单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 2001 - 2020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2001 | 2024-08-08 |
Lymphatic migration of unconventional T cells promotes site-specific immunity in distinct lymph nodes
2022-10-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.07.019
PMID:36002023
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研究论文 | 本研究通过淋巴结移植、单细胞RNA测序、光谱流式细胞术和转基因小鼠模型，展示了源自组织的非常规T细胞（UTCs）通过淋巴途径迁移到局部引流淋巴结 | 发现每个组织都拥有独特的UTCs谱，这些细胞具有局部适应的分化状态和独特的T细胞受体库，使得每个引流淋巴结都由独特的组织决定性混合淋巴细胞组成 | NA | 研究非常规T细胞在淋巴结中的迁移及其对特定部位免疫反应的影响 | 非常规T细胞（UTCs）及其在淋巴结中的迁移和功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 转基因小鼠模型 |
| 2002 | 2024-08-08 |
Phosphatase control of cytokine-mediated overproduction of galactose-deficient IgA1, the main autoantigen in IgA nephropathy
2022-10, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102883
PMID:35987175
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研究论文 | 本文研究了磷酸酶在细胞因子介导的过量产生缺乏半乳糖的IgA1（IgA肾病的主要自身抗原）中的调控作用 | 发现了IgA1分泌细胞中C1GALT1表达减少的亚群，这些细胞在细胞因子刺激下表现出异常的细胞因子信号传导调控，可能导致IgA肾病中自身抗原的过量产生 | NA | 探讨IgA肾病中自身抗原过量产生的机制 | IgA肾病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和健康对照者的PBMCs | NA | 肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自IgA肾病患者和健康对照者的PBMCs |
| 2003 | 2024-08-08 |
Intestinal single-cell atlas reveals novel lymphocytes in pigs with similarities to human cells
2022-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201442
PMID:35995567
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在猪的回肠中鉴定了26种细胞类型，并与人和小鼠的回肠细胞进行了比较 | 发现了猪特有的淋巴细胞亚群，并定义了猪的外周和回肠先天淋巴细胞的基因特征，揭示了与人类先天淋巴细胞的相似性 | NA | 深入理解猪的肠道淋巴细胞，以提高其在生物医学模型中的实用性 | 猪的肠道淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 猪的回肠中的26种细胞类型 |
| 2004 | 2024-08-08 |
A novel approach to single-cell analysis reveals intrinsic differences in immune marker expression in unstimulated BALB/c and C57BL/6 macrophages
2022-10, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14478
PMID:36001069
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研究论文 | 本文通过一种新的单细胞RNA测序分析方法，揭示了未刺激的BALB/c和C57BL/6小鼠巨噬细胞在免疫标记表达上的内在差异。 | 本文采用了一种新的单细胞RNA测序分析方法，能够揭示未刺激巨噬细胞在基因表达上的差异。 | NA | 探讨巨噬细胞在未刺激状态下基因表达的差异及其对免疫反应的影响。 | BALB/c和C57BL/6小鼠的未刺激巨噬细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | BALB/c和C57BL/6小鼠的未刺激巨噬细胞群体 |
| 2005 | 2024-08-08 |
scWMC: weighted matrix completion-based imputation of scRNA-seq data via prior subspace information
2022-09-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac570
PMID:35984287
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研究论文 | 本文提出了一种基于加权矩阵补全的scRNA-seq数据插补方法scWMC，通过利用先验子空间信息来提高插补精度 | 开发了一种新的正则化方法，利用不完美的先验信息来估计真实的潜在先验子空间，并将其嵌入到典型的基于低秩矩阵补全的框架中 | NA | 提高scRNA-seq数据中由于技术缺陷导致的基因表达值为零的插补精度 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 低秩矩阵补全 | 基因表达矩阵 | 模拟和真实scRNA-seq数据 |
| 2006 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals novel cellular heterogeneity in uterine leiomyomas
2022-09-30, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac183
PMID:36001050
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术揭示了子宫平滑肌瘤组织中的细胞异质性 | 发现了子宫平滑肌瘤和子宫肌层中平滑肌细胞、成纤维细胞和内皮细胞的异质性，并首次在单细胞水平上比较了这些组织的转录组差异 | 研究主要集中在携带MED12变异的子宫平滑肌瘤，其他遗传重排的子宫平滑肌瘤可能在细胞组成和转录组特征上有所不同 | 探究子宫肌层和子宫平滑肌瘤的细胞组成及单细胞转录组差异 | 子宫平滑肌瘤和子宫肌层的细胞组成及转录组差异 | 数字病理学 | 子宫平滑肌瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从八名患者中共收集了五个子宫平滑肌瘤和五个子宫肌层样本 |
| 2007 | 2024-08-08 |
Using human iPSC-derived kidney organoids to decipher SARS-CoV-2 pathology on single cell level
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101612
PMID:35983169
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研究论文 | 本文描述了一种用于单细胞RNA测序的SARS-CoV-2感染的人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的肾脏类器官的协议 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究SARS-CoV-2感染的iPSC衍生的肾脏类器官 | 该协议主要针对6孔Transwell格式培养的肾脏类器官，其他器官背景的类器官需要适应 | 揭示SARS-CoV-2感染后肾脏细胞的变化 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个肾脏类器官样本 |
| 2008 | 2024-08-08 |
Protocol to analyze antitumor immunity of orthotopic injection and spontaneous murine high-grade glioma models using flow cytometry and single-cell RNA sequencing
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101607
PMID:35990740
|
研究论文 | 本文描述了一种用于诱导自发脑肿瘤模型、从脑肿瘤微环境中分离单细胞并使用scRNA-seq和流式细胞术分析免疫反应的协议 | 提出了一种自发脑肿瘤模型，避免了传统骨钻和肿瘤细胞注射方法的不良影响 | 目前对脑肿瘤免疫的理解仍然不足 | 研究脑肿瘤的抗肿瘤免疫 | 自发脑肿瘤模型中的单细胞和免疫反应 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | scRNA-seq和流式细胞术 | NA | 单细胞RNA序列数据和流式细胞术数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2009 | 2024-08-08 |
Migrating Type 2 Dendritic Cells Prime Mucosal Th17 Cells Specific to Small Intestinal Commensal Bacteria
2022-09-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200204
PMID:35995508
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研究论文 | 本文研究了小肠中特定共生细菌驱动的Th17细胞的早期激活过程，发现这一过程由表达Zbtb46的DC2细胞控制 | 首次揭示了DC2细胞在小肠共生细菌驱动的Th17细胞早期激活中的关键作用 | NA | 探讨小肠中共生细菌驱动的Th17细胞的早期激活机制 | 小肠中的DC2细胞和Th17细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠共生细菌实验模型进行研究 |
| 2010 | 2024-08-08 |
Faecalibaculum rodentium remodels retinoic acid signaling to govern eosinophil-dependent intestinal epithelial homeostasis
2022-09-14, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2022.07.015
PMID:35985335
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研究论文 | 研究揭示了Faecalibaculum rodentium通过重塑视黄酸信号通路，调控依赖于嗜酸性粒细胞的肠道上皮稳态 | 首次阐明特定微生物成员通过改变上皮细胞周转率、隐窝增殖和主要组织相容性复合体II类表达，影响肠道上皮稳态 | NA | 探究微生物与肠道上皮细胞相互作用如何调节宿主生理，特别是在十二指肠中的作用 | 肠道上皮细胞和微生物Faecalibaculum rodentium | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无菌（GF）和不同常规微生物群组成的十二指肠上皮细胞样本 |
| 2011 | 2024-08-08 |
Human tau mutations in cerebral organoids induce a progressive dyshomeostasis of cholesterol
2022-09-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.07.011
PMID:35985329
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析携带V337M和R406W tau突变的人脑类器官（hCOs），发现胆固醇生物合成途径在星形胶质细胞中显著上调，表明胆固醇稳态失调可能是tau突变导致神经退行性变的早期事件 | 首次在携带tau突变的人脑类器官中揭示了胆固醇生物合成途径的早期变化，并证实了胆固醇稳态失调在tau突变相关神经退行性变中的作用 | NA | 探究tau突变在人脑类器官中引起的早期分子途径变化 | 携带V337M和R406W tau突变的人脑类器官 | 数字病理学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及携带V337M和R406W tau突变的人脑类器官及同基因对照组 |
| 2012 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the nuclear decoy lincRNA PIRAT as a regulator of systemic monocyte immunity during COVID-19
2022-09-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2120680119
PMID:35998224
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了在COVID-19期间，长非编码RNA PIRAT作为单核细胞中PU.1的主要反馈调节因子，调控警报素S100A8/A9的产生，这是COVID-19发病机制的关键驱动因素。 | 首次揭示了PIRAT作为核诱饵RNA，通过阻止PU.1与警报素启动子结合并促进其在幼稚单核细胞中与假基因结合，从而在COVID-19中发挥重要作用。 | NA | 研究长非编码RNA在SARS-CoV-2感染期间的系统免疫反应中的作用。 | 单核细胞中的长非编码RNA PIRAT及其在COVID-19中的作用。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2013 | 2024-08-08 |
The heterogeneous immune landscape between lung adenocarcinoma and squamous carcinoma revealed by single-cell RNA sequencing
2022-08-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01130-8
PMID:36008393
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肺腺癌和鳞状细胞癌之间的异质性免疫景观 | 发现了新的淋巴细胞相关巨噬细胞集群SELENOP-Mφ，并证实其在两种癌症类型中的抗肿瘤作用 | NA | 深入分析非小细胞肺癌患者的免疫景观，以指导免疫治疗策略的选择和临床反应的预测 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 72,475个免疫细胞来自19名非小细胞肺癌患者的40个肿瘤和匹配的正常组织样本 |
| 2014 | 2024-08-08 |
Human alveolar progenitors generate dual lineage bronchioalveolar organoids
2022-08-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03828-5
PMID:36008580
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析成人肺部HTII-280/EpCAM群体，揭示了富集成人干细胞签名基因的亚群，并发现肺泡祖细胞在体外器官培养中表现出谱系可塑性，能够产生肺泡或支气管细胞类型的后代。 | 本研究首次展示了肺泡祖细胞在体外器官培养中的谱系可塑性，并揭示了Wnt通路独立调控肺泡分化的机制。 | NA | 旨在阐明肺泡上皮更新的机制，并研究肺泡祖细胞的特性。 | 成人肺部的肺泡祖细胞及其在体外器官培养中的分化能力。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成人肺部的HTII-280/EpCAM群体 |
| 2015 | 2024-08-08 |
scRNA-seq of gastric tumor shows complex intercellular interaction with an alternative T cell exhaustion trajectory
2022-08-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32627-z
PMID:35999201
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌中的肿瘤微环境，揭示了肿瘤相关基质细胞和免疫细胞的复杂相互作用及T细胞耗竭的替代途径 | 首次展示了胃癌中肿瘤相关基质细胞与免疫细胞的相互作用，并发现了一种新的T细胞耗竭途径 | NA | 探究胃癌肿瘤微环境的特定特征及其对肿瘤控制的影响 | 胃癌患者的肿瘤组织、配对肿瘤旁组织及血液中的细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 10名胃癌患者的166,533个细胞 |
| 2016 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell RNA-seq and DNA methylation reveal the effects of air pollution in patients with recurrent spontaneous abortion
2022-08-23, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-022-01327-2
PMID:35999615
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和DNA甲基化数据，探讨了空气污染对复发性自然流产患者的影响及其分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和DNA甲基化数据，揭示了空气污染通过影响IGF2BP1启动子甲基化水平导致妊娠丢失的机制 | NA | 旨在理解复发性自然流产的机制及其与空气污染暴露的关系 | 复发性自然流产患者的蜕膜组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、简化代表性重亚硫酸盐测序（RRBS） | 逻辑回归模型 | RNA-seq数据、甲基化数据 | 涉及复发性自然流产患者和人工流产个体的蜕膜组织数据 |
| 2017 | 2024-08-08 |
Disease-associated oligodendrocyte responses across neurodegenerative diseases
2022-08-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111189
PMID:36001972
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了阿尔茨海默病和多发性硬化症的小鼠模型中少突胶质细胞的三种不同激活状态，并探讨了这些状态在疾病过程中的作用 | 首次识别出三种不同的少突胶质细胞激活状态，并揭示了这些状态在疾病过程中的空间分布和转录特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据相对有限，且未涉及其他神经退行性疾病 | 旨在理解少突胶质细胞在神经退行性疾病中的激活状态及其对疾病进程的影响 | 少突胶质细胞在阿尔茨海默病和多发性硬化症中的激活状态 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类单核RNA-seq数据集 |
| 2018 | 2024-08-08 |
Pituitary adenomas evade apoptosis via noxa deregulation in Cushing's disease
2022-08-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111223
PMID:36001971
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了27594个细胞，研究了库欣病（CD）垂体腺瘤的转录组特征，并发现了一种通过选择性蛋白酶体抑制来稳定noxa并诱导凋亡的治疗方法。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了CD腺瘤细胞中noxa的异常调控，并验证了选择性蛋白酶体抑制剂bortezomib作为抗肿瘤药物的潜力。 | 研究受限于缺乏体外模型和正常人类垂体腺的控制样本。 | 研究库欣病中垂体腺瘤逃避凋亡的机制，并探索潜在的治疗方法。 | 研究对象包括25名患者的垂体腺瘤及其邻近正常腺体细胞。 | 数字病理学 | 库欣病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 细胞 | 27594个细胞 |
| 2019 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics reveals cellular and molecular interactions governing the invasive niche of basal cell carcinoma
2022-08-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32670-w
PMID:35986012
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研究论文 | 本文通过结合单细胞和空间转录组学技术，研究了人类基底细胞癌的侵袭性微环境，定义了促进肿瘤进展的细胞贡献者 | 本文首次揭示了基底细胞癌侵袭性微环境中细胞间的相互作用及其转录重编程，展示了综合空间和单细胞多组学技术在解析癌症特异性侵袭特性及开发靶向疗法方面的潜力 | NA | 揭示基底细胞癌侵袭性微环境中的细胞和分子相互作用 | 人类基底细胞癌的侵袭性微环境 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2020 | 2024-08-08 |
HLJ1 amplifies endotoxin-induced sepsis severity by promoting IL-12 heterodimerization in macrophages
2022-08-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76094
PMID:35983991
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研究论文 | 研究探讨了HLJ1在调节内毒素诱导的脓毒症严重程度中的作用及其分子机制 | 首次揭示了HLJ1通过促进IL-12异二聚体的形成在脓毒症中的作用，并提出了针对HLJ1的治疗潜力 | NA | 研究HLJ1在调节内毒素诱导的脓毒症中的作用及其分子机制 | HLJ1在脓毒症中的作用及其对IL-12和IFN-γ的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用HLJ1敲除小鼠和LPS处理的小鼠进行实验 |