单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-09-08 |
Heparanase Blockade as a Novel Dual-Targeting Therapy for COVID-19
2022-04-13, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-22
PMID:35319225
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研究论文 | 研究评估了肝素酶抑制剂Roneparstat在COVID-19病理和治疗中的作用 | 首次提出肝素酶抑制剂Roneparstat作为COVID-19的双靶点治疗药物，既能减少病毒感染又能抑制炎症反应 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序分析，尚未进行临床试验验证 | 探索肝素酶抑制剂Roneparstat在COVID-19病理中的作用，并验证其作为双靶点治疗药物的潜力 | SARS-CoV-2、SARS-CoV-1、HTLV-1和HIV-1病毒，以及COVID-19患者的肺泡灌洗液细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | COVID-19患者的肺泡灌洗液细胞 |
| 262 | 2024-09-08 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of aortic valve interstitial cells demonstrates the regulation of integrin signaling by nitric oxide
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.742850
PMID:36386365
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析主动脉瓣间质细胞，揭示了硝酸氧化物通过调节整合素信号通路来预防钙化过程 | 首次描述了硝酸氧化物介导的S-亚硝基化作为预防钙化过程的新机制 | 研究仅限于猪主动脉瓣间质细胞，且需要持续的硝酸氧化物暴露来抑制钙化 | 探讨硝酸氧化物和S-亚硝基化在主动脉瓣钙化中的作用机制 | 主动脉瓣间质细胞和硝酸氧化物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,247个差异表达基因 |
| 263 | 2024-09-08 |
Single-cell transcriptomic characterization reveals the landscape of airway remodeling and inflammation in a cynomolgus monkey model of asthma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040442
PMID:36439114
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了哮喘猕猴模型中气道重塑和炎症的细胞图谱 | 发现了新的成纤维细胞亚型，该亚型介导了哮喘肺中的I型炎症反应，并揭示了细胞间相互作用网络在哮喘和气道重塑中的作用 | NA | 研究哮喘猕猴模型中气道重塑和炎症的机制 | 哮喘猕猴模型的肺部组织 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 264 | 2024-09-08 |
Identification of COVID-19 severity biomarkers based on feature selection on single-cell RNA-Seq data of CD8+ T cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1053772
PMID:36437952
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据中的特征选择，识别了CD8+ T细胞中与COVID-19严重程度相关的潜在生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序数据和多种特征选择方法，识别出CD8+ T细胞中与COVID-19严重程度相关的潜在生物标志物 | 研究仅基于三个CD8 T细胞亚型和三种疾病状态的数据，样本量有限 | 探究CD8+ T细胞在COVID-19感染中的免疫调节机制，并识别潜在的严重程度生物标志物 | CD8+ T细胞的单细胞基因表达数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 梯度提升机 | 基因表达数据 | 三个CD8 T细胞亚型（效应T细胞、记忆T细胞和幼稚T细胞），每种亚型包含三种疾病状态（急性COVID-19、康复期COVID-19和未暴露个体） |
| 265 | 2024-09-08 |
Reprogramming landscape highlighted by dynamic transcriptomes in therapy-induced neuroendocrine differentiation
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.10.031
PMID:36382181
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研究论文 | 本文研究了在药物治疗诱导的神经内分泌分化过程中，动态转录组学揭示的重编程景观 | 通过结合单细胞和批量mRNA测序工作流程，本文首次在时间解析的方式下展示了前列腺癌细胞在AR抑制剂enzalutamide作用下，从上皮形态转变为神经内分泌样形态，并激活了特定的神经内分泌相关转录程序 | 本文主要集中在AR抑制剂诱导的神经内分泌分化过程，未涉及其他治疗方式或不同类型前列腺癌的影响 | 探讨在AR抑制剂治疗下，前列腺癌从AR阳性腺癌向AR阴性神经内分泌前列腺癌转变的分子机制 | 前列腺癌细胞在AR抑制剂治疗下的转录组变化和形态学转变 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序和批量mRNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及17-25%接受AR抑制剂治疗的患者样本 |
| 266 | 2024-09-08 |
A review of spatial profiling technologies for characterizing the tumor microenvironment in immuno-oncology
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.996721
PMID:36389765
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综述 | 本文综述了空间分析技术在免疫肿瘤学中表征肿瘤微环境的作用 | 介绍了最新的基于成像和下一代单细胞测序技术的空间转录组学方法，这些技术为系统量化整个肿瘤微环境中所有或大多数基因的表达提供了平台 | NA | 探讨空间分析技术在免疫肿瘤学中的应用及其对肿瘤生物学和精准治疗靶点的潜在影响 | 肿瘤微环境中的基因表达和转录活性 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 267 | 2024-09-08 |
Alzheimer's disease alters the transcriptomic profile of natural killer cells at single-cell resolution
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1004885
PMID:36405736
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研究论文 | 研究阿尔茨海默病对自然杀伤细胞转录组特征的影响 | 首次在单细胞分辨率下分析了阿尔茨海默病患者自然杀伤细胞的转录组特征，并发现了一个独特的自然杀伤细胞亚群 | 研究仅限于血液中的自然杀伤细胞，未涵盖其他组织或器官中的细胞 | 探讨阿尔茨海默病对自然杀伤细胞转录组特征的影响 | 阿尔茨海默病患者和对照组血液中的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 转录组数据 | 阿尔茨海默病患者和对照组的血液样本 |
| 268 | 2024-09-08 |
Immune niches orchestrated by intestinal mesenchymal stromal cells lining the crypt-villus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1057932
PMID:36405734
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综述 | 本文综述了肠道间质基质细胞在免疫微环境中的作用及其空间分布和功能异质性 | 利用单细胞和空间转录组学技术，揭示了肠道间质基质细胞在不同肠段的功能多样性及其对免疫细胞和上皮细胞的调节作用 | NA | 提供对肠道间质基质细胞异质性及其与免疫细胞相互作用的整体视图，以丰富对这些细胞免疫调节功能的理解 | 肠道间质基质细胞及其在免疫微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 269 | 2024-09-08 |
Increased stromal PFKFB3-mediated glycolysis in inflammatory bowel disease contributes to intestinal inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.966067
PMID:36405760
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研究论文 | 研究探讨了PFKFB3在炎症性肠病（IBD）中的作用及其对肠道炎症的影响 | 首次揭示了PFKFB3在IBD患者中的表达增加，并探讨了其在肠道炎症中的作用 | NA | 研究PFKFB3在IBD中的作用及其对肠道炎症的影响 | 炎症性肠病患者的肠道样本和纤维母细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞测序、ssGSEA、海马实时细胞代谢分析 | NA | 基因表达数据 | IBD患者和健康对照者的肠道样本 |
| 270 | 2024-09-08 |
Single-cell and single-nuclei RNA sequencing as powerful tools to decipher cellular heterogeneity and dysregulation in neurodegenerative diseases
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.884748
PMID:36353512
|
综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在解析神经退行性疾病中的细胞异质性和失调方面的最新进展 | 介绍了单细胞和单核RNA测序技术在解析神经退行性疾病中的应用，提供了新的细胞类型和状态的识别方法 | 讨论了在研究阿尔茨海默病和帕金森病中应用这些技术的挑战和局限性 | 探讨单细胞和单核RNA测序技术在理解神经退行性疾病中的应用 | 阿尔茨海默病和帕金森病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 271 | 2024-09-08 |
Single-cell RNA-seq analysis and cell-cluster deconvolution of the human preovulatory follicular fluid cells provide insights into the pathophysiology of ovarian hyporesponse
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.945347
PMID:36339426
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和细胞簇反卷积，探讨了人类排卵前卵泡液细胞在卵巢低反应性中的病理生理机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了卵巢低反应患者与正常反应患者在卵泡液细胞类型和基因表达上的差异，并发现了与卵巢反应性相关的关键细胞簇 | 研究样本量较小，仅包括18名IVF患者，可能影响结果的普适性 | 探讨卵巢低反应性的病理生理机制，并评估其在IVF临床结果预测中的作用 | 人类排卵前卵泡液中的体细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18名接受IVF治疗的患者 |
| 272 | 2024-09-07 |
speedingCARs: accelerating the engineering of CAR T cells by signaling domain shuffling and single-cell sequencing
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34141-8
PMID:36323661
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研究论文 | 本文介绍了一种名为speedingCARs的方法，通过信号域重排和单细胞测序加速CAR T细胞工程 | 利用CRISPR-Cas9技术生成180种独特的CAR变体，并通过单细胞RNA测序和单细胞CAR测序进行高通量筛选，识别出具有肿瘤杀伤特性的变体 | NA | 扩展CAR信号域组合空间，为CAR T细胞的工程化提供工具 | CAR T细胞及其信号域 | 生物工程 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序, 单细胞CAR测序 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA数据 | 180种独特的CAR变体 |
| 273 | 2024-09-07 |
spliceJAC: transition genes and state-specific gene regulation from single-cell transcriptome data
2022-11, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202211176
PMID:36321549
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研究论文 | 本文介绍了一种名为spliceJAC的方法，用于从单细胞转录组数据中量化多变量mRNA剪接，并构建细胞状态特异性的基因-基因调控网络 | spliceJAC方法通过利用未剪接和剪接的mRNA计数矩阵，构建细胞状态特异性的基因-基因调控网络，并应用稳定性分析预测细胞状态转换中的关键驱动基因 | NA | 本文旨在从单细胞转录组数据中提取动态信息，以增进对细胞状态转换和基因间相互作用的理解 | 本文研究了胰腺内皮发育和A549肺癌细胞中的上皮-间质转化（EMT） | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及胰腺内皮发育和A549肺癌细胞的单细胞转录组数据 |
| 274 | 2024-09-07 |
Cell therapy attenuates endothelial dysfunction in hypertensive rats with heart failure and preserved ejection fraction
2022-11-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00287.2022
PMID:36083797
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研究论文 | 研究细胞疗法对高血压伴心力衰竭和保留射血分数大鼠的血管内皮功能障碍的影响 | 首次使用心脏球来源的细胞（CDCs）治疗高血压伴心力衰竭和保留射血分数的大鼠，发现其能减少炎症和纤维化，改善功能、结构和生存率 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证其疗效 | 验证炎症在心力衰竭伴保留射血分数（HFpEF）中的作用，并测试细胞疗法的效果 | 高血压伴心力衰竭和保留射血分数的大鼠 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Dahl盐敏感大鼠，分为CDCs治疗组和对照组 |
| 275 | 2024-09-07 |
Patient-Derived Organoids from Colorectal Cancer with Paired Liver Metastasis Reveal Tumor Heterogeneity and Predict Response to Chemotherapy
2022-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204097
PMID:36058001
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研究论文 | 本文构建了一个包含50个结直肠癌肝转移患者来源的类器官生物库，并分析了其多组学数据，揭示了肿瘤异质性并预测化疗反应 | 首次构建了结直肠癌肝转移患者来源的类器官生物库，并利用多组学数据全面分析了肿瘤异质性，预测了化疗反应和临床预后 | NA | 开发一种有效的方法来预测结直肠癌肝转移患者的化疗反应和术后预后 | 结直肠癌肝转移患者及其来源的类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 50个结直肠癌肝转移患者来源的类器官 |
| 276 | 2024-09-07 |
Epidermal growth factor induces a trophectoderm lineage transcriptome resembling that of human embryos during reconstruction of blastoids from extended pluripotent stem cells
2022-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13317
PMID:35880490
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研究论文 | 研究通过添加表皮生长因子（EGF）优化人类扩展多能干细胞（EPSC）向滋养层（TE）样细胞的诱导，并提高重建胚泡的质量 | 通过添加EGF，增强了EPSC向TE样细胞的分化，并使重建的胚泡更接近人类胚胎的转录组特征 | 研究规模较小，需要进一步验证和优化 | 优化人类扩展多能干细胞向滋养层样细胞的诱导，并提高重建胚泡的质量 | 人类扩展多能干细胞（EPSC）及其向滋养层（TE）样细胞的分化 | 干细胞生物学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 多个人类多能干细胞（hPSCs）和胚胎样本 |
| 277 | 2024-09-07 |
PlantPhoneDB: A manually curated pan-plant database of ligand-receptor pairs infers cell-cell communication
2022-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13893
PMID:35842742
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研究论文 | 本文开发了一个名为PlantPhoneDB的植物泛数据库，包含大量手动筛选的高可信度配体-受体对，用于推断细胞间通信 | 首次为植物物种提供了一个可靠的配体-受体相互作用数据库，并开发了相应的R包和可视化功能 | NA | 开发一个用于推断植物细胞间通信的配体-受体对数据库 | 植物细胞间的配体-受体对及其在细胞通信中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE121619数据集中的拟南芥热激根细胞样本 |
| 278 | 2024-09-07 |
Bioinformatics roadmap for therapy selection in cancer genomics
2022-11, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13286
PMID:35811332
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综述 | 本文综述了癌症基因组学中治疗选择的生物信息学方法 | 本文介绍了针对肿瘤异质性的不同类型（如肿瘤间异质性和肿瘤内异质性）的治疗选择策略，并讨论了这些策略如何整合到临床实践中 | NA | 探讨精准肿瘤学中基于生物信息学工具的治疗选择方法 | 肿瘤异质性及其对治疗选择的影响 | 生物信息学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组变异数据、表达数据、多组学数据 | NA |
| 279 | 2024-09-07 |
The Single-Cell Revelation of Thermogenic Adipose Tissue
2022-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0092
PMID:36254709
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示产热脂肪组织细胞可塑性和细胞间相互作用中的应用 | 利用单细胞转录组学技术，揭示了产热脂肪组织的复杂细胞网络和组成动态 | NA | 总结和评估单细胞转录组学在理解产热脂肪组织细胞可塑性和细胞间相互作用中的贡献 | 产热脂肪组织 | NA | 肥胖 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 280 | 2024-09-07 |
A missense variant in the nuclear localization signal of DKC1 causes Hoyeraal-Hreidarsson syndrome
2022-Oct-30, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-022-00335-8
PMID:36309505
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研究论文 | 本文报道了一个位于DKC1基因核定位信号区域的错义突变导致Hoyeraal-Hreidarsson综合征的病例 | 首次发现DKC1基因核定位信号区域的突变与Hoyeraal-Hreidarsson综合征相关，并提供了治疗方案 | 样本量较小，仅限于一个家庭的男性兄弟 | 研究DKC1基因突变在Hoyeraal-Hreidarsson综合征中的作用及潜在治疗方案 | DKC1基因突变、Hoyeraal-Hreidarsson综合征患者及其诱导多能干细胞 | NA | 遗传性皮肤病 | 单细胞RNA测序、诱导多能干细胞培养 | NA | RNA | 一个家庭的两位男性兄弟 |