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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-06 |
Efficacy and limitations of senolysis in atherosclerosis
2022-06-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab208
PMID:34142149
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研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老标志物在动脉粥样硬化中的特异性以及遗传和药物性衰老细胞清除(senolysis)对疾病的影响 | 揭示了传统衰老标志物p16在动脉粥样硬化中的局限性,并首次比较了遗传性和药物性衰老细胞清除策略的不同效果 | 传统衰老标志物缺乏特异性,药物性衰老细胞清除可能引起非特异性效应如单核细胞和血小板减少 | 评估衰老细胞清除在动脉粥样硬化治疗中的疗效和局限性 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)、小鼠动脉粥样硬化模型、人类VSMCs培养细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、谱系追踪、细胞培养 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 人类和小鼠VSMCs细胞、小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-06 |
The tumour microenvironment shapes innate lymphoid cells in patients with hepatocellular carcinoma
2022-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325288
PMID:34340996
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研究论文 | 本研究探讨肝细胞癌肿瘤微环境如何通过细胞因子梯度调控先天淋巴细胞的组成和可塑性 | 首次在肝细胞癌中系统揭示肿瘤微环境通过细胞因子梯度调控ILC亚群转化和功能可塑性 | 样本量相对有限,未在更多癌种中验证发现的特异性 | 研究肿瘤微环境对先天淋巴细胞在肝细胞癌中的调控机制 | 48例肝细胞癌患者的肿瘤组织、癌旁组织和边缘组织 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序,AbSeq | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,批量RNA测序数据 | 48例肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-06 |
The molecular and phenotypic makeup of fetal human skin T lymphocytes
2022-04-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199781
PMID:34604909
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研究论文 | 本研究开发了从胎儿人类皮肤中分离和扩增T细胞的新工作流程,并系统表征了其分子表型特征 | 建立了首个从胎儿皮肤中高效分离和扩增T细胞的工作流程,并首次全面表征了胎儿皮肤T细胞的分子表型 | 胎儿皮肤样本中T细胞数量稀少可能限制分析的深度,培养过程可能对细胞表型产生未知影响 | 研究胎儿人类皮肤中T细胞的分子和表型特征及其在早期免疫中的作用 | 胎儿人类皮肤组织中的T淋巴细胞 | 免疫学 | NA | 多参数流式细胞术、原位免疫荧光、单细胞转录组测序、TCR受体谱分析 | NA | 流式细胞数据、荧光图像、单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 胎儿皮肤活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-06 |
Advancing root developmental research through single-cell technologies
2022-02, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102113
PMID:34562694
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综述 | 探讨单细胞技术在植物根系发育研究中的应用与前景 | 提出通过整合多组学数据和空间转录组学提升根系发育研究的时空分辨率 | 当前技术仍处于初步阶段,尚未充分发挥单细胞技术的全部潜力 | 推动单细胞技术在植物根系发育研究领域的应用发展 | 拟南芥根分生组织及其他植物物种的根系发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, 轨迹分析 | 单细胞基因调控网络 | 转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Conserved Metaplasia Program in Pancreatic Injury
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.027
PMID:34695382
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胰腺损伤中腺泡向导管化生(ADM)的保守化生程序及其与肿瘤发生的关系 | 首次在单细胞水平系统描绘胰腺损伤诱导的ADM细胞群体及其发育轨迹,发现与胃幽门化生相似的转录表型,并证明KrasG12D靶向ADM群体可驱动肿瘤形成 | 样本量相对有限,人类样本仅来自15例慢性胰腺炎患者 | 定义胰腺损伤中腺泡向导管化生(ADM)产生的细胞群体、转录变化及疾病进展标志物 | 小鼠胰腺腺泡细胞、人类慢性胰腺炎手术标本 | 单细胞生物学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、免疫染色、电子显微镜 | 谱系轨迹分析 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 超过13,000个EYFP+细胞进行scRNA-seq,15例人类慢性胰腺炎患者手术标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-10-06 |
Differential abundance testing on single-cell data using k-nearest neighbor graphs
2022-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01033-z
PMID:34594043
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研究论文 | 提出基于k近邻图的单细胞数据差异丰度测试新方法Milo | 使用部分重叠的k近邻图邻域替代传统离散聚类,能识别连续轨迹变化和聚类方法无法检测的扰动 | 基于细胞间相似性结构,可能不适用于所有单细胞数据类型 | 开发单细胞数据差异丰度测试的统计框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | k近邻图 | 单细胞基因表达数据 | 模拟数据和真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 247 | 2025-10-06 |
Comparative description of the mRNA expression profile of Na+ /K+ -ATPase isoforms in adult mouse nervous system
2022-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25234
PMID:34415061
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据库分析成年小鼠神经系统中Na+/K+-ATPase不同亚型的mRNA表达模式 | 首次在单细胞水平系统描述Na+/K+-ATPase各亚型在成年小鼠神经系统中的表达谱,并鉴定出α1和α3亚型富集的特定神经元类型 | 研究基于现有数据库,缺乏实验验证;仅关注mRNA水平,未涉及蛋白质表达和功能验证 | 阐明不同Na+/K+-ATPase亚型在神经系统中的表达模式,为相关神经系统疾病的发病机制提供见解 | 成年小鼠神经系统中的不同脑区和各种神经元群体 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个成年小鼠神经系统scRNA-Seq数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2025-10-06 |
Murine AGM single-cell profiling identifies a continuum of hemogenic endothelium differentiation marked by ACE
2022-01-20, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020007885
PMID:34517413
|
研究论文 | 通过小鼠AGM区域单细胞测序揭示造血内皮细胞分化连续过程及ACE标记作用 | 首次发现血管紧张素-I转换酶(ACE)特异性标记造血前体细胞向造血内皮细胞分化的连续过程 | 研究仅限于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 解析胚胎期造血干细胞形成的分子和细胞通路 | 小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域的造血内皮细胞和背主动脉微环境细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 使用Runx1b和Gfi1/1b转基因报告小鼠模型分离的造血内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 全长单细胞RNA测序 |
| 249 | 2025-10-06 |
Deciphering Mesenchymal Drivers of Human Dupuytren's Disease at Single-Cell Level
2022-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.05.030
PMID:34274346
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别人类掌腱膜挛缩症中致病性间充质细胞亚群及其关键分子通路 | 首次在单细胞水平鉴定出Dupuytren病特异性PDPN/FAP致病性间充质细胞群,并发现TNFRSF12A和SCX在成纤维细胞分化中的关键作用 | 样本量相对有限(35,250个细胞),功能验证仅通过体外细胞培养实验完成 | 解析Dupuytren病的细胞和分子驱动机制,为开发新疗法提供靶点 | 人类Dupuytren病变组织、非致病性筋膜和健康真皮组织 | 单细胞组学 | 掌腱膜挛缩症 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 35,250个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-06 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
|
研究论文 | 本文介绍使用10x Genomics平台同时分析人类造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组与细胞表面蛋白表达的方法 | 将CITE-seq工作流程与10x Genomics平台结合,实现单细胞转录组和表面蛋白表达的同时分析 | NA | 开发同时表征蛋白质和RNA的单细胞分析方法 | 人类脐带血单核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 单细胞多组学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | 10x Genomics, BioLegend | 单细胞RNA-seq, 免疫表型分析 | 10x Chromium, TotalSeq | 基于液滴的单细胞RNA-seq商业平台, TotalSeq™寡核苷酸偶联抗体 |
| 251 | 2025-10-06 |
Delineating chromatin accessibility re-patterning at single cell level during early stage of direct cardiac reprogramming
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.09.002
PMID:34509499
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC-seq技术揭示了心脏重编程早期阶段染色质可及性重塑的动态过程 | 首次在单细胞水平系统描绘心脏重编程早期的染色质可及性重编程模式,并发现Smad3在重编程过程中具有双重作用 | 研究聚焦于重编程早期阶段(第3天),未涵盖完整重编程过程 | 解析心脏成纤维细胞直接重编程为心肌细胞过程中染色质景观变化的驱动机制 | 由Mef2c、Gata4和Tbx5诱导的早期重编程心肌细胞(iCMs) | 表观基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2025-10-06 |
Identification of HSC/MPP expansion units in fetal liver by single-cell spatiotemporal transcriptomics
2022-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00540-7
PMID:34341490
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研究论文 | 通过单细胞时空转录组技术识别小鼠胎肝中造血干细胞/多能祖细胞扩张单元 | 首次构建小鼠胎肝时空转录组图谱,发现CD93富集的HSC/MPP亚群和由多种生态位细胞组成的HSC PLUS结构单元 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 解析造血干细胞和祖细胞在天然生态位中的扩张机制 | 小鼠胎肝中的造血干细胞/多能祖细胞及其生态位细胞 | 单细胞组学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-06 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
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综述 | 本文综述了κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽在调节瘙痒和疼痛感觉中的分子遗传学机制 | 整合了单细胞测序数据重新分析显示这些分子的表达谱,并基于解剖结构系统梳理了κ阿片系统在不同部位的作用 | 仅考虑强啡肽与KOR的相互作用,未深入探讨高剂量下其他肽类对KOR的潜在刺激作用 | 探讨κ阿片受体系统在疼痛和瘙痒感觉调节中的分子遗传机制 | κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽,以及受其影响的细胞和神经回路 | 神经科学 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-10-06 |
Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1
2022-Jan, Gland surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.21037/gs-21-908
PMID:35242686
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研究论文 | 本研究探讨赖氨酰氧化酶(LOX)通过BMP1促进甲状腺未分化癌增殖和转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示LOX/BMP1轴在甲状腺未分化癌恶性进展中的关键作用 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索甲状腺未分化癌的新型治疗靶点 | 甲状腺未分化癌细胞系(8505C) | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, qRT-PCR, Western blot, RNA干扰 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | GEO数据库中的ATC单细胞RNA测序数据和微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-06 |
Cell type-specific changes identified by single-cell transcriptomics in Alzheimer's disease
2022-11-30, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01136-5
PMID:36447241
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综述 | 整合阿尔茨海默病单细胞转录组学研究的主要发现,并探讨空间组学和多模态研究的新进展 | 首次系统整合多篇单细胞研究,揭示特定细胞类型在阿尔茨海默病中的变化,并展望空间组学技术前景 | 基于已有研究数据的二次分析,未包含原始实验数据 | 系统梳理阿尔茨海默病单细胞转录组学研究进展 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的尸检脑组织 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 多个研究涉及的尸检脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
Cryobanking of Human Distal Lung Epithelial Cells for Preservation of Their Phenotypic and Functional Characteristics
2022-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0507MA
PMID:36036918
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研究论文 | 本文详述了一种用于冷冻保存小鼠或人肺组织上皮细胞以保持其表型和功能特征的方法 | 开发了有效的远端肺组织上皮细胞冷冻保存方法,解决了远端气体交换区域功能上皮细胞类型长期保存的技术空白 | NA | 建立能够长期保存远端肺组织上皮细胞表型和功能特征的冷冻保存方法 | 小鼠和人肺组织中的远端肺上皮细胞,特别是肺泡2型细胞 | 细胞生物学 | 肺部疾病 | 流式细胞术、上皮类器官形成效率分析、单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
CD38 Mediates Lung Fibrosis by Promoting Alveolar Epithelial Cell Aging
2022-08-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202109-2151OC
PMID:35687485
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研究论文 | 本研究揭示了CD38通过促进肺泡上皮细胞衰老介导肺纤维化的机制 | 首次发现CD38作为主要NAD水解酶在肺泡上皮细胞衰老和肺纤维化中的关键作用,并提出靶向CD38的治疗策略 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人类患者中的直接证据仍需进一步验证 | 探究CD38在肺泡上皮细胞衰老和肺纤维化中的作用机制 | 肺泡上皮细胞、特发性肺纤维化患者肺组织、小鼠肺纤维化模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、实时PCR、流式细胞术、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 人类IPF肺组织、年轻和年老小鼠纤维化肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals pathogenesis of viral myocarditis
2022-Oct, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00138-1
PMID:36970396
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术,构建了新生小鼠病毒性心肌炎的高分辨率时空转录组图谱 | 首次创建了呼肠孤病毒诱导心肌炎的高分辨率时空转录组图谱,揭示了心肌炎区域和边界区的空间限制性基因表达模式 | 研究仅限于新生小鼠模型,未在人类样本中验证 | 揭示病毒性心肌炎的发病机制 | 新生小鼠心脏组织和肠道组织 | 空间转录组学 | 病毒性心肌炎 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 感染后三个时间点收集的小鼠心脏和肠道样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 259 | 2025-10-07 |
The Tabula Sapiens: A multiple-organ, single-cell transcriptomic atlas of humans
2022-05-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abl4896
PMID:35549404
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研究论文 | 构建了一个包含24种人类组织器官、近50万个细胞的单细胞转录组图谱 | 首次使用同一供体的多个组织器官创建单细胞转录组图谱,能够分析T细胞在不同组织间的克隆分布、B细胞的组织特异性突变率以及共享细胞类型在不同组织中的细胞周期状态 | NA | 创建人类多器官单细胞转录组参考图谱,研究细胞类型在不同组织中的分布和基因表达差异 | 人类24种不同组织和器官的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 近500,000个细胞,来自24种不同组织器官,多数来自同一供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
Emerging drug targets for triple-negative breast cancer: a guided tour of the preclinical landscape
2022-05, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2077188
PMID:35574694
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综述 | 本文系统综述了三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点及其临床前研究进展 | 基于可药性、治疗效力、TNBC特异性及免疫治疗应用等标准,全面评估癌细胞膜分子、细胞内信号通路和肿瘤微环境等新兴靶点 | 靶点识别验证面临分子异质性、临床前到临床转化失败等挑战,缺乏统一评估标准 | 探索三阴性乳腺癌的新型有效靶向治疗策略 | 三阴性乳腺癌的分子靶点和肿瘤微环境 | 肿瘤学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 热稳定II型内含子逆转录酶测序, 人源化小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |