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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Microenvironmental Landscape of Human Melanoma Brain Metastases in Response to Immune Checkpoint Inhibition
2022-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0870
PMID:35706413
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体克隆分型，分析了黑色素瘤脑转移肿瘤微环境对免疫检查点抑制剂治疗的响应特征 | 首次系统解析黑色素瘤脑转移肿瘤微环境中髓系细胞表型异质性，特别是发现多种中性粒细胞状态及IL8表达群体与恶性细胞上皮间质转化的相关性，并揭示颅内T细胞表型、克隆型与免疫治疗响应的关联 | 样本量相对有限（32例新鲜黑色素瘤脑转移样本），需要更大规模队列验证；研究主要基于观察性关联分析，功能机制验证不足 | 解析黑色素瘤脑转移肿瘤微环境的独特组成，阐明其对免疫检查点抑制剂治疗的响应相关因素 | 黑色素瘤脑转移患者的肿瘤组织、匹配的外周血及颅外病灶 | 单细胞组学 | 黑色素瘤脑转移 | 单细胞RNA测序, T细胞受体克隆分型 | NA | 单细胞转录组数据, 文本 | 32例新鲜黑色素瘤脑转移样本及匹配的外周血和颅外病灶 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 2 | 2026-09-13 |
Protocol to dissociate, process, and analyze the human lung tissue using single-cell RNA-seq
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101776
PMID:36313536
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研究方法 | 本方案描述了从人体肺部样本中获取高质量单细胞转录组数据的实验流程，包括样本解离、活细胞分选和基于液滴的单细胞RNA测序及数据分析 | 提供了一套标准化的实验方案，涵盖多种临床样本类型（穿刺活检、细针抽吸、手术切除和胸腔积液），并整合了机械和酶解离、FACS活细胞富集以及液滴法scRNA-seq和数据分析的完整流程 | 摘要中未提及该方案的局限性 | 建立从人体肺部生物样本中获取高质量单细胞转录组数据的标准化实验和分析流程 | 人体肺部生物样本，包括穿刺活检、细针抽吸、手术切除和胸腔积液样本 | 单细胞组学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 3 | 2026-09-13 |
The Peripheral Immune Landscape in a Patient with Myocarditis after the Administration of BNT162b2 mRNA Vaccine
2022-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0031
PMID:35904026
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析外周血单个核细胞，描述了BNT162b2 mRNA疫苗接种后发生心肌炎患者的外周免疫图谱变化 | 首次描述了BNT162b2疫苗接种后心肌炎患者的外周免疫景观变化，发现单核细胞转录组改变最显著，且多个细胞簇中IL7R表达水平升高 | 仅研究了一例患者，样本量极小，无法代表所有BNT162b2疫苗接种后心肌炎患者 | 探索BNT162b2 mRNA疫苗接种后心肌炎的发病机制 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎的患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 文本 | 1例患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-08 |
CRISPRi screens in human iPSC-derived astrocytes elucidate regulators of distinct inflammatory reactive states
2022-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01180-9
PMID:36303069
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR干扰筛选技术结合单细胞转录组学，系统探究人诱导多能干细胞来源的星形胶质细胞中炎症反应状态的不同调控机制。 | 将CRISPR干扰筛选与单细胞转录组学相结合应用于人iPSC来源的星形胶质细胞，首次系统揭示了细胞因子诱导的炎症性星形胶质细胞反应中STAT3介导的两种不同炎症反应特征。 | 文中未提及明显的局限性。 | 系统研究星形胶质细胞炎症反应状态的分子机制，以指导开发选择性调节炎症反应的疗法。 | 人诱导多能干细胞来源的星形胶质细胞及小鼠神经炎症模型。 | 基因组学, 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病, 缺氧缺血性脑病 | CRISPR干扰筛选, 单细胞RNA测序 | CRISPR干扰筛选模型 | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量。 | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2026-09-07 |
scRNA-sequencing reveals subtype-specific transcriptomic perturbations in DRG neurons of PirtEGFPf mice in neuropathic pain condition
2022-10-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76063
PMID:36264609
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了神经病理性疼痛条件下DRG神经元的亚型特异性转录组扰动 | 首次利用PirtEGFPf小鼠高效纯化DRG神经元并进行scRNA-seq，发现CCI诱导的亚型特异性转录组变化及性别差异，并通过RNAscope和钙成像验证新靶基因功能 | 未提供具体局限性信息 | 探究神经病理性疼痛条件下DRG神经元亚型特异性的转录组变化及其功能意义 | 小鼠腰椎DRG神经元 | 基因组学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNAscope, 钙成像 | NA | 基因表达数据, 图像 | 未提供具体样本量信息 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 6 | 2026-09-07 |
Characterization of placental and decidual cell development in early pregnancy loss by single-cell RNA sequencing
2022-Oct-08, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00904-5
PMID:36209198
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征早期妊娠丢失中胎盘和蜕膜细胞的发育情况。 | 首次利用单细胞RNA测序对不同类型早期妊娠丢失（散发性和复发性）的绒毛和蜕膜细胞进行详细表征，并揭示了巨噬细胞在早期妊娠丢失中的免疫活性状态。 | 未提及具体的局限性。 | 研究早期妊娠丢失中胎盘-蜕膜界面损伤的发病机制。 | 不同类型早期妊娠丢失（散发性和复发性）和正常早期妊娠的绒毛和蜕膜组织。 | 单细胞测序 | 早期妊娠丢失 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-07 |
Ontogeny and Vulnerabilities of Drug-Tolerant Persisters in HER2+ Breast Cancer
2022-04-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1265
PMID:34911733
|
研究论文 | 本研究首次系统表征了HER2阳性乳腺癌中药物耐受持久性细胞的发育起源及其脆弱性，揭示了其通过随机循环进入“前DTP”状态并借助雌激素受体/SGK3通路实现耐药的机制 | 首次通过慢病毒条码和单细胞RNA测序揭示HER2阳性乳腺癌细胞会随机循环经过一种滞育/衰老相关的前DTP状态，并在此基础上分化出腔样或间质样DTP，同时发现腔样DTP通过雌激素受体依赖的SGK3诱导重编程PI3K/AKT/mTORC1通路实现AKT非依赖性mTORC1激活 | 研究主要基于体外细胞模型和临床样本相关性分析，缺乏体内动态追踪实验验证，且未探索前DTP状态的表观遗传调控机制 | 阐明HER2靶向治疗药物耐受持久性细胞的发育起源及其分子脆弱性 | HER2阳性乳腺癌细胞系及HER2+乳腺癌患者的肿瘤组织 | 癌症生物学与基因组学 | 乳腺癌 | 慢病毒条码、单细胞RNA测序、轨迹分析、细胞分选、生化实验 | 轨迹分析模型 | 单细胞转录组数据、蛋白表达数据 | 包含多个HER2阳性乳腺癌细胞系及若干HER2+患者肿瘤样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞转录组建库，采用Illumina NovaSeq平台测序 |
| 8 | 2024-08-08 |
Cytokine and Nitric Oxide-Dependent Gene Regulation in Islet Endocrine and Nonendocrine Cells
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab063
PMID:34927076
|
研究论文 | 本文探讨了细胞因子及一氧化氮在胰岛内分泌和非内分泌细胞中的基因调控作用 | 提出细胞因子信号在生理上有保护β细胞免受多种环境压力的作用，并通过单细胞RNA测序验证了这一假设 | NA | 研究细胞因子和一氧化氮在胰岛内分泌细胞中的保护作用及其机制 | 小鼠胰岛细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰岛细胞在18小时细胞因子暴露后的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2026-09-05 |
Single cell sequencing maps skeletal muscle cellular diversity as disease severity increases in dystrophic mouse models
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105415
PMID:36388984
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术绘制了肌营养不良小鼠模型中随着疾病严重程度增加而变化的骨骼肌细胞多样性图谱 | 首次系统性地描绘了从健康到严重肌营养不良状态下骨骼肌驻留细胞的异质性变化，并揭示了内皮细胞功能障碍与凝血风险随疾病严重程度增加的新发现 | 摘要中未提及明确的研究局限性 | 探索健康、肌营养不良及严重肌营养不良小鼠模型中骨骼肌驻留细胞群体的细胞异质性及其随疾病严重程度的变化 | 健康、肌营养不良及严重肌营养不良小鼠模型的骨骼肌组织驻留细胞 | 单细胞转录组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 摘要中未明确样本量，涉及健康、营养不良及严重营养不良小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-02 |
Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-09-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01382-4
PMID:36045343
|
研究论文 | 本文开发了结合蛋白质和转录组的单细胞RNA测序方法，用于人外周血单个核细胞（PBMCs）的研究，并展示了其在临床研究中的适用性。 | 首次将40种抗体与转录组单细胞测序结合，在PBMCs中实现更高分辨率的细胞亚群鉴定，优于传统流式细胞术、质谱流式或单独的单细胞RNA测序。 | 仅基于摘要，具体局限性未提及。 | 开发并验证结合蛋白质和转录组的单细胞RNA测序方法，用于PBMCs的临床研究，以评估疾病相关变化。 | 31名女性跨机构HIV研究参与者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 单细胞测序 | HIV感染及心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合蛋白质抗体标记 | Seurat UMAP和Louvain聚类 | 单细胞转录组和蛋白质数据 | 31名参与者，共41,611个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-08-28 |
A Case Series Exploration of Multi-Regional Expression Heterogeneity in Triple-Negative Breast Cancer Patients
2022-Nov-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113322
PMID:36362107
|
研究论文 | 本研究通过多区域RNA测序分析，探索了三阴性乳腺癌患者肿瘤内的基因表达异质性和影像衍生特征的差异 | 开发了一种新分析框架，区分患者间、患者区域间及患者内区域间的异质性，并使用贝叶斯变点分析分类区域变异性 | 样本量小（10名患者），未来需进一步研究区域异质性在治疗抵抗中的作用 | 评估三阴性乳腺癌中基因表达和影像衍生特征的多区域异质性 | 10名三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织标本 | 基因组学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | 贝叶斯变点分析 | 基因表达数据和影像特征数据 | 10名患者，每肿瘤2-4个区域 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-08-28 |
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205417119
PMID:36256820
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研究论文 | 本研究展示了一种抗原特异性双微粒系统可逆转小鼠晚期多发性硬化模型中的后肢瘫痪，通过减少中枢神经系统的免疫细胞浸润、脱髓鞘和炎症反应，并在单细胞水平上揭示了其作用机制 | 首次证明抗原特异性双微粒系统能在晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎中逆转瘫痪，且通过单细胞RNA测序揭示其对多种抗原呈递细胞MHC II通路的影响，并发现B细胞在治疗中的关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，需进一步验证其在人类中的安全性和有效性 | 开发一种抗原特异性疗法，用于逆转晚期多发性硬化的症状，同时避免系统性免疫抑制的副作用 | 患有晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎的小鼠，涉及免疫细胞如树突状细胞、巨噬细胞、B细胞和小胶质细胞 | 免疫学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠（具体数量未在标题和摘要中提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-08-27 |
Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01091-3
PMID:34764492
|
研究论文 | 提出Scissor方法，通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别与特定表型相关的细胞亚群。 | 首次将批量表达数据与单细胞数据结合，通过量化单细胞与批量样本的相似性并优化回归模型，直接关联细胞亚群与临床表型。 | 未提及具体局限性。 | 开发一种方法，从单细胞数据中识别与给定表型相关的细胞亚群。 | 肺癌、黑色素瘤、面肩肱型肌营养不良症和阿尔茨海默病的数据集。 | 生物信息学 | 肺癌, 黑色素瘤, 面肩肱型肌营养不良症, 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 回归模型 | 基因表达数据 | 多个数据集，具体样本量未提及。 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-08-25 |
Protocol for fast scRNA-seq raw data processing using scKB and non-arbitrary quality control with COPILOT
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101729
PMID:36181683
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研究论文 | 描述了一种利用scKB和COPILOT对单细胞RNA测序原始数据进行快速且非任意质量控制的分析协议 | 提出scKB作为kallisto和bustools的封装脚本，加速比对和转录本计数矩阵生成，比Cell Ranger更快；COPILOT通过比较低质量和高质量细胞分布实现非任意的背景噪声去除 | 未明确提及局限性 | 简化scRNA-seq数据处理流程，为新手用户提供易于入门的协议 | 单细胞RNA测序原始数据 | 生物信息学 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 15 | 2026-08-25 |
Comprehensive multi-omics single-cell data integration reveals greater heterogeneity in the human immune system
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105123
PMID:36185375
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研究论文 | 开发了一种名为SuPERR的新型多组学单细胞数据分析工作流程，用于整合转录组、蛋白质组和细胞受体库数据，以更准确地识别人类免疫系统中的异质细胞类型 | SuPERR通过整合细胞表面蛋白和免疫球蛋白转录计数信息，提高了聚类分辨率和准确性，能发现隐藏的细胞亚群，并有效去除双细胞和防止细胞类型错误分类 | 未提及 | 改进多组学单细胞数据集中多样细胞类型的识别和细胞类型分类的准确性 | 人类免疫系统中的多种免疫细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞受体库测序 | NA | 单细胞多组学数据（转录组、蛋白质组、细胞受体库） | 未提及 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-08-25 |
Decoding the transcriptome of calcified atherosclerotic plaque at single-cell resolution
2022-10-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04056-7
PMID:36224302
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和系统生物学方法，解析钙化动脉粥样硬化斑块中血管平滑肌细胞和内皮细胞的转录组，揭示解剖位置差异及细胞转分化的潜在驱动因子 | 首次在单细胞分辨率下对钙化动脉粥样硬化核心和邻近组织进行转录组比较，识别出新的细胞转分化候选驱动基因 | 仅基于有限样本的观察性研究，未进行功能验证 | 阐明动脉粥样硬化斑块中不同解剖区域的细胞转录特征，探索疾病进展的潜在机制 | 接受颈动脉内膜切除术患者的钙化动脉粥样硬化核心斑块和近端邻近颈动脉组织 | 单细胞转录组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多个患者（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-08-25 |
Single-cell analysis of immune cell transcriptome during HIV-1 infection and therapy
2022-09-29, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-022-00523-2
PMID:36175869
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析HIV-1感染及抗逆转录病毒治疗期间的免疫细胞转录组变化，揭示治疗未完全恢复的细胞功能障碍及潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上高分辨率描绘慢性HIV-1感染及ART治疗后免疫细胞转录组的持续性扰动，并鉴定表达HIV-1转录本的T细胞中的关键调控因子 | 摘要中未提及研究局限性，可能包括样本量有限或仅针对外周血细胞 | 理解HIV-1感染和ART期间免疫细胞景观的动态变化，以定义细胞功能障碍及其在治疗中的印记 | 慢性未治疗HIV-1个体、接受ART的HIV-1感染个体、HIV-1阴性个体，以及健康供者CD4+ T细胞的早期HIV-1感染原代细胞模型 | 单细胞转录组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性未治疗HIV-1个体、ART治疗HIV-1个体、HIV-1阴性个体（具体数量未提供）及健康供者CD4+ T细胞（用于原代感染模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-08-25 |
Multi-context genetic modeling of transcriptional regulation resolves novel disease loci
2022-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33212-0
PMID:36171194
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CONTENT的计算方法，利用跨环境的基因表达相关性结构，提高转录组关联研究（TWAS）的效力，并正确调整多重检验，从而发现新的疾病位点。 | CONTENT方法首次利用多环境表达研究中的个体内相关性，进行跨环境的错误发现率校正，并生成环境特异性和共享的基因表达成分，显著提高了遗传预测基因的数量和位点-表型关联的发现率。 | 本文未明确讨论CONTENT方法的局限性，但可能包括对单细胞数据噪声的敏感性或计算资源需求。 | 开发一种高效的计算方法，以改进TWAS分析，利用多环境表达数据的相关性结构，提高复杂性状相关基因和位点的发现能力。 | 研究对象为多组织bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集，以及22个复杂性状的关联分析。 | 机器学习 | 复杂性状疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了多组织bulk和单细胞RNA-seq数据集，具体样本数未在摘要中提及。 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-08-25 |
Skeletal Stem/Progenitor Cells in Periosteum and Skeletal Muscle Share a Common Molecular Response to Bone Injury
2022-08, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4616
PMID:35652423
|
研究论文 | 本研究揭示了骨膜和骨骼肌中的骨骼干/祖细胞（SSPCs）在骨损伤后共享一种共同的分子响应，由BMP信号介导，促进骨折修复中的软骨内成骨 | 首次通过单细胞RNA测序揭示骨膜细胞在稳态和骨折响应中的细胞异质性，并发现骨膜和骨骼肌SSPCs在骨折后共同经历从干/祖状态向纤维形成状态的转变，且该过程由BMP信号调控 | 摘要中未提及研究的局限性 | 探究骨膜和骨骼肌中的骨骼干/祖细胞在骨损伤后的分子响应及其在骨折修复中的作用机制 | 骨膜和骨骼肌中的骨骼干/祖细胞（SSPCs）以及骨髓基质细胞 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-08-25 |
IDEAS: individual level differential expression analysis for single-cell RNA-seq data
2022-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02605-1
PMID:35073995
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研究论文 | 提出一种针对单细胞RNA测序数据的个体水平差异表达分析方法IDEAS，用于比较两组个体间的基因表达差异 | 首提个体水平差异表达分析方法，通过汇总每个个体的基因表达分布来比较组间差异，适用于多个体单细胞RNA测序数据 | 未提及具体局限性 | 开发一种统计方法，以识别两组个体之间差异表达的基因 | 自闭症患者与对照组、轻症与重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 自闭症、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |