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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
A single-cell transcriptome of mesenchymal stromal cells to fabricate bioactive hydroxyapatite materials for bone regeneration
2022-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.009
PMID:34820571
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研究论文 | 利用单细胞转录组技术绘制间充质干细胞在不同成骨微环境中的转录图谱,揭示羟基磷灰石支架和成骨培养基的成骨机制 | 首次在单细胞分辨率下系统比较三维羟基磷灰石支架和成骨培养基对间充质干细胞的成骨调控机制,发现两种条件通过不同信号通路(如ZBTB16、WNT)驱动成骨,并揭示间充质干细胞亚群(LRRC75A、PCDH10)的功能异质性 | 未明确提及具体限制,但可能包括样本量有限或仅基于体外模型,未在体内验证 | 通过单细胞转录组解析间充质干细胞在生物活性羟基磷灰石材料中的成骨微环境,为骨再生材料优化提供数据库参考 | 间充质干细胞(MSCs)及其亚群(如LRRC75A、PCDH10) | 数字病理学 | 骨再生相关疾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-06-17 |
Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-09-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01382-4
PMID:36045343
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研究论文 | 开发了结合蛋白质(40种抗体)和转录本的单细胞RNA测序方法,应用于人外周血单核细胞 | 首次在PBMC中结合蛋白质和转录本进行单细胞RNA测序,提高了细胞亚群的分辨率,优于传统流式细胞术、质谱流式或仅转录本测序 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量较小(31名参与者)或技术复杂性 | 开发结合蛋白质和转录本的单细胞RNA测序方法,用于临床研究中外周血单核细胞的疾病相关变化评估 | 人外周血单核细胞(PBMCs),来自31名参与女性跨机构HIV研究(WIHS)的样本 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,蛋白质检测 | NA | 单细胞转录组和蛋白质数据 | 31名参与者,41,611个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3',结合40种抗体 |
| 3 | 2026-06-02 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
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研究论文 | 提供使用BASiCS Bioconductor包对单细胞RNA测序数据进行表达变异分析的逐步计算流程 | 集成框架同时处理数据标准化、技术噪声量化和下游分析,并通过概率决策规则识别细胞群间表达变异的变化,避免技术噪声和整体丰度差异的混淆效应 | 需要用户熟悉R语言和Bioconductor生态,且依赖Docker镜像确保可重复性,可能对非计算背景用户存在门槛 | 开发并指导用户使用BASiCS方法稳健量化单细胞RNA测序数据中的表达变异性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率模型 | 基因表达数据 | 使用公开数据集作为示例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-06-01 |
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205417119
PMID:36256820
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研究论文 | 开发一种抗原特异性双微颗粒系统,可逆转晚期多发性硬化症小鼠模型的后肢瘫痪 | 首次证明抗原特异性双微颗粒疗法能在临床晚期阶段逆转实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠的瘫痪,且不引起广泛免疫抑制 | 未明确说明局限性 | 评估抗原特异性双微颗粒系统在晚期多发性硬化症小鼠模型中的治疗效果及其免疫机制 | 患有晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎的小鼠 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用(小鼠样本,具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 5 | 2026-06-01 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
|
研究论文 | 优化分散胰岛细胞的冻存方法,并通过单细胞转录组分析验证其功能完整性 | 提出了一种优化的梯度冷冻方法,能够维持冻存后分散胰岛细胞的膜完整性、分子和功能表型,为糖尿病研究和细胞治疗提供了可靠细胞来源 | 未提及冻存过程中可能存在的细胞亚群偏好性损伤或长期稳定性数据 | 优化分散胰岛细胞的冻存技术,获得可用于单细胞转录组研究的活性细胞 | 分散的人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类胰岛细胞样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-31 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
|
研究论文 | 以猪、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞为对象,发现扰动血流激活JAG1-NOTCH4信号通路驱动动脉粥样硬化,并揭示内皮细胞异质性的调控机制 | 首次揭示Notch通路(JAG1-NOTCH4)在扰动血流感知中的功能,并阐明其通过调控内皮细胞异质性增强动脉粥样硬化易感性的机制 | 未明确说明,但从标题和摘要推断可能包括:研究主要集中在动物模型和体外培养细胞,人类动脉粥样硬化的直接证据有限 | 探究扰动血流如何通过Notch通路驱动动脉粥样硬化 | 猪动脉、小鼠动脉、培养的人冠状动脉内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、光片成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 猪动脉、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-05-28 |
Mechanical tension mobilizes Lgr6+ epidermal stem cells to drive skin growth
2022-04-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl8698
PMID:35476447
|
研究论文 | 使用受控组织扩张系统结合机器学习辅助三维重建和单细胞RNA测序,揭示机械张力通过Hippo通路激活Lgr6+表皮干细胞驱动小鼠皮肤生长的细胞与分子机制 | 首次在哺乳动物中系统揭示机械张力通过优先激活Lgr6+表皮干细胞驱动皮肤生长的机制,并利用机器学习三维重建和单细胞RNA测序技术构建器官大小动态变化的平台 | 主要基于小鼠模型,在人体中的适用性需要进一步验证;部分机制如Hippo通路的具体作用细节尚待阐明 | 阐明成年哺乳动物皮肤显著尺寸变化的细胞与分子基础 | 小鼠皮肤组织及Lgr6+表皮干细胞 | 机器学习, 数字病理学 | NA | RNA-seq | CNN | 图像, 文本 | 小鼠皮肤样本,具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 8 | 2026-05-28 |
The landscape of human tissue and cell type specific expression and co-regulation of senescence genes
2022-01-09, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00507-7
PMID:35000600
|
研究论文 | 对人类组织及细胞类型中衰老基因的表达与共调控网络进行了系统分析 | 首次通过整合网络分析揭示健康人类组织中衰老基因的共表达模块和细胞类型特异性 | 主要依赖公开数据库,未进行实验验证;对衰老细胞在组织中的实际分布缺乏直接证据 | 阐明人类组织中衰老基因的共表达模式及其细胞类型特异性 | 健康人类组织中的衰老基因及其在不同细胞类型中的表达特征 | 机器学习和生物信息学 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 50个人体组织的GTEx队列数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-05-28 |
Caspases and therapeutic potential of caspase inhibitors in moderate-severe SARS-CoV-2 infection and long COVID
2022-01, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14907
PMID:33993490
|
研究论文 | 研究半胱天冬酶在中度至重症SARS-CoV-2感染及长新冠中的表达及其抑制剂的治疗潜力 | 首次在单细胞水平揭示COVID-19患者免疫细胞中半胱天冬酶的独特表达模式,并发现泛半胱天冬酶抑制剂可减轻长新冠患者CD4+ T细胞中caspase-1活性 | 初步结果需进一步临床相关性验证,样本量有限可能影响结论普适性 | 探索半胱天冬酶在COVID-19疾病谱中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | COVID-19急性期和恢复期患者血液细胞,以及伴有合并症的非COVID-19对照组 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | COVID-19患者及非COVID-19对照者血液样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于免疫细胞转录组分析 |
| 10 | 2026-05-27 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析、转录因子调控网络分析、高分辨率共聚焦显微镜及胰岛素分泌测量,揭示了人类胰岛β细胞在衰老过程中发生的分子和功能变化 | 首次通过跨人类生命周期的综合分析,揭示了衰老导致β细胞转录因子网络重组、内质网应激激活和胰岛素分泌功能减退的分子机制 | 研究基于非糖尿病供体样本,可能无法完全代表糖尿病患者的β细胞衰老特征 | 探究衰老对人类胰岛β细胞功能和特性的影响机制 | 人类非糖尿病供体的胰岛β细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、高分辨率共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 覆盖人类大部分生命周期的非糖尿病供体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-05-26 |
Mitochondrial variant enrichment from high-throughput single-cell RNA sequencing resolves clonal populations
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01210-8
PMID:35210612
|
研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序富集线粒体变异,解析克隆群体 | 结合常见3'单细胞RNA测序方案与线粒体转录组富集技术,将覆盖率提高50倍以上,实现高置信度突变检测 | NA | 建立可扩展且高灵敏度的线粒体DNA变异检测方法,以解析复杂组织中细胞克隆关系 | 原代人细胞(克隆造血中的免疫细胞) | 机器学习 | 克隆造血 | 单细胞RNA测序, 线粒体转录组富集 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 常见3'单细胞RNA测序方案 |
| 12 | 2026-05-26 |
Novel bi-allelic variants in KASH5 are associated with meiotic arrest and non-obstructive azoospermia
2022-06-30, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaac021
PMID:35674372
|
研究论文 | 本研究在非梗阻性无精子症患者中鉴定出KASH5基因的新型双等位变异,证实其与减数分裂阻滞和男性不育相关 | 首次在人类细胞中评估KASH5蛋白表达,并揭示LINC复合物在人类和小鼠中的保守调控机制 | 功能验证主要依赖小鼠模型,人类样本数量有限,具体分子机制尚需进一步研究 | 探究KASH5基因变异与非梗阻性无精子症和减数分裂阻滞的关联 | 非梗阻性无精子症患者及其不孕姐妹 | 机器学习 | 男性不育症 | 全外显子组测序、CNV芯片、单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据、单细胞转录组数据 | 1例先证者及其姐妹,以及Kash5基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-23 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dynamic control of metabolic zonation and liver regeneration by endothelial cell Wnt2 and Wnt9b
2022-10-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100754
PMID:36220068
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研究论文 | 利用单细胞空间转录组学揭示内皮细胞Wnt2和Wnt9b对肝脏代谢分区和再生的动态调控 | 首次明确证明内皮细胞来源的Wnt2和Wnt9b在肝脏分区与再生中的关键作用,并发现分区过程具有动态性,同时开发四价抗体激活剂为急性肝衰竭提供再生治疗新策略 | NA | 阐明调控肝脏分区和再生的Wnt信号具体来源及其机制 | 肝脏内皮细胞、肝细胞、小鼠模型及对乙酰氨基酚中毒急性肝衰竭模型 | 单细胞组学 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 14 | 2026-05-17 |
CoSpar identifies early cell fate biases from single-cell transcriptomic and lineage information
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01209-1
PMID:35190690
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研究论文 | CoSpar是一种利用单细胞转录组和谱系信息识别早期细胞命运偏向的鲁棒计算方法 | 通过相干稀疏优化(CoSpar)方法,在谱系数据严重降采样和分散的情况下仍能稳健推断细胞动态,并发现了先前未检测到的早期命运偏向预测因子 | 未提及具体限制 | 开发稳健计算方法从整合单细胞转录组与谱系跟踪的数据中推断细胞动态 | 造血、重编程和定向分化过程中的细胞动态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | 稀疏优化模型 | 单细胞转录组数据、谱系数据 | 造血、重编程和定向分化数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-05-17 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
|
研究报告 | 通过纵向分析一名重症COVID-19患者的血浆蛋白质组和外周血单细胞转录组,揭示了从重症到康复过程中的关键生物学变化 | 首次结合无偏倚血浆蛋白质组学和单细胞转录组学纵向追踪COVID-19患者从重症到完全康复的生物学动态,特别是发现了一类具有高度干扰素应答和降低TNF-α信号的单核细胞亚群在康复后消失 | 仅基于单一个案报告,样本量有限,结果需要更大规模研究验证 | 阐明COVID-19患者从重症到完全康复过程中的关键生物学动态 | 一名接受恢复期血浆输注的重症COVID-19患者 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 蛋白质组学和转录组学数据 | 1例重症COVID-19患者 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于外周血单细胞转录组分析 |
| 16 | 2026-05-16 |
Single cell RNA-seq analysis reveals temporally-regulated and quiescence-regulated gene expression in Drosophila larval neuroblasts
2022-08-24, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-022-00163-7
PMID:36002894
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析果蝇幼虫神经母细胞的基因表达,揭示时间调控和静止调控的特征 | 首次在多个发育时间点对果蝇幼虫中枢神经系统进行单细胞转录组分析,发现新的祖细胞亚型标记物,并鉴定出静止神经母细胞对胰岛素信号通路的转录预备状态 | 未提及具体局限性 | 探究果蝇幼虫神经系统发育中神经多样性的生成机制 | 果蝇幼虫中枢神经系统中的神经母细胞和中间祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育时间点的果蝇幼虫样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-16 |
Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine
2022-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002
PMID:35429619
|
研究论文 | 系统鉴定了地西他滨在体内诱导的全局基因组和转录组改变,包括全基因组亚硫酸氢盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序分析 | 首次系统描述了地西他滨在体内治疗过程中诱导的全局性、可逆性低甲基化及其相关转录组变化,并发现红系相关通路在治疗中受抑制而在复发时逆转 | 样本量有限且患者间变异大,限制了检测较小临床效应的统计效力 | 阐明地西他滨治疗骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者时引起的体内分子变化机制 | 接受地西他滨治疗的骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者的原代骨髓样本 | 机器学习和生物信息学 | 骨髓增生异常综合征, 急性髓系白血病 | 全基因组亚硫酸氢盐测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多名患者的原代骨髓样本 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序, 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-05-15 |
Molecular and anatomical characterization of parabrachial neurons and their axonal projections
2022-11-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81868
PMID:36317965
|
研究论文 | 对臂旁核神经元及其轴突投射进行分子和解剖学特征描述 | 通过单细胞RNA测序鉴定出臂旁核及其邻近区域的21个神经元亚群,并利用多重原位杂交和21种Cre驱动小鼠品系提供了详细的分子身份、空间位置和投射模式 | 未明确讨论研究局限性 | 揭示臂旁核神经元亚群的分子特征、空间分布和轴突投射模式 | 臂旁核及其邻近区域的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,多重原位杂交 | NA | 基因表达数据,图像 | 21种Cre驱动小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-12 |
Selectively Imaging Cranial Sensory Ganglion Neurons Using AAV-PHP.S
2022 May-Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0373-21.2022
PMID:35610024
|
研究论文 | 使用AAV-PHP.S选择性成像颅脑感觉神经节神经元 | 首次利用AAV-PHP.S载体实现对小鼠颅神经V、VII、IX、X感觉神经节神经元的高效转导和荧光标记,并结合功能成像揭示此前未记录的膝状神经节耳廓神经元的感官特性 | 研究主要基于小鼠模型,且转导效率约为66%,可能未覆盖全部神经元亚型 | 开发并验证AAV-PHP.S作为工具用于外周感觉神经元的解剖和功能映射 | 小鼠颅神经V、VII、IX、X感觉神经节的感觉神经元(包括躯体性和内脏性假单极神经元)以及卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | AAV介导的基因传递、荧光成像、光片显微镜、钙成像 | NA | 图像 | 小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | NA | AAV-PHP.S | AAV-PHP.S携带GFP或mScarlet荧光蛋白以及Cre依赖性报告基因 |
| 20 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA-seq of primary bone marrow neutrophils from female and male adult mice
2022-07-23, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01544-7
PMID:35871169
|
研究论文 | 使用单细胞RNA-seq技术对成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞进行转录组分析 | 首次对雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞进行单细胞分辨率转录组分析,克服了中性粒细胞RNA含量低的技术挑战 | 仅分析了小鼠模型,尚未涉及人类样本或更复杂的生理病理条件 | 研究哺乳动物免疫系统的性别二态性,特别是中性粒细胞在单细胞水平的转录组差异 | 成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 约2500个雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞(具体数量需参考原文) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |