单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 4052 篇文献,本页显示第 2221 - 2240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
2221 2024-08-08
Single-cell and spatial mapping Identify cell types and signaling Networks in the human ureter
2022-08-08, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序、空间基因表达和免疫荧光技术,定义并空间映射了人类输尿管中的细胞群体,重点关注基质细胞和尿路上皮细胞,并分析了sonic hedgehog(SHH)信号通路在成年干细胞维持中的重要性。 首次通过单细胞和空间映射技术详细描述了人类输尿管的细胞类型和信号网络,并验证了SHH信号通路在输尿管组织稳态中的作用。 NA 深入理解输尿管组织再生的结构、细胞异质性和信号通路,为组织工程提供治疗策略。 人类输尿管的细胞群体和信号网络。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、空间基因表达、免疫荧光 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
2222 2024-08-08
Glioblastoma hijacks neuronal mechanisms for brain invasion
2022-08-04, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文研究了胶质母细胞瘤如何利用神经机制进行脑部侵袭 首次揭示了胶质母细胞瘤细胞通过接收神经元输入并模仿神经迁移机制进行脑部侵袭的机制 NA 探讨胶质母细胞瘤细胞如何利用神经机制进行脑部侵袭 胶质母细胞瘤细胞及其与神经元的关系 NA 脑肿瘤 单细胞转录组学 NA 单细胞数据 包括小鼠模型和人类疾病样本
2223 2024-08-08
Single-cell analysis reveals differences among iNKT cells colonizing peripheral organs and identifies Klf2 as a key gene for iNKT emigration
2022-Aug-02, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了不同外周器官中不变自然杀伤T细胞(iNKT细胞)的差异,并揭示了Klf2转录因子在iNKT细胞迁移和分化中的关键作用 首次揭示了iNKT细胞在外周器官中的表型和功能差异,并发现了Klf2在iNKT细胞迁移和分化中的重要作用 NA 探究iNKT细胞在外周器官中的分布差异及其迁移机制 iNKT细胞在外周器官中的表型和功能差异,以及Klf2在iNKT细胞迁移和分化中的作用 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 来自肝脏、脾脏和淋巴结的iNKT细胞
2224 2024-08-08
Identification of the immune subtype of ovarian cancer patients by integrated analyses of transcriptome and single-cell sequencing data
2022-08-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过综合分析转录组和单细胞测序数据,构建了基于M1和M2巨噬细胞的巨噬细胞风险评分(MRS)和基于与MRS相关的预后基因的基因风险评分(GRS),以识别卵巢癌患者的免疫亚型 本研究首次构建了MRS和GRS模型,用于识别具有更好总体生存率和炎症性免疫微环境的卵巢癌免疫亚型,并探讨了M1和M2巨噬细胞通过与CD8 T细胞的信号交流影响卵巢癌预后的可能性 NA 旨在通过综合分析转录组和单细胞测序数据,识别卵巢癌患者的免疫亚型,并探讨其对免疫检查点抑制剂的敏感性 卵巢癌患者的免疫亚型及其对免疫治疗的响应 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
2225 2024-08-08
Single-cell transcriptomics of staged oocytes and somatic cells reveal novel regulators of follicle activation
2022-08-01, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 本文描述了一种从原始卵泡中分离单个卵母细胞和体细胞的方法,并鉴定了驱动其激活的信号 开发了一种新的方法来收集和研究原始卵泡及其相关卵母细胞和体细胞,通过单细胞RNA测序揭示了卵母细胞和体细胞从原始到初级卵泡阶段过渡过程中的分子特征 NA 研究卵巢卵泡发育过程中的调控机制 原始卵泡中的卵母细胞和体细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 新生小鼠卵巢中的原始卵泡及其相关卵母细胞和体细胞
2226 2024-08-08
Evolution of multiple omics approaches to define pathophysiology of pediatric acute respiratory distress syndrome
2022-08-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文综述了多组学技术在儿科急性呼吸窘迫综合征(PARDS)病理生理机制研究中的应用 引入了单细胞RNA测序(scRNA-seq)等新型分析方法,以更全面、无偏见地评估跨组织和细胞类型的病理生理机制 组学研究在儿童中的应用相对较少,且缺乏跨多种组织类型的分析 探索PARDS的分子机制,以期发现靶向治疗 儿科急性呼吸窘迫综合征(PARDS)的病理生理机制 组学 儿科疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据 NA
2227 2024-08-08
Screening of cell-virus, cell-cell, gene-gene crosstalk among animal kingdom at single cell resolution
2022-08, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序技术分析了20个物种的多组织样本,并与公共资源整合,以探索病毒受体分布,揭示了从爬行动物到人类的基本细胞间和基因间交叉对话。 首次在单细胞分辨率下研究了动物界的细胞-病毒、细胞-细胞、基因-基因交叉对话,并构建了动物界的单细胞图谱。 NA 旨在揭示严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的宿主范围和组织嗜性,以预防跨物种传播。 研究对象包括20个物种的多组织样本,以及45个涵盖26个物种的公共数据集。 生物信息学 NA 单细胞测序 NA 转录组数据 20个物种的多组织样本,共30个数据集;整合45个公共数据集,涵盖26个物种。
2228 2024-08-08
The impact of neoadjuvant chemotherapy on the tumor microenvironment in advanced high-grade serous carcinoma
2022-Jul-30, Oncogenesis IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了新辅助化疗(NACT)前后高级浆液性输卵管癌的肿瘤微环境变化 首次展示了NACT前后肿瘤微环境中恶性上皮细胞的高度异质性,并揭示了主要耐药克隆的存在及其与不良临床预后的关联 仅基于单一病例的样本,可能限制了研究结果的普遍性 探讨新辅助化疗对高级浆液性癌肿瘤微环境的影响及耐药机制 高级浆液性卵巢、输卵管或腹膜癌 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞数据 共分析了32,079个单细胞,其中17,249个来自NACT前的肿瘤组织样本,14,830个来自NACT后的肿瘤组织样本
2229 2024-08-08
Single cell transcriptome sequencing of inspiratory neurons of the preBötzinger complex in neonatal mice
2022-07-30, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究对新生小鼠脑干preBötzinger复合体中的吸气神经元进行了单细胞转录组测序 首次对preBötzinger复合体中的吸气神经元进行单细胞RNA测序,提供了这些神经元转录组的详细信息 NA 研究脑干preBötzinger复合体中吸气神经元的转录组 新生小鼠脑干preBötzinger复合体中的吸气神经元 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 多个神经元的细胞内容物
2230 2024-08-08
CXCR4high megakaryocytes regulate host-defense immunity against bacterial pathogens
2022-07-29, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文通过单细胞测序技术发现了一群高表达CXCR4的巨核细胞亚群,这些细胞在细菌感染中调节宿主防御免疫反应 首次揭示了高表达CXCR4的巨核细胞在细菌感染中的免疫调节作用及其机制 NA 研究巨核细胞在细菌感染中的免疫调节作用 巨核细胞及其在细菌感染中的免疫功能 NA NA 单细胞测序 NA 细胞 使用造血干细胞系追踪的小鼠模型进行研究
2231 2024-08-08
Single-cell transcriptomic analysis of vascular endothelial cells in zebrafish embryos
2022-07-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼胚胎中血管内皮细胞的转录组特征 首次揭示了斑马鱼胚胎发育早期血管内皮细胞的单细胞转录组图谱,并识别出六种不同的血管内皮细胞亚型 NA 探索斑马鱼胚胎中血管内皮细胞多样性的分子机制 斑马鱼胚胎中的血管内皮细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 从斑马鱼胚胎中分离的血管内皮细胞
2232 2024-08-08
Polarization disorder of decidual NK cells in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by single-cell transcriptome analysis
2022-Jul-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和高通量转录组测序分析,探讨了不明原因反复自然流产患者中基质自然杀伤细胞的特征分布 首次通过单细胞RNA测序揭示了不明原因反复自然流产患者中基质自然杀伤细胞的分化过程和极化紊乱 样本量较小,仅包括正常孕妇和不明原因反复自然流产患者的各3例样本 探究不明原因反复自然流产患者中基质自然杀伤细胞的特征分布及其在免疫耐受微环境中的作用 不明原因反复自然流产患者的基质自然杀伤细胞 数字病理学 妊娠疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 正常孕妇3例,不明原因反复自然流产患者3例
2233 2024-08-08
A Differentiation-Related Gene Prognostic Index Contributes to Prognosis and Immunotherapy Evaluation in Patients with Hepatocellular Carcinoma
2022-07-26, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究构建了一个基于肝细胞癌(HCC)分化相关基因的DRGPI,用于评估免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的预后和效益 首次探讨了细胞分化相关分子在预测ICI治疗效益和预后中的潜在价值 NA 研究HCC细胞的分化轨迹及其临床意义 肝细胞癌患者及其免疫治疗评估 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 NA RNA序列数据 四个HCC样本
2234 2024-08-08
Single-Cell Transcriptome Analysis of Radiation Pneumonitis Mice
2022-Jul-26, Antioxidants (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过无偏差的单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了辐射性肺炎(RP)小鼠模型的单细胞病理景观 首次揭示了RP小鼠肺组织中不同细胞亚型的具体贡献,并发现了特定亚群的巨噬细胞和线粒体基因表达的变化 NA 探讨辐射性肺炎小鼠模型中不同细胞亚型对肺损伤的具体贡献 辐射性肺炎(RP)小鼠的肺组织 数字病理学 肺部疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
2235 2024-08-08
Immunomodulatory Responses of Subcapsular Sinus Floor Lymphatic Endothelial Cells in Tumor-Draining Lymph Nodes
2022-Jul-24, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了肿瘤引流淋巴结中的淋巴内皮细胞的免疫调节反应 发现了肿瘤衍生因子诱导的淋巴内皮细胞转录变化,并揭示了podoplanin在介导巨噬细胞粘附和正确定位中的新功能 NA 探讨肿瘤引流淋巴结中淋巴内皮细胞的免疫调节作用 肿瘤引流淋巴结中的淋巴内皮细胞 NA 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA RNA B16F10黑色素瘤引流淋巴结与非肿瘤引流淋巴结中的淋巴内皮细胞
2236 2024-08-08
scAPAmod: Profiling Alternative Polyadenylation Modalities in Single Cells from Single-Cell RNA-Seq Data
2022-Jul-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 提出了一种基于高斯混合模型的分析框架scAPAmod,用于从单细胞RNA-seq数据中识别单细胞水平的APA使用模式 首次在单细胞水平上系统地分析了APA使用模式的多样性和模式,揭示了单细胞基因表达的异质性 NA 研究单细胞中APA使用模式的多样性和动态变化 单细胞中的APA使用模式 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq 高斯混合模型 RNA-seq数据 NA
2237 2024-08-08
Identification of Malignant Cell Populations Associated with Poor Prognosis in High-Grade Serous Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing
2022-Jul-22, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了高级别浆液性卵巢癌中的肿瘤异质性,并识别出与不良预后相关的两种恶性肿瘤细胞亚型 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别出与不良预后相关的两种恶性肿瘤细胞亚型,并发现SLC3A1和PEG10作为癌症起始细胞的标记基因,以及CA125表达的恶性细胞群与肿瘤浸润性细胞毒性T淋巴细胞减少有关 NA 揭示卵巢癌中的肿瘤异质性,并识别与不良预后相关的恶性肿瘤细胞亚型 高级别浆液性卵巢癌中的恶性肿瘤细胞亚型 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用The Cancer Genome Atlas (TCGA)的生存数据和基因表达数据进行分析
2238 2024-08-08
Emerging pathogenic mechanisms in human brain arteriovenous malformations: a contemporary review in the multiomics era
2022-07, Neurosurgical focus IF:3.3Q1
综述 本文综述了在多组学时代下,人类脑动静脉畸形(bAVMs)的新兴发病机制 引入新的组学技术和单细胞测序技术,揭示了bAVMs中细胞特异性的分子异常 潜在的治疗益处或临床应用尚未明确 探讨bAVMs的病理细胞转化及其分子基础 人类脑动静脉畸形(bAVMs) NA 脑血管疾病 单细胞测序 NA 基因组和转录组数据 NA
2239 2024-08-08
Identification and Quantification of Microexons Using Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了一种名为MicroExonator的可重复计算工作流程,用于使用批量或单细胞RNA-seq数据进行微外显子剪接分析 提出了专门用于检测和量化微外显子的计算工作流程MicroExonator NA 改进对转录组的表征和理解,特别是扩展替代剪接事件的目录 微外显子,即长度可达30 nt的极短外显子 生物信息学 NA RNA-seq NA RNA-seq数据 NA
2240 2024-08-08
Bioinformatics Analysis Identifies Potential Ferroptosis Key Gene in Type 2 Diabetic Islet Dysfunction
2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析,筛选出与2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍相关的潜在铁死亡关键基因 首次揭示了铁死亡与2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍之间的关系,并筛选出潜在的关键基因MGST1 仅在两个数据集中验证了MGST1,需要更多实验和数据集来进一步验证 旨在筛选潜在的铁死亡关键基因,揭示2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍的潜在生理和病理过程 2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍及其与铁死亡的关系 生物信息学 2型糖尿病 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 89个2型糖尿病关键基因,3个2型糖尿病-铁死亡相关基因
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