单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2481 - 2500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2481 | 2024-08-08 |
Dynamic immune ecosystem of dengue infection revealed by single-cell sequencing
2022-12, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MA0622-738RR
PMID:35766188
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了登革热感染患者的免疫细胞类型及其动态变化 | 首次揭示了登革热感染过程中免疫生态系统的动态变化，并发现了关键的转录因子和信号通路 | NA | 深入理解登革热感染的发病机制并开发有效的治疗策略 | 登革热感染患者的免疫细胞及其动态变化 | 数字病理学 | 登革热 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13127个细胞，来自10名登革热感染患者 |
| 2482 | 2024-08-08 |
Soluble TREM2 levels reflect the recruitment and expansion of TREM2+ macrophages that localize to fibrotic areas and limit NASH
2022-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.004
PMID:35750138
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的功能作用 | 发现系统性可溶性TREM2水平在NASH中的临床相关性，并揭示了TREM2+巨噬细胞在肝纤维化区域的定位及其对NASH的限制作用 | NA | 功能性地表征骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在NASH中的作用 | TREM2表达的巨噬细胞及其在NASH中的功能 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类临床队列 |
| 2483 | 2024-08-08 |
Complement C1QC as a potential prognostic marker and therapeutic target in colon carcinoma based on single-cell RNA sequencing and immunohistochemical analysis
2022-Oct-23, Bosnian journal of basic medical sciences
IF:3.1Q2
DOI:10.17305/bjbms.2022.7309
PMID:35765947
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组化分析，探讨了C1QC作为结肠癌的潜在预后标志物和治疗靶点 | 首次揭示了C1QC在结肠癌中的关键调控作用，并验证了其作为潜在免疫治疗靶点的可能性 | 研究主要基于数据库数据和分子对接分析，需要进一步的临床试验验证 | 探索结肠癌中免疫细胞浸润及其基因调控，为诊断和治疗提供新视角 | 结肠癌中的免疫细胞浸润及其基因调控 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的单细胞RNA测序表达谱和TCGA结肠癌数据集 |
| 2484 | 2024-08-08 |
Distinct Transcriptional Programs in Ascitic and Solid Cancer Cells Induce Different Responses to Chemotherapy in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2022-10-04, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-21-0565
PMID:35749080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者在不同疾病阶段的细胞，揭示了腹水和实体癌细胞在转录组水平上的显著差异及其对化疗的不同反应 | 发现了新的癌症相关成纤维细胞亚型，该亚型在化疗后显著富集，并提出了基于肿瘤异质性的新型治疗策略 | NA | 探究高级别浆液性卵巢癌治疗抵抗的机制，并寻找新的治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌患者的腹水和实体癌细胞及其对化疗的反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过十万细胞 |
| 2485 | 2024-08-08 |
Immune mechanisms linking metabolic injury to inflammation and fibrosis in fatty liver disease - novel insights into cellular communication circuits
2022-10, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.012
PMID:35750137
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中免疫机制与代谢损伤、炎症和纤维化的关联，并探讨了细胞通信电路的新见解。 | 近年来，单细胞RNA测序和高维多组学（蛋白质组学、脂质组学）以及空间转录组学的应用，极大地推进了对健康和疾病中肝脏免疫细胞亚群复杂异质性的理解。 | NA | 旨在强调NAFLD中与炎症相关的最新发现，讨论免疫细胞亚群在疾病不同阶段（包括疾病消退期）的作用，并整合驱动炎症的多系统。 | NAFLD中的免疫机制和细胞通信电路。 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序、高维多组学（蛋白质组学、脂质组学）、空间转录组学 | NA | RNA | NA |
| 2486 | 2024-08-08 |
A Survey of the Metabolic Landscape of the Developing Cerebellum at Single-Cell Resolution
2022-Oct, Cerebellum (London, England)
DOI:10.1007/s12311-022-01415-2
PMID:35767214
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综述 | 本文探讨并比较了从发育中的人类小脑及其体外合成对应物（干细胞衍生的cerebellar organoids）获得的单细胞RNA测序数据，重点关注关键代谢途径基因的表达 | 利用单细胞RNA测序技术，可视化组织中亚群的关键转录特征，并比较了体外模型与原生组织的代谢状态 | 体外模型与原生组织之间存在差异，这些差异可能影响对分化后代谢状态的理解 | 理解体外小脑模型的状态，这对于模拟各种细胞类型对小脑疾病的易感性至关重要 | 发育中的人类小脑及其体外合成对应物（干细胞衍生的cerebellar organoids） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2487 | 2024-08-08 |
Processing human skin samples for single-cell assays
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101470
PMID:35769924
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研究论文 | 本文描述了一种优化的协议，用于从6毫米皮肤穿刺活检中快速分离出可存活的细胞，并结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）来研究皮肤常驻和外周循环记忆及效应T细胞的转录组和克隆型 | 该协议基于Saluzzo等人（2021）的改进，提供了更快速的皮肤细胞分离方法 | NA | 研究皮肤常驻免疫细胞在感染、炎症和癌症中的作用 | 人类皮肤样本中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | 细胞 | 6毫米皮肤穿刺活检样本 |
| 2488 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Heterogeneity of Cell Communications between Schwann Cells and Fibroblasts within Vestibular Schwannoma Microenvironment
2022-09, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2022.06.006
PMID:35750260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了前庭神经鞘瘤中的细胞组成和细胞间通信的异质性 | 首次揭示了前庭神经鞘瘤微环境中施万细胞和成纤维细胞之间通过整合素和生长因子信号的紧密细胞间通信 | NA | 探讨前庭神经鞘瘤肿瘤进展的细胞成分和机制 | 前庭神经鞘瘤样本中的施万细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床手术分离的前庭神经鞘瘤样本 |
| 2489 | 2024-08-08 |
A single-cell survey unveils cellular heterogeneity and sensitive responses in mouse cortices induced by oral exposure to triphenyl phosphate
2022-09, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-022-03301-6
PMID:35752650
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了三苯基磷酸酯（TPhP）对小鼠皮质细胞异质性和敏感反应的影响 | 首次揭示了TPhP暴露下神经发育毒性的特异性细胞过程，并发现神经发生障碍、血管屏障破坏和伴随的神经炎症是其敏感反应 | NA | 研究TPhP暴露对小鼠皮质细胞的影响及其机制 | 小鼠皮质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 共检测了17,229个细胞和26,338个基因 |
| 2490 | 2024-08-08 |
Regulatory Programs of B-cell Activation and Germinal Center Reaction Allow B-ALL Escape from CD19 CAR T-cell Therapy
2022-09-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0626
PMID:35759797
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研究论文 | 本文研究了B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）细胞如何通过减少CD19表达来逃避CD19 CAR T细胞疗法 | 首次揭示了B-ALL细胞通过转录重编程和生理性B细胞激活及生发中心反应维持低水平CD19表达的机制 | NA | 探讨B-ALL细胞逃避CD19 CAR T细胞疗法的机制 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞及CD19 CAR T细胞 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | RNA | NA |
| 2491 | 2024-08-08 |
Machine-learning-optimized Cas12a barcoding enables the recovery of single-cell lineages and transcriptional profiles
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.001
PMID:35752172
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISY的高容量Cas12a条形码系统，结合高通量筛选和机器学习优化条形码序列，用于恢复单细胞谱系和转录组信息 | DAISY条形码系统具有高容量和可靠性，能够在小尺寸下实现高效条形码生成，并成功应用于单细胞RNA测序 | NA | 开发一种高效的CRISPR-based条形码方法，以理解细胞谱系和转录组信息 | 人类黑色素瘤细胞的单细胞谱系和基因表达谱 | 机器学习 | NA | CRISPR-based条形码技术 | 机器学习模型 | 文本 | 约47,000个人类黑色素瘤细胞 |
| 2492 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling reveals roles of intercellular Fgf9 signaling in astrocyte maturation and synaptic refinement during brainstem development
2022-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102176
PMID:35753346
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了脑干中斜方体内侧核（MNTB）细胞类型的转录组特征，并探讨了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在星形胶质细胞成熟和突触细化中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了MNTB中主要细胞类型的转录组特征，并阐明了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路的功能 | NA | 研究神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在脑干发育中的作用 | 脑干中斜方体内侧核（MNTB）的细胞类型及其转录组特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2493 | 2024-08-08 |
The role of specialized cell cycles during erythroid lineage development: insights from single-cell RNA sequencing
2022-Aug, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-022-03406-9
PMID:35759181
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综述 | 本文综述了通过流式细胞术和单细胞RNA测序研究，对红细胞系发育中CFU-e到红细胞终末分化（ETD）过渡的调控机制的新见解 | 发现CFU-e/ETD过渡是一个快速依赖于S期的转录开关，且与细胞周期和S期重塑事件直接相关 | NA | 探讨红细胞系发育中细胞周期在CFU-e到ETD过渡中的调控作用 | 红细胞系发育中的CFU-e细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2494 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: expansion, integration and translation
2022-07-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac011
PMID:35753690
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术的发展及其在多组学研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术已扩展到基因组学、蛋白质组学和代谢组学等领域，并与其他技术如空间数据和CRISPR筛选技术集成，以增强对复杂细胞行为的理解 | NA | 旨在全面理解复杂的细胞行为，并通过集成多组学数据和其他技术层信息来获得新的知识或功能 | 单细胞测序技术及其在多组学研究中的应用 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 2495 | 2024-08-08 |
Identification of Pathogenic Immune Cell Subsets Associated With Checkpoint Inhibitor-Induced Myocarditis
2022-07-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过时间飞行质谱技术和多组学单细胞技术，识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 发现了一种在免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者中显著增加的克隆性细胞毒性Temra CD8+细胞，并揭示了其独特的转录变化 | NA | 识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者的外周血单个核细胞和Pdcd1-/-小鼠 | 免疫学 | 心肌炎 | 时间飞行质谱技术，单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序，细胞转录组和表位索引测序 | NA | 细胞 | 52名个体（29名患者和23名健康对照），30名患者/对照，Pdcd1-/-小鼠 |
| 2496 | 2024-08-08 |
Mapping developmental paths of monkey primordial germ-like cells differentiation from pluripotent stem cells by single cell ribonucleic acid sequencing analysis†
2022-07-25, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac133
PMID:35766401
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了猕猴多能干细胞向原始生殖样细胞的分化路径 | 首次在猕猴中利用胚胎体分化系统诱导原始生殖样细胞的形成，并揭示了关键生长因子在分化过程中的作用 | 研究仅限于猕猴，尚未扩展到其他非人类灵长类动物 | 探讨多能干细胞向原始生殖样细胞分化的细胞和分子机制 | 猕猴的多能干细胞及其分化形成的原始生殖样细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约40,000个多能干细胞及胚胎体内的细胞 |
| 2497 | 2024-08-08 |
Cell-cell communication inference and analysis in the tumour microenvironments from single-cell transcriptomics: data resources and computational strategies
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac234
PMID:35753695
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研究论文 | 本文介绍了从单细胞转录组数据中推断和分析肿瘤微环境中细胞间通讯的流程，并列举了相关的数据库和可视化工具 | 本文提出了七种经典的细胞间通讯评分策略，并强调了四种代表性的细胞间通讯推断方法，包括基于网络的方法、基于机器学习的方法、基于空间信息的方法和其他方法 | 本文分析了上述四种细胞间通讯方法的优势和局限性，并指出了在肿瘤微环境中进行细胞间通讯分析时面临的主要挑战 | 旨在改进癌症治疗，通过量化肿瘤微环境中不同细胞类型之间的交叉对话 | 肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2498 | 2024-08-08 |
A comprehensive comparison on cell-type composition inference for spatial transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac245
PMID:35753702
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研究论文 | 本文综述了空间转录组学数据中细胞类型组成推断的先进方法，并比较了它们的优缺点 | 构建了来自单细胞水平的空间转录组数据点，评估了10种方法的性能，并比较了它们在不同组织和技术平台上的表现 | 空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 | 评估和比较空间转录组学数据中细胞类型组成推断方法的性能 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 10种方法在不同组织和技术平台上的表现被评估 |
| 2499 | 2024-08-08 |
Fast and accurate matching of cellular barcodes across short-reads and long-reads of single-cell RNA-seq experiments
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104530
PMID:35747387
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scTagger的计算方法，用于匹配单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | scTagger在准确性和时间效率上显著优于现有先进工具 | NA | 克服利用长读和短读技术进行单细胞测序时匹配细胞条码的挑战 | 单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 使用了真实和模拟数据集进行测试 |
| 2500 | 2024-08-08 |
ICOS-Deficient Regulatory T Cells Can Prevent Spontaneous Autoimmunity but Are Impaired in Controlling Acute Inflammation
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100897
PMID:35760518
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研究论文 | 研究探讨了ICOS缺陷的调节性T细胞在预防自发性自身免疫和控制急性炎症中的作用 | 通过条件性敲除系统，选择性地在表达Foxp3的细胞中消除ICOS表达，揭示了ICOS在调节性T细胞中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究ICOS在调节性T细胞中的功能及其在自身免疫和炎症控制中的作用 | ICOS缺陷的调节性T细胞及其在自身免疫和炎症中的作用 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 条件性敲除技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用ICOS FC小鼠和Foxp3-Cre控制小鼠进行比较研究 |