单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2941 - 2960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2941 | 2024-08-08 |
miR-6077 promotes cisplatin/pemetrexed resistance in lung adenocarcinoma via CDKN1A/cell cycle arrest and KEAP1/ferroptosis pathways
2022-Jun-14, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2022.03.020
PMID:35505963
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9筛选技术，发现miR-6077通过调控CDKN1A/细胞周期阻滞和KEAP1/铁死亡途径，促进肺癌腺癌对顺铂/培美曲塞的耐药性 | 首次揭示miR-6077在肺癌腺癌中通过调控CDKN1A和KEAP1途径影响顺铂/培美曲塞的耐药性，为克服临床化疗耐药提供新策略 | NA | 探讨miR-6077在肺癌腺癌中对顺铂/培美曲塞耐药性的作用机制 | 肺癌腺癌细胞及其对顺铂/培美曲塞的耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | CRISPR-Cas9筛选, RNA测序, 单细胞测序 | NA | RNA | 细胞系和患者来源的异种移植模型 |
| 2942 | 2024-08-08 |
Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafish embryogenesis
2022-05-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.04.009
PMID:35512701
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研究论文 | 本研究利用Stereo-seq技术对91个斑马鱼胚胎切片在发育前24小时内的六个关键时间点进行了空间转录组分析，重建了斑马鱼胚胎发育过程中的细胞命运转变和分子变化的空间解析发育轨迹。 | 首次在接近细胞大小的分辨率下，通过空间转录组学技术，详细描绘了斑马鱼胚胎发育过程中的基因表达景观和发育轨迹。 | NA | 旨在通过空间转录组学技术，深入理解脊椎动物胚胎发育过程中的细胞命运决定和分子变化。 | 斑马鱼胚胎在发育前24小时内的基因表达和细胞命运转变。 | 数字病理学 | NA | Stereo-seq | NA | 空间转录组数据 | 91个斑马鱼胚胎切片，覆盖六个关键时间点，共获得152,977个spots。 |
| 2943 | 2024-08-08 |
Deep neural network modeling identifies biomarkers of response to immune-checkpoint therapy
2022-May-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104228
PMID:35494249
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研究论文 | 开发了一种名为DeepGeneX的计算框架，利用深度神经网络模型和特征消除技术，从单细胞RNA测序数据中筛选出六个关键基因，用于预测免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 首次利用深度神经网络模型从大量基因数据中筛选出关键的六个基因，用于准确预测免疫疗法的反应 | NA | 开发一种新的计算框架，用于识别预测免疫检查点疗法反应的生物标志物 | 单细胞RNA测序数据和免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因数据 | 约26,000个基因 |
| 2944 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals the Comma-1D cell line as a unique model for mammary gland development and breast cancer
2022-05-15, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.259329
PMID:35502723
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究，揭示了Comma-1D细胞系在乳腺发育和乳腺癌研究中的独特模型作用 | 发现Comma-1D细胞系包含具有腔上皮和基底上皮特征的主要细胞群，以及具有混合谱系和双潜能特征的较小细胞群 | 研究主要基于细胞系模型，可能与体内情况存在差异 | 研究乳腺上皮细胞异质性的发展及其对肿瘤发生的影响 | Comma-1D细胞系及其在乳腺发育和乳腺癌研究中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个Comma-1D细胞群 |
| 2945 | 2024-08-08 |
Simplified, Shear Induced Generation of Double Emulsions for Robust Compartmentalization during Single Genome Analysis
2022-May-11, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c22692
PMID:35502700
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研究论文 | 本文展示了双乳液滴（DE）在单基因分析中通过防止内容混合来解决单乳液滴（SE）的不稳定性问题 | 开发了一种简单的一层双乳液滴制造装置，兼容简单的表面处理，使得双乳液滴设备的制造更加容易，促进了其更广泛的应用 | NA | 解决单乳液滴在分析过程中的不稳定性问题，提高多步骤反应在液滴中的可行性 | 双乳液滴的稳定性和其在单基因分析中的应用 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA |
| 2946 | 2024-08-08 |
scSemiAE: a deep model with semi-supervised learning for single-cell transcriptomics
2022-May-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04703-0
PMID:35513780
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scSemiAE的半监督降维方法，基于自编码器模型，用于单细胞转录组学数据分析 | scSemiAE方法利用带有细胞亚群标签的数据集信息，指导寻找更好的低维表示，从而简化进一步分析 | NA | 开发一种半监督学习方法，用于单细胞RNA测序数据的降维和细胞亚群识别 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 自编码器（Autoencoder） | 转录组数据 | 五个公共数据集 |
| 2947 | 2024-08-08 |
Correction: Single-cell RNA sequencing of cultured human endometrial CD140b+CD146+ perivascular cells highlights the importance of in vivo microenvironment
2022-May-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02872-6
PMID:35513860
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2948 | 2024-08-08 |
Dual functions of microRNA-17 in maintaining cartilage homeostasis and protection against osteoarthritis
2022-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30119-8
PMID:35508470
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研究论文 | 本文研究了微RNA-17在维持软骨稳态和预防骨关节炎中的双重功能 | 首次报道了微RNA-17在骨关节炎中的保护作用及其通过靶向病理分解代谢因子来预防骨关节炎的机制 | NA | 探讨微RNA-17在维持软骨稳态和预防骨关节炎中的作用 | 微RNA-17在骨关节炎中的表达及其对软骨细胞的影响 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及透明软骨中的两种不同表层软骨细胞群体（C1/C2） |
| 2949 | 2024-08-08 |
Author Correction: scGNN is a novel graph neural network framework for single-cell RNA-Seq analyses
2022-May-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30331-6
PMID:35508488
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2950 | 2024-08-08 |
Single-cell N6-methyladenosine regulator patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to colorectal cancer progression and immunotherapy
2022-05-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03395-7
PMID:35509079
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，探讨了N6-甲基腺苷（m6A）RNA甲基化调节因子在肿瘤微环境（TME）中的作用，以及其对结直肠癌进展和免疫治疗的影响 | 首次揭示了m6A甲基化介导的肿瘤微环境细胞间通信在调控肿瘤生长和抗肿瘤免疫调节过程中的作用 | NA | 探究m6A RNA甲基化在肿瘤微环境中的功能及其对结直肠癌进展和免疫治疗的影响 | 结直肠癌肿瘤样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 65,362个单细胞来自33个结直肠癌肿瘤样本 |
| 2951 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Distinct Immune Landscape of Myeloid Cells in Coronary Culprit Plaques Causing Acute Coronary Syndrome
2022-05-03, Circulation
IF:35.5Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2952 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal a unique memory-like NK cell subset that accumulates with ageing and correlates with disease severity in COVID-19
2022-05-03, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01049-3
PMID:35501841
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了一种独特的记忆样NK细胞亚群，该亚群随年龄积累，并与COVID-19疾病严重程度相关 | 发现了一种独特的记忆样NK细胞亚群（NK2.1），该亚群在老年人群中积累，具有促炎特性，并表现出I型干扰素反应状态 | NA | 研究年龄对人类NK细胞的影响，特别是在单细胞水平上，并探讨其在COVID-19疾病中的作用 | 人类淋巴细胞和NK细胞，以及COVID-19患者和健康个体的NK细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 总共124名年轻和老年健康捐赠者，以及56名年轻和老年COVID-19患者 |
| 2953 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the immune heterogeneity and the repopulation of microglia by Hif1α in mice after spinal cord injury
2022-05-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04864-z
PMID:35504882
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠脊髓损伤后免疫细胞的异质性和微胶质细胞的再生过程 | 首次展示了脊髓损伤后微胶质细胞的再生来源及其调控因子Hif1α的作用 | NA | 探究脊髓损伤后微胶质细胞的再生机制及其对功能恢复的影响 | 小鼠脊髓损伤后的免疫细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后的早期和晚期阶段的免疫细胞 |
| 2954 | 2024-08-08 |
High-throughput single-сell sequencing in cancer research
2022-05-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00990-4
PMID:35504878
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综述 | 本文综述了高通量单细胞测序技术在肿瘤细胞演化、肿瘤免疫学和肿瘤免疫治疗领域的临床应用 | 介绍了单细胞测序在评估肿瘤进展、环境扰动响应、肿瘤微环境异质性和细胞间相互作用中的应用 | 讨论了单细胞分析在癌症研究中的局限性 | 总结单细胞测序在肿瘤研究中的临床应用，并分析肿瘤细胞对治疗的响应和免疫检查点免疫治疗的响应或抵抗 | 肿瘤细胞、基质细胞和浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 大量细胞 |
| 2955 | 2024-08-08 |
Ferroptosis-related local immune cytolytic activity in tumor microenvironment of basal cell and squamous cell carcinoma
2022-05-02, Aging
DOI:10.18632/aging.204057
PMID:35501667
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研究论文 | 本研究系统分析了铁死亡相关基因（FRGs）及其在基底细胞癌（BCC）和鳞状细胞癌（SCC）中的局部免疫细胞溶解活性（LICA）和肿瘤微环境（TME）代谢功能差异 | 首次详细揭示了铁死亡在BCC和SCC中的作用，并提出了基于FRGs的NQO1稳态模型 | 仅基于两个bulk RNA-seq数据集和一个单细胞RNA-seq数据集进行分析，可能需要更多数据支持 | 提高对BCC和SCC肿瘤进展及治疗效果差异的理解，寻找潜在的治疗靶点 | 基底细胞癌（BCC）和鳞状细胞癌（SCC） | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两个bulk RNA-seq数据集（GSE7553和GSE125285）和一个单细胞RNA-seq数据集（GSE123813） |
| 2956 | 2024-08-08 |
Expression-based species deconvolution and realignment removes misalignment error in multispecies single-cell data
2022-May-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04676-0
PMID:35501695
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研究论文 | 本文介绍了一种新的生物信息学流程，用于处理多物种单细胞数据中的错配错误，通过基于表达的物种反卷积和重对齐来最小化错误 | 开发了一种新的生物信息学流程，用于处理人和鼠混合单细胞分析中的错配错误和外显子多重映射事件 | NA | 评估错配错误和外显子多重映射事件的影响，并开发新的算法来最小化这些错误 | 人和鼠混合单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 包含乳腺癌异种移植组织的多种物种多样本单细胞文库 |
| 2957 | 2024-08-08 |
The macrophage-associated microRNA-4715-3p / Gasdermin D axis potentially indicates fibrosis progression in nonalcoholic fatty liver disease: evidence from transcriptome and biological data
2022-05, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2072602
PMID:35521691
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研究论文 | 本研究旨在探索非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展中可能指示或介导的新因子，通过使用多个批量和单细胞RNA测序数据集，明确了细胞群体的景观，并发现了NAFLD进展过程中显著高浸润的巨噬细胞（MPs）。 | 本研究通过蛋白质-蛋白质相互作用分析和验证，确定了八个作为有前景目标的枢纽基因，并预测了微小RNA（miR）-蛋白质相互作用，验证了在游离脂肪酸（FFA）诱导的巨噬细胞损伤模型中的作用。 | NA | 探索非酒精性脂肪肝病进展中可能指示或介导的新因子 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的巨噬细胞及相关分子 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个批量和单细胞RNA测序数据集 |
| 2958 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic and chromatin accessibility analyses of dairy cattle peripheral blood mononuclear cells and their responses to lipopolysaccharide
2022-Apr-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08562-0
PMID:35501711
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研究论文 | 本研究首次报道了奶牛外周血单个核细胞（PBMCs）的单细胞转录组和染色质可及性分析及其对脂多糖（LPS）刺激的响应 | 首次进行了奶牛PBMCs的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq），并分析了LPS刺激后的细胞响应 | NA | 研究奶牛PBMCs对LPS刺激的单细胞转录组和染色质可及性响应 | 奶牛外周血单个核细胞（PBMCs）及其对LPS的响应 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 涉及多种细胞类型，包括CD4 T细胞、CD8 T细胞、B细胞、单核细胞、自然杀伤细胞、固有淋巴细胞和树突状细胞 |
| 2959 | 2024-08-08 |
Dissecting Human Gonadal Cell Lineage Specification and Sex Determination Using A Single-cell RNA-seq Approach
2022-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.04.002
PMID:35513251
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类胚胎和胎儿中的胎儿生殖细胞（FGCs）和性腺体细胞，揭示了性腺发育中的细胞亚型和信号通路作用 | 发现了新的细胞亚型，如POU5F1SPARC FGCs和KRT19体细胞，并揭示了BMP信号通路在睾丸发育中的特定作用 | NA | 研究性腺细胞谱系特化和性别决定机制 | 人类胚胎和胎儿中的胎儿生殖细胞和性腺体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 涉及多个胚胎和胎儿样本 |
| 2960 | 2024-08-08 |
Identify the Prognostic and Immune Profile of VSIR in the Tumor Microenvironment: A Pan-Cancer Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.821649
PMID:35493077
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研究论文 | 本研究系统探讨了VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | 首次全面分析了VSIR在多种癌症中的表达模式及其与肿瘤免疫的关系，并预测了针对VSIR的敏感药物和免疫治疗价值 | NA | 探讨VSIR在肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序分析，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 33种癌症的样本 |