单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2024-08-08 |
Genetic and Epigenetic Regulation of Brain Organoids
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.948818
PMID:35846370
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综述 | 本文综述了脑类器官领域的最新知识和技术，以及其在疾病模型和临床前研究中的当前和潜在应用 | 脑类器官模拟人类大脑的发育、成熟、信号生成和功能，为神经学研究提供了独特的优势 | NA | 揭示神经发育机制和神经疾病发病机制 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因转录数据 | NA |
| 2382 | 2024-08-08 |
Embryonic Programs in Cancer and Metastasis-Insights From the Mammary Gland
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.938625
PMID:35846378
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综述 | 本文综述了胚胎发育机制在鼠乳腺发育中的关键作用，并探讨了这些机制在乳腺或乳腺癌发生和转移中的作用 | 本文揭示了胚胎发育途径在肿瘤发生和转移中的重新激活或失调，为癌症的诊断和治疗提供了新的视角 | NA | 探讨胚胎发育机制在癌症和转移中的作用，并寻找新的治疗靶点和策略 | 鼠乳腺发育中的基因和信号通路成分，以及这些成分在乳腺癌发生和转移中的作用 | NA | 乳腺癌 | NA | NA | NA | NA |
| 2383 | 2024-08-08 |
The Shape of μ-How Morphological Analyses Shape the Study of Microglia
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.942462
PMID:35846562
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综述 | 本文综述了微胶质细胞形态学分析方法，探讨了每种方法的优缺点，并强调了形态学分析在理解中枢神经系统中微胶质细胞功能方面的重要贡献 | 提倡未来研究中使用无偏见的自动化形态重建方法，以利用微胶质细胞所处细胞结构中嵌入的有价值信息 | 尽管高通量方法在其他类型的分析中变得普遍，但形态重建的标准尚未建立 | 探讨微胶质细胞形态学分析方法，并强调其在理解微胶质细胞功能中的作用 | 微胶质细胞的形态学分析方法及其在中枢神经系统中的功能 | NA | 神经发育疾病，神经退行性疾病，神经炎症 | NA | NA | NA | NA |
| 2384 | 2024-08-08 |
TBX3 regulates the transcription of VEGFA to promote osteoblasts proliferation and microvascular regeneration
2022, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.13722
PMID:35846885
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研究论文 | 研究探讨了TBX3在调节VEGFA表达以促进成骨细胞增殖和微血管再生中的作用 | 首次揭示了TBX3通过调节VEGFA表达促进成骨细胞增殖和微血管再生的机制 | NA | 研究成骨细胞微血管再生的机制 | TBX3在成骨细胞和血管化中的作用 | NA | NA | scRNA-seq, pySCENIC, qRT-PCR, 蛋白质印迹, CCK-8细胞增殖试验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类骨膜来源细胞(hPDCs) |
| 2385 | 2024-08-08 |
ORIGINS: A protein network-based approach to quantify cell pluripotency from scRNA-seq data
2022, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2022.101778
PMID:35855951
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研究论文 | 本文提出了一种基于蛋白质互作网络的方法，用于从单细胞RNA测序数据中量化细胞多能性 | 该方法使用与分化过程相关的蛋白质-蛋白质互作网络作为骨架，结合基因表达矩阵计算分化活性得分，从而量化每个细胞的多能性 | NA | 开发一种计算工具，用于从单细胞转录组数据中量化细胞多能性 | 单细胞转录组数据中的细胞多能性 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达矩阵 | 四个健康人数据集：乳腺、结肠、造血和肺 |
| 2386 | 2024-08-08 |
Single-cell entropy network detects the activity of immune cells based on ribosomal protein genes
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.056
PMID:35860411
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研究论文 | 开发了一种名为单细胞熵网络（SCEN）的新计算方法，用于分析单细胞RNA-seq数据，以发现免疫细胞的新异质性并识别现有细胞类型 | 提出了基于基因共表达网络的关联熵（AE）概念，用于衡量单个基因与所有其他基因在单细胞分辨率下的关联强度 | NA | 研究免疫细胞的异质性和多样性，特别是疾病状态下免疫细胞的变化 | 免疫细胞的活性及其在健康/疾病状态下的变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞熵网络（SCEN） | 基因表达数据 | 使用了公共数据集进行分析 |
| 2387 | 2024-08-08 |
The Cellular and Molecular Landscape of Synchronous Pediatric Sialoblastoma and Hepatoblastoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.893206
PMID:35860547
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研究论文 | 本文报道了一例6个月大婴儿同时患有腮腺胚细胞瘤（SBL）和肝母细胞瘤（HB）的病例，并通过全外显子测序（WES）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了肿瘤的细胞和分子特征。 | 首次详细描述了同时发生的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤的细胞和分子特征，并揭示了化疗后肿瘤细胞的成熟变化。 | 病例数量有限，研究结果可能不适用于所有同时发生的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤病例。 | 揭示同时发生的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤的细胞异质性和化疗后的适应性变化。 | 腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤的细胞和分子特征。 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 全外显子测序（WES），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 一例6个月大婴儿的腮腺胚细胞瘤和肝母细胞瘤组织样本 |
| 2388 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of Immune-Related Long Non-Coding RNA Signature for Predicting Immunotherapeutic Response and Prognosis in NSCLC Patients Treated With Immunotherapy
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.899925
PMID:35860577
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研究论文 | 本研究通过转录组数据识别并验证了与免疫治疗反应和非小细胞肺癌（NSCLC）患者预后相关的免疫相关长非编码RNA（lncRNA）特征。 | 首次识别并验证了39个与免疫治疗反应相关的lncRNA，其中38个被功能注释，并构建了一个新的四lncRNA特征来预测免疫治疗反应和预后。 | NA | 识别并验证与免疫治疗反应和NSCLC患者预后相关的免疫相关lncRNA特征。 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者的免疫治疗反应和预后。 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析 | LASSO和多元Cox分析 | 转录组数据 | 7,693个新的lncRNA被识别，涉及NSCLC和黑色素瘤患者的四个独立数据集。 |
| 2389 | 2024-08-08 |
Patient Derived Organoids Confirm That PI3K/AKT Signalling Is an Escape Pathway for Radioresistance and a Target for Therapy in Rectal Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.920444
PMID:35860583
|
研究论文 | 本研究使用患者来源的类器官模型，探讨了直肠癌对化学放疗抵抗的机制，并验证了PI3K/AKT信号通路作为治疗靶点的有效性 | 首次通过患者来源的类器官模型和单细胞测序技术，证实了PI3K/AKT/mTOR通路在直肠癌放疗抵抗中的作用，并测试了双PI3K/mTOR抑制剂在提高癌细胞对放疗敏感性方面的效果 | 研究主要集中在实验室模型上，需要进一步的临床试验来验证这些发现 | 理解直肠癌对化学放疗抵抗的机制，并探索新的治疗策略 | 直肠癌患者来源的类器官模型 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞测序，CRISPR-Cas9 | NA | 转录组数据 | 涉及多个患者来源的类器官模型和结直肠癌细胞系HCT116 |
| 2390 | 2024-08-08 |
The role of toll-like receptors (TLRs) in pan-cancer
2022-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2022.2095664
PMID:35801728
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研究论文 | 本研究分析了Toll样受体（TLRs）在泛癌数据集中的mRNA水平表达及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | 本研究通过多组学分析，揭示了TLRs作为癌症发生和进展的生物标志物、潜在的抗肿瘤治疗靶点以及预后生物标志物的可能性 | NA | 分析TLRs在泛癌数据集中的临床重要性及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | TLRs在泛癌数据集中的表达及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | NA | 泛癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA | NA |
| 2391 | 2024-08-08 |
Diet triggers specific responses of hypothalamic astrocytes in time and region dependent manner
2022-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24237
PMID:35802021
|
研究论文 | 本研究探讨了高脂肪高糖饮食对下丘脑弓状核（ARC）星形胶质细胞的分子响应，特别是它们在不同时间点的转录组和蛋白质组变化 | 通过单细胞测序和多组学分析，揭示了高脂肪高糖饮食对下丘脑星形胶质细胞的时间和细胞特异性转录组响应，以及空间和分子特征的变化 | NA | 研究高热量饮食对下丘脑星形胶质细胞的分子响应及其时空变化 | 下丘脑弓状核的星形胶质细胞 | NA | NA | RNA测序，蛋白质组学，单细胞测序 | NA | RNA序列，蛋白质数据 | 具体样本数量未明确提及 |
| 2392 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome atlas reveals developmental trajectories and a novel metabolic pathway of catechin esters in tea leaves
2022-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13891
PMID:35810348
|
研究论文 | 本文通过建立快速原生质体分离方法，研究了16,977个单细胞的转录组，揭示了茶树叶中儿茶素酯的发育轨迹和新陈代谢途径。 | 首次报道了木本作物叶片的单细胞转录组图谱，并发现了植物中儿茶素酯的新陈代谢途径。 | NA | 揭示茶树叶中儿茶素酯的形成机制及其在不同细胞类型中的分布。 | 茶树的1st和3rd叶片的单细胞转录组。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16,977个单细胞 |
| 2393 | 2024-08-08 |
Determinants of Dental Pulp Stem Cell Heterogeneity
2022-Oct, Journal of endodontics
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.joen.2022.06.013
PMID:35809811
|
综述 | 本文综述了影响牙髓干细胞再生特性的异质性决定因素 | 单细胞RNA测序有望阐明牙髓干细胞的异质性，并有助于建立标准化技术 | 临床应用中缺乏一致和可靠的结果可能是由于牙髓干细胞群体的异质性 | 提供关于牙髓干细胞异质性决定因素的叙述性综述 | 牙髓干细胞的异质性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 2394 | 2024-08-08 |
A systematic evaluation of the computational tools for ligand-receptor-based cell-cell interaction inference
2022-09-16, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac019
PMID:35822343
|
研究论文 | 本文系统评估了用于推断基于配体-受体细胞间相互作用的计算工具 | 本文填补了关于当前基于配体-受体的细胞间相互作用预测工具在公共单细胞RNA测序数据集上的性能和运行结果的研究空白 | NA | 评估和比较用于预测基于配体-受体的细胞间相互作用的计算工具的性能 | 九种最新的基于配体-受体的细胞间相互作用预测计算工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA | 15个经过充分研究的scRNA-Seq样本，对应约10万个单细胞在不同实验条件下的数据 |
| 2395 | 2024-08-08 |
Isolation of mouse ovarian follicles for single-cell RNA-seq and in vitro culture
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101537
PMID:35830306
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研究论文 | 本文提供了一种结合单细胞基因组学和功能实验的方案，用于研究卵泡发育的逐步过程 | 该方案能够分离不同发育阶段的鼠卵巢卵泡，进行单细胞RNA测序和体外培养，从而解析和验证指导卵泡发育的关键分子事件 | NA | 研究卵泡发育的逐步过程 | 鼠卵巢卵泡 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同发育阶段的鼠卵巢卵泡 |
| 2396 | 2024-08-08 |
Anti-GD2 Antibodies Conjugated to IL15 and IL21 Mediate Potent Antitumor Cytotoxicity against Neuroblastoma
2022-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-0717
PMID:35802683
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研究论文 | 本文研究了通过将IL15和IL21与hu14.18抗体结合，增强其对神经母细胞瘤的抗肿瘤细胞毒性作用 | 开发了两种新的免疫细胞因子（IC），通过将IL15和IL21与hu14.18抗体结合，提高了对神经母细胞瘤的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性（ADCC） | NA | 比较hu14.18-IL15和-IL21与hu14.18-IL2在诱导神经母细胞瘤ADCC能力上的差异 | 神经母细胞瘤细胞系和移植瘤模型 | NA | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用了T细胞缺陷的小鼠和免疫活性小鼠进行实验 |
| 2397 | 2024-08-08 |
Ets21C sustains a pro-regenerative transcriptional program in blastema cells of Drosophila imaginal discs
2022-08-08, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.06.040
PMID:35820420
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研究论文 | 研究探讨了果蝇成虫盘细胞在损伤后通过局部增殖再生缺失部分的过程中，Ets21C转录因子如何维持再生特异性的转录程序 | 发现Ets21C转录因子在再生过程中调控特定基因表达网络，且这种机制可能被肿瘤利用以促进异常生长 | NA | 探究再生过程中基因调控网络的再激活与再生特异性转录程序的激活程度 | 果蝇成虫盘细胞及其再生过程中的基因表达 | 再生生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及再生翅盘中的两种特定细胞群Blastema1和Blastema2 |
| 2398 | 2024-08-08 |
Cell plasticity in regeneration in the stomach and beyond
2022-08, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2022.101948
PMID:35809361
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research paper | 本文探讨了胃及其他器官在稳态和损伤后利用细胞可塑性程序招募祖细胞进行组织再生的机制 | 揭示了细胞可塑性在组织再生中的普遍性和重要性，以及其在病理过程中的潜在作用 | NA | 研究正常干细胞分化与可塑性在稳态和损伤后的相互作用，以及再生程序的共同特征 | 胃上皮细胞及其他器官的细胞可塑性和再生机制 | NA | NA | 细胞系追踪技术、类器官培养、单细胞RNA测序分析 | NA | NA | NA |
| 2399 | 2024-08-08 |
Heterogeneity analysis of astrocytes following spinal cord injury at single-cell resolution
2022-08, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200463R
PMID:35816276
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠脊髓损伤后不同时间点的星形胶质细胞转录组特征 | 揭示了六种转录上不同的星形胶质细胞状态，并分析了这些亚型在脊髓损伤后的动态演变过程 | NA | 旨在阐明星形胶质细胞在脊髓损伤后的异质性及其动态变化 | 星形胶质细胞在脊髓损伤后的亚型及其转录组特征 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后不同时间点的组织样本 |
| 2400 | 2024-08-08 |
Propensity score matching enables batch-effect-corrected imputation in single-cell RNA-seq analysis
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac275
PMID:35821114
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研究论文 | 本文提出了一种新的倾向评分匹配方法（scPSM），用于单细胞RNA测序数据中同时去除批次效应、填补缺失值和降噪 | scPSM方法结合了因果推断的思想，通过从深度测序批次中借用信息并进行加权平均，实现了在全基因表达空间内的批次效应校正、缺失值填补和数据降噪 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应和缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 倾向评分匹配 | 基因表达数据 | 涉及多种真实的单细胞RNA测序数据集 |