单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2341 - 2360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2341 | 2024-08-08 |
Integrated single cell and spatial transcriptomics reveal autoreactive differentiated B cells in joints of early rheumatoid arthritis
2022-07-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-15293-5
PMID:35831338
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，探讨了早期类风湿性关节炎关节组织中分化B细胞的存在及其特性 | 首次揭示了早期类风湿性关节炎关节组织中存在自身反应性分化B细胞，并展示了局部B细胞成熟和浆细胞生存的组织结构 | 样本量较小，仅包括8个滑膜活检样本 | 探究早期类风湿性关节炎关节组织中分化B细胞的存在及其在疾病发展中的作用 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织中的B细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA序列 | 8个滑膜活检样本，3414个B细胞 |
| 2342 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional pharmacodynamics of trifluridine in a tumor-immune model
2022-07-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-16077-7
PMID:35831404
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术评估三氟胸苷在肿瘤-免疫共培养模型中的转录药效学效应 | 首次在肿瘤和免疫细胞的共培养模型中使用单细胞RNA测序技术评估三氟胸苷的药效学效应，并提供了对T细胞介导的抗肿瘤反应的治疗诱导效应的新见解 | NA | 理解化疗的免疫学效应，特别是在化疗和免疫治疗结合的时代 | 人结直肠癌细胞和外周血单个核细胞的共培养模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数千个单独的癌症和免疫细胞 |
| 2343 | 2024-08-08 |
A functional reference map of the RNF8 interactome in cancer
2022-07-13, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-022-00331-z
PMID:35831895
|
研究论文 | 本研究通过LC-MS技术构建了RNF8在癌症中的互作组参考图谱，并发现了新的互作蛋白和生物学功能 | 首次构建了RNF8的互作组参考图谱，并揭示了RNF8与神经退行性疾病及肿瘤浸润免疫细胞的关联 | NA | 探索RNF8在癌症中的生物学功能及其作为治疗靶点的潜力 | RNF8互作蛋白及其在癌症中的作用 | NA | 癌症 | LC-MS | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 2344 | 2024-08-08 |
SH3GLB1-related autophagy mediates mitochondrial metabolism to acquire resistance against temozolomide in glioblastoma
2022-Jul-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02429-8
PMID:35831908
|
研究论文 | 研究SH3GLB1基因在胶质母细胞瘤中通过自噬调节线粒体代谢，从而获得对替莫唑胺（TMZ）的耐药性的机制 | 首次揭示了SH3GLB1通过调节自噬影响线粒体功能，从而在胶质母细胞瘤中产生对TMZ的耐药性 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的临床验证 | 探讨胶质母细胞瘤如何逃避替莫唑胺诱导的细胞毒性，特别是线粒体在此过程中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞、SH3GLB1基因、线粒体代谢 | NA | 脑肿瘤 | RNA干扰、基因扩增、单细胞转录组分析 | NA | RNA转录组 | 临床样本和肿瘤细胞 |
| 2345 | 2024-08-08 |
Targeted inducible delivery of immunoactivating cytokines reprograms glioblastoma microenvironment and inhibits growth in mouse models
2022-07-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl4106
PMID:35857642
|
研究论文 | 本文利用基于慢病毒载体的平台，体外改造造血干细胞，使其肿瘤浸润的单核/巨噬细胞后代在空间和时间上选择性释放干扰素-α（IFN-α）或白细胞介素-12（IL-12），以重编程胶质母细胞瘤的微环境并抑制其在小鼠模型中的生长。 | 本文创新性地利用慢病毒载体改造造血干细胞，实现免疫激活细胞因子在肿瘤微环境中的选择性释放，从而克服了系统性给药的严重毒性问题。 | NA | 研究旨在开发一种新的治疗胶质母细胞瘤的方法，通过重编程肿瘤微环境来提高免疫疗法的疗效。 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其免疫抑制性肿瘤微环境（TME）。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 慢病毒载体 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用同基因GBM小鼠模型进行实验 |
| 2346 | 2024-08-08 |
Detection of cell markers from single cell RNA-seq with sc2marker
2022-Jul-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04817-5
PMID:35831796
|
research paper | 本文提出了一种基于最大边缘指数和抗体蛋白数据库的sc2marker方法，用于从单细胞RNA测序数据中选择流式细胞术或成像的标记物 | sc2marker方法在准确性上优于竞争方法，同时具有竞争性的运行时间 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中选择特定标记基因 | 单细胞RNA测序数据中的免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最大边缘指数 | RNA测序数据 | NA |
| 2347 | 2024-08-08 |
scDLC: a deep learning framework to classify large sample single-cell RNA-seq data
