单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2601 - 2620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2601 | 2024-08-08 |
Identification and characterization of stem cells in mammalian esophageal stratified squamous epithelia
2022-11-17, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac038
PMID:35709398
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研究论文 | 本研究通过体内外实验，利用5-溴-2'-脱氧尿苷标记追踪、全基因组DNA甲基化和单细胞RNA测序技术，鉴定和表征了哺乳动物食管复层鳞状上皮中的干细胞群体 | 首次鉴定出食管复层鳞状上皮中含高水平的半桥粒（HDs）和低水平的Wnt信号的慢循环/静止干细胞群体，并揭示了HDs和Wnt信号在定义基底层干细胞中的关键作用 | NA | 探究食管复层鳞状上皮中干细胞的鉴定和表征 | 哺乳动物食管复层鳞状上皮中的干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA甲基化数据 | 使用大鼠进行体内外实验 |
| 2602 | 2024-08-08 |
Antiretroviral therapy restores the homeostatic state of microglia in SIV-infected rhesus macaques
2022-11, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.3HI0422-635R
PMID:35686500
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研究论文 | 本研究使用SIV感染的恒河猴模型，通过单细胞RNA测序、生物信息学和通路分析，探讨了联合抗逆转录病毒治疗（cART）对脑微胶质细胞稳态恢复的影响 | 本研究首次揭示了cART治疗能够恢复SIV感染恒河猴脑微胶质细胞的稳态，减少了炎症反应 | 研究仅限于SIV感染的恒河猴模型，尚未在人类中验证 | 测试联合抗逆转录病毒治疗是否能使SIV感染的脑微胶质细胞恢复到更接近稳态的状态 | SIV感染的恒河猴脑微胶质细胞 | NA | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | SIV感染的恒河猴脑微胶质细胞在不同条件下的样本 |
| 2603 | 2024-08-08 |
Interferon-stimulated and metallothionein-expressing macrophages are associated with acute and chronic allograft dysfunction after lung transplantation
2022-11, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2022.05.005
PMID:35691795
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了稳定和急性肺同种异体移植物功能障碍（ALAD）患者的支气管肺泡灌洗细胞以及慢性肺同种异体移植物功能障碍（CLAD）的肺组织细胞，识别了与肺移植后急性及慢性功能障碍相关的特定巨噬细胞亚群。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了肺移植后肺巨噬细胞的广泛异质性，并识别了与同种异体移植物功能障碍相关的特定巨噬细胞亚群，为治疗提供了潜在靶点。 | NA | 确定肺同种异体移植物功能障碍中的关键细胞元素，特别是巨噬细胞。 | 稳定和急性肺同种异体移植物功能障碍患者的支气管肺泡灌洗细胞以及慢性肺同种异体移植物功能障碍的肺组织细胞。 | 数字病理学 | 肺移植 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 稳定和ALAD患者的支气管肺泡灌洗细胞，以及4个慢性肺同种异体移植物功能障碍的肺组织细胞。 |
| 2604 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to explore composition of peripheral blood NK cells in patients with chronic myeloid leukemia in treatment-free remission
2022-11, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2022.2086243
PMID:35695125
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索治疗无复发生存期慢性髓性白血病患者外周血NK细胞的组成 | 首次通过单细胞RNA测序分析确定了在治疗无复发生存期慢性髓性白血病患者中，成熟和终末期、CD56亮和过渡期NK细胞亚群在维持无复发生存状态中的关键作用 | NA | 探索NK细胞亚群及其基因表达在维持治疗无复发生存状态中的作用 | 慢性髓性白血病患者的外周血NK细胞 | 数字病理学 | 慢性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括健康对照组和治疗无复发生存期患者的外周血单个核细胞 |
| 2605 | 2024-08-08 |
Estimating intraclonal heterogeneity and subpopulation changes from bulk expression profiles in CMap
2022-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101299
PMID:35688486
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研究论文 | 本文提出了一种计算框架Premnas，用于从CMap中的L1000批量表达谱估计未确定亚群的丰度，以理解药物和疾病相关的治疗途径和生物过程 | Premnas框架通过从单细胞RNA-seq数据中学习的亚群表示，直接从L1000谱估计亚群丰度，恢复了扰动后亚群变化的信息 | 由于L1000测定法的批量级表达谱性质，内克隆异质性和亚群组成变化在很大程度上被忽视 | 提高CMap中扰动连接的可解释性和可重复性 | CMap库中的批量表达谱数据 | 生物信息学 | NA | L1000测定法，单细胞RNA-seq | 原型分析 | 表达谱 | NA |
| 2606 | 2024-08-08 |
c-Rel-dependent monocytes are potent immune suppressor cells in cancer
2022-10, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.1MA0422-518RR
PMID:35694784
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和基因敲除方法，描述了一类由转录因子c-Rel编程的鼠和人类髓源抑制细胞，命名为rel依赖性单核细胞（rMos），这些细胞在肿瘤生长中通过强烈抑制T细胞功能和表现出强烈的迁移表型来促进肿瘤生长。 | 本文首次描述了由c-Rel调控的rel依赖性单核细胞，这些细胞表达高水平的促炎细胞因子IL-1β和低水平的抑制分子精氨酸酶1，通过c-Rel增强体控制单核细胞特征基因的表达。 | NA | 研究c-Rel依赖性单核细胞在肿瘤免疫抑制中的作用及其机制。 | 鼠和人类的髓源抑制细胞，特别是c-Rel依赖性单核细胞。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学，基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 鼠和人类样本 |
| 2607 | 2024-08-08 |
PRMT1 is required for the generation of MHC-associated microglia and remyelination in the central nervous system
2022-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201467
PMID:35705491
|
研究论文 | 本文通过使用铜唑（CPZ）饮食诱导的去髓鞘和再髓鞘化小鼠模型，发现PRMT1是中枢神经系统再髓鞘化所需的MHC相关小胶质细胞群体的驱动因子 | 首次鉴定PRMT1为调控再髓鞘化小胶质细胞激活的关键因子 | NA | 研究PRMT1在中枢神经系统再髓鞘化中的作用 | PRMT1在小胶质细胞中的作用及其对再髓鞘化的影响 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用CPZ饮食诱导的小鼠模型 |
| 2608 | 2024-08-08 |
Clonality and timing of relapsing colorectal cancer metastasis revealed through whole-genome single-cell sequencing
2022-09-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215767
PMID:35688262
|
研究论文 | 本文通过全基因组单细胞测序技术揭示了复发性结直肠癌转移的克隆性和时间特征 | 利用单细胞全基因组测序数据分析了复发性肝转移瘤的进化历史，揭示了治疗诱导的种群瓶颈和先前分化的克隆系的存活 | 研究样本仅为单一患者，可能限制了结果的普遍性 | 旨在更好地理解复发性肿瘤病变的进化历史，以识别转移进展的空间和时间模式 | 复发性结直肠癌的转移瘤 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 全基因组单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 单一转移性结直肠癌患者 |
| 2609 | 2024-08-08 |
Fangchinoline inhibits non-small cell lung cancer metastasis by reversing epithelial-mesenchymal transition and suppressing the cytosolic ROS-related Akt-mTOR signaling pathway
2022-09-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215783
PMID:35700820
|
研究论文 | 本文研究了防己碱通过逆转上皮-间质转化和抑制细胞质ROS相关的Akt-mTOR信号通路来抑制非小细胞肺癌转移的作用 | 防己碱通过直接靶向NOX4并促进其降解，从而减少细胞质ROS，抑制Akt-mTOR信号通路，显示出抑制非小细胞肺癌转移的新机制 | NA | 研究防己碱抑制非小细胞肺癌转移的机制 | 非小细胞肺癌细胞和动物模型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 包括TCGA和香港队列的多个样本，以及小鼠模型 |
| 2610 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of liver reveals the enhanced entry and release abilities of human adenovirus F41, partially explaining acute hepatitis in children
2022-09, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2022.06.007
PMID:35700865
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2611 | 2024-08-08 |
Brain-wide bidirectional neuropeptide modulation of individual neuron classes regulates a developmental decision
2022-08-08, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.05.048
PMID:35679871
|
研究论文 | 本文通过系统层面的研究，探讨了神经肽受体信号功能和细胞类型特异性分布在Caenorhabditis elegans发育决策中的作用 | 本文采用系统层面的方法，全面分析了神经肽受体突变体在诱导滞育进入表型中的功能，并结合单细胞RNA测序数据，揭示了几乎所有神经元类群都表达至少一种与滞育进入相关的受体 | NA | 研究神经肽在Caenorhabditis elegans发育决策中的作用 | Caenorhabditis elegans的神经肽受体信号功能和细胞类型特异性分布 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 2612 | 2024-08-08 |
scCNC: a method based on capsule network for clustering scRNA-seq data
2022-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac393
PMID:35699473
|
研究论文 | 本文提出了一种基于胶囊网络的半监督聚类方法scCNC，用于scRNA-seq数据的聚类分析 | scCNC方法将领域知识整合到聚类步骤中，并提出了一种半监督贪婪迭代训练方法来训练整个网络 | NA | 提高scRNA-seq数据聚类性能并促进下游分析 | scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 胶囊网络 | 胶囊网络 | scRNA-seq数据 | 一些真实scRNA-seq数据集 |
| 2613 | 2024-08-08 |
IsoLGs (Isolevuglandins) Drive Neutrophil Migration in Hypertension and Are Essential for the Formation of Neutrophil Extracellular Traps
2022-08, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究探讨了IsoLGs（异构月桂酸）在高血压中驱动中性粒细胞迁移和NET形成的作用 | 首次揭示了IsoLGs在高血压中对中性粒细胞迁移和NETosis的关键作用 | NA | 确定IsoLGs在高血压中对中性粒细胞迁移和NET形成的作用 | 小鼠和人类中性粒细胞 | NA | 高血压 | 单细胞测序、流式细胞术、免疫荧光和活细胞共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 小鼠和人类中性粒细胞 |
| 2614 | 2024-08-08 |
The antioxidant enzyme Peroxiredoxin-1 controls stroke-associated microglia against acute ischemic stroke
2022-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2022.102347
PMID:35688114
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了缺血再灌注损伤后大脑中与卒中相关的新型微胶质细胞类型，并探讨了抗氧化酶Peroxiredoxin-1在其功能中的作用 | 首次鉴定出一种具有增强抗氧化功能的新型微胶质细胞类型，称为卒中相关微胶质细胞（SAM），并揭示了Peroxiredoxin-1在其抗氧化功能中的关键作用 | NA | 研究缺血再灌注损伤后大脑中微胶质细胞的新型类型及其在抗氧化防御中的作用 | 卒中相关微胶质细胞及其抗氧化酶Peroxiredoxin-1的表达和功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 2615 | 2024-08-08 |
Thyrotropin-releasing hormone induces Ca2+ increase in a subset of vagal nodose ganglion neurons
2022-Aug, Neuropeptides
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.npep.2022.102261
PMID:35704969
|
研究论文 | 本文通过原位杂交和免疫组织化学方法验证了甲状腺释放激素受体1（TRHR1）在迷走神经结状神经节（NG）神经元中的表达，并使用遗传编码的钙指示剂（GECI）显示甲状腺释放激素（TRH）在NG神经元中诱导钙增加 | 首次证明了TRHR1在NG神经元中具有功能活性，并揭示了TRH通过Gq途径激活NG神经元 | NA | 探讨甲状腺释放激素（TRH）在迷走神经结状神经节神经元中的功能活性及其信号传导途径 | 迷走神经结状神经节神经元 | NA | NA | 原位杂交、免疫组织化学、遗传编码的钙指示剂（GECI） | NA | 神经元信号 | NA |
| 2616 | 2024-08-08 |
Dissecting the Heterogeneity of Human Thoracic Aortic Aneurysms Using Single-Cell Transcriptomics
2022-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.317484
PMID:35708028
|
综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术在人类胸主动脉瘤和夹层研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了单细胞RNA测序技术在解析胸主动脉瘤和夹层复杂性方面的应用 | 目前尚无有效的治疗方法来预防或临床管理胸主动脉瘤和夹层，仅有的有效治疗是手术修复 | 理解胸主动脉瘤和夹层发病机制中的瘤内和瘤间异质性 | 人类胸主动脉瘤和夹层 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 2617 | 2024-08-08 |
Cortical VIP+ Interneurons in the Upper and Deeper Layers Are Transcriptionally Distinct
2022-Aug, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-022-02040-8
PMID:35708842
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了大脑皮层中VIP中间神经元在不同层次的转录组差异 | 揭示了VIP中间神经元在浅层和深层层次的转录组差异，并发现了可能的标记基因 | 研究主要集中在视觉皮层和运动皮层，其他脑区的研究较少 | 探讨同一类中间神经元在不同层次的分子差异 | 大脑皮层中的VIP中间神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 1175个高质量的VIP中间神经元 |
| 2618 | 2024-08-08 |
Entropy-based inference of transition states and cellular trajectory for single-cell transcriptomics
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac225
PMID:35696651
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研究论文 | 本文提出了一种基于过渡熵的单细胞轨迹推断方法scTite，用于从scRNA-seq数据中识别过渡状态并重建细胞轨迹 | 引入了一种新的度量标准——过渡熵，用于测量细胞属于不同细胞集群的不确定性，并据此识别细胞状态和过渡细胞 | NA | 开发一种新的单细胞轨迹推断方法，以更准确地重建细胞轨迹 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型、状态和过渡 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 四组真实scRNA-seq数据和一个综合数据集 |
| 2619 | 2024-08-08 |
DURIAN: an integrative deconvolution and imputation method for robust signaling analysis of single-cell transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac223
PMID:35709795
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研究论文 | 介绍了一种名为DURIAN的集成去卷积和插补方法，用于恢复单细胞转录组数据中的基因表达 | DURIAN方法通过多任务回归基础的插补技术，提高了单细胞数据的聚类、低维嵌入和细胞间信号网络的恢复 | NA | 开发一种新的方法来恢复单细胞转录组数据中的基因表达信息 | 单细胞转录组数据中的基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多任务回归 | 转录组数据 | 使用合成数据集和已发表的数据集进行系统基准测试 |
| 2620 | 2024-08-08 |
Analysis of Gene Expression and TCR/B Cell Receptor Profiling of Immune Cells in Primary Sjögren's Syndrome by Single-Cell Sequencing
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100803
PMID:35705251
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术全面分析了原发性干燥综合征（pSS）患者外周血单个核细胞（PBMCs）的基因表达变化及TCR/BCR谱系特征 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞V(D)J测序技术，全面揭示了pSS患者免疫细胞亚群的变化及其TCR/BCR谱系的改变 | 研究仅限于pSS患者的外周血单个核细胞，未涉及其他组织或器官的免疫细胞 | 旨在全面表征pSS患者PBMCs的转录变化，以更好地理解pSS的发病机制、诊断和治疗 | 原发性干燥综合征（pSS）患者的免疫细胞及其TCR/BCR谱系 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |