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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2461 | 2024-08-08 |
Natural high-avidity T-cell receptor efficiently mediates regression of cancer/testis antigen 83 positive common solid cancers
2022-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004713
PMID:35798537
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研究论文 | 本文研究了从年轻健康捐赠者中分离出的高亲和力T细胞受体(TCR)对CT83阳性常见实体癌的疗效 | 本文首次从年轻健康捐赠者中分离出针对常见实体癌中频繁表达的CTA的高亲和力TCR,并展示了其在体外和体内的抗肿瘤活性 | NA | 研究高亲和力TCR对CT83阳性常见实体癌的疗效 | CT83蛋白和其特异性TCR | 免疫学 | 实体癌 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质 | 来自年轻健康捐赠者的T细胞 |
2462 | 2024-08-08 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了2,3,7,8-四氯二苯并-对二恶英(TCDD)对斑马鱼精子发生的影响 | 利用单细胞RNA测序技术详细分析了TCDD暴露后斑马鱼睾丸中不同细胞类型的基因表达变化 | NA | 探讨TCDD暴露对斑马鱼精子发生的影响及其分子机制 | 斑马鱼精子发生过程中的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年斑马鱼睾丸中的多种细胞类型 |
2463 | 2024-08-08 |
Integration and Reanalysis of Four RNA-Seq Datasets Including BALF, Nasopharyngeal Swabs, Lung Biopsy, and Mouse Models Reveals Common Immune Features of COVID-19
2022-Jun, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2022.22.e22
PMID:35799708
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研究论文 | 本研究重新分析了四个COVID-19的RNA测序数据集,包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠,揭示了COVID-19的共同免疫特征。 | 使用统一的标准化方法重新分析多个RNA测序数据集,揭示了COVID-19的共同免疫特征,与单细胞RNA测序研究结果一致。 | NA | 理解COVID-19的发病机制,并开发更好的治疗策略。 | COVID-19患者的免疫反应。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠的四个数据集 |
2464 | 2024-08-08 |
Human obstructive (postvasectomy) and nonobstructive azoospermia - Insights from scRNA-Seq and transcriptome analysis
2022-May, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2020.09.004
PMID:35782978
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸活检样本,探索其分子基础和转录调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了阻塞性和非阻塞性无精症患者的转录组变化,特别是在Sertoli细胞和生殖细胞的相互作用方面的发现 | 研究样本量较小,仅包括两名患者,可能影响结果的普遍性 | 揭示无精症的分子病因和转录调控机制 | 阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名患者 |
2465 | 2024-08-08 |
ASCL2 Affects the Efficacy of Immunotherapy in Colon Adenocarcinoma Based on Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.829640
PMID:35774798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了ASCL2在结肠腺癌中对免疫治疗效果的影响及其潜在机制 | 首次揭示了ASCL2与癌症干细胞的正相关性,并通过负调控DUSP4间接影响肿瘤免疫细胞浸润,进而影响免疫治疗效果 | 研究主要集中在ASCL2与DUSP4的关系及其对免疫治疗的影响,未涉及其他可能的调控机制 | 探讨ASCL2在结肠腺癌中的生物学功能及其对免疫治疗效果的影响 | 结肠腺癌中的ASCL2表达及其与癌症干细胞和肿瘤免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | RNA | NA |
2466 | 2024-08-08 |
Direct FACS Isolation of Neural Stem/Progenitor Lineages from the Adult Brain
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2409-8_8
PMID:35776349
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研究论文 | 本文提供了一种简化的协议,用于直接从鼠脑中收获和分离神经干细胞谱系,以便为单细胞RNA测序提供输入材料 | 该方法能够在神经干细胞谱系的 niche 环境中阐明真实的转录特征和激活的通路 | 主要挑战是成年神经干细胞数量有限,以及体外培养和扩增对其特性的显著改变 | 理解调节神经干细胞/祖细胞在脑内功能的机制,为维持或增强神经功能的发展再生策略提供关键步骤 | 成年脑中的神经干细胞和祖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠脑样本 |
2467 | 2024-08-08 |
Hydrogels for Single-Cell Microgel Production: Recent Advances and Applications
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.891461
PMID:35782502
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综述 | 本文综述了水凝胶在单细胞微凝胶生产中的最新进展和应用 | 介绍了水凝胶在微流控液滴生产中的应用,提供了新颖且更稳健的分析和筛选应用 | NA | 探讨水凝胶在单细胞微凝胶生产中的应用及其在细胞生物学研究中的潜力 | 单细胞技术及其在细胞生物学研究中的应用 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA |
2468 | 2024-08-08 |
MarkerCount: A stable, count-based cell type identifier for single-cell RNA-seq experiments
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.010
PMID:35782735
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MarkerCount的细胞类型识别工具,该工具基于单细胞RNA测序实验中表达标记的数量进行细胞类型识别 | MarkerCount不仅能够识别已知细胞群体,还能识别可能代表已知细胞类型未知亚群或未知表型肿瘤细胞的未知集群 | NA | 开发一种稳定的细胞类型识别工具,用于单细胞RNA测序实验的下游分析 | 单细胞RNA测序实验中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开可用的数据集和标记数据库进行评估 |
2469 | 2024-08-08 |
Bridging Glycomics and Genomics: New Uses of Functional Genetics in the Study of Cellular Glycosylation
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.934584
PMID:35782863
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综述 | 本文综述了功能基因组学技术在细胞糖基化研究中的应用 | 介绍了ChIP-seq、RNA-seq、CRISPR基因组筛选和scRNA-seq等新技术在糖基化状态基因组基础研究中的应用 | NA | 深入理解糖基化调控机制及其在疾病中的变化 | 细胞表面的糖蛋白和糖脂抗原 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, RNA-seq, CRISPR, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
2470 | 2024-08-08 |
Holliday Cross-Recognition Protein HJURP: Association With the Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma and With Patient Prognosis
2022, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2022.1610506
PMID:35783358
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研究论文 | 本文探讨了Holliday交叉识别蛋白HJURP与肝细胞癌肿瘤微环境及患者预后的关系 | 使用单细胞RNA测序和IOBR软件包分析HJURP在肿瘤微环境中的潜在作用,并建立了基于HJURP表达的预后预测模型 | NA | 研究HJURP与肝细胞癌肿瘤微环境的关系及对患者预后的影响 | HJURP蛋白及其在肝细胞癌中的表达与作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及正常肝脏组织和肝细胞癌组织的单细胞RNA测序数据 |
2471 | 2024-08-08 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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研究论文 | 本文报道了一例通过恢复期血浆输注实现严重COVID-19完全缓解的病例,并通过纵向无偏蛋白组学和单细胞转录组学分析,揭示了从严重疾病到无病状态转变的关键生物学过程。 | 首次通过纵向无偏蛋白组学和单细胞转录组学分析,揭示了COVID-19恢复过程中的关键生物学动态变化。 | 仅基于单一病例的研究,可能缺乏更广泛的适用性和代表性。 | 探讨COVID-19恢复过程中的生物标志物和关键生物学动态。 | 严重COVID-19患者的恢复过程及其生物学机制。 | NA | COVID-19 | 蛋白组学分析、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质、RNA | 单一病例 |
2472 | 2024-08-08 |
Dynamic Changes in Uterine NK Cell Subset Frequency and Function Over the Menstrual Cycle and Pregnancy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.880438
PMID:35784314
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研究论文 | 本文通过整合先前发表的单细胞RNA测序数据和新的流式细胞术数据,研究了子宫自然杀伤细胞(uNK)在月经周期和妊娠不同阶段的频率、表型和功能变化 | 首次揭示了uNK细胞在健康生殖周期中频率和功能的动态变化,为研究不孕、反复流产、先兆子痫和早产等问题提供了平台 | NA | 探讨uNK细胞在月经周期和妊娠中的动态变化及其对妊娠成功的影响 | 子宫自然杀伤细胞(uNK)及其在不同生殖周期阶段的频率和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 七个生殖周期阶段的数据 |
2473 | 2024-08-08 |
Identification of Genes Related to 5-Fluorouracil Based Chemotherapy for Colorectal Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.887048
PMID:35784334
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研究论文 | 本研究旨在识别与结直肠癌5-氟尿嘧啶(5-FU)化疗相关的基因,以预测化疗反应和改善患者预后 | 本研究首次识别出与5-FU化疗抵抗相关的免疫相关基因,并开发了预测模型 | 研究依赖于公共数据库的数据,可能存在样本选择偏倚 | 识别新的生物标志物以预测结直肠癌患者对5-FU化疗的反应 | 结直肠癌样本及5-FU化疗抵抗相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | CRC样本来自GEO和TCGA数据库,具体数量未详述 |
2474 | 2024-08-08 |
Subsets of Tissue CD4 T Cells Display Different Susceptibilities to HIV Infection and Death: Analysis by CyTOF and Single Cell RNA-seq
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883420
PMID:35784348
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research paper | 本研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了人类扁桃体淋巴细胞中不同CD4 T细胞亚群对HIV感染和死亡的敏感性差异 | 研究发现,被HIV优先杀死的CD4 T细胞亚群在表型上与对HIV相关细胞死亡有抵抗力的亚群不同,且这种差异不完全由其对生产性感染的敏感性解释 | NA | 旨在定义不同CD4 T淋巴细胞亚群对HIV相关杀伤的敏感性或抵抗力 | 人类扁桃体中的淋巴细胞 | NA | HIV感染 | 质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
2475 | 2024-08-08 |
Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.856762
PMID:35784351
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研究论文 | 研究了长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化中的调控作用 | 首次详细描述了MIAT在早期人类Th17细胞分化中的作用及其对关键Th17基因表达的调控机制 | NA | 探究长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化中的功能 | 长链非编码RNA MIAT及其在Th17细胞分化中的作用 | NA | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自类风湿性关节炎患者滑膜的T细胞 |
2476 | 2024-08-08 |
Comprehensive Evaluation of the m6A Regulator Prognostic Risk Score in the Prediction of Immunotherapy Response in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.818120
PMID:35784363
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研究论文 | 本研究通过综合分析m6A修饰,构建了一个m6A调控因子预后风险评分(MRPRS),用于预测透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的生存和免疫治疗反应 | 本研究构建的MRPRS与免疫治疗反应呈正相关,并能区分高风险和低风险组的临床病理特征和免疫浸润特征 | NA | 旨在开发一种新的生物标志物,用于预测ccRCC患者的临床结果和治疗反应 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的m6A修饰和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | TCGA-ccRC队列及13个外部验证队列的数据 |
2477 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Characterization of Human Post-implantation Embryos Cultured In Vitro Delineates Morphogenesis in Primary Syncytialization
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.835445
PMID:35784461
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了体外培养的人类植入后胚胎,建立了分层模型,并详细描述了滋养层细胞的形态发生和功能。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类植入后胚胎中滋养层细胞的形态发生和功能,为理解早期妊娠中的病理过程提供了宝贵的资源。 | NA | 研究人类植入后胚胎中滋养层细胞的形态发生和功能,以及其在早期妊娠病理中的作用。 | 人类植入后胚胎的滋养层细胞。 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 分层模型 | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
2478 | 2024-08-08 |
Research Progress of Cell Lineage Tracing and Single-Cell Sequencing Technology in Malignant Skin Tumors
2022, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2022.934828
PMID:35784923
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综述 | 本文综述了细胞谱系追踪和单细胞测序技术在恶性皮肤肿瘤研究中的进展 | 提供了深入理解肿瘤起源、肿瘤细胞异质性和肿瘤耐药机制的新方法 | NA | 总结细胞谱系追踪和单细胞测序技术在恶性黑色素瘤和皮肤鳞状细胞癌研究中的进展,激发皮肤肿瘤进一步研究的新思路 | 恶性黑色素瘤和皮肤鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
2479 | 2024-08-08 |
Integrated Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Gastric Cancer Identifies FABP1 as a Novel Prognostic Biomarker
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/4761403
PMID:35799608
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌样本,发现并验证了脂肪酸结合蛋白1(FABP1)作为胃癌的新型预后生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出FABP1作为胃癌进展的关键调控基因,并验证了其在胃癌预后评估中的作用 | 研究仅基于TCGA数据库和有限的组织微阵列样本进行验证,需要更多临床样本进一步验证FABP1的预后价值 | 开发具有高敏感性和特异性的新型生物标志物,以准确评估胃癌患者的预后 | 胃癌样本中的单细胞RNA测序数据和FABP1的表达水平 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3385个差异表达基因,胃癌组织微阵列样本 |
2480 | 2024-08-08 |
Gpx3 and Egr1 Are Involved in Regulating the Differentiation Fate of Cardiac Fibroblasts under Pressure Overload
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/3235250
PMID:35799890
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析心脏压力超载模型中成纤维细胞的分化命运和基因表达动态变化 | 首次揭示了Gpx3和Egr1在心脏压力超载条件下调控成纤维细胞分化命运中的作用 | 研究基于小鼠模型和公共数据集,未来需在人类样本中验证 | 阐明心脏压力超载下成纤维细胞的分化命运及其分子调控机制 | 心脏成纤维细胞及其在压力超载条件下的分化命运 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO数据库的GSE155882数据集,涉及小鼠横膈膜主动脉缩窄模型 |