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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-26 |
The Transcriptional Cell Atlas of Testis Development in Sheep at Pre-Sexual Maturity
2022-Jan-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb44020033
PMID:35723319
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研究论文 | 本研究使用10× Genomics Chromium单细胞RNA测序技术,对三只三个月大的公羊睾丸发育过程中的12,843个睾丸细胞进行了测序,并鉴定了多种细胞类型及其特定标记基因 | 首次在羊的睾丸发育过程中使用单细胞RNA测序技术,揭示了不同细胞类型及其在不同分化状态下的特定标记基因 | NA | 探索羊睾丸在性成熟前的发育过程及其细胞类型和分化状态 | 羊睾丸中的细胞类型及其在性成熟前的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12,843个睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-26 |
Basal-Like Cell-Conditioned Medium Exerts Anti-Fibrotic Effects In Vitro and In Vivo
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.844119
PMID:35350187
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研究论文 | 研究证实基底样细胞在特发性肺纤维化中的存在及其对纤维化的抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序和体外实验证实基底样细胞通过旁分泌机制抑制特发性肺纤维化中的纤维化过程 | NA | 验证基底样细胞在特发性肺纤维化中的存在及其对纤维化的影响 | 特发性肺纤维化中的基底样细胞及其对纤维化的影响 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及特发性肺纤维化患者的肺组织样本及受博来霉素损伤的实验鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-26 |
Exploring the Genomic Patterns in Human and Mouse Cerebellums Via Single-Cell Sequencing and Machine Learning Method
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.857851
PMID:35309141
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法探索人鼠小脑的基因组模式 | 使用基因表达谱作为特征,实现了对不同小脑细胞类型的高效分类,揭示了人鼠小脑基因组模式的显著差异 | NA | 识别人鼠小脑四种亚细胞类型之间的转录差异 | 人鼠小脑的四种亚细胞类型:Golgi、颗粒、中间神经元和单极刷细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 分类模型 | 基因表达数据 | 共使用了321,387个单细胞测序数据,包括四种细胞类型:Golgi(5,048个,1.57%)、颗粒(250,307个,77.88%)、中间神经元(60,526个,18.83%)和单极刷细胞(5,506个,1.72%) | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-25 |
Adaptation of the Oxygen Sensing System during Lung Development
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/9714669
PMID:35242281
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研究论文 | 研究了在肺发育过程中氧气感应系统的适应性及其目标,即缺氧诱导因子(HIF)调控基因(HRGs) | 通过整合qPCR、免疫印迹、杂交和单细胞RNA测序数据,详细描绘了氧气感应系统在肺发育中的变化 | 系统性缺氧或roxadustat治疗仅显示出HRGs的有限反应 | 理解肺发育从囊状到肺泡阶段的氧气感应系统组件的相互作用,以对抗与早产相关的疾病 | 肺发育中的氧气感应系统和HIF调控基因 | NA | 早产相关疾病 | qPCR、免疫印迹、杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-25 |
Insights Gained and Future Outlook From scRNAseq Studies in Autoimmune Rheumatic Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.849050
PMID:35251048
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNAseq)在自身免疫性风湿病研究中的主要发现,并展望了新兴的单细胞技术(如免疫组库测序和空间转录组学)在扩展对免疫和基质细胞行为的理解方面的潜力。 | scRNAseq作为一种强大的新工具,能够评估风湿病中的生物异质性和单个细胞功能,揭示了新的细胞群和关键分子特征。 | 目前scRNAseq在风湿病领域的应用尚未充分利用新兴的单细胞技术,如免疫组库测序和空间转录组学。 | 探讨scRNAseq在自身免疫性风湿病研究中的应用,并展望新兴单细胞技术在扩展对免疫和基质细胞行为理解方面的潜力。 | 自身免疫性风湿病及其相关细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-25 |
A Necroptosis-Related Prognostic Model of Uveal Melanoma Was Constructed by Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.847624
PMID:35242144
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和加权共表达网络分析,构建了一个与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型 | 首次通过单细胞测序和加权共表达网络分析,构建了与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型,并通过细胞实验验证了模型中关键基因ITPA的作用 | NA | 研究坏死性凋亡在葡萄膜黑色素瘤中的临床意义,并构建预后模型 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其预后 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序分析,加权共表达网络分析 | COX回归,Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库的GSE139829数据集和TCGA数据进行分析,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-25 |
The Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Atherosclerotic Disease
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.826103
PMID:35211529
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化疾病研究中的应用 | 利用单细胞转录组学技术深入分析动脉粥样硬化斑块的细胞组成,提供更精细的信息 | NA | 探讨单细胞转录组学如何影响我们对动脉粥样硬化的当前理解 | 动脉粥样硬化斑块的细胞组成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-23 |
New horizons in the stormy sea of multimodal single-cell data integration
2022-01-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2021.12.012
PMID:35063095
|
综述 | 本文综述了多模态单细胞数据整合的生物信息学挑战和实验设计挑战 | 探讨了整合多模态单细胞数据以识别高度特异的细胞亚群和推断因果生物机制的新方法 | NA | 设计、执行和分析多模态单细胞实验,以学习新的因果和机制生物学 | 多模态单细胞数据整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 多模态数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-23 |
Single-cell sequencing reveals lineage-specific dynamic genetic regulation of gene expression during human cardiomyocyte differentiation
2022-01, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009666
PMID:35061661
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了从诱导多能干细胞到心肌细胞分化过程中基因表达的动态遗传调控 | 本研究采用灵活的方法来映射动态eQTL,这些eQTL的效果在分叉分化轨迹的过程中显著变化,并且特定于某一谱系 | NA | 揭示人类心肌细胞分化过程中基因表达的谱系特异性动态遗传调控 | 从诱导多能干细胞到心肌细胞的分化过程中的基因调控变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 19个人类细胞系,在7个独特的时间点采样 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-23 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.908815
PMID:35844519
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性心肌梗死患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次揭示了在斑块破裂和非破裂情况下,不同免疫细胞亚群在急性心肌梗死中的具体作用 | 样本量较小,仅包括10名患者 | 探讨急性心肌梗死患者中斑块破裂与非破裂情况下循环免疫细胞的差异 | 急性心肌梗死患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名急性心肌梗死患者 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-23 |
RNA-Seq of Single Fish Cells - Seeking Out the Leukocytes Mediating Immunity in Teleost Fishes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798712
PMID:35140719
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统研究中的应用,特别是揭示白细胞亚群及其相互作用对整体免疫反应的贡献 | 单细胞RNA测序技术揭示了白细胞群体的意外可塑性和异质性,改变了免疫学的几个长期范式 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统中的应用,揭示白细胞亚群的个体贡献及其相互作用 | 硬骨鱼类的白细胞及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个鱼细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-22 |
A matter of space and time: Emerging roles of disease-associated proteins in neural development
2022-01-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.10.035
PMID:34847355
|
研究论文 | 本文探讨了神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的新兴角色 | 新证据表明,这些蛋白质在未成熟细胞中具有新颖的、不同的作用,特别是在神经系统在产前发育中的组装过程中 | NA | 探讨神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的作用 | 神经发育障碍中的突触蛋白和离子通道 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-22 |
Challenges and Opportunities for the Translation of Single-Cell RNA Sequencing Technologies to Dermatology
2022-Jan-04, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12010067
PMID:35054460
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在皮肤生物学领域的最新进展,特别关注皮肤病理学及其向临床的转化 | 本文总结了单细胞分析的优势和局限性,有助于将这些新技术的新见解转化为临床应用 | 目前这些新技术的临床转化尚不足 | 总结单细胞RNA测序技术在皮肤生物学中的应用现状,并探讨其向临床转化的挑战与机遇 | 人类皮肤细胞类型及其在稳态和多种皮肤病中的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 大量 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-22 |
A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15
2022-01-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210420
PMID:34846534
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研究论文 | 本文研究了肌肉再生过程中,一种表达生长因子的巨噬细胞亚群通过GDF-15调控再生性炎症的机制 | 首次揭示了GDF-15在肌肉再生中的作用及其调控机制,并识别出一种新的巨噬细胞亚群——生长因子表达巨噬细胞(GFEMs) | NA | 探讨肌肉再生过程中巨噬细胞亚群的特化及其在再生性炎症中的作用 | 肌肉再生过程中的巨噬细胞及其表达的GDF-15 | NA | NA | 基因表达动力学聚类分析,免疫单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 受伤肌肉中分离的Ly6Chigh和Ly6Clow巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-21 |
Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell levels
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab878
PMID:34591957
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research paper | 本文介绍了一个名为Gene Expression Nebulas(GEN)的综合数据门户,该门户整合了多个物种在批量和单细胞层面的转录组数据 | GEN通过使用标准化的数据处理流程和结构化的管理模型,收集了高质量的批量和单细胞RNA测序数据集 | NA | 旨在提供一个全面的转录组数据集,以更好地理解从组织到细胞的遗传调控结构和功能机制 | 多个物种的转录组数据 | NA | NA | RNA sequencing | NA | transcriptomic profiles | 50,500个样本和15,540,169个细胞,涵盖30个物种 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing to characterize the response of pancreatic cancer to anti-PD-1 immunotherapy
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101262
PMID:34768100
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研究论文 | 本研究通过建立四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术分析了αPD-1抗体治疗对胰腺癌的响应,揭示了肿瘤微环境中免疫细胞的差异及其与免疫治疗响应的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制,特别是肿瘤相关巨噬细胞与效应CD8 T细胞的失衡对治疗响应的影响 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在临床样本中验证这些发现 | 探究胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制 | 胰腺癌及其对αPD-1免疫治疗的响应 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-09 |
Blocking LAIR1 signaling in immune cells inhibits tumor development
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.996026
PMID:36211388
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研究论文 | 本文研究了通过阻断免疫细胞中的LAIR1信号来抑制肿瘤发展的效果 | 开发了特异性的拮抗性抗LAIR1单克隆抗体,并研究了其在癌症治疗中的免疫激活作用 | NA | 探索新的癌症免疫学分子靶点和治疗策略 | 免疫细胞中的LAIR1信号阻断对肿瘤发展的影响 | 癌症免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了同源人类LAIR1转基因小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-07 |
The human myocardium harbors a population of naive B-cells with a distinctive gene expression signature conserved across species
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.973211
PMID:36248879
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研究论文 | 本文通过免疫组织化学染色和单细胞测序技术,研究了人类心肌中的B细胞数量、分布及其基因表达特征,并与小鼠数据进行了比较 | 首次详细描述了人类心肌中B细胞的分布和基因表达特征,并发现这些特征在不同物种间具有保守性 | 研究主要基于公开数据集和少量心脏辅助设备接受者的样本,可能需要更多临床样本以验证结果 | 探讨人类心肌中B细胞的生物学特性及其在心脏疾病治疗中的潜在应用 | 人类心肌中的B细胞及其基因表达特征 | 免疫学 | 心脏疾病 | 免疫组织化学染色,单细胞测序 | NA | 组织样本,基因表达数据 | 分析了健康人类心脏样本中的B细胞与T细胞比例,以及心脏辅助设备接受者的心脏和外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-05 |
Perspectives on Bulk-Tissue RNA Sequencing and Single-Cell RNA Sequencing for Cardiac Transcriptomics
2022, Frontiers in molecular medicine
DOI:10.3389/fmmed.2022.839338
PMID:39086967
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评论 | 本文探讨了心脏转录组学中对大规模组织RNA测序和单细胞RNA测序的看法 | 提出了单细胞测序在心脏功能和衰竭研究中的应用潜力 | 尚未完全理解心脏内细胞类型之间的复杂相互作用 | 旨在为使用NGS技术进行转录组研究的研究人员提供入门指南 | 关注心脏在功能和衰竭中的遗传和转录组贡献 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 下一代测序 (NGS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-05 |
A neural network-based method for exhaustive cell label assignment using single cell RNA-seq data
2022-Jan-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04473-4
PMID:35042860
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研究论文 | 本文开发了一种基于神经网络的方法NeuCA,用于使用单细胞RNA-seq数据进行细胞注释。 | 该方法利用细胞类型的层次结构信息来提高注释准确性,特别是对于相似细胞类型的数据。 | 该方法可能对未知细胞类型仍然标记为未分配,特别是在无法预期未知细胞类型的情况下。 | 本文旨在提高单细胞RNA测序数据的细胞注释准确性。 | 研究对象为单细胞RNA测序数据,特别是来自已研究组织的数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA-seq数据 | 应用于八个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |