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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2541 | 2024-08-08 |
The Crosstalk Between Immune Infiltration, Circulating Tumor Cells, and Metastasis in Pancreatic Cancer: Identification of HMGB3 From a Multiple Omics Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.892177
PMID:35754798
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,探讨了胰腺癌中免疫浸润、循环肿瘤细胞与转移之间的关系,并识别出HMGB3作为关键基因 | 首次基于循环肿瘤细胞的bulk RNA测序和单细胞测序数据,揭示了胰腺癌转移的机制,并识别出HMGB3作为与转移相关的重要基因 | 研究依赖于公开数据库中的现有数据,可能存在样本选择偏倚 | 探讨胰腺癌中免疫浸润、循环肿瘤细胞与转移之间的关系,并识别关键基因 | 胰腺癌中的循环肿瘤细胞及其与转移的关系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序 | WGCNA | RNA | 多个数据集中的循环肿瘤细胞样本 |
2542 | 2024-08-08 |
Relationship Between CNVs and Immune Cells Infiltration in Gastric Tumor Microenvironment
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.869967
PMID:35754804
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌肿瘤微环境中拷贝数变异(CNVs)与免疫细胞浸润之间的关系 | 首次通过单细胞测序数据分析,识别并验证了胃癌中与CNVs高度相关的基因,并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关联 | NA | 旨在识别和验证胃癌的潜在治疗和预后靶点 | 胃癌中的拷贝数变异(CNVs)与免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | LASSO | RNA-seq数据 | 使用了来自GEO和TCGA的胃癌及正常上皮细胞的RNA-seq数据 |
2543 | 2024-08-08 |
Identification of a Recurrence Gene Signature for Ovarian Cancer Prognosis by Integrating Single-Cell RNA Sequencing and Bulk Expression Datasets
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.823082
PMID:35754835
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量表达数据集,识别出卵巢癌复发相关的基因特征,用于预测卵巢癌的预后 | 首次在单细胞水平上探索肿瘤复发的内在生物学机制,并从复发事件中衍生出新的预后标志物 | NA | 识别卵巢癌复发相关的基因特征,以提高对卵巢癌预后的理解并辅助治疗决策 | 卵巢癌患者的单细胞RNA测序和批量表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 基因风险模型 | 基因表达数据 | 524个卵巢癌样本 |
2544 | 2024-08-08 |
Aged Callus Skeletal Stem/Progenitor Cells Contain an Inflammatory Osteogenic Population With Increased IRF and NF-κB Pathways and Reduced Osteogenic Potential
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.806528
PMID:35755815
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠骨痂中的骨骼干细胞/祖细胞(SSPCs),揭示了老年骨痂中炎症性成骨细胞群的增加及其成骨潜能的降低 | 首次揭示了老年骨痂中骨骼干细胞/祖细胞的分子特征,特别是炎症性成骨细胞群的增加及其成骨潜能的降低 | NA | 研究老年骨痂中骨骼干细胞/祖细胞的分子特征 | 年轻和老年小鼠骨痂中的骨骼干细胞/祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,957个CD45CD31Ter119骨骼干细胞/祖细胞 |
2545 | 2024-08-08 |
Single Cell Meta-Analysis of Endothelial to Mesenchymal Transition (EndMT) in Glucose Metabolism of the Digestive Diseases
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.866408
PMID:35755820
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meta-分析 | 本研究旨在阐明内皮细胞向间质细胞转化(EndMT)在消化系统疾病中的作用及其代谢状态 | 首次发现EndMT在消化系统疾病中的作用及其在葡萄糖代谢中的关键作用 | NA | 阐明EndMT在消化系统疾病中的作用及其代谢状态 | 消化系统疾病中的EndMT及其代谢状态 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 涉及多种消化器官的组织样本,包括胃、肠和胰腺的癌前病变和癌症 |
2546 | 2024-08-08 |
Identification of Five Hub Genes Based on Single-Cell RNA Sequencing Data and Network Pharmacology in Patients With Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2022.894129
PMID:35757636
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和网络药理学方法,在急性心肌梗死患者中识别了五个关键基因 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学分析,识别了与急性心肌梗死进展相关的五个关键基因,并预测了一种潜在的抑制剂 | 研究主要基于数据库中的现有数据,未进行实验验证 | 旨在通过单细胞RNA测序和网络药理学方法,识别急性心肌梗死的关键基因及其潜在药物 | 急性心肌梗死患者的单细胞RNA测序数据和相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个细胞集群,标记为5种细胞类型 |
2547 | 2024-08-08 |
Single-Cell Landscape of Mouse Islet Allograft and Syngeneic Graft
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.853349
PMID:35757709
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠胰岛移植模型中的免疫异质性 | 首次全面分析了胰岛同种异体移植和同基因移植中免疫微环境的复杂性,并揭示了同种异体胰岛细胞向抗原呈递细胞样细胞的转变 | NA | 研究胰岛移植中的免疫排斥机制及其对移植功能的影响 | 小鼠胰岛同种异体移植和同基因移植中的免疫细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰岛移植模型 |
2548 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of ILC2s in the Lungs
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.918458
PMID:35757740
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综述 | 本文综述了肺部第2组先天淋巴细胞(ILC2s)的异质性及其在免疫学中的新领域 | 探讨了ILC2s在不同组织环境中的多样性及其对免疫记忆和衰竭的影响 | 需要更全面的理解ILC2s的多样性,而不仅仅是单一截面的快照 | 阐明ILC2s如何影响人类疾病 | 肺部的第2组先天淋巴细胞(ILC2s) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | NA |
2549 | 2024-08-08 |
Tissue-Specific Diversity of Group 2 Innate Lymphoid Cells in the Skin
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.885642
PMID:35757747
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综述 | 本文综述了皮肤中第2组先天淋巴细胞(ILC2s)的组织特异性特征 | 讨论了皮肤ILC2s在细胞表面标记物表达模式、对组织衍生细胞因子的反应以及在稳态和炎症中的功能方面的不同特点 | NA | 探讨皮肤中ILC2s的表型和功能异质性,并强调ILC生物学领域的未来方向 | 皮肤中的第2组先天淋巴细胞(ILC2s) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | NA |
2550 | 2024-08-08 |
Discovering Immune-Mediated Mechanisms of Gastric Carcinogenesis Through Single-Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.902017
PMID:35757757
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胃癌免疫学领域的应用,揭示了免疫细胞在胃癌发生中的作用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的肿瘤内和肿瘤间异质性的免疫学、细胞和分子水平见解 | 当前研究识别了肿瘤微环境中多种巨噬细胞和肥大细胞亚群,但需要进一步研究确定它们促进癌症生长的作用 | 探讨单细胞RNA测序技术在胃癌免疫机制研究中的应用和发现 | 胃癌组织、胃癌患者腹水及实验室胃病模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及胃癌组织、腹水及实验室模型数据 |
2551 | 2024-08-08 |
Intestinal accumulation of microbiota-produced succinate caused by loss of microRNAs leads to diarrhea in weanling piglets
2022 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2022.2091369
PMID:35758253
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研究论文 | 本研究通过猪模型探讨了断奶应激诱导腹泻的机制,发现肠道微生物产生的琥珀酸在微小RNA缺失情况下积累,导致腹泻。 | 首次揭示了微小RNA缺失导致肠道微生物产生的琥珀酸积累,进而引发断奶仔猪腹泻的机制。 | 研究仅限于猪模型,需要进一步在其他动物模型或人类中验证。 | 阐明和丰富断奶应激诱导腹泻的机制基础。 | 断奶仔猪的腹泻及其与肠道微生物和代谢物的关系。 | NA | 腹泻 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及断奶仔猪的粪便微生物组、代谢物和微小RNA水平。 |
2552 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis and Multiple Machine Learning Methods Identified G0S2 and HPSE as Novel Biomarkers for Abdominal Aortic Aneurysm
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.907309
PMID:35769488
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、加权共表达网络分析和差异表达分析,结合多种机器学习方法,从公共数据库中识别出腹主动脉瘤的新型生物标志物G0S2和HPSE,并验证了它们在不同数据集中的表现。 | 首次通过单细胞测序和机器学习方法识别出腹主动脉瘤的新型生物标志物G0S2和HPSE,并探讨了它们与免疫细胞浸润的关系。 | 研究主要依赖公共数据库数据,未涉及临床样本的直接验证。 | 识别腹主动脉瘤的新型生物标志物,以促进其病理机制的理解和治疗策略的发展。 | 腹主动脉瘤的生物标志物及其与免疫细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 288个差异表达基因(DEGs)用于腹主动脉瘤和正常样本,17个DEGs用于大和小腹主动脉瘤样本。 |
2553 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals that DBI is the Key Gene and Potential Therapeutic Target in Quiescent Bladder Cancer Stem Cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.904536
PMID:35769986
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,在肌肉侵袭性膀胱癌(MIBC)中识别癌症干细胞(CSCs),并评估其分子特征,以发现可能的治疗措施 | 本研究首次识别出DBI作为静止期膀胱癌干细胞的关键基因,并预测了乙酰氨基酚作为潜在的治疗药物 | 研究主要基于GEO数据库和TCGA数据集进行分析,未来需要进一步的实验验证 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别膀胱癌干细胞并探索其治疗策略 | 肌肉侵袭性膀胱癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GEO数据集GSE130001和GSE146137以及TCGA数据集 |
2554 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq dissecting heterogeneity of tumor cells and comprehensive dynamics in tumor microenvironment during lymph nodes metastasis in gastric cancer
2022-10-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34172
PMID:35716132
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境动态变化 | 首次全面揭示了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中肿瘤细胞和肿瘤微环境的异质性,并识别出具有淋巴结转移潜力的胃癌细胞亚型 | NA | 揭示胃癌淋巴结转移过程中肿瘤细胞的动态变化及潜在机制 | 胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的肿瘤细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的组织样本 |
2555 | 2024-08-08 |
A map of the spatial distribution and tumour-associated macrophage states in glioblastoma and grade 4 IDH-mutant astrocytoma
2022-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5984
PMID:35723032
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研究论文 | 本研究旨在解析高级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的转录状态、空间分布及临床病理意义 | 首次揭示了IDH突变型4级星形细胞瘤中TAMs的多样性及其功能状态,并探讨了其在肿瘤微环境中的空间分布和临床相关性 | 研究样本量较小,仅包括四例人类胶质母细胞瘤和三例IDH突变型4级星形细胞瘤 | 探讨高级别胶质瘤中TAMs的多样性及其在肿瘤微环境中的作用和临床意义 | 高级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其在IDH突变型4级星形细胞瘤中的多样性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24,227个髓系细胞 |
2556 | 2024-08-08 |
Development of a novel signature derived from single cell RNA-sequencing for preoperative prediction of lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2022-10, Head & neck
DOI:10.1002/hed.27126
PMID:35726502
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发并验证了一种用于头颈部鳞状细胞癌患者术前预测淋巴结转移的LNM特征 | 首次利用单细胞RNA测序数据开发了一种新的LNM特征,用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移 | NA | 开发并验证一种用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者淋巴结转移的LNM特征 | 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | NA |
2557 | 2024-08-08 |
Regional and age-related diversity of human mature oligodendrocytes
2022-10, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24230
PMID:35735919
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了人成熟少突胶质细胞(MOLs)在不同脑区和年龄段的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的转录异质性 | 研究仅限于特定脑区和脊髓样本,可能无法全面代表所有脑区的少突胶质细胞异质性 | 探讨人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的异质性 | 人成熟少突胶质细胞(MOLs) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自皮质/皮质下、室下带脑组织样本和胸腰椎脊髓样本的细胞 |
2558 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics identifies enriched gene expression and cell types in human liver fibrosis
2022-09, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.2001
PMID:35726350
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学结合单细胞RNA测序和基因解卷积分析,探索了纤维化肝脏区域中细胞类型的定位。 | 首次使用空间转录组学与单细胞RNA测序相结合的方法,精确地定位了纤维化肝脏中的细胞类型及其基因表达。 | 研究样本量较小,且仅限于特定类型的肝病患者。 | 评估纤维化肝脏区域是否特异性地富集某些细胞类型,并探索这些细胞类型的空间定位。 | 纤维化肝脏组织中的细胞类型及其基因表达。 | 数字病理学 | 肝病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 基因解卷积分析 | 基因表达数据 | 8例终末期肝病患者样本 |
2559 | 2024-08-08 |
Isolation of Leydig cells from adult rat testes by magnetic-activated cell sorting protocol based on prolactin receptor expression
2022-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13211
PMID:35735181
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研究论文 | 本文介绍了一种基于催乳素受体表达的磁激活细胞分选方法,用于从成年大鼠睾丸中大量分离高纯度和活性的莱迪细胞。 | 本文提出了一种新的方法,通过磁激活细胞分选技术,基于催乳素受体表达,成功从成年大鼠睾丸中分离出高产量、高纯度和高活性的莱迪细胞。 | NA | 研究莱迪细胞的分离方法,以提高细胞的产量、纯度和活性,进而用于体外研究细胞的生理学、药理学和毒理学。 | 成年大鼠睾丸中的莱迪细胞。 | NA | NA | 磁激活细胞分选(MACS) | NA | 细胞 | 每个睾丸约10^6个细胞 |
2560 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies Col1a1 and Col1a2 as hub genes in obesity-induced cardiac fibrosis
2022-08-27, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.06.018
PMID:35714568
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,筛选肥胖诱导的心脏纤维化的关键标志物 | 首次通过单细胞转录组学技术识别出Col1a1和Col1a2作为肥胖诱导心脏纤维化的枢纽基因 | 研究仅在肥胖小鼠模型中进行,尚未在人体中验证 | 旨在早期检测和治疗肥胖相关的心脏疾病,以限制其进展 | 肥胖诱导的心脏纤维化及其关键标志物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及15种不同细胞类型,包括纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞,共33个差异表达基因 |