单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2581 - 2600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2581 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing-based immunological feature analysis of a COVID-19 patient with recurrent positive SARS-CoV-2 RNA
2022-04-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001956
PMID:35730376
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2582 | 2024-08-08 |
Identification of Heparan Sulfate in Dilated Cardiomyopathy by Integrated Bioinformatics Analysis
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.900428
PMID:35711374
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，探讨了肝素硫酸盐（HS）在扩张型心肌病（DCM）中的作用 | 建立了基于肝素硫酸盐蛋白聚糖（HSPGs）的DCM患者分子分类 | NA | 探索肝素硫酸盐在扩张型心肌病中的作用 | 扩张型心肌病心脏中的肝素硫酸盐及其蛋白聚糖 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序，微阵列，单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 两个高通量RNA测序数据集，两个微阵列数据集，一个单细胞RNA测序数据集 |
| 2583 | 2024-08-08 |
Differential Expression of Genes Regulating Store-operated Calcium Entry in Conjunction With Mitochondrial Dynamics as Potential Biomarkers for Cancer: A Single-Cell RNA Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.866473
PMID:35711942
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研究论文 | 本研究分析了头颈鳞状细胞癌患者中调节存储操作钙通道（SOCs）及相关线粒体动态基因的mRNA和蛋白质表达，并探讨了它们作为癌症生物标志物的潜力。 | 首次在单细胞水平上分析了SOCs与线粒体动态基因在头颈鳞状细胞癌中的表达关系，并验证了蛋白质-蛋白质对接结果。 | 研究仅限于头颈鳞状细胞癌，且依赖于TCGA、CPTAC和GEO数据库的数据。 | 探讨SOCs及相关线粒体动态基因在头颈鳞状细胞癌中的表达及其作为生物标志物的潜力。 | 头颈鳞状细胞癌患者的SOCs及相关线粒体动态基因的mRNA和蛋白质表达。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 |
| 2584 | 2024-08-08 |
Lipid-associated macrophages in the tumor-adipose microenvironment facilitate breast cancer progression
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2085432
PMID:35712121
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研究论文 | 本文首次揭示了肿瘤-脂肪微环境中的M2样巨噬细胞浸润与乳腺癌不良生存率相关，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，识别出一种新型巨噬细胞亚群——脂质相关巨噬细胞（LAMs），其在肿瘤-脂肪交界区域分布，具有M2样巨噬细胞的典型功能特征，并能增强吞噬作用。 | 本文首次定义了肿瘤-脂肪微环境中的一种新型巨噬细胞亚群——脂质相关巨噬细胞（LAMs），并揭示了其在乳腺癌中的独特特征和临床结果。 | NA | 探索肿瘤-脂肪微环境中脂质相关变化及其对巨噬细胞功能的影响。 | 肿瘤-脂肪微环境中的巨噬细胞及其在乳腺癌中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学 | NA | RNA | NA |
| 2585 | 2024-08-08 |
A Germline Mutation in ATR Is Associated With Lung Adenocarcinoma in Asian Patients
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.855305
PMID:35712480
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和单细胞RNA测序，发现ATR基因的胚系突变与亚洲患者中的肺腺癌有关 | 首次在家族性肺腺癌患者中发现ATR基因的胚系突变，并探讨了其在肿瘤免疫细胞和基质细胞中的表达差异 | 研究样本仅限于一个中国家族的三姐妹，可能存在样本量较小的问题 | 旨在识别与家族性肺腺癌相关的基因 | 研究对象为一个被诊断为肺腺癌的中国家族的三姐妹 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 3名患者 |
| 2586 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Uncover Key Regulators of Skin Regeneration in Human Long-Term Mechanical Stretch-Mediated Expansion Therapy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.865983
PMID:35712657
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组测序技术研究了长期机械拉伸组织扩张疗法中人类表皮的变化，并通过免疫荧光分析验证了主要发现。 | 首次揭示了长期组织扩张疗法中人类表皮的转录变化，并识别了新的治疗靶点以提高皮肤扩张效率。 | NA | 研究长期机械拉伸组织扩张疗法中人类表皮的生物学变化。 | 人类表皮细胞在长期组织扩张疗法中的变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 临床样本 |
| 2587 | 2024-08-08 |
Identification of Neural Progenitor Cell-associated Chemoradiotherapy Resistance Gene Set (ARL4C, MSN, TNFAIP6) for Prognosis of Glioma
2022, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过构建由三个基因（ARL4C, MSN, TNFAIP6）组成的预后风险评分模型，评估了胶质瘤患者的预后情况，并探讨了化疗放疗抵抗相关基因在不同胶质瘤细胞中的异质性。 | 本研究构建了一个由三个基因组成的预后风险评分模型，为胶质瘤的诊断提供了新的视角，并揭示了化疗放疗抵抗机制。 | NA | 评估胶质瘤患者的预后，并提供精准治疗的新靶点和方向。 | 胶质瘤患者及其化疗放疗抵抗机制。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 53个与胶质瘤化疗放疗抵抗相关的基因，GSE117891队列中的单细胞数据 |
| 2588 | 2024-08-08 |
Gene Coexpression Network Characterizing Microenvironmental Heterogeneity and Intercellular Communication in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: Implications of Prognostic Significance and Therapeutic Target
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.840474
PMID:35719923
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据和加权基因共表达网络分析（WGCNA），揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）微环境异质性和细胞间通讯的基因共表达网络，并探讨了其对预后和治疗靶点的意义 | 利用单细胞数据和WGCNA解析了大量转录组，开发了新的PDAC预后预测策略，并发现ITGA2作为关键基因可以作为治疗靶点 | NA | 阐明指示肿瘤微环境（TME）特征的基因网络，并找到对抗胰腺癌的脆弱点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的微环境异质性和细胞间通讯 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因数据 | 使用了KrasG12D驱动的鼠胰腺癌模型进行体内评估 |
| 2589 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and TCGA RNA-Seq to Analyze the Heterogeneity of HPV+ and HPV- Cervical Cancer Immune Cells and Establish Molecular Risk Models
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.860900
PMID:35719936
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和TCGA的RNA测序数据，分析了HPV阳性和阴性宫颈癌患者的免疫细胞异质性，并建立了分子风险模型。 | 首次在单细胞水平上分析HPV阳性和阴性宫颈癌患者的免疫细胞异质性，并基于此建立了生存和复发模型。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序和TCGA数据分析，深入理解HPV诱导的宫颈癌的细胞机制，并建立准确的预后风险评估模型。 | HPV阳性和阴性宫颈癌患者的免疫细胞异质性及分子风险模型。 | 数字病理学 | 宫颈癌 | scRNA-Seq, TCGA RNA-Seq | WGCNA, LASSO Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 2590 | 2024-08-08 |
CCL5-Secreting Virtual Memory CD8+ T Cells Inversely Associate With Viral Reservoir Size in HIV-1-Infected Individuals on Antiretroviral Therapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.897569
PMID:35720272
|
研究论文 | 研究探讨了HIV-1感染者在抗逆转录病毒治疗(ART)下，CD8+ T细胞的效应分子和表型亚群与HIV-1 DNA及细胞相关未剪接RNA(CA usRNA)的相关性 | 发现CCL5分泌的虚拟记忆CD8+ T细胞亚群可能是HIV-1病毒库大小的潜在决定因素 | 研究对象仅为60名病毒学抑制的HIV-1感染者，样本量有限 | 揭示HIV-1感染者在ART下CD8+ T细胞的细胞和分子机制 | CD8+ T细胞的效应分子和表型亚群与HIV-1 DNA及CA usRNA的相关性 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 60名病毒学抑制的HIV-1感染者 |
| 2591 | 2024-08-08 |
A Global Regulatory Network for Dysregulated Gene Expression and Abnormal Metabolic Signaling in Immune Cells in the Microenvironment of Graves' Disease and Hashimoto's Thyroiditis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.879824
PMID:35720300
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研究论文 | 本研究探讨了桥本甲状腺炎和格雷夫斯病中免疫细胞亚群异常表达基因和代谢信号的分子机制，并通过单细胞RNA测序等技术构建了免疫细胞的全球调控网络。 | 首次在单细胞水平上揭示了桥本甲状腺炎和格雷夫斯病中免疫细胞亚群的异常基因表达和代谢信号，并构建了免疫细胞的全球调控网络。 | 研究样本量较小，仅包括2名桥本甲状腺炎患者、2名格雷夫斯病患者和1名对照捐赠者。 | 阐明桥本甲状腺炎和格雷夫斯病中免疫细胞亚群异常免疫功能的分子机制。 | 桥本甲状腺炎和格雷夫斯病患者的甲状腺样本中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 甲状腺疾病 | 单细胞RNA测序、全转录组测序、全长转录组测序（Oxford Nanopore Technologies）、代谢组测序 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 2名桥本甲状腺炎患者、2名格雷夫斯病患者和1名对照捐赠者的甲状腺样本 |
| 2592 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA and ATAC Sequencing Reveal Hemodialysis-Related Immune Dysregulation of Circulating Immune Cell Subpopulations
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.878226
PMID:35720370
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，分析了健康对照组和维持性血液透析患者的循环免疫细胞亚群的转录组和染色质可及性特征 | 首次揭示了长期血液透析对循环免疫细胞亚群的转录程序和染色质可及性的影响 | NA | 探讨血液透析相关的免疫失调机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 健康对照组和维持性血液透析患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 健康对照组和维持性血液透析患者的PBMCs |
| 2593 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis of the db/db Mouse Hippocampus Reveals Cell-Type-Specific Insights Into the Pathobiology of Diabetes-Associated Cognitive Dysfunction
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.891039
PMID:35721719
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了db/db小鼠海马体的细胞类型特异性变化，以揭示糖尿病相关认知功能障碍的病理生物学机制 | 首次在单细胞水平上揭示了糖尿病小鼠海马体中与炎症和氧化应激相关的细胞类型特异性基因表达变化，并发现了一种与促炎性疾病相关的微胶质细胞亚群 | 研究仅限于db/db小鼠模型，可能需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 深入了解糖尿病相关认知功能障碍的分子和细胞变化，并识别潜在的诊断生物标志物和治疗干预措施 | db/db小鼠的海马体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 14621个海马体细胞 |
| 2594 | 2024-08-08 |
Identification of Type 2 Diabetes Biomarkers From Mixed Single-Cell Sequencing Data With Feature Selection Methods
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.890901
PMID:35721855
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研究论文 | 本研究通过特征选择方法从混合单细胞测序数据中识别出2型糖尿病的生物标志物 | 揭示了传统批量测序技术忽视的新型潜在致病机制，并发现了与2型糖尿病相关的新的基因 | NA | 探索2型糖尿病在分子层面的本质，并识别其在单细胞水平的差异表达特征 | 2型糖尿病患者的单细胞表达谱 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 1600多个单细胞，其中949个来自2型糖尿病患者，651个来自正常对照 |
| 2595 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptomic Analysis Reveals Organ Specific Pericyte Markers and Identities
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.876591
PMID:35722109
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，识别了特定组织中周细胞的特异性标记物 | 首次在肺、心脏、肾脏和膀胱中识别出特定周细胞标记物，并揭示了壁细胞之间的差异表达基因和功能关系 | NA | 识别周细胞特异性标记物，并揭示其在不同组织中的功能和关系 | 小鼠特定组织的周细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自小鼠肺、心脏、肾脏和膀胱的特定组织周细胞群体 |
| 2596 | 2024-08-08 |
Correction: Differential expression profile of gluten-specific T cells identified by single-cell RNA-seq
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0270444
PMID:35727765
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2597 | 2024-08-08 |
Identification of Ligand-Receptor Pairs Associated With Tumour Characteristics in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.874056
PMID:35734169
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞测序数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤微环境中配体-受体（LR）对的复杂组成及其与肿瘤特征的关联 | 提出了基于46个LR对的新的分子亚型分类模型，并构建了LR.score模型用于准确预测ccRCC患者的预后 | NA | 识别与透明细胞肾细胞癌肿瘤特征相关的配体-受体对，并探索其在分子亚型分类和免疫治疗效果预测中的应用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤微环境及其配体-受体对的表达模式和临床相关性 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自Gene expression omnibus数据库和TCGA-KIRC数据集的ccRCC患者数据 |
| 2598 | 2024-08-08 |
Identification of the Immune Subtype of Hepatocellular Carcinoma for the Prediction of Disease-Free Survival Time and Prevention of Recurrence by Integrated Analysis of Bulk- and Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868325
PMID:35734185
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，识别肝细胞癌的免疫亚型，用于预测无病生存时间并预防复发 | 构建了一种新的高效T细胞风险评分（TCRS），用于识别具有较长无病生存时间和炎症免疫特征的肝细胞癌患者免疫亚型 | NA | 预测肝细胞癌患者手术后的无病生存时间并预防复发 | 肝细胞癌患者的免疫细胞及其在无病生存时间预测和复发预防中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型 | RNA测序数据 | NA |
| 2599 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Using Fluidigm C1 Platform for Characterization of Heterogeneous Transcriptomes
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2376-3_19
PMID:35737246
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研究论文 | 本文详细介绍了一种使用Fluidigm C1平台进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析的工作流程和协议，并引入了验证差异基因表达的策略 | scRNA-seq技术能够在单细胞分辨率下表征转录组异质性 | NA | 表征转录组异质性 | 单细胞RNA测序分析 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | cDNA | 单细胞 |
| 2600 | 2024-08-08 |
Dysregulated Th1 cells in lung squamous cell carcinoma
2022-12, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.1MA0422-208R
PMID:35686499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光染色技术，分析了肺鳞状细胞癌（LUSC）中Th1细胞的功能失调情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了LUSC中Th1细胞功能下降与内质网应激的相关性 | 研究样本量较小，需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探讨肺鳞状细胞癌中Th1细胞的功能状态及其与肿瘤微环境的关系 | 肺鳞状细胞癌患者的Th1细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 8名LUSC患者组织样本，32名LUSC患者免疫荧光染色样本 |