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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-28 |
Foam Cells in Atherosclerosis: Novel Insights Into Its Origins, Consequences, and Molecular Mechanisms
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.845942
PMID:35498045
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综述 | 本文综述了泡沫细胞在动脉粥样硬化中的起源、后果及分子机制的新见解 | 采用谱系追踪和单细胞RNA测序(scRNA-seq)等新技术,揭示了来自单核细胞和血管平滑肌细胞(VSMC)的泡沫细胞亚型,并发现了核受体、非编码RNA和肠道微生物群等新机制 | 单核细胞的异质性和非编码RNA的复杂性为靶向泡沫细胞带来了挑战 | 总结泡沫细胞在动脉粥样硬化斑块中的起源、后果和分子机制的新见解 | 泡沫细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-28 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Inter-Tumor Heterogeneity in Bilateral Papillary Thyroid Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.840811
PMID:35515000
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了双侧乳头状甲状腺癌中的肿瘤间异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了双侧乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境,揭示了其细胞组成和表型特征 | 研究样本量相对较小,且仅限于特定的甲状腺癌类型 | 探究双侧乳头状甲状腺癌肿瘤微环境中的细胞组成和表型特征 | 双侧乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,561个细胞来自3对双侧乳头状甲状腺癌和1个非肿瘤甲状腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-27 |
Single-Cell RNA Sequencing of Urinary Cells Reveals Distinct Cellular Diversity in COVID-19-Associated AKI
2022-01-27, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0005522021
PMID:35368565
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞,揭示了其细胞多样性和基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术非侵入性地研究COVID-19相关急性肾损伤的细胞变化,并提供了尿液膀胱细胞直接被SARS-CoV-2感染的初步证据 | 样本量较小,且仅包括住院患者 | 探究COVID-19相关急性肾损伤在尿液细胞中的表现和机制 | COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共分析了30,076个细胞,来自8名COVID-19患者和4名非COVID-19急性肾损伤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-27 |
Loss of Function of the Neural Cell Adhesion Molecule NrCAM Regulates Differentiation, Proliferation and Neurogenesis in Early Postnatal Hypothalamic Tanycytes
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.832961
PMID:35464310
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研究论文 | 本文研究了神经细胞粘附分子NrCAM在早期新生小鼠下丘脑tanycytes中的功能丧失对分化、增殖和神经发生的影响 | 首次提供了NrCAM在成年小鼠tanycytes中调控作用的证据,并使用单细胞RNA测序技术揭示了tanycyte特异性基因表达的变化 | NrCAM缺陷小鼠中观察到的tanycyte减少和标记物丢失仅与轻微的代谢表型相关,可能需要进一步研究以揭示更深层次的影响 | 探讨NrCAM在tanycytes中的功能及其对细胞稳态的调控作用 | 下丘脑tanycytes及NrCAM的功能 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学分析、杂交分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠及E16胚胎小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-27 |
Analysis of Half a Billion Datapoints Across Ten Machine-Learning Algorithms Identifies Key Elements Associated With Insulin Transcription in Human Pancreatic Islet Cells
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.853863
PMID:35399953
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研究论文 | 本研究通过分析超过4.9亿个数据点,比较了10种不同的机器学习工作流程,以识别与人类胰腺单细胞转录组中胰岛素转录相关基因 | 本研究首次在大规模数据集上比较了多种机器学习算法,特别是随机森林算法显示出高预测能力和敏感性 | NA | 比较不同机器学习工作流程在大数据分析中的表现,并识别与胰岛素转录相关的关键元素 | 人类胰腺单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 机器学习 | 随机森林 | 转录组数据 | 训练数据集包含11,652个样本,验证数据集包含2,913个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-26 |
The Transcriptional Cell Atlas of Testis Development in Sheep at Pre-Sexual Maturity
2022-Jan-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb44020033
PMID:35723319
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研究论文 | 本研究使用10× Genomics Chromium单细胞RNA测序技术,对三只三个月大的公羊睾丸发育过程中的12,843个睾丸细胞进行了测序,并鉴定了多种细胞类型及其特定标记基因 | 首次在羊的睾丸发育过程中使用单细胞RNA测序技术,揭示了不同细胞类型及其在不同分化状态下的特定标记基因 | NA | 探索羊睾丸在性成熟前的发育过程及其细胞类型和分化状态 | 羊睾丸中的细胞类型及其在性成熟前的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12,843个睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-26 |
Basal-Like Cell-Conditioned Medium Exerts Anti-Fibrotic Effects In Vitro and In Vivo
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.844119
PMID:35350187
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研究论文 | 研究证实基底样细胞在特发性肺纤维化中的存在及其对纤维化的抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序和体外实验证实基底样细胞通过旁分泌机制抑制特发性肺纤维化中的纤维化过程 | NA | 验证基底样细胞在特发性肺纤维化中的存在及其对纤维化的影响 | 特发性肺纤维化中的基底样细胞及其对纤维化的影响 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及特发性肺纤维化患者的肺组织样本及受博来霉素损伤的实验鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-26 |
Exploring the Genomic Patterns in Human and Mouse Cerebellums Via Single-Cell Sequencing and Machine Learning Method
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.857851
PMID:35309141
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法探索人鼠小脑的基因组模式 | 使用基因表达谱作为特征,实现了对不同小脑细胞类型的高效分类,揭示了人鼠小脑基因组模式的显著差异 | NA | 识别人鼠小脑四种亚细胞类型之间的转录差异 | 人鼠小脑的四种亚细胞类型:Golgi、颗粒、中间神经元和单极刷细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 分类模型 | 基因表达数据 | 共使用了321,387个单细胞测序数据,包括四种细胞类型:Golgi(5,048个,1.57%)、颗粒(250,307个,77.88%)、中间神经元(60,526个,18.83%)和单极刷细胞(5,506个,1.72%) | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-25 |
Adaptation of the Oxygen Sensing System during Lung Development
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/9714669
PMID:35242281
|
研究论文 | 研究了在肺发育过程中氧气感应系统的适应性及其目标,即缺氧诱导因子(HIF)调控基因(HRGs) | 通过整合qPCR、免疫印迹、杂交和单细胞RNA测序数据,详细描绘了氧气感应系统在肺发育中的变化 | 系统性缺氧或roxadustat治疗仅显示出HRGs的有限反应 | 理解肺发育从囊状到肺泡阶段的氧气感应系统组件的相互作用,以对抗与早产相关的疾病 | 肺发育中的氧气感应系统和HIF调控基因 | NA | 早产相关疾病 | qPCR、免疫印迹、杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-25 |
Insights Gained and Future Outlook From scRNAseq Studies in Autoimmune Rheumatic Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.849050
PMID:35251048
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNAseq)在自身免疫性风湿病研究中的主要发现,并展望了新兴的单细胞技术(如免疫组库测序和空间转录组学)在扩展对免疫和基质细胞行为的理解方面的潜力。 | scRNAseq作为一种强大的新工具,能够评估风湿病中的生物异质性和单个细胞功能,揭示了新的细胞群和关键分子特征。 | 目前scRNAseq在风湿病领域的应用尚未充分利用新兴的单细胞技术,如免疫组库测序和空间转录组学。 | 探讨scRNAseq在自身免疫性风湿病研究中的应用,并展望新兴单细胞技术在扩展对免疫和基质细胞行为理解方面的潜力。 | 自身免疫性风湿病及其相关细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-25 |
A Necroptosis-Related Prognostic Model of Uveal Melanoma Was Constructed by Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.847624
PMID:35242144
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和加权共表达网络分析,构建了一个与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型 | 首次通过单细胞测序和加权共表达网络分析,构建了与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型,并通过细胞实验验证了模型中关键基因ITPA的作用 | NA | 研究坏死性凋亡在葡萄膜黑色素瘤中的临床意义,并构建预后模型 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其预后 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序分析,加权共表达网络分析 | COX回归,Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库的GSE139829数据集和TCGA数据进行分析,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-25 |
The Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Atherosclerotic Disease
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.826103
PMID:35211529
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化疾病研究中的应用 | 利用单细胞转录组学技术深入分析动脉粥样硬化斑块的细胞组成,提供更精细的信息 | NA | 探讨单细胞转录组学如何影响我们对动脉粥样硬化的当前理解 | 动脉粥样硬化斑块的细胞组成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-23 |
New horizons in the stormy sea of multimodal single-cell data integration
2022-01-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2021.12.012
PMID:35063095
|
综述 | 本文综述了多模态单细胞数据整合的生物信息学挑战和实验设计挑战 | 探讨了整合多模态单细胞数据以识别高度特异的细胞亚群和推断因果生物机制的新方法 | NA | 设计、执行和分析多模态单细胞实验,以学习新的因果和机制生物学 | 多模态单细胞数据整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 多模态数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-23 |
Single-cell sequencing reveals lineage-specific dynamic genetic regulation of gene expression during human cardiomyocyte differentiation
2022-01, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009666
PMID:35061661
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了从诱导多能干细胞到心肌细胞分化过程中基因表达的动态遗传调控 | 本研究采用灵活的方法来映射动态eQTL,这些eQTL的效果在分叉分化轨迹的过程中显著变化,并且特定于某一谱系 | NA | 揭示人类心肌细胞分化过程中基因表达的谱系特异性动态遗传调控 | 从诱导多能干细胞到心肌细胞的分化过程中的基因调控变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 19个人类细胞系,在7个独特的时间点采样 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-23 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.908815
PMID:35844519
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性心肌梗死患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次揭示了在斑块破裂和非破裂情况下,不同免疫细胞亚群在急性心肌梗死中的具体作用 | 样本量较小,仅包括10名患者 | 探讨急性心肌梗死患者中斑块破裂与非破裂情况下循环免疫细胞的差异 | 急性心肌梗死患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名急性心肌梗死患者 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-23 |
RNA-Seq of Single Fish Cells - Seeking Out the Leukocytes Mediating Immunity in Teleost Fishes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798712
PMID:35140719
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统研究中的应用,特别是揭示白细胞亚群及其相互作用对整体免疫反应的贡献 | 单细胞RNA测序技术揭示了白细胞群体的意外可塑性和异质性,改变了免疫学的几个长期范式 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统中的应用,揭示白细胞亚群的个体贡献及其相互作用 | 硬骨鱼类的白细胞及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个鱼细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-22 |
A matter of space and time: Emerging roles of disease-associated proteins in neural development
2022-01-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.10.035
PMID:34847355
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研究论文 | 本文探讨了神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的新兴角色 | 新证据表明,这些蛋白质在未成熟细胞中具有新颖的、不同的作用,特别是在神经系统在产前发育中的组装过程中 | NA | 探讨神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的作用 | 神经发育障碍中的突触蛋白和离子通道 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-22 |
Challenges and Opportunities for the Translation of Single-Cell RNA Sequencing Technologies to Dermatology
2022-Jan-04, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12010067
PMID:35054460
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在皮肤生物学领域的最新进展,特别关注皮肤病理学及其向临床的转化 | 本文总结了单细胞分析的优势和局限性,有助于将这些新技术的新见解转化为临床应用 | 目前这些新技术的临床转化尚不足 | 总结单细胞RNA测序技术在皮肤生物学中的应用现状,并探讨其向临床转化的挑战与机遇 | 人类皮肤细胞类型及其在稳态和多种皮肤病中的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 大量 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-22 |
A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15
2022-01-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210420
PMID:34846534
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研究论文 | 本文研究了肌肉再生过程中,一种表达生长因子的巨噬细胞亚群通过GDF-15调控再生性炎症的机制 | 首次揭示了GDF-15在肌肉再生中的作用及其调控机制,并识别出一种新的巨噬细胞亚群——生长因子表达巨噬细胞(GFEMs) | NA | 探讨肌肉再生过程中巨噬细胞亚群的特化及其在再生性炎症中的作用 | 肌肉再生过程中的巨噬细胞及其表达的GDF-15 | NA | NA | 基因表达动力学聚类分析,免疫单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 受伤肌肉中分离的Ly6Chigh和Ly6Clow巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-21 |
Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell levels
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab878
PMID:34591957
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research paper | 本文介绍了一个名为Gene Expression Nebulas(GEN)的综合数据门户,该门户整合了多个物种在批量和单细胞层面的转录组数据 | GEN通过使用标准化的数据处理流程和结构化的管理模型,收集了高质量的批量和单细胞RNA测序数据集 | NA | 旨在提供一个全面的转录组数据集,以更好地理解从组织到细胞的遗传调控结构和功能机制 | 多个物种的转录组数据 | NA | NA | RNA sequencing | NA | transcriptomic profiles | 50,500个样本和15,540,169个细胞,涵盖30个物种 | NA | NA | NA | NA |