单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2661 - 2680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis Identifies Cell-Type-Specific Genes Within Tumor Microenvironment as Prognostic Indicators in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.878923
PMID:35707353
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研究论文 | 本研究通过综合分析确定了肿瘤微环境中特定细胞类型的基因作为肝细胞癌的预后标志物 | 开发了一种基于优化标志物的肝细胞癌复发预测模型，并验证了其在预测肝细胞癌复发中的独立性和优越性 | NA | 旨在提高肝细胞癌复发的预测准确性和理解其复发机制 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的特定细胞类型基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 训练和三个验证队列中的肝细胞癌样本 |
| 2662 | 2024-08-08 |
Redefining the Foreign Antigen and Self-Driven Memory CD4+ T-Cell Compartments via Transcriptomic, Phenotypic, and Functional Analyses
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.870542
PMID:35707543
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，重新定义了自我驱动记忆CD4+ T细胞和外来抗原特异性记忆CD4+ T细胞的亚群 | 首次识别出自我驱动记忆CD4+ T细胞的不同亚群，并揭示了这些亚群与传统外来抗原特异性记忆细胞在标记表达和功能上的差异 | NA | 重新定义和区分自我驱动记忆CD4+ T细胞和外来抗原特异性记忆CD4+ T细胞的亚群 | CD4+ T淋巴细胞的亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞 | 多个CD4+ T细胞亚群 |
| 2663 | 2024-08-08 |
A gastruloid model of the interaction between embryonic and extra-embryonic cell types
2022 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314221103042
PMID:35707767
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研究论文 | 本文报道了由小鼠胚胎干细胞（mESCs）和胚外内胚层（XEN）细胞组成的gastruloids的形成，并展示了这些XEN增强型gastruloids（XEGs）在神经上皮形成方面的特性 | 首次报道了XEN细胞与mESCs在gastruloids中的相互作用，以及这种相互作用对神经上皮组织形成的影响 | NA | 探索异型细胞间的相互作用及其在体外发育中的后果 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs）和胚外内胚层（XEN）细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，成像技术，分化实验 | NA | 细胞 | NA |
| 2664 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Atlas of Gingival Mucosa in Type 2 Diabetes
2022-12, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221092752
PMID:35656582
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了2型糖尿病背景下牙龈黏膜的转录组图谱 | 揭示了2型糖尿病中牙龈黏膜的异质性，特别是免疫样成纤维细胞在糖尿病牙龈中的作用 | NA | 探讨2型糖尿病对牙龈屏障功能的影响及其潜在机制 | 2型糖尿病小鼠的牙龈组织 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | leptin受体缺陷小鼠的牙龈组织样本 |
| 2665 | 2024-08-08 |
Global characterization of megakaryocytes in bone marrow, peripheral blood, and cord blood by single-cell RNA sequencing
2022-11, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-022-00476-z
PMID:35650393
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对骨髓、外周血和脐血中的巨核细胞（MK）进行了全局特征分析 | 发现了巨核细胞在不同来源中的分布差异及其与免疫功能和非小细胞肺癌的关联 | NA | 探究巨核细胞在不同来源中的异质性及其潜在功能 | 骨髓、外周血和脐血中的巨核细胞及其亚型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 132个样本，包含1.2百万个单细胞转录组数据 |
| 2666 | 2024-08-08 |
Genome architecture used to supplement species delineation in two cryptic marine ciliates
2022-Nov, Molecular ecology resources
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/1755-0998.13664
PMID:35675173
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研究论文 | 本研究旨在确定哪些分类学方法能够阐明两种隐秘纤毛虫物种之间的清晰且可量化的差异，并测试基因组结构作为新的诊断特征在区分其他无法区分的分类群中的效用。 | 本研究首次使用单细胞'组学分析（单细胞转录组学和基因组学）来阐明和比较两种隐秘纤毛虫物种之间的微核基因组结构模式，并设计了物种特异性引物作为独特的“结构条形码”。 | 本研究仅限于两种隐秘纤毛虫物种，且主要依赖于基因组结构分析，未涉及其他可能的分类学方法。 | 确定分类学方法的有效性，并测试基因组结构在区分隐秘纤毛虫物种中的应用。 | 两种隐秘纤毛虫物种Schmidingerella arcuata和Schmidingerella meunieri。 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学和基因组学 | NA | 基因组数据 | 两种纤毛虫物种的11种猎物处理中的9种无法区分生长反应。 |
| 2667 | 2024-08-08 |
The clinical and bioinformatics analysis for the role of antihypertension drugs on mortality among patients with hypertension hospitalized with COVID-19
2022-10, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.27914
PMID:35656698
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研究论文 | 本研究探讨了不同类别降压药物对患有高血压并因COVID-19住院患者死亡率的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了血管紧张素II受体阻滞剂和钙通道阻滞剂显著提高生存率，而血管紧张素转换酶抑制剂/β阻滞剂/利尿剂药物对COVID-19导致的死亡率无影响 | 研究样本仅来自武汉地区，且时间范围有限，可能影响结果的普遍性 | 研究不同降压药物对COVID-19患者死亡率的影响 | 患有高血压并因COVID-19住院的患者 | 生物信息学 | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 278名患有高血压并确诊COVID-19的患者 |
| 2668 | 2024-08-08 |
Recombinant multimeric dog allergen prevents airway hyperresponsiveness in a model of asthma marked by vigorous TH 2 and TH 17 cell responses
2022-10, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15399
PMID:35657107
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研究论文 | 研究通过建立狗过敏的小鼠模型，评估重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6在预防狗过敏原引起的炎症反应中的效果 | 首次使用重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6在狗过敏模型中诱导耐受，减少气道高反应性和2型炎症 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨狗过敏原引起的炎症反应及重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6的预防效果 | 狗过敏的小鼠模型及重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6 | NA | 哮喘 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 2669 | 2024-08-08 |
Autoreactive CD8 T cells in NOD mice exhibit phenotypic heterogeneity but restricted TCR gene usage
2022-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201503
PMID:35667687
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA和T细胞受体测序（scRNA-seq和scTCR-seq）分析了非肥胖糖尿病小鼠胰岛和脾脏中的自身反应性CD8 T细胞，发现这些细胞在表型上具有异质性，但在TCR基因使用上受限 | 首次详细描述了自身反应性CD8 T细胞在非肥胖糖尿病小鼠中的克隆异质性和TCR基因使用的限制性 | 研究仅限于非肥胖糖尿病小鼠模型，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于人类或其他动物模型 | 探讨非肥胖糖尿病小鼠中自身反应性CD8 T细胞的表型和克隆异质性 | 非肥胖糖尿病小鼠的胰岛和脾脏中的自身反应性CD8 T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | RNA和T细胞受体序列 | 多个非肥胖糖尿病小鼠的胰岛和脾脏样本 |
| 2670 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling from whole embryos to single neuroblast lineages in Drosophila
2022-09, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.05.018
PMID:35660371
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析果蝇胚胎中的基因表达，以揭示不同细胞和组织类型在发育过程中的特征基因 | 首次对单个确定的神经母细胞系进行转录组分析，并发现了一个新的神经母细胞系特异性转录因子 | NA | 揭示构成每个器官的细胞类型‘部件清单’ | 果蝇胚胎中的不同细胞和组织类型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 三个不同时间点的果蝇胚胎样本 |
| 2671 | 2024-08-08 |
Identification of CD4+ T cells with T follicular helper cell characteristics in the pig
2022-09, Developmental and comparative immunology
IF:2.7Q1
DOI:10.1016/j.dci.2022.104462
PMID:35667468
|
研究论文 | 本研究通过使用交叉反应抗体，首次在猪的淋巴组织和血液中鉴定出具有滤泡辅助T细胞特征的CD4+ T细胞 | 首次在猪中鉴定出具有滤泡辅助T细胞特征的CD4+ T细胞，并证实了它们对B细胞的帮助能力 | 由于缺乏特定物种的抗体，猪的滤泡辅助T细胞研究之前未得到详细研究 | 研究猪中具有滤泡辅助T细胞特征的CD4+ T细胞 | 猪的淋巴组织和血液中的CD4+ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康猪的淋巴组织和血液样本 |
| 2672 | 2024-08-08 |
Intermediary Role of Lung Alveolar Type 1 Cells in Epithelial Repair upon Sendai Virus Infection
2022-09, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0421OC
PMID:35679221
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研究论文 | 本研究探讨了肺泡类型1细胞（AT1细胞）在仙台病毒感染后肺上皮修复中的中介作用 | 首次揭示了AT1细胞在肺损伤修复中的重要作用，特别是在AT2细胞缺失区域的维持和修复中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 研究肺上皮在仙台病毒感染后的修复机制 | 肺泡类型1细胞（AT1细胞）及其在肺上皮修复中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 2673 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Tissue Architecture in Human High-Grade Serous Ovarian Cancer
2022-08-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-0296
PMID:35675036
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类高级别浆液性卵巢癌的组织结构 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了高级别浆液性卵巢癌在早期和晚期的生态系统景观，并关注了其与肿瘤微环境的异质性 | NA | 研究高级别浆液性卵巢癌的异质性及其在肿瘤微环境中的特征 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本及年龄匹配的非恶性卵巢样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7名未经治疗的高级别浆液性卵巢癌患者和5名年龄匹配的非恶性卵巢样本 |
| 2674 | 2024-08-08 |
InterCellDB: A User-Defined Database for Inferring Intercellular Networks
2022-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202200045
PMID:35652265
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研究论文 | 本文介绍了InterCellDB平台，该平台允许用户自定义分析细胞间通信，结合scRNA-seq数据和蛋白质注释信息 | InterCellDB平台提供了一种新的可定制数据分析工具，用于解析与生物功能相关的基因表达中的细胞间通信 | NA | 开发一种新的平台，用于分析细胞间通信 | 细胞间通信和配体-受体对 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两个独立的scRNA-seq数据集，分别来自人和小鼠 |
| 2675 | 2024-08-08 |
Skeletal Stem/Progenitor Cells in Periosteum and Skeletal Muscle Share a Common Molecular Response to Bone Injury
2022-08, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4616
PMID:35652423
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研究论文 | 研究显示，骨再生过程中，来自骨膜和骨骼肌的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）在骨折修复期间比骨髓基质细胞更有效地参与软骨内骨化 | 首次揭示了骨膜和骨骼肌中的SSPCs在骨折后共同激活的分子机制，并发现BMP信号传导在此过程中的关键作用 | NA | 探讨骨骼干细胞/祖细胞在骨再生过程中的分子响应和功能 | 骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）及其在骨膜和骨骼肌中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNAseq） | NA | RNA | NA |
| 2676 | 2024-08-08 |
Detection of cell-cell interactions via photocatalytic cell tagging
2022-08, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-022-01044-0
PMID:35654846
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研究论文 | 本文介绍了利用光催化细胞标记技术（PhoTag）来研究细胞间相互作用的方法 | 引入了光催化细胞标记技术（PhoTag），结合单域抗体和光活化黄素基辅因子，实现了对细胞间相互作用的高分辨率分析 | NA | 开发一种新技术来研究疾病环境中免疫细胞间的相互作用 | 免疫细胞间的相互作用，特别是抗原呈递细胞与T细胞系统中的PD-1/PD-L1轴 | 生物技术 | NA | 光催化细胞标记技术（PhoTag） | NA | 细胞 | 外周血单个核细胞和Raji PD-L1 B细胞 |
| 2677 | 2024-08-08 |
Single cell- and spatial 'Omics revolutionize physiology
2022-08, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.13848
PMID:35656634
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综述 | 本文综述了单细胞多组学和空间转录组学技术在生理学研究中的应用 | 介绍了单细胞和空间转录组学技术在胚胎发育、肿瘤免疫学等领域的最新进展 | 讨论了这些技术的优势和局限性 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在生理学研究中的应用 | 胚胎发育、肿瘤免疫学、复杂组织的细胞组成和功能等 | 生物技术 | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2678 | 2024-08-08 |
Future directions for precision oncology in prostate cancer
2022-08, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24354
PMID:35657153
|
综述 | 本文综述了前列腺癌精准肿瘤学未来的发展方向，重点讨论了临床基因组检测、肿瘤异质性、分子特征及新技术在前列腺癌精准治疗中的应用 | 探讨了全基因组测序、转录组分析、表观遗传分析和单细胞RNA测序等扩展组织技术以及基于血液的细胞游离DNA、循环肿瘤细胞和外泌体等技术在前列腺癌精准医学中的潜在应用 | 目前前列腺癌中可操作的基因组改变总体发生率较低，且对肿瘤异质性和共存改变对治疗反应和结果的影响理解有限 | 探讨前列腺癌精准肿瘤学测试的未来实施和技术进步 | 前列腺癌患者及肿瘤分子特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 全基因组测序、转录组分析、表观遗传分析、单细胞RNA测序、细胞游离DNA、循环肿瘤细胞、外泌体 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、单细胞RNA数据、细胞游离DNA、循环肿瘤细胞、外泌体 | NA |
| 2679 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals pro-fibrotic PLA2G7high macrophages in pulmonary fibrosis
2022-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106286
PMID:35662628
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研究论文 | 本研究通过综合分析肺部单细胞和批量RNA测序数据，揭示了在肺纤维化中高度表达PLA2G7的特定巨噬细胞亚群及其在纤维化过程中的作用 | 首次发现并验证了PLA2G7在肺纤维化中的特定巨噬细胞亚群，并揭示了其在纤维母细胞向肌纤维母细胞转化中的作用机制 | NA | 探讨肺纤维化中特定巨噬细胞亚群的作用及其分子机制 | 肺纤维化患者的肺部单细胞和批量RNA测序数据，以及bleomycin诱导的小鼠肺纤维化模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及肺纤维化患者和小鼠模型的肺部样本 |
| 2680 | 2024-08-08 |
Hepatobiliary Tumor Organoids Reveal HLA Class I Neoantigen Landscape and Antitumoral Activity of Neoantigen Peptide Enhanced with Immune Checkpoint Inhibitors
2022-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105810
PMID:35665491
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研究论文 | 本研究通过分析肿瘤组织和匹配的肿瘤类器官（27对）的neoantigen-peptides的免疫原性潜力，利用全基因组测序（WGS）基于HLA-I类算法的Score工具，揭示了肝胆肿瘤的HLA-I类新抗原景观及新抗原肽增强的抗肿瘤活性与免疫检查点抑制剂的联合作用 | 开发了一个平台来评估T细胞对新抗原的反应，用于新抗原筛选 | NA | 研究肝胆肿瘤的HLA-I类新抗原景观，并探索新抗原肽在个性化免疫治疗中的应用 | 肿瘤组织和匹配的肿瘤类器官的新抗原肽 | 数字病理学 | 肝胆肿瘤 | 全基因组测序（WGS），RNA-seq，单细胞RNA-seq，质谱 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 27对肿瘤组织和匹配的肿瘤类器官 |