2022-Jul-12, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08715-1
PMID:35831808
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scDLC的深度学习框架，用于分类大型样本的单细胞RNA测序数据 | scDLC基于长短期记忆循环神经网络（LSTMs），不需要对数据分布有先验知识，而是考虑了最显著特征基因的依赖性 | NA | 开发一种新的深度学习方法，用于处理大型样本的单细胞RNA测序数据分类问题 | 大型样本的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 长短期记忆循环神经网络（LSTMs） | 单细胞RNA测序数据 | 大型样本 |
| 2348 | 2024-08-08 |
Neoantigens in precision cancer immunotherapy: from identification to clinical applications
2022-Jun-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002181
PMID:35838545
|
综述 | 本文综述了癌症免疫治疗中基于新抗原的疗法，从识别到临床应用的进展 | 新抗原相关疗法在临床实践中的广泛应用，包括新抗原疫苗、新抗原特异性CD8+和CD4+ T细胞以及新抗原脉冲树突状细胞 | 需要不断努力揭示新抗原在抗肿瘤免疫中的全面作用并扩展其临床应用 | 总结新抗原研究的进展，并讨论其在精准癌症免疫治疗中的机遇和挑战 | 新抗原在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | NA | 下一代测序、高通量单细胞测序、质谱分析 | NA | 测序数据、质谱数据 | NA |
| 2349 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of lower mitochondrial complex I expression is associated with cell metastasis of clear cell renal cell carcinoma
2022-Jun, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-242
PMID:35836523
|
研究论文 | 本研究分析了线粒体复合物I（CI）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞转移中的作用 | 首次揭示了线粒体复合物I在ccRCC转移中的关键作用，并提出了CI和PPARG作为潜在的转移性ccRCC生物标志物 | NA | 探讨ccRCC转移的机制并开发有效的治疗方法 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的细胞转移机制 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络 | 基因表达数据 | 使用了GSE73121和TCGA-KIRC数据库中的数据 |
| 2350 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the immune space-time landscape reveals dendritic cell regulatory program in polymicrobial sepsis
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72760
PMID:35832091
|
研究论文 | 本研究利用多隔室单细胞RNA测序技术，分析了脓毒症进展过程中免疫细胞亚群的异质性，并揭示了树突状细胞在脓毒症中的免疫调节程序。 | 首次全面描绘了多微生物脓毒症的单细胞免疫时空景观，并发现了树突状细胞中与超炎症和器官功能障碍相关的保守且可靶向的免疫调节程序。 | NA | 揭示脓毒症中宿主免疫反应的全面视图，并探索树突状细胞在脓毒症中的免疫调节功能。 | 小鼠脓毒症模型中的免疫细胞亚群，特别是树突状细胞。 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的多个免疫相关组织部位 |
| 2351 | 2024-08-08 |
Concordant and Heterogeneity of Single-Cell Transcriptome in Cardiac Development of Human and Mouse
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.892766
PMID:35832197
|
研究论文 | 本研究基于人类和小鼠胚胎心脏的单细胞转录组数据，鉴定了几种主要类型的心脏细胞，并比较了这些细胞在两个物种中的发育阶段相似性 | 首次详细比较了人类和小鼠心脏细胞在发育过程中的转录组异同，并确定了物种共享和物种特异的标记基因 | NA | 揭示哺乳动物心脏发育的异同，为研究心脏细胞类型和发育轨迹提供资源 | 人类和小鼠的胚胎心脏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的胚胎心脏细胞 |
| 2352 | 2024-08-08 |
Bulk RNA Sequencing With Integrated Single-Cell RNA Sequencing Identifies BCL2A1 as a Potential Diagnostic and Prognostic Biomarker for Sepsis
2022, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2022.937303
PMID:35832273
|
研究论文 | 本研究通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，识别出BCL2A1作为脓毒症潜在的诊断和预后生物标志物 | 首次通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，识别出BCL2A1作为脓毒症的潜在生物标志物 | NA | 旨在发现新的脓毒症相关生物标志物，并验证其诊断和预后价值 | 脓毒症及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 随机森林回归分析 | RNA序列 | 141个候选基因，17个预后基因 |
| 2353 | 2024-08-08 |
Revealing the Key MSCs Niches and Pathogenic Genes in Influencing CEP Homeostasis: A Conjoint Analysis of Single-Cell and WGCNA
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.933721
PMID:35833124
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），系统分析了软骨终板（CEP）中的感兴趣模块、免疫浸润情况和细胞微环境，揭示了CEP中间充质干细胞群体的复杂性和表型特征。 | 首次结合scRNA-seq和WGCNA技术，全面分析了CEP中的细胞异质性和基因共表达网络，揭示了CEP中关键的间充质干细胞微环境和致病基因。 | NA | 揭示软骨终板（CEP）中的间充质干细胞群体复杂性和表型特征，以及这些细胞在维持CEP稳态中的作用。 | 软骨终板（CEP）中的间充质干细胞和其他细胞成分。 | 数字病理学 | 退行性椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | RNA | 8个不同的细胞亚群 |
| 2354 | 2024-08-08 |
Checkpoint Inhibitors Modulate Plasticity of Innate Lymphoid Cells in Peripheral Blood of Patients With Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.849958
PMID:35833139
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点抑制剂对肝细胞癌患者外周血中固有淋巴细胞（ILC）可塑性的影响 | 首次探索了ILC在外周血中的存在及其在免疫检查点抑制剂治疗中的作用和功能 | NA | 研究免疫检查点抑制剂对肝细胞癌患者外周血中ILC组成和可塑性的影响 | 肝细胞癌患者外周血中的固有淋巴细胞（ILC） | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞 | 大型肝细胞癌队列 |
| 2355 | 2024-08-08 |
Overexpression of LIMA1 Indicates Poor Prognosis and Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549221109493
PMID:35837368
|
研究论文 | 本文研究了LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | 首次全面探讨了LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的恶性行为及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤细胞功能状态的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 多组学研究 | NA | 基因组数据 | 基于The Cancer Genome Atlas数据 |
| 2356 | 2024-08-08 |
Response: Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted CoExpression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923283
PMID:35837392
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2357 | 2024-08-08 |
Vascular Regulation by Super Enhancer-Derived LINC00607
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.881916
PMID:35837599
|
研究论文 | 研究探讨了超级增强子衍生的长非编码RNA LINC00607在人动脉内皮细胞中的表达及其对糖尿病条件下血管细胞基因调控网络的影响 | 首次展示了LINC00607在糖尿病患者动脉中的高表达，并证明了其通过c-Myc转录因子调控内皮细胞和血管平滑肌细胞的转录组 | NA | 研究LINC00607在血管细胞中的功能及其在糖尿病等疾病中的作用 | 人动脉内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康和糖尿病捐赠者的人动脉样本 |
| 2358 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Between Immune Cells and Altered Vascular Smooth Muscle Cell Phenotypes in Aortic Aneurysm From Single-Cell Transcriptome Data
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.936287
PMID:35837612
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据分析，揭示了主动脉瘤中免疫细胞与血管平滑肌细胞（VSMC）之间的细胞间通讯及其在主动脉瘤发展中的作用 | 首次详细分析了主动脉瘤中免疫细胞与VSMC之间的细胞间通讯网络，并识别了关键的信号通路和配体-受体对 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及实验验证所有识别的信号通路和配体-受体对 | 探讨主动脉瘤中VSMC表型转换的驱动因素及其在疾病中的作用 | 主动脉瘤中的免疫细胞和VSMC | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8个主动脉瘤样本和3个正常主动脉样本，共42,611个细胞 |
| 2359 | 2024-08-08 |
T Cells With Activated STAT4 Drive the High-Risk Rejection State to Renal Allograft Failure After Kidney Transplantation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.895762
PMID:35844542
|
研究论文 | 本研究利用统一流形近似和投影及莱顿算法分析2611个公开的肾移植微阵列数据集，揭示了六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，通过构建基因调控网络，发现激活的STAT4作为核心转录因子与移植肾功能和预后密切相关。 | 本研究首次揭示了肾移植后的六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，为精确诊断肾移植排斥进展提供了新策略。 | NA | 研究肾移植后排斥状态的分子机制，以提高排斥反应的诊断和治疗水平。 | 肾移植排斥状态及其相关基因和细胞群。 | NA | 肾移植 | 微阵列数据分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2611个微阵列数据集 |
| 2360 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Upregulation of Immune Cell Crosstalk in Relapsed Pediatric Ependymoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.903246
PMID:35844565
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童复发性室管膜瘤中免疫细胞间相互作用的增强 | 采用了一种新的轨迹评分方法来揭示与不良生存结果相关的细胞组成，并识别了复发和原发样本之间的潜在细胞间通信特征 | NA | 研究儿童室管膜瘤的肿瘤内异质性及其对生存结果的影响 | 儿童室管膜瘤的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |