单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2901 - 2920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2901 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional profiling of human carotid plaques reveals a subpopulation of endothelial cells associated with stroke incidences
2022-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17354
PMID:35527426
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了有症状和无症状患者颈动脉斑块中的细胞异质性，并揭示了与中风发生相关的内皮细胞亚群 | 首次揭示了有症状和无症状颈动脉斑块中内皮细胞的异质性，并发现了与斑块稳定性和出血相关的特定基因AOC3 | NA | 揭示不同颈动脉斑块中的细胞异质性及其与中风发生的关系 | 有症状和无症状患者的颈动脉斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 有症状和无症状患者的颈动脉斑块样本 |
| 2902 | 2024-08-08 |
A downsampling method enables robust clustering and integration of single-cell transcriptome data
2022-06, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2022.104093
PMID:35537690
|
研究论文 | 本文提出了一种基于最小无偏代表点（MURP）的模型驱动下采样算法，用于增强单细胞转录组数据的聚类和整合 | MURP算法通过减少基因水平的随机独立误差并保留生物学来源的协方差结构，提供了一种无偏的细胞群体表示 | NA | 调整单细胞RNA测序数据中的随机噪声、采样偏差和批次效应，以增强下游分析的鲁棒性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | MURP | 转录组数据 | NA |
| 2903 | 2024-08-08 |
Lineage tracing reveals the phylodynamics, plasticity, and paths of tumor evolution
2022-05-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.04.015
PMID:35523183
|
研究论文 | 本研究通过引入一个具有单细胞RNA测序读出的进化谱系追踪系统，在Kras;Trp53(KP)驱动的肺腺癌小鼠模型中，以空前的分辨率追踪了从单个转化细胞到转移性肿瘤的肿瘤进化过程。 | 研究首次在单细胞水平上追踪了肿瘤从初始稳定状态到转移性亚克隆的进化过程，揭示了肿瘤进化的层次性质和可塑性的变化。 | 研究主要集中在小鼠模型上，其结果在人类肿瘤中的适用性需要进一步验证。 | 揭示肿瘤进化的动态过程和可塑性，以及肿瘤发展的典型进化轨迹。 | Kras;Trp53(KP)驱动的肺腺癌小鼠模型中的肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及从小鼠模型中获得的多个肿瘤样本 |
| 2904 | 2024-08-08 |
scIMC: a platform for benchmarking comparison and visualization analysis of scRNA-seq data imputation methods
2022-05-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac317
PMID:35524568
|
研究论文 | 本文介绍了scIMC平台，用于比较和可视化分析scRNA-seq数据插补方法 | 开发了首个集成所有先进插补方法的在线平台scIMC，用于基准比较和可视化分析 | NA | 全面评估和比较现有的scRNA-seq数据插补方法 | scRNA-seq数据插补方法的性能 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | 深度学习模型 | scRNA-seq数据 | 六个模拟数据集和两个真实数据集 |
| 2905 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: a promising approach for uncovering the mechanisms of tumor metastasis
2022-05-12, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-022-01280-w
PMID:35549970
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肿瘤转移机制研究和治疗策略开发中的应用 | 单细胞测序技术结合人工智能用于液体活检中循环肿瘤细胞的识别，为肿瘤转移治疗提供了新策略 | 讨论了单细胞测序技术的前景和局限性，为寻找治疗靶点和转移机制提供了理论基础 | 探索肿瘤转移机制和开发治疗策略 | 肿瘤转移相关的恶性生物特征、细胞图谱构建、治疗靶点识别 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组学、转录组学和表观遗传学数据 | 单个细胞级别 |
| 2906 | 2024-08-08 |
Variant calling from scRNA-seq data allows the assessment of cellular identity in patient-derived cell lines
2022-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30230-w
PMID:35551450
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2907 | 2024-08-08 |
Conservation and divergence of myelin proteome and oligodendrocyte transcriptome profiles between humans and mice
2022-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77019
PMID:35543322
|
研究论文 | 本文通过定量蛋白质组学分析人类和鼠类髓鞘的蛋白质组成，发现结构髓鞘蛋白的相对丰度在人类和C57Bl/6N鼠之间高度相关，但也存在一些特异性的蛋白质表达差异 | 首次系统比较了人类和鼠类髓鞘蛋白质组和少突胶质细胞转录组谱的相似性与差异性 | NA | 探讨人类和鼠类髓鞘蛋白质组成和少突胶质细胞转录组谱的相似性与差异性 | 人类和鼠类的髓鞘蛋白质和少突胶质细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 人类和C57Bl/6N鼠的髓鞘样本 |
| 2908 | 2024-08-08 |
Decoding the pathogenesis of Diamond-Blackfan anemia using single-cell RNA-seq
2022-May-10, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00389-z
PMID:35534476
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自不同治疗组（未治疗、糖皮质激素响应和非响应）的Diamond-Blackfan贫血（DBA）患者的纯化红系前体细胞的转录组 | 首次将红系前体细胞的固有较短细胞周期与DBA发病机制联系起来，并证明了干扰素介导的细胞周期控制在糖皮质激素临床疗效中的作用 | NA | 探索Diamond-Blackfan贫血的发病机制及潜在治疗策略 | DBA患者的红系前体细胞 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自不同治疗组的DBA患者骨髓中的红系前体细胞 |
| 2909 | 2024-08-08 |
Robust and scalable barcoding for massively parallel long-read sequencing
2022-05-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-11656-0
PMID:35538127
|
研究论文 | 本文介绍了使用NS-watermark条形码技术在ONT MinION平台上对两种远缘物种的扩增子进行标记和同时测序的方法 | 首次报道了基于微阵列的合成作为大型寡核苷酸池来源用于条形码技术，并实现了迄今为止最大数量的非随机标签并行测序 | NA | 验证NS-watermark条形码在长读长测序技术中的错误校正能力和应用潜力 | NS-watermark条形码在ONT MinION平台上的应用 | 测序技术 | NA | ONT | NA | 序列数据 | 3840个NS-watermark条形码 |
| 2910 | 2024-08-08 |
Identification of distinct non-myogenic skeletal-muscle-resident mesenchymal cell populations
2022-05-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110785
PMID:35545045
|
研究论文 | 本文通过多种技术手段，包括谱系/报告基因分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫荧光染色和分化实验，对正常和受伤的小鼠肌肉中的非肌源性肌肉驻留间充质细胞进行了详细鉴定 | 本文首次鉴定出六种不同的Pdgfra非肌源性肌肉驻留间充质细胞群，并描述了它们从共同前体细胞向两个不同分化轨迹的演变 | NA | 进一步定义肌肉驻留间充质细胞群 | 非肌源性肌肉驻留间充质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 细胞 | 小鼠肌肉组织 |
| 2911 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics provides insights into hypertrophic cardiomyopathy
2022-05-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110809
PMID:35545053
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析肥厚型心肌病患者的间隔心肌切除样本，揭示了与疾病相关的基因、转录因子和细胞大小的功能联系 | 首次利用单细胞RNA测序技术在人类肥厚型心脏中揭示了心肌细胞异质性和分子事件，为开发增强疗法提供了新见解 | NA | 深入理解驱动心肌细胞肥大的基因网络，以改进治疗策略 | 肥厚型心肌病患者的间隔心肌切除样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 2912 | 2024-08-08 |
Global coordination level in single-cell transcriptomic data
2022-05-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-11507-y
PMID:35534606
|
研究论文 | 本文系统分析了单细胞转录组数据中基因全局协调水平（GCL）的性能 | 开发了一种'自上而下'的方法来评估单细胞转录组数据中基因之间的全局协调水平 | 单个异常细胞可能对计算出的GCL有不成比例的影响，且GCL受数据中集群存在的影响 | 评估和分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中基因的全局协调水平 | 单细胞转录组数据中的基因协调水平 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2913 | 2024-08-08 |
Adamantinomatous craniopharyngioma cyst fluid can trigger inflammatory activation of microglia to damage the hypothalamic neurons by inducing the production of β-amyloid
2022-May-07, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02470-6
PMID:35525962
|
research paper | 本研究构建了一种新的动物模型，用于研究颅咽管瘤囊液引起的下丘脑损伤及其机制 | 首次发现颅咽管瘤囊液能够触发小胶质细胞的炎症激活，从而损伤下丘脑 | NA | 构建可靠的颅咽管瘤囊液诱导的下丘脑损伤动物模型，并探索囊液导致下丘脑损伤的具体机制 | 颅咽管瘤囊液对下丘脑的影响及其机制 | NA | 颅咽管瘤 | ScRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及颅咽管瘤样本 |
| 2914 | 2024-08-08 |
The role of serum amyloid A1 in the adipogenic differentiation of human adipose-derived stem cells basing on single-cell RNA sequencing analysis
2022-05-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02873-5
PMID:35525990
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了血清淀粉样蛋白A1（SAA1）在人脂肪干细胞向脂肪细胞分化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了SAA1在脂肪干细胞分化过程中的表达变化及其对炎症反应的调控作用 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内环境的影响 | 探究SAA1在人脂肪干细胞向脂肪细胞分化中的分子机制 | 人脂肪干细胞及其向脂肪细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 共分析了8849个细胞，其中未分化组4415个细胞，分化组4634个细胞 |
| 2915 | 2024-08-08 |
Single-cell characterization of malignant phenotypes and microenvironment alteration in retinoblastoma
2022-05-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04904-8
PMID:35523772
|
研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组和全外显子测序分析，详细描述了视网膜母细胞瘤（RB）中的恶性表型和微环境改变 | 首次详细描绘了RB中单细胞水平的恶性表型和微环境特征，揭示了肿瘤细胞和微环境在RB恶性进展中的作用 | NA | 探究视网膜母细胞瘤中肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境对恶性进展的影响 | 视网膜母细胞瘤患者的肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 儿童常见眼内原发性恶性肿瘤 | 单细胞转录组测序和全外显子测序 | NA | 转录组数据 | 7名RB患者的肿瘤样本，约70,000个细胞 |
| 2916 | 2024-08-08 |
Human branching cholangiocyte organoids recapitulate functional bile duct formation
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.011
PMID:35523140
|
研究论文 | 本文报道了建立人类分支胆管上皮细胞类器官（BRCO）培养方法，这些类器官自发组织成复杂的管状结构，类似于肝内胆管的结构 | BRCOs能够模拟肝内胆管的分支生长，并且这种生长依赖于JAG1/NOTCH2信号传导，为胆管疾病的研究提供了改进的模型 | NA | 研究胆管上皮细胞类器官的分支形态发生及其在胆管疾病研究中的应用 | 人类分支胆管上皮细胞类器官（BRCO）及其在胆管癌类器官中的应用 | 数字病理学 | 胆管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 类器官 | NA |
| 2917 | 2024-08-08 |
p57Kip2 imposes the reserve stem cell state of gastric chief cells
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.001
PMID:35523142
|
研究论文 | 本文研究了p57在维持胃主细胞干细胞状态中的作用 | 首次确定p57作为调节胃主细胞干细胞状态的分子开关 | NA | 探讨p57在胃主细胞干细胞状态中的作用及其对组织再生的影响 | 胃主细胞及其干细胞状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序，dox诱导的谱系追踪 | NA | RNA | 小鼠 |
| 2918 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.821
PMID:35522918
|
研究论文 | 本研究构建了首个涵盖整个妊娠期的孕妇外周血单个核细胞的单细胞图谱 | 首次构建了孕妇外周血单个核细胞的单细胞图谱，并开发了特定细胞类型模型来预测正常妊娠的孕周 | NA | 旨在深入理解孕妇外周血单个核细胞在妊娠期间的组成变化 | 孕妇的外周血单个核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 特定细胞类型模型 | RNA | 198,356个外周血单个核细胞来自136名孕妇 |
| 2919 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling-guided combination therapy of c-Fos and histone deacetylase inhibitors in diffuse large B-cell lymphoma
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.798
PMID:35522945
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术评估了c-Fos和组蛋白去乙酰化酶抑制剂在弥漫大B细胞淋巴瘤中的联合治疗效果 | 本研究筛选并确认了LAQ824在弥漫大B细胞淋巴瘤中的高效性，并提出了一种基于HDACi的联合治疗策略 | NA | 探索更优的组蛋白去乙酰化酶抑制剂及优化相关的联合治疗策略 | 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2920 | 2024-08-08 |
RETRACTED: Parallel bimodal single-cell sequencing of transcriptome and methylome provides molecular and translational insights on oocyte maturation and maternal aging
2022-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110379
PMID:35526740
|
correction | 本文已被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |