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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies the interaction of altered renal tubules with basophils orchestrating kidney fibrosis
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01200-7
PMID:35552540
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示了肾脏纤维化中改变肾小管与嗜碱性粒细胞的相互作用机制 | 首次发现促纤维化肾小管通过分泌CXCL1招募CXCR2阳性嗜碱性粒细胞,并证实这些细胞是IL-6和Th17细胞招募的重要来源 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 探究肾脏纤维化过程中的免疫调控机制 | 小鼠肾脏纤维化模型和人类肾脏纤维化患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序,免疫染色,基因表达分析 | NA | 单细胞基因表达数据,bulk RNA-seq数据,免疫组织化学数据 | 小鼠模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2025-10-07 |
An estrogen-sensitive fibroblast population drives abdominal muscle fibrosis in an inguinal hernia mouse model
2022-04-19, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.152011
PMID:35439171
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现雌激素敏感成纤维细胞群驱动腹股沟疝小鼠模型中腹部肌肉纤维化 | 鉴定出两个潜在新型疝相关成纤维细胞群,其中Esr1hi成纤维细胞作为表达ECM修饰酶Mmp3hi细胞群的前体细胞 | 研究基于转基因小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 探究雌激素驱动肌肉纤维化的细胞基础 | 人芳香酶基因转基因雄性小鼠(Aromhum)和野生型同窝小鼠的下腹部肌肉组织 | 单细胞生物学 | 腹股沟疝 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转基因和野生型小鼠的下腹部肌肉组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-07 |
m6A is required for resolving progenitor identity during planarian stem cell differentiation
2022-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021109895
PMID:35971838
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研究论文 | 本研究揭示了m6A mRNA修饰在涡虫干细胞分化和组织稳态中的关键作用 | 首次发现m6A修饰与染色质修饰复合体NuRD之间的功能联系,并证明m6A在细胞命运决定中的必要性 | 研究仅限于涡虫模型,在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究m6A mRNA修饰在干细胞分化和组织再生中的功能机制 | 涡虫干细胞(新生细胞)及其分化过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达数据集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞进行单细胞RNA测序,分析超过1,000个基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2025-10-07 |
Macrophage-specific inhibition of the histone demethylase JMJD3 decreases STING and pathologic inflammation in diabetic wound repair
2022-11, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-022-00919-5
PMID:36127466
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现JMJD3在糖尿病伤口巨噬细胞中表达升高,并通过纳米颗粒特异性抑制JMJD3可改善糖尿病伤口修复 | 首次揭示JMJD3通过调控STING基因表达影响糖尿病伤口巨噬细胞的炎症状态,并提出巨噬细胞特异性靶向治疗策略 | 研究主要关注巨噬细胞特异性机制,其他细胞类型在糖尿病伤口修复中的作用未充分探讨 | 探究JMJD3在糖尿病伤口修复中调控巨噬细胞炎症反应的分子机制 | 人类糖尿病伤口组织、小鼠糖尿病伤口模型、巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类糖尿病伤口样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-07 |
Venus: An efficient virus infection detection and fusion site discovery method using single-cell and bulk RNA-seq data
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010636
PMID:36301997
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研究论文 | 开发了一种名为Venus的高效计算方法,用于检测病毒感染并发现病毒整合位点 | 提出首个能够同时处理单细胞和批量组织RNA-seq数据的病毒检测与整合位点发现流程 | NA | 开发高效的病毒检测和整合位点发现计算方法 | 病毒感染的组织/细胞类型 | 生物信息学 | 病毒感染 | RNA-seq | 计算流程 | RNA-seq数据 | 多种病毒数据集(HBV-肝细胞癌、HIV感染等) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2025-10-07 |
Molecular hallmarks of heterochronic parabiosis at single-cell resolution
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04461-2
PMID:35236985
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析20个器官,揭示异种共生模型中年轻和老年血液对不同细胞类型的特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统研究异种共生对多种器官细胞类型的影响,发现线粒体功能在复苏过程中的关键作用 | 研究主要关注基因表达变化,对具体分子机制和长期效果仍需进一步验证 | 探索血液因子对衰老过程的影响及潜在复苏机制 | 小鼠20个器官中的多种细胞类型 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 异种共生模型 | 单细胞转录组数据 | 20个器官的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2025-10-07 |
Ornithine decarboxylase supports ILC3 responses in infectious and autoimmune colitis through positive regulation of IL-22 transcription
2022-Nov-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2214900119
PMID:36279426
|
研究论文 | 本研究揭示了鸟氨酸脱羧酶通过调节IL-22转录支持ILC3细胞在感染性和自身免疫性结肠炎中的免疫应答 | 首次发现ILC3细胞具有独特的多胺生物合成代谢特征,并证明ODC1通过正调控IL-22转录影响肠道免疫防御和自身免疫性结肠炎 | 研究主要基于小鼠模型,人类ILC3细胞中多胺代谢的作用仍需验证 | 探究ILC3细胞的代谢特征及其在肠道免疫应答中的作用机制 | 第3组固有淋巴细胞(ILC3s)及其代谢途径 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, 代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 小鼠肠道ILC细胞亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-07 |
Opposing roles of hepatic stellate cell subpopulations in hepatocarcinogenesis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05289-6
PMID:36198802
|
研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞不同亚群在肝癌发生中的双重作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定肝星状细胞亚群,并发现其从肝癌保护向促进的动态转换机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究肝星状细胞在肝细胞癌发生发展过程中的功能作用 | 肝星状细胞亚群及其与肝细胞的相互作用 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,遗传消融技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类肝星状细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2025-10-07 |
Redefining inflammatory macrophage phenotypes across stages and tissues by single-cell transcriptomics
2022-04-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abo4652
PMID:35427177
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学重新定义不同阶段和组织中的炎症巨噬细胞表型 | 利用单细胞转录组数据识别单核细胞衍生巨噬细胞的主要活化路径,为炎症组织巨噬细胞提供新框架 | NA | 建立炎症巨噬细胞表型的分类框架 | 单核细胞衍生巨噬细胞和炎症组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Features of Heterogeneity in the Murine Retinal Pigment Epithelium
2022-Sep-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810419
PMID:36142331
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠视网膜色素上皮细胞的分子异质性特征 | 首次在小鼠视网膜色素上皮中识别出6个不同的细胞群体,包括含有1-2%细胞的干细胞/祖细胞群体,并构建了细胞分化伪时间轨迹 | 仅使用2只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠,样本量较小 | 研究视网膜色素上皮细胞的转录组异质性及其发育过程中的分子特征 | 小鼠视网膜色素上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | 主成分分析,UMAP,K-means聚类,伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 2只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠的5513个RPE细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2025-10-07 |
Protocol to isolate live single cells while retaining spatial information by combining cell photolabeling and FACS
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101795
PMID:36325581
|
研究论文 | 开发了一种结合细胞光标记和流式细胞分选技术来分离活单细胞同时保留空间信息的实验方案 | 提出PADME方法,通过光转换技术标记特定区域细胞,在单细胞分离过程中保留空间定位信息 | NA | 开发保留空间信息的单细胞分离技术 | 原发性乳腺肿瘤细胞 | 单细胞技术 | 乳腺癌 | 细胞光标记,FACS,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | NA |
| 272 | 2025-10-07 |
Mucosal Vaccination with Cyclic Dinucleotide Adjuvants Induces Effective T Cell Homing and IL-17-Dependent Protection against Mycobacterium tuberculosis Infection
2022-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100029
PMID:34965963
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研究论文 | 本研究揭示了环二核苷酸佐剂通过黏膜疫苗接种诱导T细胞归巢和IL-17依赖性保护机制抵抗结核分枝杆菌感染 | 首次阐明CDN佐剂疫苗通过诱导Th17细胞代谢状态改变和CD153表达实现保护作用的机制,并证明单纯诱导Th17细胞不足以提供保护 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证 | 探究环二核苷酸佐剂疫苗对抗结核感染的免疫保护机制 | 小鼠模型中的免疫细胞反应和结核分枝杆菌感染 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-07 |
Targeting the TREM1-positive myeloid microenvironment in glioblastoma
2022 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdac149
PMID:36249290
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中TREM1阳性髓系微环境的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现TREM1阳性髓系微环境促进胶质母细胞瘤异质性,并证明HuR二聚化抑制剂SRI42127可有效抑制该微环境 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 研究胶质母细胞瘤中髓系微环境的作用机制并探索其治疗靶向策略 | 胶质母细胞瘤患者样本、PDX细胞系、小鼠胶质母细胞瘤模型 | 肿瘤微环境研究 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外细胞融合实验、细胞迁移实验 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 转录组数据、单细胞数据、体内外实验数据 | 5个PDX细胞系、2个小鼠胶质母细胞瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-10-07 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现重症COVID-19与鼻咽部真菌定植及鼻腔上皮IL-17反应增强相关 | 首次在单细胞水平揭示重症COVID-19患者鼻咽部真菌定植与IL-17免疫应答的关联 | 样本量有限,真菌检测方法可能存在灵敏度限制 | 探讨COVID-19严重程度与呼吸道真菌定植及局部免疫应答的关系 | COVID-19患者的鼻咽部和气管样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 先前研究队列的子集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2025-10-07 |
CD4+ T-Cell Dysfunction in Severe COVID-19 Disease Is Tumor Necrosis Factor-α/Tumor Necrosis Factor Receptor 1-Dependent
2022-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202111-2493OC
PMID:35348444
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研究论文 | 本研究揭示了严重COVID-19患者CD4+ T细胞功能失调与TNF-α/TNFR1信号通路的依赖性关系 | 首次证明严重COVID-19中CD4+ T细胞功能失调依赖于TNF-α/TNFR1通路,且TNF-α阻断能挽救T细胞功能 | 研究样本量有限,需要更大规模研究验证TNF-α阻断治疗的临床效益 | 探究严重COVID-19患者T细胞功能失调的免疫机制 | 148名严重COVID-19患者及轻度康复患者的免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 148名严重COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-07 |
Multimodal profiling of lung granulomas in macaques reveals cellular correlates of tuberculosis control
2022-05-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.04.004
PMID:35483355
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研究论文 | 通过多模态方法研究猕猴肺肉芽肿,揭示结核病控制的细胞相关性 | 首次通过共配准纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序和细菌清除测量,系统识别肉芽肿中细菌控制的细胞相关性 | 研究仅限于猕猴模型,人类肉芽肿可能存在差异 | 揭示结核病肉芽肿中细菌控制与持续的细胞和分子机制 | 食蟹猕猴肺结核肉芽肿 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, PET-CT成像 | NA | 影像数据, 基因表达数据 | 猕猴肺肉芽肿样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-07 |
Transcriptional programming of immunoregulatory responses in human Langerhans cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.892254
PMID:36203560
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析研究人表皮朗格汉斯细胞在稳态和迁移过程中的转录编程及其免疫调节功能 | 首次揭示稳态朗格汉斯细胞存在于连续成熟状态,并发现迁移诱导的免疫调节基因组模块和关键转录因子网络 | NA | 研究人原代朗格汉斯细胞在稳态期间的转录编程和免疫调节功能 | 人表皮朗格汉斯细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC, Partial Information Decomposition in Context | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2025-10-07 |
Heterogeneity and Molecular Markers for CNS Glial Cells Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2022-Nov, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-021-01159-3
PMID:34704168
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综述 | 本文通过单细胞转录组学技术系统总结了中枢神经系统主要胶质细胞的分子标记及其异质性特征 | 从单细胞转录组层面系统揭示胶质细胞在不同物种、CNS区域、发育阶段和病理状态下的异质性特征 | NA | 总结中枢神经系统胶质细胞的分子标记和异质性特征 | 星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞等中枢神经系统胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病、脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-07 |
Sphingolipids control dermal fibroblast heterogeneity
2022-04-15, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abh1623
PMID:35420948
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研究论文 | 本研究通过结合高分辨率质谱成像与单细胞转录组学,揭示鞘脂代谢调控真皮成纤维细胞异质性的机制 | 首次在单细胞水平同时分析脂质组和转录组,发现细胞间脂质组成差异对细胞状态决定具有调控作用 | 研究仅针对真皮成纤维细胞,未验证其他细胞类型中脂质异质性的普遍性 | 探究细胞间脂质组成差异在细胞状态决定中的功能 | 人类真皮成纤维细胞 | 单细胞多组学 | NA | 高分辨率质谱成像, 单细胞转录组学 | NA | 脂质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 质谱成像, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-10-07 |
Single-cell resolution of MET- and EMT-like programs in osteoblasts during zebrafish fin regeneration
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103784
PMID:35169687
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究斑马鱼尾鳍再生过程中成骨细胞的MET和EMT样程序 | 首次在单细胞分辨率下揭示成骨祖细胞中EMT和MET相关程序的共存,并发现剪接调控因子在骨再生过程中的表达 | 研究仅限于斑马鱼模型,需要进一步验证在哺乳动物系统中的普适性 | 阐明斑马鱼鳍再生过程中成骨细胞的转录程序 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的成骨细胞和成骨祖细胞 | 单细胞生物学 | 组织再生 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的成骨细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |