单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-25 |
The Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Atherosclerotic Disease
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.826103
PMID:35211529
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化疾病研究中的应用 | 利用单细胞转录组学技术深入分析动脉粥样硬化斑块的细胞组成，提供更精细的信息 | NA | 探讨单细胞转录组学如何影响我们对动脉粥样硬化的当前理解 | 动脉粥样硬化斑块的细胞组成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 102 | 2024-08-23 |
New horizons in the stormy sea of multimodal single-cell data integration
2022-01-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2021.12.012
PMID:35063095
|
综述 | 本文综述了多模态单细胞数据整合的生物信息学挑战和实验设计挑战 | 探讨了整合多模态单细胞数据以识别高度特异的细胞亚群和推断因果生物机制的新方法 | NA | 设计、执行和分析多模态单细胞实验，以学习新的因果和机制生物学 | 多模态单细胞数据整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 多模态数据 | NA |
| 103 | 2024-08-23 |
Single-cell sequencing reveals lineage-specific dynamic genetic regulation of gene expression during human cardiomyocyte differentiation
2022-01, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009666
PMID:35061661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了从诱导多能干细胞到心肌细胞分化过程中基因表达的动态遗传调控 | 本研究采用灵活的方法来映射动态eQTL，这些eQTL的效果在分叉分化轨迹的过程中显著变化，并且特定于某一谱系 | NA | 揭示人类心肌细胞分化过程中基因表达的谱系特异性动态遗传调控 | 从诱导多能干细胞到心肌细胞的分化过程中的基因调控变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 19个人类细胞系，在7个独特的时间点采样 |
| 104 | 2024-08-23 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.908815
PMID:35844519
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性心肌梗死患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次揭示了在斑块破裂和非破裂情况下，不同免疫细胞亚群在急性心肌梗死中的具体作用 | 样本量较小，仅包括10名患者 | 探讨急性心肌梗死患者中斑块破裂与非破裂情况下循环免疫细胞的差异 | 急性心肌梗死患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名急性心肌梗死患者 |
| 105 | 2024-08-23 |
RNA-Seq of Single Fish Cells - Seeking Out the Leukocytes Mediating Immunity in Teleost Fishes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798712
PMID:35140719
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统研究中的应用，特别是揭示白细胞亚群及其相互作用对整体免疫反应的贡献 | 单细胞RNA测序技术揭示了白细胞群体的意外可塑性和异质性，改变了免疫学的几个长期范式 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统中的应用，揭示白细胞亚群的个体贡献及其相互作用 | 硬骨鱼类的白细胞及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个鱼细胞 |
| 106 | 2024-08-22 |
A matter of space and time: Emerging roles of disease-associated proteins in neural development
2022-01-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.10.035
PMID:34847355
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研究论文 | 本文探讨了神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的新兴角色 | 新证据表明，这些蛋白质在未成熟细胞中具有新颖的、不同的作用，特别是在神经系统在产前发育中的组装过程中 | NA | 探讨神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的作用 | 神经发育障碍中的突触蛋白和离子通道 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-22 |
Challenges and Opportunities for the Translation of Single-Cell RNA Sequencing Technologies to Dermatology
2022-Jan-04, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12010067
PMID:35054460
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在皮肤生物学领域的最新进展，特别关注皮肤病理学及其向临床的转化 | 本文总结了单细胞分析的优势和局限性，有助于将这些新技术的新见解转化为临床应用 | 目前这些新技术的临床转化尚不足 | 总结单细胞RNA测序技术在皮肤生物学中的应用现状，并探讨其向临床转化的挑战与机遇 | 人类皮肤细胞类型及其在稳态和多种皮肤病中的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 大量 |
| 108 | 2024-08-22 |
A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15
2022-01-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210420
PMID:34846534
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研究论文 | 本文研究了肌肉再生过程中，一种表达生长因子的巨噬细胞亚群通过GDF-15调控再生性炎症的机制 | 首次揭示了GDF-15在肌肉再生中的作用及其调控机制，并识别出一种新的巨噬细胞亚群——生长因子表达巨噬细胞（GFEMs） | NA | 探讨肌肉再生过程中巨噬细胞亚群的特化及其在再生性炎症中的作用 | 肌肉再生过程中的巨噬细胞及其表达的GDF-15 | NA | NA | 基因表达动力学聚类分析，免疫单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 受伤肌肉中分离的Ly6Chigh和Ly6Clow巨噬细胞 |
| 109 | 2024-08-21 |
Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell levels
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab878
PMID:34591957
|
research paper | 本文介绍了一个名为Gene Expression Nebulas（GEN）的综合数据门户，该门户整合了多个物种在批量和单细胞层面的转录组数据 | GEN通过使用标准化的数据处理流程和结构化的管理模型，收集了高质量的批量和单细胞RNA测序数据集 | NA | 旨在提供一个全面的转录组数据集，以更好地理解从组织到细胞的遗传调控结构和功能机制 | 多个物种的转录组数据 | NA | NA | RNA sequencing | NA | transcriptomic profiles | 50,500个样本和15,540,169个细胞，涵盖30个物种 |
| 110 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing to characterize the response of pancreatic cancer to anti-PD-1 immunotherapy
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101262
PMID:34768100
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研究论文 | 本研究通过建立四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型，利用单细胞RNA测序技术分析了αPD-1抗体治疗对胰腺癌的响应，揭示了肿瘤微环境中免疫细胞的差异及其与免疫治疗响应的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制，特别是肿瘤相关巨噬细胞与效应CD8 T细胞的失衡对治疗响应的影响 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在临床样本中验证这些发现 | 探究胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制 | 胰腺癌及其对αPD-1免疫治疗的响应 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型 |
| 111 | 2024-08-11 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
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研究论文 | 本文介绍了一个使用BASiCS Bioconductor包的计算工作流程，用于稳健地量化单细胞RNA测序数据中的表达变异性 | BASiCS工作流程整合了数据标准化、技术噪声量化和下游分析的框架，能够在单一细胞群体中识别高度变异和低度变异的基因，并使用概率决策规则识别细胞群体间表达变异性的变化 | NA | 量化单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 112 | 2024-08-09 |
Blocking LAIR1 signaling in immune cells inhibits tumor development
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.996026
PMID:36211388
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研究论文 | 本文研究了通过阻断免疫细胞中的LAIR1信号来抑制肿瘤发展的效果 | 开发了特异性的拮抗性抗LAIR1单克隆抗体，并研究了其在癌症治疗中的免疫激活作用 | NA | 探索新的癌症免疫学分子靶点和治疗策略 | 免疫细胞中的LAIR1信号阻断对肿瘤发展的影响 | 癌症免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了同源人类LAIR1转基因小鼠模型 |
| 113 | 2024-08-07 |
The human myocardium harbors a population of naive B-cells with a distinctive gene expression signature conserved across species
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.973211
PMID:36248879
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研究论文 | 本文通过免疫组织化学染色和单细胞测序技术，研究了人类心肌中的B细胞数量、分布及其基因表达特征，并与小鼠数据进行了比较 | 首次详细描述了人类心肌中B细胞的分布和基因表达特征，并发现这些特征在不同物种间具有保守性 | 研究主要基于公开数据集和少量心脏辅助设备接受者的样本，可能需要更多临床样本以验证结果 | 探讨人类心肌中B细胞的生物学特性及其在心脏疾病治疗中的潜在应用 | 人类心肌中的B细胞及其基因表达特征 | 免疫学 | 心脏疾病 | 免疫组织化学染色，单细胞测序 | NA | 组织样本，基因表达数据 | 分析了健康人类心脏样本中的B细胞与T细胞比例，以及心脏辅助设备接受者的心脏和外周血样本 |
| 114 | 2024-08-05 |
Perspectives on Bulk-Tissue RNA Sequencing and Single-Cell RNA Sequencing for Cardiac Transcriptomics
2022, Frontiers in molecular medicine
DOI:10.3389/fmmed.2022.839338
PMID:39086967
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评论 | 本文探讨了心脏转录组学中对大规模组织RNA测序和单细胞RNA测序的看法 | 提出了单细胞测序在心脏功能和衰竭研究中的应用潜力 | 尚未完全理解心脏内细胞类型之间的复杂相互作用 | 旨在为使用NGS技术进行转录组研究的研究人员提供入门指南 | 关注心脏在功能和衰竭中的遗传和转录组贡献 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 下一代测序 (NGS) | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-05 |
A neural network-based method for exhaustive cell label assignment using single cell RNA-seq data
2022-Jan-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04473-4
PMID:35042860
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研究论文 | 本文开发了一种基于神经网络的方法NeuCA，用于使用单细胞RNA-seq数据进行细胞注释。 | 该方法利用细胞类型的层次结构信息来提高注释准确性，特别是对于相似细胞类型的数据。 | 该方法可能对未知细胞类型仍然标记为未分配，特别是在无法预期未知细胞类型的情况下。 | 本文旨在提高单细胞RNA测序数据的细胞注释准确性。 | 研究对象为单细胞RNA测序数据，特别是来自已研究组织的数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA-seq数据 | 应用于八个真实数据集 |
| 116 | 2024-08-05 |
InterCellar enables interactive analysis and exploration of cell-cell communication in single-cell transcriptomic data
2022-Jan-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02986-2
PMID:35017628
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研究论文 | InterCellar是一个互动平台，支持科学家分析和探索单细胞转录组数据中的细胞-细胞通信 | Strikingly, InterCellar使实验室科学家能够在无需编程技能的情况下分析和探索细胞-细胞通信 | 尽管InterCellar提供了便捷的分析功能，但其效果仍然依赖用户对生物学信号的理解 | 本研究旨在提供一个无编程需求的工具，帮助分析单细胞转录组数据中的细胞-细胞通信 | 主要研究COVID-19和黑色素瘤中的细胞-细胞交互 | 数字病理学 | COVID-19, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据驱动分析 | 分析了来自COVID-19和黑色素瘤的细胞-细胞交互数据 |
| 117 | 2024-08-05 |
Morphological characteristics and a single-cell analysis provide insights into function of immune and fat storage in the lamprey supraneural body
2022-Jan, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106131
PMID:34838690
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研究论文 | 本文探讨了灯盏细鱼上神经体的形态特征和单细胞分析，揭示了其在免疫和脂肪储存中的功能 | 首次利用单细胞转录组测序揭示上神经体中至少四种细胞类型及其独特的分子组成 | 对上神经体细胞的生理功能知之甚少，仍需深入研究 | 探究上神经体在免疫和脂肪储存中的生理功能 | 研究了上神经体中的白色脂肪细胞、粒细胞、淋巴细胞和红细胞等多种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 118 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell Transcriptomics With a High Throughput Functional Screening Assay to Resolve Cell Type, Growth Kinetics, and Stemness Heterogeneity Within the Comma-1D Cell Line
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.894597
PMID:36630696
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研究论文 | 本研究利用高通量单细胞测序与功能筛选，分析Comma-1D细胞系的细胞类型、生长动力学和干性异质性 | 首次集成高通量单细胞 assays 研究细胞系内的克隆异质性，并提出了一种新的自动化细胞识别平台 | 当前细胞分离方法在功能上存在显著局限性，影响了对细胞特性的深入理解 | 研究Comma-1D细胞系中的细胞异质性及其生长动力学特征 | Comma-1D小鼠细胞系以及其中的细胞亚群 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, 单细胞功能表型检测 | NA | 基因组数据 | 5,195个测序细胞 |
| 119 | 2024-08-05 |
AhR Activation Leads to Attenuation of Murine Autoimmune Hepatitis: Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Unique Immune Cell Phenotypes and Gene Expression Changes in the Liver
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.899609
PMID:35720411
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研究论文 | 本研究探讨了芳香烃受体（AhR）激活如何通过单细胞RNA测序分析减少小鼠自身免疫性肝炎中的免疫细胞炎症。 | 本文创新性地揭示了AhR激活导致小鼠自身免疫性肝炎中免疫细胞表型和基因表达的变化。 | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全反映人类的复杂免疫反应。 | 探讨AhR激活在小鼠自身免疫性肝炎中的作用机制。 | 小鼠模型及其肝脏中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 120 | 2024-08-05 |
BATF promotes group 2 innate lymphoid cell-mediated lung tissue protection during acute respiratory virus infection
2022-Jan-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abc9934
PMID:35030033
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研究论文 | 本文研究了BATF在急性呼吸病毒感染中促进第2类固有淋巴细胞介导的肺组织保护的作用 | 识别了转录上独特的ILC2亚群，并揭示BATF在控制ILC2细胞的增殖、功能及其可塑性中的重要机制 | ILC2在肺部的异质性及其在组织修复中的具体贡献机制仍不清楚 | 研究BATF在急性呼吸病毒感染中对ILC2的影响及其在组织修复中的作用 | 激活的第2类固有淋巴细胞（ILC2s） | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |