单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2761 - 2780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Lung Epithelial Cell Type-Specific Responses to HDM and Regulation by Tet1
2022-05-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13050880
PMID:35627266
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了Tet1在屋尘螨（HDM）诱导的肺部炎症中对不同肺上皮细胞类型的作用 | 首次揭示了Tet1缺失对肺上皮细胞转录组网络的影响，并探讨了HDM可能促进AP和BAS细胞向AT2细胞分化的机制 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人体中验证结果 | 探索Tet1在屋尘螨诱导的肺部炎症中对个体肺上皮细胞类型的作用 | 肺上皮细胞类型在HDM诱导的炎症中的响应及Tet1的调控作用 | 数字病理学 | 过敏性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | Tet1敲除和野生型小鼠的肺上皮细胞 |
| 2762 | 2024-08-08 |
Chitooligosaccharides Improve the Efficacy of Checkpoint Inhibitors in a Mouse Model of Lung Cancer
2022-May-12, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics14051046
PMID:35631632
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研究论文 | 研究探讨了壳寡糖（COS）在肺癌小鼠模型中与免疫检查点抑制剂（ICIs）联合使用的效果 | 首次研究了壳寡糖与免疫检查点抑制剂联合使用对肺癌小鼠模型的影响，发现联合治疗能延缓肿瘤生长 | 研究未进一步探讨壳寡糖的其他潜在抗肿瘤机制 | 探究壳寡糖在肺癌治疗中的作用及其与免疫检查点抑制剂的联合应用效果 | 肺癌小鼠模型及人类肿瘤单细胞RNA测序数据 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用Lewis肺癌（LL2）模型进行实验 |
| 2763 | 2024-08-08 |
Dissecting Human Blood Immune Cells Response to Intracellular Infection Using Single-Cell RNA Sequencing
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1971-1_12
PMID:35619031
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研究论文 | 本文开发了一种使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析体外感染的人外周血单个核细胞（PBMCs）对细胞内病原体反应的协议 | 利用scRNA-seq技术揭示人体免疫系统对多种细胞内病原体的复杂相互作用 | NA | 揭示人体免疫系统对细胞内病原体的复杂相互作用 | 人体外周血单个核细胞（PBMCs）对细胞内病原体的免疫反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2764 | 2024-08-08 |
Landscape of Immune Cells Heterogeneity in Liver Transplantation by Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.890019
PMID:35619708
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝移植中免疫细胞异质性的全景图 | 首次在人类肝移植中发现CD4+CD8+FOXP3+ T细胞亚群，并识别LDLR作为激活MDSC的新标志物，以防止肝移植排斥反应 | NA | 揭示肝移植排斥反应的潜在机制 | 肝移植中的T细胞、NK细胞、B细胞和髓样细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类肝和血液中的多种免疫细胞亚群 |
| 2765 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Profiles Identify Important Pathophysiologic Factors in the Progression of Diabetic Nephropathy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.798316
PMID:35620059
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析糖尿病肾病中的细胞类型和病理生理因子 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别糖尿病肾病中的关键细胞类型和病理生理因子 | 研究样本量较小，仅包括三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本 | 旨在识别糖尿病肾病进展中的细胞类型和病理生理因子 | 人类糖尿病肾病样本和对照样本中的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本 |
| 2766 | 2024-08-08 |
Intercellular Communication-Related Molecular Subtypes and a Gene Signature Identified by the Single-Cell RNA Sequencing Combined with a Transcriptomic Analysis
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/6837849
PMID:35620271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合转录组分析，识别了肺腺癌中的细胞类型，并筛选了细胞间通讯相关的基因，进而构建了一个新的预后风险模型。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了肺腺癌中的细胞类型，并基于细胞间通讯相关基因开发了一个新的预后风险模型。 | NA | 识别肺腺癌中的细胞类型，并开发基于细胞间通讯相关基因的预后风险模型。 | 肺腺癌患者的肿瘤微环境中的细胞类型和细胞间通讯相关基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA-seq数据 | 8170个细胞样本 |
| 2767 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Dysregulated Cell-Cell Interactions in a Tumor Microenvironment Related to HCC Development
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/4971621
PMID:35634447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中细胞间相互作用（CCE）的失调情况 | 本研究构建了肿瘤微环境的CCE景观，并识别了在HCC中失调的细胞类型和改变的分子功能，提取了基于CCE的免疫调节网络，并确定了基于CCE基因的预后标志 | NA | 揭示从健康供体到HCC的肝脏组织中CCE的差异 | 健康供体、癌旁非肿瘤组织和HCC的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约62000个细胞 |
| 2768 | 2024-08-08 |
Heterogeneous Skeletal Muscle Cell and Nucleus Populations Identified by Single-Cell and Single-Nucleus Resolution Transcriptome Assays
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.835099
PMID:35646075
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研究论文 | 本文通过单细胞和单核分辨率转录组测定法，研究了骨骼肌细胞和细胞核的异质性 | 单核RNA测序（snRNA-seq）不仅作为单细胞RNA测序（scRNA-seq）的替代方法，而且作为一种新颖的方法，为多核细胞如肌纤维提供了有价值的见解 | NA | 探讨单细胞和单核分辨率转录组测定法在骨骼肌研究中的应用 | 骨骼肌细胞、肌纤维及其细胞核 | 基因组学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及卫星细胞、肌母细胞、肌管和肌纤维等多种细胞类型 |
| 2769 | 2024-08-08 |
Identification of Transcriptional Heterogeneity and Construction of a Prognostic Model for Melanoma Based on Single-Cell and Bulk Transcriptome Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.874429
PMID:35646893
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量转录组分析探索黑色素瘤细胞亚群的肿瘤内异质性，并构建了一个预测黑色素瘤患者预后的诺模图工具 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析黑色素瘤细胞亚群的异质性，并开发了一种新的诺模图工具来预测黑色素瘤患者的预后 | NA | 探索黑色素瘤的转录异质性并构建预后模型 | 黑色素瘤细胞亚群及其临床预后 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TCGA数据集的黑色素瘤患者样本 |
| 2770 | 2024-08-08 |
Deciphering Innate Immune Cell-Tumor Microenvironment Crosstalk at a Single-Cell Level
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.803947
PMID:35646915
|
综述 | 本文综述了基于单细胞技术在肿瘤微环境中对先天免疫细胞亚型及其功能的最新研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术解析肿瘤微环境中先天免疫细胞的转录组，为癌症免疫治疗提供了新的见解 | NA | 总结先天免疫细胞在肿瘤微环境中的亚型和功能，并探讨如何利用这些细胞进行癌症免疫治疗 | 肿瘤微环境中的先天免疫细胞，包括树突状细胞、单核细胞/巨噬细胞、自然杀伤细胞和先天淋巴细胞 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 2771 | 2024-08-08 |
Periodontal tissue stem cells and mesenchymal stem cells in the periodontal ligament
2022-Nov, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2022.04.001
PMID:35607404
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综述 | 本文综述了牙周韧带中牙周组织干细胞和间充质干细胞的最新发现，并讨论了未来牙周再生治疗的研究方向 | 利用遗传谱系追踪、标记保留细胞鉴定和单细胞转录组分析等干细胞生物学进展，分析牙周韧带中的组织干细胞 | 牙周韧带中的组织干细胞尚未得到充分研究，可能与间充质干细胞不同 | 总结牙周韧带中干细胞群体的最新发现，并探讨牙周再生治疗的未来研究方向 | 牙周组织干细胞和牙周韧带中的间充质干细胞 | NA | NA | 遗传谱系追踪、标记保留细胞鉴定、单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 2772 | 2024-08-08 |
scCODE: an R package for data-specific differentially expressed gene detection on single-cell RNA-sequencing data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac180
PMID:35598331
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scCODE的R包，用于在单细胞RNA测序数据中进行数据特异性的差异表达基因检测 | 提出了基于两个新指标的单细胞共识优化差异表达基因检测方法，能够自动优化每个实验单细胞RNA测序数据的差异表达基因检测 | 未明确说明基因过滤对差异表达方法性能的影响 | 旨在改进单细胞RNA测序数据中差异表达基因检测的方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2773 | 2024-08-08 |
Breaking through the Poisson Distribution: A compact high-efficiency droplet microfluidic system for single-bead encapsulation and digital immunoassay detection
2022-Sep-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114384
PMID:35609455
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研究论文 | 本文提出了一种名为BOAD的微流控系统，通过结合鞘流、Dean涡流和压缩流道，实现了粒子的有序排列，从而突破了泊松分布对单粒子封装效率的限制 | BOAD系统首次实现了粒子的有序排列，并将单珠封装效率提高至86% | NA | 提高微流控系统中单粒子封装的效率 | 微流控系统中的单珠封装 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 微滴 | NA |
| 2774 | 2024-08-08 |
Calcium-dependent transcriptional changes in human pancreatic islet cells reveal functional diversity in islet cell subtypes
2022-09, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-022-05718-1
PMID:35616696
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研究论文 | 本文研究了人类胰腺胰岛细胞在钙离子依赖性条件下转录变化，揭示了胰岛细胞亚型的功能多样性 | 首次尝试在所有胰岛细胞类型中分析钙离子调节的基因表达 | NA | 构建一个大规模的单细胞转录组数据集，以研究在诱导或抑制细胞内钙信号传导条件下的人类胰岛细胞 | 人类胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 68,650个细胞，其中59,373个表达INS、GCG、SST或PPY的内分泌细胞 |
| 2775 | 2024-08-08 |
Mogroside V ameliorates the oxidative stress-induced meiotic defects in porcine oocytes in vitro
2022-08, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2022.05.008
PMID:35597324
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研究论文 | 研究探讨了Mogroside V（MV）如何改善由氧化应激引起的猪卵母细胞减数分裂缺陷 | 首次揭示了MV通过恢复线粒体完整性来减轻氧化应激引起的减数分裂缺陷的机制 | NA | 探索MV改善氧化应激引起的猪卵母细胞减数分裂缺陷的机制 | 猪卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2776 | 2024-08-08 |
Transcriptional landscapes of de novo root regeneration from detached Arabidopsis leaves revealed by time-lapse and single-cell RNA sequencing analyses
2022-07-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2022.100306
PMID:35605192
|
研究论文 | 研究通过时间序列和单细胞RNA测序分析，揭示了从离体拟南芥叶片再生新根的转录组重编程过程 | 首次提供了从伤口反应到根器官发生的高分辨率转录组重编程图谱，并揭示了参与新根再生的关键因子 | NA | 研究离体拟南芥叶片新根再生的转录调控框架 | 拟南芥离体叶片的新根再生过程 | 分子生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 整个叶片在叶片脱离后12小时和5天内的样本 |
| 2777 | 2024-08-08 |
scCloudMine: A cloud-based app for visualization, comparison, and exploration of single-cell transcriptomic data
2022-07-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2022.100302
PMID:35605202
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研究论文 | scCloudMine是一款基于云的应用程序，用于单细胞转录组数据的可视化、比较和探索 | scCloudMine不需要现场的高性能计算服务器、安装或相关专业知识和费用，用户可以通过网页浏览器上传预处理后的scRNA-seq数据进行可视化 | NA | 开发一个云基础的应用程序，用于单细胞转录组数据的可视化、比较和探索 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 2778 | 2024-08-08 |
WebCSEA: web-based cell-type-specific enrichment analysis of genes
2022-07-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac392
PMID:35610053
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研究论文 | 介绍了一个名为WebCSEA的基于网络的应用程序，用于快速评估基因的细胞类型特异性 | 首次开发了一个基于网络的应用程序WebCSEA，用于评估基因在人类组织细胞类型中的特异性，并采用了改进的deTS算法和基于排列的方法来准确估计细胞类型特异性 | NA | 旨在利用单细胞RNA测序技术揭示人类组织中的细胞异质性，并理解复杂性状相关基因在人类组织细胞类型中的特定表达 | 人类组织细胞类型中的基因特异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | deTS算法 | 基因列表 | 111个scRNA-seq面板，涵盖11个人体器官系统的61种不同组织中的1,355个组织细胞类型 |
| 2779 | 2024-08-08 |
Distinguishing cell-cell complexes from dual lineage cells using single-cell transcriptomics is not trivial
2022-07, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24656
PMID:35594038
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研究论文 | 本文回应了Jie等人的观点，通过单细胞转录组数据分析，探讨了DE细胞群是否为双系共表达细胞或B细胞与T细胞的复合体 | 本文通过分析DE细胞的基因特征和转录组特征，提出了DE细胞可能是三系共表达细胞或三组分细胞聚集体的可能性 | 仅基于单细胞转录组数据，无法完全确定DE细胞的性质 | 探讨单细胞转录组数据中DE细胞群的性质 | DE细胞群的性质及其与B细胞和T细胞复合体的关系 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2780 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Demonstrates the Regulation of Peach Polysaccharides on Circadian Rhythm Disturbance
2022-07, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202101170
PMID:35598297
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型评估了桃多糖（PPS）对由持续黑暗引起的昼夜节律紊乱的调节作用 | 首次通过单细胞转录组学分析了PPS对昼夜节律紊乱小鼠肠道微生物群结构和下丘脑细胞类型及时钟基因表达的影响 | NA | 评估桃多糖对昼夜节律紊乱的调节作用 | 桃多糖、昼夜节律紊乱的小鼠 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |