of Transcription Factors Regulating SARS-CoV-2 Tropism Factor Expression by Inferring Cell-Type-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Human Lungs
2022-04-17, Viruses
DOI:10.3390/v14040837
PMID:35458567
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研究论文 | 本研究通过计算方法识别调控SARS-CoV-2趋向性因子的转录因子,并构建了人类肺部细胞类型的特定转录调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序数据构建了健康捐赠者和COVID-19患者的SARS-CoV-2趋向性因子的转录调控网络,并分析了转录因子在健康和感染网络中的差异调控作用 | NA | 研究SARS-CoV-2在人类肺部细胞中的趋向性因子表达的转录调控机制 | SARS-CoV-2趋向性因子的转录调控网络 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康捐赠者和COVID-19患者的肺部细胞 |
3034 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing: Ariadne's Thread in the Maze of Acute Myeloid Leukemia
2022-Apr-15, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics12040996
PMID:35454044
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病(AML)研究中的应用,揭示了其对AML克隆结构和突变历史的洞察 | 单细胞技术提供了AML克隆结构的新见解,揭示了从诊断、治疗到复发的突变历史 | NA | 探讨单细胞技术在急性髓系白血病研究中的应用及其对疾病理解和治疗的影响 | 急性髓系白血病(AML)及其克隆结构和突变历史 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观遗传和蛋白质组数据 | NA |
3035 | 2024-08-08 |
G-Protein Subunit Gamma 4 as a Potential Biomarker for Predicting the Response of Chemotherapy and Immunotherapy in Bladder Cancer
2022-04-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13040693
PMID:35456499
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研究论文 | 本文探讨了GNG4在膀胱癌中的表达及其作为预测化疗和免疫治疗反应的潜在生物标志物的作用 | 首次研究GNG4在膀胱癌中的作用及其作为指导化疗或免疫治疗标志物的潜力 | NA | 研究GNG4在膀胱癌治疗反应预测中的潜在作用 | GNG4在膀胱癌中的表达及其与免疫细胞浸润和基因突变的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 七个膀胱癌队列 |
3036 | 2024-08-08 |
Deciphering Cardiac Biology and Disease by Single-Cell Transcriptomic Profiling
2022-04-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040566
PMID:35454155
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术,全面描述了心脏中细胞的多样性和动态变化 | 通过识别细胞异质性、构建调控网络、构建谱系轨迹和绘制细胞间对话,深化了对心脏的理解 | NA | 介绍心脏前体细胞及其在胚胎发育中的转录调控,强调心脏健康与疾病中的细胞异质性和细胞亚型功能 | 心脏细胞的多样性和动态变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数百至数百万个单细胞 |
3037 | 2024-08-08 |
Novel Techniques and Future Perspective for Investigating Critical-Size Bone Defects
2022-Apr-11, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering9040171
PMID:35447731
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综述 | 本文综述了研究关键尺寸骨缺损的当前动物模型和四种新颖分析技术 | 介绍了四种新技术:质谱流式细胞术(CyTOF)、成像质谱流式细胞术(IMC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和Luminex试剂,用于增强细胞分析、组织特异性成像、转录组详细分析和蛋白质分泌组全面分析 | 未具体提及 | 开发侵入性较小但同样有效的治疗选项,以促进骨桥接 | 关键尺寸骨缺损的愈合过程 | NA | 骨科疾病 | 质谱流式细胞术(CyTOF)、成像质谱流式细胞术(IMC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Luminex试剂 | NA | 细胞、组织、转录组、蛋白质 | 未具体提及 |
3038 | 2024-08-08 |
Laser Microdissection for Species-Agnostic Single-Tissue Applications
2022-03-31, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63666
PMID:35435919
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研究论文 | 本文优化了激光显微切割技术(LMD),用于在不破坏细胞或不需要物种特异性工具包的情况下,隔离单个线虫尾部尖端,以研究雄性尾部尖端形态发生过程中的基因表达 | LMD技术允许在不需要细胞破坏或物种特异性工具包的情况下隔离动物的一部分,因此适用于任何物种 | 限制包括切割出感兴趣的组织的能力和样本大小 | 研究不同物种中特定组织发育的转录组是保守还是不同的 | 线虫尾部尖端的基因表达 | NA | NA | 激光显微切割(LMD) | NA | 单细胞RNA测序 | 每种条件下至少需要70个尾部尖端以达到80%的统计功效 |
3039 | 2024-08-08 |
Cellular Distribution of Brain Aquaporins and Their Contribution to Cerebrospinal Fluid Homeostasis and Hydrocephalus
2022-03-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040530
PMID:35454119
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研究论文 | 本文分析了小鼠大脑中四种最丰富的水通道蛋白(AQP1、AQP4、AQP9和AQP11)的表达,并探讨了它们对脑积水的影响 | 研究首次结合单细胞RNA测序数据与qPCR、western blot和免疫组织化学方法,详细描述了水通道蛋白在中枢神经系统中的分布 | 研究主要基于小鼠模型,可能需要进一步在人类中验证相关发现 | 探讨水通道蛋白在脑脊液稳态和脑积水中的作用 | 小鼠大脑中的水通道蛋白表达及其对脑积水的影响 | 神经科学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠大脑样本 |
3040 | 2024-08-08 |
Endothelial Dysfunction in the Pathogenesis of Abdominal Aortic Aneurysm
2022-03-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040509
PMID:35454098
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综述 | 本文综述了腹主动脉瘤(AAA)发病机制中内皮细胞功能障碍的作用 | 利用单细胞RNA测序揭示了动脉瘤组织中内皮细胞的异质性亚群 | NA | 提高对腹主动脉瘤发病机制的理解,并可能开发针对内皮细胞的治疗方法 | 腹主动脉瘤中的内皮细胞功能障碍及其分子和细胞机制 | NA | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |