单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2821 - 2840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2821 | 2024-08-08 |
Analysis of single-cell RNA-sequencing data identifies a hypoxic tumor subpopulation associated with poor prognosis in triple-negative breast cancer
2022-04-06, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022271
PMID:35603379
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析三阴性乳腺癌中的缺氧肿瘤亚群，并探讨其与不良预后的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与三阴性乳腺癌不良预后相关的缺氧肿瘤亚群，并构建了预测总体生存的风险评分模型 | 需要进一步研究缺氧肿瘤微环境中的细胞间通讯异质性 | 探索三阴性乳腺癌中缺氧肿瘤亚群与不良预后的机制 | 三阴性乳腺癌中的缺氧肿瘤亚群及其在肿瘤发展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞RNA测序数据GSM4476488，以及来自The Cancer Genome Atlas和GEO的数据集 |
| 2822 | 2024-08-08 |
Deciphering the Molecular Mechanism of Flares in Patients with Systemic Lupus Erythematosus through Single-Cell Transcriptome Analysis of the Peripheral Blood
2022-Mar, Mediterranean journal of rheumatology
DOI:10.31138/mjr.33.1.94
PMID:35611101
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析技术，探索系统性红斑狼疮患者外周血中细胞和分子机制，以解释疾病从静止期到活动期的进展 | 采用单细胞测序技术，详细描绘了系统性红斑狼疮从静止期到活动期进展中免疫细胞亚群的分子和调控程序 | NA | 解码系统性红斑狼疮患者病情加重的细胞和分子基础 | 系统性红斑狼疮患者的外周血细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 数千个细胞 |
| 2823 | 2024-08-08 |
NISC: Neural Network-Imputation for Single-Cell RNA Sequencing and Cell Type Clustering
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.847112
PMID:35591853
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研究论文 | 本研究开发了一种基于神经网络的单细胞RNA测序数据插补方法NISC，用于处理高稀疏性的scRNA-seq数据并提高细胞类型识别的准确性 | NISC利用自编码器结合加权损失函数和正则化技术，有效纠正scRNA-seq数据中的缺失值，其性能优于现有的插补方法 | NA | 开发一种新的插补方法以处理单细胞RNA测序数据中的高稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型聚类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 数万个单个细胞 |
| 2824 | 2024-08-08 |
PRKAR1A and SDCBP Serve as Potential Predictors of Heart Failure Following Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.878876
PMID:35592331
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研究论文 | 本研究旨在通过转录组数据分析，识别急性心肌梗死后心力衰竭进展的新预测生物标志物，并揭示这些标志基因在心力衰竭进展中的病理机制 | 本研究首次发现PRKAR1A和SDCBP作为急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物，并揭示了它们在心力衰竭进展中的潜在调控机制 | 研究样本量较小，需要在更大规模的研究中验证这些生物标志物的预测价值 | 识别急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物，并揭示其病理机制 | 急性心肌梗死患者的心力衰竭进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 转录组数据 | 32名急性心肌梗死患者（16名心力衰竭进展，16名无进展），17名急性心肌梗死患者（9名心力衰竭进展，8名无进展），正常和梗死小鼠心脏组织中的白细胞 |
| 2825 | 2024-08-08 |
A Protocol for the Cryopreservation of Human Intestinal Mucosal Biopsies Compatible With Single-Cell Transcriptomics and Ex Vivo Studies
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.878389
PMID:35600311
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人肠道黏膜活检的冷冻保存工作流程，该流程适用于单细胞转录组学和体外研究 | 该研究提供了一种可行的方法，用于从冷冻保存的肠道黏膜活检中进行单细胞转录组学研究 | NA | 旨在理解疾病状态下人肠道上皮细胞的异质性及其病理生理机制 | 人肠道黏膜活检和肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 单细胞 | 59,653个肠道细胞，来自10名参与者 |
| 2826 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Targets for Parkinson's Disease
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.686739
PMID:35601482
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示帕金森病（PD）的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析PD患者与健康人的中脑样本，揭示了PD的细胞异质性及其在细胞间通讯中的作用，并发现了五个可能的治疗靶点 | 研究样本量较小，且仅限于中脑样本，需要进一步的大规模临床研究验证 | 揭示帕金森病的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 帕金森病患者与健康人的中脑样本 | 单细胞转录组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析（PCA） | 转录组数据 | 18名帕金森病患者和18名健康人的血液样本 |
| 2827 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveal Intratumoral Heterogeneity and Tumor Microenvironment Characteristics in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.881345
PMID:35601491
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的肿瘤内异质性和肿瘤微环境特征 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了DLBCL中恶性细胞和免疫细胞的不同亚群，并构建了一个预测DLBCL患者预后的模型 | NA | 旨在深入解析弥漫大B细胞淋巴瘤的转录特征和肿瘤微环境 | 弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2个反应性淋巴结组织样本和2个DLBCL淋巴结活检组织样本 |
| 2828 | 2024-08-08 |
A Molecular Landscape of Mouse Hippocampal Neuromodulation
2022, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2022.836930
PMID:35601530
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据和转录组神经分类学，探索了小鼠海马区CA1区域的细胞类型特异性基因表达，旨在揭示这一脑结构的神经调节网络架构 | 利用新的单细胞RNA测序数据和转录组神经分类学，为神经调节的网络级组织提供了新的见解 | 神经调节在网络级别的组织仍然是一个谜 | 揭示小鼠海马区CA1区域的神经调节网络架构 | 小鼠海马区CA1区域的细胞类型特异性基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠海马区CA1区域的细胞 |
| 2829 | 2024-08-08 |
Revisiting the Transcriptome Landscape of Pig Embryo Implantation Site at Single-Cell Resolution
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.796358
PMID:35602598
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了猪胚胎着床位点的转录组景观，揭示了胚胎细胞与母体子宫内膜细胞之间的细胞间通讯机制 | 成功分离胚胎细胞与母体子宫内膜细胞，并利用CellChat工具揭示了两种细胞类型间的细胞间通讯 | NA | 解析猪胚胎着床的分子机制 | 猪胚胎着床位点的胚胎细胞与母体子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 少量胚胎及其周围子宫内膜组织 |
| 2830 | 2024-08-08 |
Identification of Energy Metabolism-Related Gene Signatures From scRNA-Seq Data to Predict the Prognosis of Liver Cancer Patients
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.858336
PMID:35602603
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序数据，从能量代谢角度分析肝癌，并识别与能量代谢相关的基因特征，以预测肝癌患者的预后 | 首次基于单细胞测序数据，从能量代谢角度分析肝癌，并建立能量代谢相关评分（EM评分），分析不同评分组患者对化疗药物和免疫检查点抑制剂的敏感性 | NA | 通过分析肝癌患者的单细胞测序数据，识别与能量代谢相关的基因特征，以改善肝癌的靶向治疗策略 | 肝癌患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 基因数据 | 肝癌患者的单细胞和批量测序数据 |
| 2831 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals Types of Hepatopancreatic Cells and Haemocytes in Black Tiger Shrimp (Penaeus monodon) and Their Molecular Responses to Ammonia Stress
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883043
PMID:35603188
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了黑虎虾肝胰腺和血细胞的单细胞转录图谱，并分析了它们对氨氮压力的分子应答机制 | 首次应用10× Genomics的单细胞RNA测序技术于虾类研究，构建了虾类肝胰腺细胞和血细胞在氨氮压力下的单细胞转录图谱 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术分析虾类细胞类型及其对氨氮压力的免疫应答分子机制 | 黑虎虾的肝胰腺细胞和血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在两种组织（血细胞和肝胰腺）中分别成功识别出七个细胞簇 |
| 2832 | 2024-08-08 |
Single Cell Dissection of Epithelial-Immune Cellular Interplay in Acute Kidney Injury Microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857025
PMID:35603220
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，系统解析了急性肾损伤（AKI）微环境中上皮细胞与免疫细胞的相互作用 | 发现了三种新的近端小管细胞亚型，并揭示了它们在AKI进展中的分子变化和功能 | NA | 深入理解急性肾损伤的分子变化机制，并开发新的靶向治疗 | 小鼠肾脏组织样本在缺血-再灌注AKI后的不同时间点 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠肾脏组织样本在AKI后的1天、2天和3天以及健康对照组 |
| 2833 | 2024-08-08 |
scEFSC: Accurate single-cell RNA-seq data analysis via ensemble consensus clustering based on multiple feature selections
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.04.023
PMID:35615016
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研究论文 | 本文提出了一种基于多特征选择的集成共识聚类方法scEFSC，用于准确分析单细胞RNA测序数据 | scEFSC算法采用多种无监督特征选择方法去除对单细胞RNA测序数据贡献不大的基因，并通过加权元聚类组合不同聚类算法的结果，提高了聚类性能 | 文章未明确提及现有方法的具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据分析中的数值不稳定、高维度和计算可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA测序数据 | 14个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 2834 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis implicates TH17-to-TH2 cell plasticity in the pathogenesis of palmoplantar pustulosis
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.04.027
PMID:35568077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了掌跖脓疱病（PPP）患者的皮肤活检样本和外周血单个核细胞，揭示了TH17向TH2细胞可塑性在PPP发病机制中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了PPP患者中TH17向TH2细胞的可塑性，并验证了这一发现。 | 研究仅限于皮肤活检样本和外周血单个核细胞的分析，未涉及其他组织或细胞类型。 | 探究掌跖脓疱病（PPP）的免疫途径和发病机制。 | 掌跖脓疱病（PPP）患者的皮肤活检样本和外周血单个核细胞。 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序（RNA-Seq）、流式细胞术、免疫荧光显微镜 | NA | RNA | 涉及健康个体和PPP患者的皮肤活检样本及外周血单个核细胞。 |
| 2835 | 2024-08-08 |
Identification of islet cell characteristics in humans with type 2 diabetes by single-cell sequencing
2022-Oct, Journal of diabetes investigation
IF:3.1Q2
DOI:10.1111/jdi.13833
PMID:35578579
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了2型糖尿病患者胰岛细胞的特征 | 首次通过单细胞测序技术识别了2型糖尿病状态下人类β细胞中调节蛋白活性的改变 | 实验在人体胰腺β细胞中的应用存在困难，限制了治疗选项的开发 | 探索逆转或保护β细胞免于失败的策略 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2836 | 2024-08-08 |
FIRM: Flexible integration of single-cell RNA-sequencing data for large-scale multi-tissue cell atlas datasets
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac167
PMID:35561293
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FIRM的重新缩放算法，用于跨多种组织类型、平台和实验批次准确整合单细胞RNA测序数据集 | FIRM算法能够准确混合共享的细胞类型身份，并保留原始结构，避免了过度校正，为下游探索和分析生成稳健的整合数据集 | NA | 开发一种算法以解决不同单细胞RNA测序技术平台和批次效应带来的数据整合难题 | 单细胞RNA测序数据集的整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模多组织细胞图谱数据集 |
| 2837 | 2024-08-08 |
Reprogramming of Hepatic Metabolism and Microenvironment in Nonalcoholic Steatohepatitis
2022-08-22, Annual review of nutrition
IF:12.6Q1
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）及其严重形式非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的最新研究进展，特别是遗传、表观遗传和饮食因素以及代谢功能障碍在其他组织中的作用，以及单细胞RNA测序揭示的肝脏细胞异质性和微环境重编程的分子细节。 | 单细胞RNA测序技术揭示了肝脏细胞异质性和微环境的分子细节，为理解NASH的发病机制提供了新的视角。 | NA | 探讨NAFLD/NASH的病理生理机制及潜在的治疗机会。 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）及其严重形式非酒精性脂肪性肝炎（NASH）。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2838 | 2024-08-08 |
Distinct disease-specific Tfh cell populations in 2 different fibrotic diseases: IgG4-related disease and Kimura disease
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.03.034
PMID:35568079
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研究论文 | 本文研究了两种不同纤维化疾病中特定Tfh细胞亚群的特征，包括IgG4相关疾病和Kimura病。 | 发现了IgG4相关疾病患者受累器官中浸润的IL-10+LAG3+ Tfh细胞的新亚群，以及Kimura病患者中IL-13+ Tfh细胞和类型2免疫细胞的浸润。 | NA | 旨在识别次级和三级淋巴器官中表达IL-10或IL-13的疾病特异性Tfh细胞亚群，以识别两种不同类型纤维化疾病的不同细胞驱动因子。 | B细胞、Tfh细胞和浸润的类型2细胞在Kimura病或IgG4相关疾病患者病变组织中的特征。 | 免疫学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、原位测序和多色免疫荧光分析 | NA | 组织样本 | Kimura病和IgG4相关疾病患者的病变组织样本 |
| 2839 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq of UVB-radiated skin reveals landscape of photoaging-related inflammation and protection by vitamin D
2022-Jul-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.146563
PMID:35577040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探究了紫外线辐射对小鼠皮肤的影响，并发现维生素D对皮肤炎症的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了紫外线辐射引起的皮肤炎症反应及其相关基因表达变化 | NA | 探究紫外线辐射对皮肤的影响及维生素D的保护作用 | 紫外线辐射的小鼠皮肤 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2840 | 2024-08-08 |
The MAP3K1/c-JUN signaling axis regulates glioblastoma stem cell invasion and tumor progression
2022-07-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.04.057
PMID:35567901
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研究论文 | 本研究通过公共单细胞RNA测序数据，发现MAP3K1通过调控c-JUN信号通路在胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）的侵袭和肿瘤进展中起主要作用 | 首次揭示了MAP3K1通过磷酸化下游c-JUN在丝氨酸63和73位点调控GSC侵袭的机制，并证实了MAP3K1/c-JUN信号轴作为侵袭性GBM治疗靶点的潜力 | NA | 研究MAP3K1在胶质母细胞瘤干细胞侵袭和肿瘤进展中的作用机制 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | NA |