单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2421 - 2440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2421 | 2024-08-08 |
Comparison of human skin- and nerve-derived Schwann cells reveals many similarities and subtle genomic and functional differences
2022-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24242
PMID:35796321
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研究论文 | 比较人皮肤来源和神经来源的施万细胞，揭示了许多相似之处和细微的基因组及功能差异 | 使用单细胞RNA测序和一系列体外及体内实验，探索了皮肤来源和神经来源施万细胞的功能差异 | 文章未提及具体的局限性 | 提高从小块皮肤样本中获取施万细胞的可靠性和特异性，并探索皮肤来源和神经来源施万细胞的功能差异 | 皮肤来源的施万细胞和神经来源的施万细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2422 | 2024-08-08 |
A probabilistic gene expression barcode for annotation of cell types from single-cell RNA-seq data
2022-10-14, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac021
PMID:35770795
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研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型注释的概率基因表达条形码方法 | 提出了一种统计方法，该方法利用公共数据集结合数千个基因信息，使用潜在变量模型定义细胞类型特异性条形码并考虑批次效应，从而概率性地注释细胞类型身份 | 当前方法依赖已知标记基因或因研究间系统差异（批次效应）导致的过拟合问题 | 开发一种数据驱动的细胞类型注释方法，以克服大规模细胞注释的实验技术限制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在变量模型 | 基因表达数据 | 涉及数千个基因和多个数据集 |
| 2423 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of T helper cell differentiation and heterogeneity
2022-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2022.119321
PMID:35779629
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法分析了人类外周血中分离的T辅助细胞在体外细胞因子介导分化下的表型多样性 | 本文采用了结合Seurat、Nebulosa、GGplot等多种生物信息学工具的综合分析方法，揭示了T辅助细胞表型的高表达相似性和特定标记基因的表达 | 单细胞分析的通用流程通常不足以适用于所有细胞类型 | 分析T辅助细胞的多样性和分化 | 人类外周血中的T辅助细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类外周血中的T细胞 |
| 2424 | 2024-08-08 |
Isolation of macrophages from mouse skin wounds for single-cell RNA sequencing
2022-Sep-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101488
PMID:35779263
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2425 | 2024-08-08 |
Physioxia-induced downregulation of Tet2 in hematopoietic stem cells contributes to enhanced self-renewal
2022-09-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015499
PMID:35772013
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研究论文 | 研究探讨了生理性缺氧条件下，造血干细胞（HSCs）中Tet2下调对自我更新能力的影响及其分子机制 | 首次定义了Tet2在生理性缺氧条件下调控HSCs的分子程序 | NA | 探究生理性缺氧对HSCs自我更新和分化的影响及其分子机制 | 造血干细胞（HSCs）和造血祖细胞（HPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2426 | 2024-08-08 |
P2Y12 inhibitor clopidogrel inhibits renal fibrosis by blocking macrophage-to-myofibroblast transition
2022-09-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.06.019
PMID:35791881
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研究论文 | 研究P2Y12抑制剂氯吡格雷通过阻断巨噬细胞向肌成纤维细胞转化抑制肾脏纤维化的机制 | 首次揭示了P2Y12在慢性肾脏病中通过促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转化介导肾脏纤维化的机制 | 研究主要在动物模型和小规模患者样本中进行，需要进一步在更大规模的人体研究中验证 | 探究P2Y12抑制剂氯吡格雷在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 慢性肾脏病患者及单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠模型 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小规模患者样本及UUO小鼠模型 |
| 2427 | 2024-08-08 |
Heterogeneous Development of β-Cell Populations in Diabetes-Resistant and -Susceptible Mice
2022-09-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-1030
PMID:35771990
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研究论文 | 研究了两种肥胖小鼠品系在糖尿病易感性不同的情况下，β细胞群的异质性发展 | 通过胰岛单细胞RNA测序，揭示了糖尿病抵抗和易感小鼠β细胞群在糖尿病饮食诱导下的不同发展模式 | 研究仅限于两种小鼠品系，且仅在特定饮食条件下进行 | 探讨β细胞在2型糖尿病中的损失机制 | 肥胖小鼠的胰岛β细胞 | NA | 2型糖尿病 | 胰岛单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 两种肥胖小鼠品系 |
| 2428 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals the natural product Shi-Bi-Man promotes hair regeneration by activating the FGF pathway in dermal papilla cells
