单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2024-08-08 |
Ets21C sustains a pro-regenerative transcriptional program in blastema cells of Drosophila imaginal discs
2022-08-08, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.06.040
PMID:35820420
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研究论文 | 研究探讨了果蝇成虫盘细胞在损伤后通过局部增殖再生缺失部分的过程中，Ets21C转录因子如何维持再生特异性的转录程序 | 发现Ets21C转录因子在再生过程中调控特定基因表达网络，且这种机制可能被肿瘤利用以促进异常生长 | NA | 探究再生过程中基因调控网络的再激活与再生特异性转录程序的激活程度 | 果蝇成虫盘细胞及其再生过程中的基因表达 | 再生生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及再生翅盘中的两种特定细胞群Blastema1和Blastema2 |
| 2382 | 2024-08-08 |
Cell plasticity in regeneration in the stomach and beyond
2022-08, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2022.101948
PMID:35809361
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research paper | 本文探讨了胃及其他器官在稳态和损伤后利用细胞可塑性程序招募祖细胞进行组织再生的机制 | 揭示了细胞可塑性在组织再生中的普遍性和重要性，以及其在病理过程中的潜在作用 | NA | 研究正常干细胞分化与可塑性在稳态和损伤后的相互作用，以及再生程序的共同特征 | 胃上皮细胞及其他器官的细胞可塑性和再生机制 | NA | NA | 细胞系追踪技术、类器官培养、单细胞RNA测序分析 | NA | NA | NA |
| 2383 | 2024-08-08 |
Heterogeneity analysis of astrocytes following spinal cord injury at single-cell resolution
2022-08, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200463R
PMID:35816276
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠脊髓损伤后不同时间点的星形胶质细胞转录组特征 | 揭示了六种转录上不同的星形胶质细胞状态，并分析了这些亚型在脊髓损伤后的动态演变过程 | NA | 旨在阐明星形胶质细胞在脊髓损伤后的异质性及其动态变化 | 星形胶质细胞在脊髓损伤后的亚型及其转录组特征 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后不同时间点的组织样本 |
| 2384 | 2024-08-08 |
Propensity score matching enables batch-effect-corrected imputation in single-cell RNA-seq analysis
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac275
PMID:35821114
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研究论文 | 本文提出了一种新的倾向评分匹配方法（scPSM），用于单细胞RNA测序数据中同时去除批次效应、填补缺失值和降噪 | scPSM方法结合了因果推断的思想，通过从深度测序批次中借用信息并进行加权平均，实现了在全基因表达空间内的批次效应校正、缺失值填补和数据降噪 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应和缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 倾向评分匹配 | 基因表达数据 | 涉及多种真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 2385 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of keratoconus corneas revealed aberrant transcriptional signatures and implicated mechanical stretch as a trigger for keratoconus pathogenesis
2022-Jul-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00397-z
PMID:35821117
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了圆锥角膜患者和健康个体的中央角膜细胞，揭示了疾病进展中每种细胞类型的作用 | 发现了圆锥角膜基质细胞中的两个潜在新型标记物CTSD和CTSK，以及YAP1和TEAD1水平的升高，并揭示了机械拉伸在圆锥角膜进展中的作用 | NA | 深入理解圆锥角膜发病机制，为诊断和潜在干预提供见解 | 圆锥角膜患者和健康个体的中央角膜细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 39,214个细胞 |
| 2386 | 2024-08-08 |
Ductal keratin 15+ luminal progenitors in normal breast exhibit a basal-like breast cancer transcriptomic signature
2022-Jul-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-022-00444-8
PMID:35821504
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研究论文 | 本文通过结合显微镜下采集的乳房缩小手术中的类器官和单细胞mRNA测序（scRNA-seq），研究了正常乳腺管腔上皮祖细胞与基底样乳腺癌之间的转录组特征关系 | 首次通过空间映射和基因表达谱比较，揭示了正常乳腺管腔祖细胞与基底样乳腺癌之间的强相关性 | NA | 探讨正常乳腺管腔上皮祖细胞与基底样乳腺癌的细胞起源和转录组特征 | 正常乳腺管腔上皮祖细胞和基底样乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自乳房缩小手术的类器官和通过FACS排序的管腔上皮细胞 |
| 2387 | 2024-08-08 |
Mesenchymal-epithelial interaction regulates gastrointestinal tract development in mouse embryos
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111053
PMID:35830795
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，构建了小鼠胚胎期E9.5至E15.5胃和肠的时空转录组图谱 | 识别了多个亚群，包括Lox胃间质、Aldh1a3小肠间质和Adamdec1大肠间质，并揭示了上皮和间质细胞的区域化和异质性 | NA | 探究胚胎期小鼠胃和肠发育的细胞和分子变化机制 | 小鼠胚胎期胃和肠的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎期E9.5至E15.5的胃和肠样本 |
| 2388 | 2024-08-08 |
A guiding role of the Arabidopsis circadian clock in cell differentiation revealed by time-series single-cell RNA sequencing
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111059
PMID:35830805
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研究论文 | 本文通过时间序列单细胞RNA测序，揭示了拟南芥生物钟在细胞分化中的指导作用 | 利用高细胞命运可塑性的植物细胞进行单细胞RNA测序，开发了PeakMatch方法分析细胞分化过程，发现时钟基因表达变化先于细胞分化 | NA | 探究生物钟是否调控细胞分化 | 拟南芥的细胞分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2389 | 2024-08-08 |
A human adipose tissue cell-type transcriptome atlas
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111046
PMID:35830816
|
研究论文 | 本研究通过未分选的人体脂肪组织RNA-seq数据，解析了细胞类型特异性转录组图谱 | 本研究提供了一种利用批量RNA-seq数据来分析细胞类型特异性转录组的可访问方法 | NA | 定义细胞类型特异性基因并解析其在人体脂肪组织中的表达 | 人体脂肪组织的细胞类型特异性转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 527个内脏脂肪组织样本和646个皮下脂肪组织样本 |
| 2390 | 2024-08-08 |
Lymphocyte subsets in Atlantic cod (Gadus morhua) interrogated by single-cell sequencing
2022-07-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03645-w
PMID:35821077
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了大西洋鳕鱼（Gadus morhua）脾脏中的淋巴细胞异质性 | 首次描述了大西洋鳕鱼中的五种T细胞亚群和八种B细胞亚群，并提出了B细胞的分化轨迹 | NA | 进一步阐明因缺乏CD4阳性T淋巴细胞而引发的免疫适应性 | 大西洋鳕鱼（Gadus morhua）的淋巴细胞亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2391 | 2024-08-08 |
Increased H3K27 trimethylation contributes to cone survival in a mouse model of cone dystrophy
2022-Jul-10, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04436-6
PMID:35810394
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研究论文 | 本研究使用Pde6c小鼠模型，探讨了组蛋白去甲基化酶抑制剂GSK-J4对锥细胞生存的潜在治疗益处 | 首次研究了GSK-J4对锥细胞生存的影响，并发现其通过调节甲基化和乙酰化之间的相互作用，对受遗传性视网膜疾病影响的锥细胞有积极响应 | NA | 探讨GSK-J4对锥细胞生存的影响及其在遗传性视网膜疾病治疗中的潜在应用 | Pde6c小鼠模型中的锥细胞 | 遗传性视网膜疾病 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2392 | 2024-08-08 |
Innate immune regulation in HIV latency models
2022-07-08, Retrovirology
IF:2.7Q3
DOI:10.1186/s12977-022-00599-z
PMID:35804422
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研究论文 | 本文评估了在多种T细胞模型中，HIV潜伏期内的先天免疫和IFN反应 | 发现了潜伏感染的T细胞系在先天免疫激活或类型1 IFN治疗下未能诱导特定的干扰素刺激基因（ISGs） | NA | 研究HIV潜伏期内的先天免疫调控机制 | HIV潜伏模型中的T细胞 | NA | HIV感染 | RNA测序 | NA | RNA | 包括已建立的潜伏细胞系、Jurkat细胞以及ART抑制的初级CD4+ T细胞模型 |
| 2393 | 2024-08-08 |
The Desmoplastic Stroma of Pancreatic Cancer: Multilayered Levels of Heterogeneity, Clinical Significance, and Therapeutic Opportunities
2022-Jul-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14133293
PMID:35805064
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综述 | 本文综述了胰腺癌中促结缔组织增生基质的多层次异质性及其临床意义和治疗机会 | 利用单细胞转录组学和多重组织成像技术，深入了解胰腺癌患者和遗传工程小鼠模型中CAF的异质性 | NA | 探讨胰腺癌促结缔组织增生基质的分子病理基础及其在临床治疗中的潜在应用 | 胰腺癌中的促结缔组织增生基质及其相关纤维母细胞（CAFs） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学、多重组织成像技术 | NA | 组织 | NA |
| 2394 | 2024-08-08 |
Patient-derived renal cell carcinoma organoids for personalized cancer therapy
2022-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.970
PMID:35802820
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研究论文 | 本文建立了一种有效的三维培养系统，用于从临床肾细胞癌样本中生成肾癌类器官，并评估其在个性化癌症治疗中的应用 | 开发了一种新的三维培养系统，用于生成肾癌类器官，这些类器官保留了原始肿瘤组织的组织学结构、突变景观和转录组特征 | NA | 推进人类肾癌研究和治疗 | 肾细胞癌类器官 | 数字病理学 | 肾癌 | 全外显子测序、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 33种不同亚型的肾癌类器官 |
| 2395 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals localized tumour ablation and intratumoural immunostimulant delivery potentiate T cell mediated tumour killing
2022-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.937
PMID:35808806
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了局部肿瘤消融和肿瘤内免疫刺激剂递送对T细胞介导的肿瘤杀伤的影响。 | 首次揭示了局部消融免疫疗法（LAIT）通过诱导广泛的促炎反应和抑制抑制性信号来促进T细胞的免疫重塑，从而驱动抗肿瘤免疫。 | NA | 探讨局部消融免疫疗法（LAIT）对T细胞介导的肿瘤杀伤的影响。 | CD8+和CD4+ T细胞在局部消融免疫疗法（LAIT）治疗后的反应。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 肿瘤浸润T细胞 |
| 2396 | 2024-08-08 |
The accuracy of absolute differential abundance analysis from relative count data
2022-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010284
PMID:35816553
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研究论文 | 本文探讨了从相对计数数据进行绝对差异丰度分析的准确性 | 使用模拟数据和真实数据集验证了重规范化相对丰度与绝对丰度在差异丰度检测中的一致性，并评估了相对丰度数据特征的预测效用 | 在特征丰度广泛变化的条件下，一致性可能显著降低 | 研究相对丰度数据在差异丰度分析中的准确性和适用性 | 相对丰度数据的重规范化策略及其在差异丰度分析中的表现 | 生物信息学 | NA | 下一代测序 | NA | 序列数据 | 涉及大量真实数据集，包括16S metabarcoding、表达阵列、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq实验 |
| 2397 | 2024-08-08 |
The Role of Microglia in Neuroinflammation of the Spinal Cord after Peripheral Nerve Injury
2022-06-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132083
PMID:35805167
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综述 | 本文综述了周围神经损伤后脊髓中微胶质细胞在神经炎症中的作用及其激活机制和功能 | 利用单细胞转录组学、新型遗传小鼠模型和活体成像等神经免疫研究技术，深入分析了微胶质细胞激活的机制及其在神经保护、退化、再生、突触可塑性和脊髓回路重组中的功能 | NA | 旨在阐明周围神经损伤后脊髓微胶质细胞与神经元相互作用的多样性，解决相关争议 | 微胶质细胞在脊髓中的激活机制及其功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 2398 | 2024-08-08 |
Single B Cell Gene Co-Expression Networks Implicated in Prognosis, Proliferation, and Therapeutic Responses in Non-Small Cell Lung Cancer Bulk Tumors
2022-Jun-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14133123
PMID:35804895
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研究论文 | 本文通过比较非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤B细胞和正常B细胞的单细胞RNA测序数据，构建了肿瘤特异性B细胞基因共表达网络，并利用CRISPR-Cas9/RNA干扰筛选数据在92多个人类NSCLC上皮细胞系中筛选增殖基因，评估了这些基因的预后和预测价值。 | 本文首次构建了NSCLC肿瘤B细胞的基因共表达网络，并发现了一个九基因标志物，该标志物在NSCLC肿瘤转录组和蛋白质组中提供了准确的预后分层。 | NA | 探索非小细胞肺癌中B细胞功能障碍的机制及其在预后中的重要性，并寻找免疫治疗预测生物标志物。 | 非小细胞肺癌肿瘤B细胞和正常B细胞的基因共表达网络。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 1313个NSCLC肿瘤转录组样本和103个蛋白质组样本 |
| 2399 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Astrocyte and Microglial Heterogeneity in Health and Disease
2022-06-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132021
PMID:35805105
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究健康与疾病状态下星形胶质细胞和小胶质细胞异质性方面的应用 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了星形胶质细胞和小胶质细胞在神经退行性疾病及HIV感染中的异质性 | NA | 旨在理解星形胶质细胞和小胶质细胞在维持神经功能中的异质性，并识别调节其对HIV反应的基因和机制 | 星形胶质细胞和小胶质细胞的异质性及其在疾病状态下的变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2400 | 2024-08-08 |
Role of GDF15/MAPK14 Axis in Chondrocyte Senescence as a Novel Senomorphic Agent in Osteoarthritis
2022-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137043
PMID:35806043
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研究论文 | 本文探讨了GDF15/MAPK14轴在软骨细胞衰老中的作用，以及GDF15作为骨关节炎新型抗衰老剂的潜力 | 首次揭示了GDF15在骨关节炎中通过诱导血管生成促进软骨细胞衰老的作用 | NA | 研究GDF15在骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 软骨细胞衰老和骨关节炎的进展 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序RNA | NA | 组织和滑膜液样本 | 来自骨关节炎患者的组织和滑膜液样本，C20A4细胞系和HUVEC细胞系 |