单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2301 - 2320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals New Immune Disorder Complexities in Hypersplenism
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.921900
PMID:35865544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了脾功能亢进（HS）组织中的细胞转录组特征 | 首次揭示了HS中B细胞的缺失及其在HS合并肝细胞癌（HS-HCC）中的存在，并发现了HS中CD74-COPA和CD94-HLA-E的上调 | NA | 探索脾功能亢进的遗传特征 | 脾功能亢进组织及其对照组织的细胞转录组 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 43,037个细胞，来自四个HS组织和一个对照组织 |
| 2302 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Mesenchymal Stem Cells in Cavernous Hemangioma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.916045
PMID:35865633
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了海绵状血管瘤中的细胞异质性，发现大量胚胎间充质干细胞，并提出海绵状血管瘤可能起源于胚胎间充质干细胞 | 首次在海绵状血管瘤中发现大量胚胎间充质干细胞，并揭示了这些细胞在免疫反应中的作用 | NA | 探究海绵状血管瘤的起源及其相关的细胞类型和分子机制 | 海绵状血管瘤中的细胞类型和分子机制 | 数字病理学 | 血管畸形 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2303 | 2024-08-08 |
From single-omics to interactomics: How can ligand-induced perturbations modulate single-cell phenotypes?
2022, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2022.05.006
PMID:35871896
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研究论文 | 本文探讨了从单组学到相互作用组学的发展，以及配体诱导的扰动如何调节单细胞表型 | 介绍了单细胞转录组学数据与其他组学数据（如蛋白质组学和表观基因组学数据）的整合，以阐明细胞水平的扰动效应和机制 | 文章提到当前计算工具和算法的局限性，以及大量数据处理的挑战 | 旨在通过单细胞组学数据和计算工具，提高对药物研究和开发的认识 | 研究对象包括单细胞表型、药物治疗对生物系统的影响以及相关的计算工具和算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学数据、蛋白质组学数据、表观基因组学数据 | NA |
| 2304 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Yields Insights in the Evolution of Foot-and-Mouth Disease Virus Persistent Infection
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.940906
PMID:35873170
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，探讨了口蹄疫病毒（FMDV）持续感染细胞系的细胞异质性及其机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示口蹄疫病毒持续感染的形成机制，并首次应用伪时间轨迹分析于口蹄疫病毒持续感染细胞系 | NA | 阐明口蹄疫病毒持续感染细胞系的细胞异质性机制 | 口蹄疫病毒持续感染细胞系 | 数字病理学 | 口蹄疫 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | BHK-Op细胞系 |
| 2305 | 2024-08-08 |
A Novel Artificial Neural Network Prognostic Model Based on a Cancer-Associated Fibroblast Activation Score System in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.927041
PMID:35874676
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研究论文 | 本文构建了一种基于癌症相关成纤维细胞激活评分系统的新型人工神经网络预测模型，用于肝细胞癌的预后评估 | 本文创新性地利用12个癌症相关成纤维细胞相关基因构建了人工神经网络模型，并通过功能、突变、免疫和临床分析揭示了模型的信息 | NA | 识别肝细胞癌进展机制并预测患者预后 | 肝细胞癌患者及其癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组和配体-受体相互作用分析 | 人工神经网络（ANN） | 基因表达数据 | 数据来自The Cancer Genome Atlas、International Cancer Genome Consortium和Gene Expression Omnibus数据库 |
| 2306 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis From Multicenter Studies Identifies a WGCNA-Derived Cancer-Associated Fibroblast Signature for Ovarian Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.951582
PMID:35874760
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研究论文 | 本研究通过多中心研究的综合分析，利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）鉴定了与卵巢癌相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）特征。 | 首次通过多中心研究的综合分析，利用WGCNA方法鉴定了与卵巢癌相关的CAF特征，并构建了预后标志物。 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证。 | 旨在鉴定与卵巢癌高发病率和死亡率相关的CAF预后基因。 | 卵巢癌患者的癌症相关成纤维细胞及其预后基因。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 机器学习 | 基因表达数据 | 2742名患者 |
| 2307 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Distinct Tumor Microenvironment of Different Components of Lung Adenocarcinoma Featured as Mixed Ground-Glass Opacity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.903513
PMID:35874770
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了混合磨玻璃影特征的肺腺癌中不同成分的肿瘤微环境差异 | 首次通过单细胞测序技术，详细分析了混合磨玻璃影肺腺癌中固体成分和磨玻璃成分的细胞组成和转录组特征 | 研究样本仅限于三名患者的六对成分，可能限制了结果的普遍性 | 探究混合磨玻璃影特征的肺腺癌中不同成分的肿瘤微环境差异及其机制 | 混合磨玻璃影肺腺癌的固体成分和磨玻璃成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 19,391个单细胞数据，来自三名患者的六对成分 |
| 2308 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Immune Cells Reveal Diversity and Exhaustion Signatures in Non-Small-Cell Lung Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.854724
PMID:35874785
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了非小细胞肺癌患者肿瘤、正常组织和血液中的CD45免疫细胞，揭示了免疫细胞的多样性和耗竭特征。 | 本文首次识别出三种具有免疫抑制作用的免疫细胞簇，包括耗竭的CD8 T细胞、具有促炎M2表型的肿瘤相关巨噬细胞和具有肿瘤促进特性的调节性B细胞。 | NA | 旨在理解肿瘤微环境中免疫细胞表型，以解释和预测非小细胞肺癌的进展及其对免疫治疗的反应。 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤、正常组织和血液中的CD45免疫细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2309 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Pathogenic Relevance of Intracranial Atherosclerosis in Blood Blister-Like Aneurysms
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.927125
PMID:35874788
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了颅内非分支部位血泡样动脉瘤（BBA）与颅内动脉粥样硬化的致病相关性 | 首次通过单细胞RNA测序技术研究BBA的转录组景观，揭示了其与颅内动脉粥样硬化的致病相关性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的颅内动脉瘤类型 | 探究颅内血泡样动脉瘤的转录组景观及其与颅内动脉粥样硬化的潜在致病机制 | 颅内血泡样动脉瘤和囊状颅内动脉瘤的细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat-based pipeline | 细胞 | 12,245个细胞来自1个BBA和2个囊状颅内动脉瘤，以及10个BBA和30个颅内动脉瘤用于病理验证 |
| 2310 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Difference in Human Normal and Degenerative Nucleus Pulposus Tissue Profiles and Cellular Interactions
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.910626
PMID:35874809
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序技术，比较了人类正常和退变髓核细胞的表达谱，揭示了两者在细胞类型和功能上的差异 | 首次在椎间盘组织单细胞转录组测序研究中发现并鉴定了表达疼痛炎症基因的软骨细胞4和钙化软骨细胞5 | NA | 阐明人类正常和退变髓核细胞的转录组差异表达谱，探索其细胞异质性及功能 | 人类正常髓核细胞（NNP）和退变髓核细胞（DNP） | 数字病理学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两组样本，分别包含正常和退变的髓核细胞 |
| 2311 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing for Analyzing the Intestinal Tract in Healthy and Diseased Individuals
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.915654
PMID:35874838
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在健康和患病个体肠道分析中的应用 | scRNA-seq技术能够揭示在整体水平上难以观察到的罕见和中间细胞状态 | NA | 探讨scRNA-seq在识别新的细胞亚型和状态、目标以及解释肠道疾病分子机制中的应用 | 肠道中的不同细胞系及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2312 | 2024-08-08 |
Arecoline Is Associated With Inhibition of Cuproptosis and Proliferation of Cancer-Associated Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma: A Potential Mechanism for Tumor Metastasis
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.925743
PMID:35875097
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研究论文 | 本文探讨了槟榔碱与口腔鳞状细胞癌（OSCC）中铜死亡和癌症相关成纤维细胞（CAFs）增殖的抑制之间的关系，以及这种关系对肿瘤转移的可能机制。 | 首次揭示了槟榔碱通过影响铜死亡和CAFs的增殖，可能在OSCC的转移中发挥重要作用。 | 研究主要基于基因表达数据和细胞实验，缺乏临床样本的直接验证。 | 探究槟榔碱在口腔鳞状细胞癌转移中的作用机制。 | 口腔鳞状细胞癌、癌症相关成纤维细胞、槟榔碱的作用。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 基因表达分析、LASSO回归、GO和KEGG分析、单细胞测序。 | NA | 基因表达数据 | GSE139869数据集（n=10）和TCGA-OSCC数据集（n=361）。 |
| 2313 | 2024-08-08 |
Epigenetic Regulation of Profibrotic Macrophages in Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease
2022-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42286
PMID:35849803
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研究论文 | 本研究探讨了系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）中促纤维化分泌磷蛋白1（SPP1）表达的巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，以揭示其在促进纤维化中的作用及相关的转录因子。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术，详细分析了SSc-ILD中SPP1巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，并预测了调控这些巨噬细胞分化的转录因子。 | 研究仅限于5个肺样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 旨在揭示SSc-ILD中促纤维化SPP1巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，并识别相关的转录因子，为治疗SSc-ILD提供新的靶点。 | 系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）中的促纤维化SPP1表达巨噬细胞。 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据 | 11个SSc-ILD和健康对照肺样本，5个肺样本用于染色质可及性测序 |
| 2314 | 2024-08-08 |
Different Molecular Features of Epithelioid and Giant Cells in Foreign Body Reaction Identified by Single-Cell RNA Sequencing
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.014
PMID:35853485
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间测序技术，分析了海绵和丝绸引起的外来体反应中的上皮细胞和巨细胞的分子特征 | 首次揭示了上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的独特分子特征，并识别了巨细胞特异性标记基因 | NA | 探索上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的分子特征，以促进皮肤外来体反应的预防和治疗管理策略 | 上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类组织中的多种细胞类型 |
| 2315 | 2024-08-08 |
Comparative Spatial Transcriptomic and Single-Cell Analyses of Human Nail Units and Hair Follicles Show Transcriptional Similarities between the Onychodermis and Follicular Dermal Papilla
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.022
PMID:35853486
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研究论文 | 本研究利用数字空间分析和单细胞RNA测序技术，比较了人类指甲单元和毛囊的空间转录组和单细胞分析，发现甲床和毛囊真皮乳头在转录水平上具有相似性 | 首次揭示了甲床中的特定间充质细胞群——甲床成纤维细胞的存在，并发现甲床和毛囊真皮乳头在Wnt和骨形态发生蛋白信号分子表达上的相似性 | NA | 探讨人类指甲单元和毛囊的转录组相似性及其生物学意义 | 人类指甲单元和毛囊 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2316 | 2024-08-08 |
Multidimensional Immunophenotyping of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Reveals Novel T Cell and Macrophage Signature
2022-Nov, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-022-12157-0
PMID:35831529
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和流式细胞术技术，全面分析了导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）中的免疫细胞浸润情况 | 发现了IPMN中T细胞和巨噬细胞的新型特征，并揭示了这些细胞在不同程度异型增生区域中的分布差异 | 研究样本量较小，仅包括12名患者的IPMN组织 | 探究导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）向癌症进展过程中的免疫细胞浸润情况 | 导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）及其不同程度异型增生区域中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据 | 12名患者的IPMN组织 |
| 2317 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profiling to evaluate the effects of Di(2-ethylhexyl)phthalate exposure on early meiosis of female mouse germ cells
2022-Nov, Chemosphere
IF:8.1Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了母体暴露于邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)后，胎鼠在胚胎第12.5天和第14.5天的卵巢，探讨DEHP对雌性小鼠生殖细胞早期减数分裂的影响。 | 首次通过单细胞转录组测序技术揭示DEHP暴露激活了生殖细胞中与DNA修复相关的通路，增加了DNA损伤相关基因的表达，并改变了生殖细胞的发育轨迹。 | 研究仅限于胎鼠的特定胚胎阶段，且未探讨DEHP对成年小鼠生殖细胞的影响。 | 探讨DEHP暴露对雌性小鼠生殖细胞早期减数分裂分子机制的影响。 | 雌性小鼠的生殖细胞及DEHP暴露对其的影响。 | 数字病理学 | 生殖健康问题 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 胎鼠卵巢样本 |
| 2318 | 2024-08-08 |
PTX3 mediates the infiltration, migration, and inflammation-resolving-polarization of macrophages in glioblastoma
2022-11, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.13913
PMID:35855654
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研究论文 | 本文探讨了PTX3在胶质母细胞瘤中对巨噬细胞浸润、迁移和炎症消解极化的作用 | 首次阐明了PTX3在胶质瘤肿瘤微环境中对免疫系统的调节作用 | NA | 研究PTX3在胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | PTX3在胶质母细胞瘤中的表达及其对巨噬细胞功能的影响 | 数字病理学 | 脑癌 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 组织切片 | 60个湘雅队列的胶质瘤样本 |
| 2319 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic atlas reveals distinct immunological responses between COVID-19 vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2022-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28012
PMID:35859327
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了接种CoronaVac疫苗与自然感染SARS-CoV-2后免疫反应的差异 | 首次揭示了灭活COVID-19疫苗与SARS-CoV-2感染在免疫细胞类型比例、B细胞激活分化及基因表达等方面的不同反应 | 研究样本量较小，仅包括六名接种疫苗的个体和来自单细胞联盟的COVID-19感染患者 | 探究灭活COVID-19疫苗与SARS-CoV-2感染在免疫反应上的差异 | 接种CoronaVac疫苗的个体和SARS-CoV-2感染患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六名接种疫苗的个体和COVID-19感染患者 |
| 2320 | 2024-08-08 |
Dimensionality Reduction of Single-Cell RNA Sequencing Data by Combining Entropy and Denoising AutoEncoder
2022-10, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0118
PMID:35834604
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研究论文 | 本文通过结合熵和去噪自编码器的方法，对单细胞RNA测序数据进行降维 | 提出了一种新的降维方法，结合了熵和去噪自编码器的优势 | NA | 研究如何有效地对单细胞RNA测序数据进行降维 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 去噪自编码器 | RNA测序数据 | NA |