单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 2681 - 2700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2681 | 2024-08-08 |
Viral coinfection promotes tuberculosis immunopathogenesis by type I IFN signaling-dependent impediment of Th1 cell pulmonary influx
2022-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30914-3
PMID:35672321
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研究论文 | 本研究使用Mtb和淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒共感染模型，探讨了病毒共感染如何通过I型IFN信号依赖性阻碍Th1细胞肺部浸润，从而促进结核病的免疫病理发生。 | 本研究首次揭示了病毒共感染通过诱导I型IFN信号，抑制CXCL9/10在髓系细胞中的产生，从而阻碍Mtb特异性CD4 T细胞的肺部迁移，加剧结核病的免疫病理过程。 | NA | 阐明病毒共感染如何通过免疫机制加剧结核病的病理过程。 | Mtb和淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒共感染模型。 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞测序，组织免疫荧光染色，过继转移实验 | NA | 细胞 | NA |
| 2682 | 2024-08-08 |
Cardiac fibroblasts regulate the development of heart failure via Htra3-TGF-β-IGFBP7 axis
2022-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30630-y
PMID:35672400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和遗传扰动，揭示了Htra3通过降解TGF-β维持静息态心脏成纤维细胞的身份，从而调控心脏纤维化和心力衰竭的发展 | 首次阐明Htra3通过Htra3-TGF-β-IGFBP7轴调控心脏成纤维细胞和心肌细胞稳态，为心力衰竭的治疗提供了新的靶点 | NA | 探究心脏成纤维细胞如何通过Htra3-TGF-β-IGFBP7轴调控心脏纤维化和心力衰竭的发展 | 心脏成纤维细胞、心肌细胞、心脏纤维化、心力衰竭 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组、蛋白质组 | NA |
| 2683 | 2024-08-08 |
PGE2-EP2/EP4 signaling elicits immunosuppression by driving the mregDC-Treg axis in inflammatory tumor microenvironment
2022-06-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110914
PMID:35675777
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研究论文 | 本研究使用免疫检查点抑制剂不敏感的小鼠癌症模型和单细胞RNA测序技术，揭示了PGE2-EP2/EP4信号通路在肿瘤微环境中通过促进mregDC-Treg轴的驱动，同时引发炎症和免疫抑制的双重作用 | 首次阐明PGE2-EP2/EP4信号通路在肿瘤微环境中连接活跃炎症和免疫抑制的关键调节作用，并提出EP2和EP4拮抗剂作为癌症治疗的新策略 | NA | 探究肿瘤微环境中炎症与免疫抑制的关系及其分子机制 | PGE2-EP2/EP4信号通路在肿瘤微环境中的作用及其对免疫细胞的影响 | NA | 各种人类癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠癌症模型 |
| 2684 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq-based proteogenomics identifies glioblastoma-specific transposable elements encoding HLA-I-presented peptides
2022-06-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110916
PMID:35675780
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组学、肿瘤和健康组织样本的批量RNA测序以及免疫肽组学样本，分析了胶质母细胞瘤（GBM）患者中的转座元件（TEs），并识别出370个人类白细胞抗原（HLA）-I结合肽，这些肽由在GBM中差异表达的TEs编码 | 本文首次识别出由胶质母细胞瘤特异性TEs编码的HLA-I结合肽，这些肽可能作为肿瘤特异性靶点用于癌症免疫治疗 | NA | 识别胶质母细胞瘤特异性转座元件编码的HLA-I结合肽，为癌症免疫治疗提供潜在靶点 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者中的转座元件（TEs） | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 肿瘤和健康组织样本 |
| 2685 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mitotic-arrested prospermatogonia with DAZL::GFP chickens and revealing unique epigenetic reprogramming of chickens
2022-Jun-06, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-022-00712-4
PMID:35659766
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了DAZL::GFP鸡中处于有丝分裂停滞期的雄性生殖细胞的转录动态，揭示了鸡生殖细胞独特的表观遗传重编程过程。 | 发现了鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间独特的表观遗传重编程时间表，包括组蛋白H3K9和H3K14的乙酰化以及DNA的去甲基化，这些发现与哺乳动物的基因组表观遗传重编程不同。 | NA | 研究鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间的表观遗传重编程过程。 | DAZL::GFP鸡中处于有丝分裂停滞期的雄性生殖细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同发育阶段（E12, E16, 孵化后）的细胞 |
| 2686 | 2024-08-08 |
A Multi-Omics Common Data Model for Primary Immunodeficiencies
2022-Jun-06, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI220031
PMID:35672970
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研究论文 | 本文旨在开发一个整合临床和多组学数据的综合数据模型，用于原发性免疫缺陷病（PIDs）的特征描述和系统分析 | 提出了一种扩展的OMOP通用数据模型（OMOP-CDM），用于整合多组学数据，并可定制用于其他类型的罕见疾病 | NA | 开发一个综合数据模型，以标准化信息来描述PIDs患者并进行进一步的系统分析 | 原发性免疫缺陷病（PIDs）及其多组学数据 | NA | 原发性免疫缺陷病 | 单细胞转录组学、表观遗传学、蛋白质组学、代谢组学、宏基因组学和脂质组学 | OMOP通用数据模型（OMOP-CDM） | 多组学数据 | NA |
| 2687 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing analysis reveals gastric cancer microenvironment cells respond vastly different to oxidative stress
2022-06-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03411-w
PMID:35659682
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据分析胃癌微环境细胞对氧化应激的反应差异 | 首次揭示了胃癌微环境中不同细胞类型对氧化应激的反应差异，并鉴定了与胃癌患者预后相关的关键基因 | 研究结果需要进一步的临床研究验证 | 探究胃癌微环境细胞对氧化应激的反应及其与患者预后的关系 | 胃癌微环境中的细胞类型及其对氧化应激的反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 胃癌组织与正常胃组织样本 |
| 2688 | 2024-08-08 |
Integrating spatial transcriptomics with single-cell transcriptomics reveals a spatiotemporal gene landscape of the human developing kidney
2022-Jun-03, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00801-x
PMID:35659756
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研究论文 | 本文通过整合基于微阵列的空间转录组学和单细胞转录组学，研究了人类胚胎肾脏在9周和18周孕龄的时空基因程序 | 本文揭示了发育中细胞亚群的空间景观，并建立了以GDNF-ETV4为中心的调控网络，强调了Wnt、FGF和JAG1-Notch2信号在维持肾脏分支形态发生中的关键作用 | NA | 研究人类肾脏发育的时空基因景观，促进肾脏类器官培养 | 人类胚胎肾脏在9周和18周孕龄的时空基因程序 | 数字病理学 | NA | 微阵列空间转录组学，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 9周和18周孕龄的人类胚胎肾脏样本 |
| 2689 | 2024-08-08 |
The spatiotemporal program of zonal liver regeneration following acute injury
2022-06-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.008
PMID:35659879
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研究论文 | 本研究利用空间解析的单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠肝脏在急性对乙酰氨基酚中毒后再生的时空动态过程 | 首次使用空间解析的单细胞RNA测序技术研究肝脏再生过程，揭示了肝细胞在再生前沿暂时上调胎儿特异性基因的现象 | NA | 理解肝脏在急性损伤后区域性再生的协调程序 | 小鼠肝脏在急性损伤后的再生过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2690 | 2024-08-08 |
Molecularly defined circuits for cardiovascular and cardiopulmonary control
2022-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04760-8
PMID:35650438
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研究论文 | 本文通过逆行神经追踪、单细胞RNA测序、光遗传学和生理实验，解析了小鼠心脏副交感控制回路，揭示了脑干核歧义核（Amb）中的心脏神经支配神经元包含两种分子、解剖和功能上不同的亚型。 | 本文首次揭示了心脏副交感控制存在两个并行回路：一个专门控制心脏功能（ACV回路），另一个协调心脏和肺功能（ACP回路）。 | NA | 解析心脏副交感控制回路的分子和功能多样性。 | 小鼠心脏副交感控制回路。 | NA | 心脏和肺疾病 | 逆行神经追踪、单细胞RNA测序、光遗传学 | NA | NA | 小鼠实验样本 |
| 2691 | 2024-08-08 |
The Promise of Single-cell Technology in Providing New Insights Into the Molecular Heterogeneity and Management of Acute Lymphoblastic Leukemia
2022-Jun, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1097/HS9.0000000000000734
PMID:35651714
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序技术在揭示急性淋巴细胞白血病（ALL）分子异质性和克隆进化方面的应用及其对临床治疗决策的影响 | 单细胞测序技术能够以前所未有的细节分析单个细胞的转录组、基因组、表观遗传和蛋白质组变异，为理解ALL的基本生物学提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在改善ALL患者临床治疗结果中的应用 | 急性淋巴细胞白血病（ALL）的分子异质性和克隆进化 | 基因组学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 2692 | 2024-08-08 |
A stromal Integrated Stress Response activates perivascular cancer-associated fibroblasts to drive angiogenesis and tumour progression
2022-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00918-8
PMID:35654839
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研究论文 | 本文研究了ATF4在肿瘤微环境中的作用，特别是其在癌症相关成纤维细胞（CAFs）中的功能，以及其对肿瘤血管生成和进展的影响。 | 首次揭示了ATF4在肿瘤微环境中作为癌症相关成纤维细胞功能、恶性进展和转移的关键驱动因素。 | NA | 探讨ATF4在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤血管生成和进展的影响。 | ATF4在癌症相关成纤维细胞中的功能及其对肿瘤血管生成和进展的影响。 | 数字病理学 | 黑色素瘤，胰腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用条件性敲除ATF4小鼠进行实验，分析了人类黑色素瘤和胰腺癌样本。 |
| 2693 | 2024-08-08 |
The multi-molecular mechanisms of tumor-targeted drug resistance in precision medicine
2022-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113064
PMID:35658234
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综述 | 本文综述了肿瘤靶向药物耐药的多分子机制，并从肿瘤微环境的角度讨论了克服耐药性的方法 | 介绍了基因检测、液体活检ctDNA技术和单细胞测序技术在揭示肿瘤药物耐药分子机制中的应用 | NA | 探讨肿瘤靶向药物耐药的多分子机制及克服方法 | 肿瘤靶向药物耐药机制 | 精准医学 | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | 基因数据 | NA |
| 2694 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the characteristics of cerebrospinal fluid tumour environment in breast cancer and lung cancer leptomeningeal metastases
2022-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.885
PMID:35678121
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌和肺癌脑膜转移患者的脑脊液肿瘤微环境特征 | 首次在单细胞水平上全面分析了脑膜转移患者的脑脊液肿瘤微环境，并发现了肿瘤免疫抑制的方向以及肿瘤细胞的异质性 | 研究样本量较小，且仅包括乳腺癌和肺癌脑膜转移患者 | 探讨乳腺癌和肺癌脑膜转移患者的脑脊液肿瘤微环境特征 | 乳腺癌和肺癌脑膜转移患者的脑脊液细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括五个乳腺癌脑膜转移和肺癌脑膜转移患者的脑脊液样本，以及四个特发性颅内高压患者的脑脊液样本作为对照 |
| 2695 | 2024-08-08 |
Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11A upregulation is a biomarker of poor prognosis in patients with head and neck squamous cell carcinoma
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0269166
PMID:35653344
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研究论文 | 本研究旨在探讨微粒体信号肽酶复合体（SPC）五个亚基基因（SEC11A、SEC11C、SPCS1、SPCS2和SPCS3）在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的表达及其预后价值 | 发现SEC11A上调是头颈部鳞状细胞癌中的一个独立预后生物标志物，并与特定类型免疫细胞的浸润有关 | NA | 研究头颈部鳞状细胞癌中微粒体信号肽酶复合体亚基基因的表达及其预后价值 | 微粒体信号肽酶复合体五个亚基基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 基因集富集分析（GSEA），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自TCGA的头颈部鳞状细胞癌子集数据和一个先前的单细胞RNA测序数据集 |
| 2696 | 2024-08-08 |
Intracranial Aneurysms Induced by RUNX1 Through Regulation of NFKB1 in Patients With Hypertension-An Integrated Analysis Based on Multiple Datasets and Algorithms
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.877801
PMID:35655614
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研究论文 | 本研究旨在通过分析高血压患者颅内动脉瘤（IA）进展中的关键基因，识别潜在的治疗靶点 | 本研究通过整合多个数据集和算法，识别了RUNX1作为高血压患者颅内动脉瘤进展中的关键基因，并揭示了其通过调节NFKB1在单核细胞/巨噬细胞相关网络中的作用 | NA | 识别高血压患者颅内动脉瘤进展中的潜在治疗靶点 | 高血压患者的颅内动脉瘤进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除算法 | 基因表达数据 | 包括高血压和颅内动脉瘤的批量RNA测序数据集，以及腹主动脉瘤患者的单细胞RNA测序数据集 |
| 2697 | 2024-08-08 |
Leveraging Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data of NSCLC Tumor Microenvironment and Therapeutic Potential of NLOC-15A, A Novel Multi-Target Small Molecule
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.872470
PMID:35655775
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研究论文 | 本文通过分析大量和单细胞RNA测序数据，探讨了NSCLC肿瘤微环境及新型多靶点小分子NLOC-15A的治疗潜力 | 本文首次提供了NLOC-015A作为多靶点小分子抑制剂在治疗NSCLC中的临床前证据，并揭示了其在重塑肿瘤免疫微环境中的作用 | NA | 研究新型多靶点小分子NLOC-015A在治疗NSCLC中的疗效和机制 | NSCLC肿瘤微环境及NLOC-015A的作用机制 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个NSCLC患者的临床数据和细胞系 |
| 2698 | 2024-08-08 |
Astrocyte Reprogramming in Stroke: Opportunities and Challenges
2022, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2022.885707
PMID:35663583
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞重编程在脑卒中治疗中的应用及其争议 | 介绍了通过靶向关键转录因子或微小RNA使小鼠脑中的星形胶质细胞重编程为功能性神经元的方法 | 目前缺乏细胞谱系追踪和单细胞测序实验来提供基因表达谱变化证据 | 探讨星形胶质细胞重编程的过程及其在脑卒中治疗中的应用 | 星形胶质细胞重编程及其在脑卒中治疗中的应用 | NA | 脑卒中 | 细胞谱系追踪和单细胞测序 | NA | 基因表达谱 | 小鼠脑中的星形胶质细胞 |
| 2699 | 2024-08-08 |
Lessons From Transcriptome Analysis of Autoimmune Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857269
PMID:35663941
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综述 | 本文综述了转录组分析如何增进我们对自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的认识，特别关注了ImmuNexUT数据库 | 介绍了单细胞RNA测序在识别各种自身免疫疾病病变中浸润免疫细胞的作用，以及eQTL分析在识别候选因果基因和免疫细胞中的应用 | NA | 总结转录组分析在自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的理解上的进展 | 自身免疫疾病中的免疫细胞及其在疾病中的作用 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2700 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Cellular Functional Heterogeneity in Dermis Between Fibrotic and Regenerative Wound Healing Fates
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.875407
PMID:35664010
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的类型和功能差异 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类伤口愈合的情况 | 旨在揭示纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 纤维化和再生性伤口愈合过程中的真皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 纤维化和再生性伤口的真皮细胞 |