2022-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2022.154260
PMID:35777117
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研究论文 | 本研究探讨了中药补充剂Shi-Bi-Man（SBM）通过激活成纤维细胞生长因子（FGF）信号通路促进毛发生长的机制 | 首次通过单细胞转录组测序揭示SBM通过激活FGF信号通路促进毛发生长的机制 | NA | 寻找SBM中潜在的有效单体成分以促进毛发生长，并探索SBM促进毛发生长的机制 | SBM中的主要成分及其对毛发生长的影响 | NA | NA | UPLC/MS, UPLC/LTQ-Orbitrap-MS, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠 |
| 2429 | 2024-08-08 |
A deep matrix factorization based approach for single-cell RNA-seq data clustering
2022-09, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2022.06.010
PMID:35777719
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research paper | 本文介绍了一种基于深度矩阵分解的单细胞RNA测序数据聚类方法DeepCI | DeepCI使用两个自编码器来获取细胞嵌入和基因嵌入，能够同时学习细胞的低维表示和聚类，并通过细胞和基因嵌入的矩阵乘法恢复基因表达矩阵 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | autoencoder | 基因表达数据 | 多个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 2430 | 2024-08-08 |
New insights from the single-cell level: Tumor associated macrophages heterogeneity and personalized therapy
2022-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113343
PMID:35785706
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综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性及其在个性化治疗中的应用 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示TAMs的RNA表达谱，为TAMs相关研究提供更高效的检测方法和更准确的信息 | NA | 探讨肿瘤进展和药物干预的机制，为针对巨噬细胞的个性化治疗策略提供新视角 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | NA |
| 2431 | 2024-08-08 |
The role of single-cell genomics in human genetics
2022-09, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2022-108588
PMID:35790352
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类遗传学中的应用及其在疾病检测、诊断和治疗中的潜力 | 单细胞测序技术能够以细胞分辨率检测遗传变异及其表型后果，保留细胞异质性，允许检测正常组织中的小病变亚群细胞 | 目前单细胞测序技术主要用于基础研究，临床应用仍面临实验和分析流程的挑战 | 旨在帮助临床医生理解和解释单细胞测序数据和分析，并探讨其在人类遗传学中的前沿应用 | 单细胞测序技术在人类遗传学中的应用，特别是非编码基因组的注释和单细胞测序数据在虚拟变异优先级中的应用 | 基因组学 | 遗传性疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2432 | 2024-08-08 |
Maternal exome analysis for the diagnosis of oocyte maturation defects and early embryonic developmental arrest
2022-09, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2022.05.009
PMID:35798635
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研究论文 | 本文通过全外显子测序分析，开发了一种方法来选择和分析因卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞而导致不孕的女性 | 本文开发了一种统计方法来识别不孕的内表型，并通过全外显子测序和生物信息学分析，识别了与卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞相关的新基因 | 本文的研究样本量较小，且仅限于特定医院的数据，可能影响结果的普遍性 | 开发一种方法来诊断因卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞导致的不孕症 | 因卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞导致不孕的女性 | NA | 不孕症 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 28名不孕女性 |
| 2433 | 2024-08-08 |
Characterization of Aldosterone-producing Cell Cluster (APCC) at Single-cell Resolution
2022-08-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgac394
PMID:35796577
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞分辨率分析醛固酮产生细胞簇（APCC）的转录组，并推断其发育轨迹 | 首次在单细胞分辨率下揭示了APCC的基因表达特征，并展示了部分ZG细胞重塑为APCC的过程 | NA | 分析APCC的转录组特征并推断其发育轨迹 | 成人肾上腺中的醛固酮产生细胞簇（APCC） | NA | 原发性醛固酮增多症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 2个成人肾上腺中的2928个肾上腺细胞 |
| 2434 | 2024-08-08 |
ResPAN: a powerful batch correction model for scRNA-seq data through residual adversarial networks
2022-08-10, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac427
PMID:35771600
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研究论文 | 本文提出了一种名为ResPAN的轻量级深度学习框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的整合，通过残差对抗网络减少批次效应 | ResPAN结合了Wasserstein生成对抗网络（WGAN）、随机游走互最近邻配对和完全跳跃连接的自编码器，以减少批次间的差异 | NA | 解决多个scRNA-seq数据集整合分析中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 残差对抗网络（WGAN） | 基因组数据 | 超过五十万细胞的数据集 |
| 2435 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals a senescence-associated IL-6/CCR6 axis driving radiodermatitis
2022-08-08, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202115653
PMID:35785521
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序分析受照射的皮肤细胞与基因敲除和分子抑制研究，揭示了衰老相关IL-6和IL-1信号以及IL-17上调和CCR6介导的免疫细胞迁移是放射性皮炎的关键驱动因素 | 首次揭示了衰老相关IL-6/CCR6轴在放射性皮炎中的作用，并证明了靶向治疗策略的有效性 | NA | 探究放射治疗引起的脱发和皮炎的分子和细胞基础 | 放射治疗引起的脱发和皮炎 | 数字病理学 | 放射性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及受照射的皮肤细胞、IL-6或IL-1R小鼠、CCR6小鼠等样本 |
| 2436 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of the Circle of Willis in a Mouse Cerebral Aneurysm Model
2022-08, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.122.038776
PMID:35770669
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研究论文 | 本文首次对健康和动脉瘤小鼠Willis环的血管细胞进行了单细胞RNA测序分析，揭示了细胞谱系异质性和转录组特征的变化 | 首次全面分析了健康和动脉瘤小鼠Willis环血管细胞的谱系异质性和转录组变化 | NA | 研究Willis环在健康和动脉瘤状态下的细胞异质性和转录组特征 | 小鼠Willis环的血管细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过3900个Willis环细胞样本 |
| 2437 | 2024-08-08 |
Zedoarondiol inhibits atherosclerosis by regulating monocyte migration and adhesion via CXCL12/CXCR4 pathway
2022-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106328
PMID:35772647
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研究论文 | 本研究探讨了zedoarondiol通过调节CXCL12/CXCR4通路抑制单核细胞迁移和粘附，从而减轻动脉粥样硬化的效果 | 首次揭示了zedoarondiol通过调节CXCL12/CXCR4通路抑制单核细胞迁移和粘附，从而减轻动脉粥样硬化的机制 | NA | 探究zedoarondiol在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | zedoarondiol对动脉粥样硬化斑块的影响及对单核细胞迁移和粘附的调节作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序分析（scRNA-seq） | NA | NA | apoE基因敲除小鼠 |
| 2438 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the antifibrotic effects of YAP/TAZ in systemic sclerosis
2022-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2022.106257
PMID:35772663
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研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术探讨了YAP/TAZ在系统性硬化症中的抗纤维化作用及其机制 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了YAP/TAZ信号通路在系统性硬化症患者纤维细胞中的表达差异，并验证了YAP/TAZ敲低对系统性硬化症小鼠模型的抗纤维化效果 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人体中验证YAP/TAZ的治疗潜力 | 探究YAP/TAZ在系统性硬化症中的作用机制及其作为治疗靶点的可能性 | 系统性硬化症患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括系统性硬化症患者和健康志愿者的样本，以及系统性硬化症小鼠模型 |
| 2439 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals CD133+CD44--originating evolution and novel stemness related variants in human colorectal cancer
2022-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104125
PMID:35785618
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研究论文 | 本文通过单细胞全外显子测序和批量细胞目标外显子测序，研究了人类结直肠癌起始细胞中的干细胞特异性体细胞变异或克隆进化 | 揭示了CD133+CD44-结直肠癌起始细胞可能是结直肠癌的原始来源，并发现了与干细胞特性相关的新变异基因 | NA | 高分辨率检测结直肠癌起始细胞的异质性 | 结直肠癌起始细胞、结直肠癌细胞和对照细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞全外显子测序（scWES）、目标外显子测序（TES） | NA | 基因组数据 | 从一名结直肠癌患者的组织中分离出单细胞，并对96个样本（20名患者）进行了验证 |
| 2440 | 2024-08-08 |
Shared Differential Expression-Based Distance Reflects Global Cell Type Relationships in Single-Cell RNA Sequencing Data
2022-08, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0652
PMID:35793527
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研究论文 | 本文修改了一种生物学驱动的距离度量SIDEseq，用于大规模单细胞RNA测序（scRNA seq）数据中细胞类型的聚合比较，并展示了该修改后的距离度量SIDEREF在模拟和真实数据中能更一致地保留细胞类型的全局关系 | 提出了修改后的距离度量SIDEREF，该度量在保留单细胞RNA测序数据的全局细胞类型关系方面优于常用的距离度量 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的距离度量，以更好地反映细胞类型的全局关系 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及12种组织的单细胞RNA测序数据集 |