单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2024-08-08 |
Bottom-up proteomic analysis of human adult cardiac tissue and isolated cardiomyocytes
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.08.008
PMID:34437879
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研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻保存的人类心脏组织中分离心肌细胞的方法，并描述了用于自下而上蛋白质组分析的样品制备流程 | 首次描述了从冷冻保存的人类心脏组织中分离心肌细胞的方法，并提供了用于蛋白质组分析的样品制备流程 | NA | 促进未来针对人类心脏的细胞类型特异性分析 | 人类成年心脏组织和分离的心肌细胞 | 蛋白质组学 | NA | 自下而上蛋白质组分析 | NA | 蛋白质 | NA |
| 1142 | 2024-08-08 |
UBCH5 Family Members Differentially Impact Stabilization of Mutant p53 via RNF128 Iso1 During Barrett's Progression to Esophageal Adenocarcinoma
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.08.003
PMID:34416429
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研究论文 | 研究探讨了UBCH5家族成员在Barrett's食管进展至食管腺癌过程中通过RNF128 Iso1对突变型p53稳定性的不同影响。 | 发现UBE2D1（UBCH5A）和RNF128 Iso1在异常增生Barrett's食管和食管腺癌中形成不活跃的E2-E3复合体，稳定突变型p53，为治疗提供了新策略。 | NA | 研究突变型p53在Barrett's食管进展至食管腺癌中的稳定性及其调控机制。 | UBCH5家族成员、RNF128 Iso1、突变型p53。 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 配对的正常食管和Barrett's食管组织样本 |
| 1143 | 2024-08-08 |
Spatiotemporal Immune Landscape of Colorectal Cancer Liver Metastasis at Single-Cell Level
2022-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-0316
PMID:34417225
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，分析了结直肠癌肝转移的时空免疫景观，并开发了计算工具scMetabolism来量化单细胞代谢活性 | 首次揭示了结直肠癌肝转移微环境中M2样巨噬细胞的代谢活化状态，并探讨了新辅助化疗对此状态的影响 | NA | 描述结直肠癌肝转移的免疫演化过程，并揭示肿瘤如何响应新辅助化疗 | 结直肠癌肝转移的免疫微环境及M2样巨噬细胞的代谢活性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 97个匹配样本 |
| 1144 | 2024-08-08 |
Developmental Origins of Human Cortical Oligodendrocytes and Astrocytes
2022-Jan, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-021-00759-9
PMID:34374948
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研究论文 | 本文通过整合分析已发表的人类皮质单细胞RNA测序数据和免疫组织化学分析，揭示了人类皮质放射状胶质细胞在妊娠第18周左右产生基底多能中间前体细胞（bMIPCs），进而生成皮质少突胶质细胞、星形胶质细胞和嗅球GABA能中间神经元的过程 | 本文首次展示了人类皮质截短的放射状胶质细胞（tRGs）如何产生基底多能中间前体细胞（bMIPCs），并进一步生成皮质少突胶质细胞和星形胶质细胞 | NA | 揭示人类皮质放射状胶质细胞的谱系进展，这是发育中的人类大脑皮质的一个基本过程 | 人类皮质放射状胶质细胞及其产生的少突胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1145 | 2024-08-08 |
Regulatory mechanisms ensuring coordinated expression of functionally related genes
2022-01, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2021.07.008
PMID:34376301
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研究论文 | 本文探讨了生物体如何通过多种策略确保功能相关基因的协调表达 | 结合基因编辑工具和计算模型，研究了相邻基因对和集群的优势 | NA | 探讨不同协调表达策略在多种生物过程中的功能重要性 | 功能相关基因的协调表达机制 | NA | NA | 基因编辑 | 计算模型 | NA | NA |
| 1146 | 2024-08-08 |
SLUG-related partial epithelial-to-mesenchymal transition is a transcriptomic prognosticator of head and neck cancer survival
2022-01, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13075
PMID:34382739
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，开发了一种基于细胞类型依赖性反卷积的pEMT量化方法，用于预测头颈癌患者的生存率 | 首次提出pEMT-Singscores作为头颈癌的新风险预测指标，并发现SLUG转录因子在pEMT中的关键作用 | NA | 研究部分上皮-间质转化（pEMT）在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的预后价值 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的生存率和治疗反应 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 大型HNSCC队列，包括TCGA、MD Anderson癌症中心和Fred Hutchinson癌症研究中心的数据 |
| 1147 | 2024-08-08 |
Identification of HSC/MPP expansion units in fetal liver by single-cell spatiotemporal transcriptomics
2022-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00540-7
PMID:34341490
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研究论文 | 通过单细胞时空转录组学技术，研究了小鼠胎肝中造血干细胞和多能祖细胞（HSC/MPP）的扩展单元 | 发现了新的HSC/MPP '口袋状'单元（HSC PLUS），并验证了巨噬细胞和生长因子在HSC/MPP扩展中的支持作用 | NA | 探索胎肝中HSC/MPP扩展的细胞和分子机制，为基于干细胞的血液恶性肿瘤治疗提供新见解 | 小鼠胎肝中的造血干细胞和多能祖细胞（HSC/MPP） | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胎肝样本 |
| 1148 | 2024-08-08 |
Advances and Challenges in Kidney Organoids
2022, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
|
综述 | 本文综述了肾脏类器官的最新进展、应用及面临的挑战 | 介绍了单细胞RNA测序、3D生物打印和微流控技术在肾脏类器官研究中的应用 | 目前缺乏针对肾脏类器官方法学的全面综述 | 总结肾脏类器官的分化方法、应用及挑战 | 肾脏类器官的生成及其在体外细胞培养系统中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序、3D生物打印、微流控技术 | NA | NA | NA |
| 1149 | 2024-08-08 |
rPanglaoDB: an R package to download and merge labeled single-cell RNA-seq data from the PanglaoDB database
2022-01-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab549
PMID:34320637
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研究论文 | 介绍了一个名为rPanglaoDB的R包，用于从PanglaoDB数据库下载和合并标记的单细胞RNA测序数据 | 首次提供了纤维细胞的无偏转录组图谱报告，并通过比较纤维细胞与同一组织样本中收集的成纤维细胞的转录组图谱，确认了它们与组织损伤和感染愈合过程的关联 | NA | 通过整合多个公共单细胞实验数据，增加目标细胞类型的样本量，实现稳健的细胞类型转录组特征描述 | 纤维细胞，一种罕见的单核细胞衍生细胞类型 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 157个纤维细胞 |
| 1150 | 2024-08-08 |
Molecular Fingerprinting by Single Cell Clone Analysis in Adverse Drug Reaction (ADR) Assessment
2022, Current drug safety
IF:1.1Q4
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研究论文 | 本文通过单细胞克隆分析技术，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq），对药物不良反应（ADR）进行分子指纹识别，以区分不同克隆细胞在个体器官中的差异敏感性 | 利用scRNA-seq技术对ADR进行分子指纹识别，识别特定克隆中直接表达的基因（DEG），为靶向治疗策略提供机会 | 成本效益、ADR的频率/严重程度和人群差异等因素仍需考虑 | 开发一种新的框架，用于使用scRNA-seq技术对ADR进行潜在评估，并探讨其对药物警戒和药物开发的潜在监管影响 | 药物不良反应（ADR）的分子指纹识别 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及可活检/采样的组织（如皮肤、肝脏、肾脏、血液、干细胞） |
| 1151 | 2024-08-08 |
Role of laminin and collagen chains in human spermatogenesis - Insights from studies in rodents and scRNA-Seq transcriptome profiling
2022-01, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2021.07.011
PMID:34325997
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综述 | 本文综述了在啮齿动物和单细胞RNA测序转录组分析中，层粘连蛋白和胶原蛋白链在人类精子发生中的作用 | 通过分析公开的单细胞RNA测序转录组数据集，揭示了不同类型的人类睾丸中胶原蛋白链和层粘连蛋白链的差异表达，提出了人类睾丸中可能存在的局部调节网络 | NA | 探讨层粘连蛋白和胶原蛋白链在人类精子发生中的作用及其在不同类型睾丸疾病中的潜在影响 | 人类睾丸中的层粘连蛋白和胶原蛋白链 | NA | 男性不育症 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 1152 | 2024-08-08 |
Identification and characterization of relapse-initiating cells in MLL-rearranged infant ALL by single-cell transcriptomics
2022-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01341-y
PMID:34304246
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了MLL重排婴儿急性淋巴细胞白血病（MLL-r iALL）中对糖皮质激素药物泼尼松的反应，以识别和表征复发启动细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术量化了对治疗敏感和抵抗的癌细胞群体，以更好地预测个体患者的未来复发情况 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和表征MLL-r iALL中的复发启动细胞，以改善风险分层和理解白血病治疗抵抗亚群 | MLL重排婴儿急性淋巴细胞白血病中的复发启动细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 诊断性骨髓和外周血样本 |
| 1153 | 2024-08-08 |
Immune cell profiling in atherosclerosis: role in research and precision medicine
2022-01, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-021-00589-2
PMID:34267377
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综述 | 本文综述了单细胞技术在动脉粥样硬化免疫细胞图谱构建及精准免疫治疗发现中的应用 | 探讨了单细胞技术如单细胞质谱细胞仪、单细胞RNA测序和细胞转录组及表位索引测序在动脉粥样硬化斑块细胞和分子组成图谱中的应用，并强调了这些数据在发现新型精准免疫治疗中的作用 | 需要进一步在相关实验模型中严格验证来自人类研究的单细胞数据 | 探讨单细胞技术在动脉粥样硬化研究及精准医学中的作用 | 动脉粥样硬化中的免疫细胞及其在精准医疗中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1154 | 2024-08-08 |
A novel patient stratification strategy to enhance the therapeutic efficacy of dasatinib in glioblastoma
2022-01-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab158
PMID:34232320
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研究论文 | 本文研究了一种新的患者分层策略，以提高达沙替尼在胶质母细胞瘤治疗中的疗效 | 提出了一种基于基因表达分型的患者分层策略，以优化达沙替尼在胶质母细胞瘤治疗中的应用 | NA | 探讨不同亚型胶质母细胞瘤对达沙替尼的反应差异，并提出临床试验中的患者富集策略 | 胶质母细胞瘤及其亚型对达沙替尼的敏感性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 来自原发性患者肿瘤的胶质母细胞瘤干细胞样细胞（GSCs） |
| 1155 | 2024-08-08 |
Adipocyte Heterogeneity Underlying Adipose Tissue Functions
2022-01-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqab138
PMID:34223880
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研究论文 | 本文讨论了利用单细胞RNA测序和单核测序技术研究脂肪细胞异质性的策略，以更好地理解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其与代谢疾病的关系 | 采用了单细胞RNA测序和单核测序技术来揭示脂肪细胞亚型的复杂性，这些技术之前因脂肪细胞的大小、浮力和脆弱性而难以应用 | NA | 深入了解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其在代谢疾病中的作用 | 脂肪细胞亚型及其在不同脂肪库中的功能 | NA | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 1156 | 2024-08-08 |
Induction of Interferon-γ and Tissue Inflammation by Overexpression of Eosinophil Cationic Protein in T Cells and Exosomes
2022-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41920
PMID:34224653
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮（SLE）发病机制中的作用，特别是嗜酸性阳离子蛋白（ECP）的过度表达。 | 首次揭示了ECP在T细胞和T细胞衍生的外泌体中过度表达可能导致SLE相关的肾炎、肝炎和关节炎。 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 研究T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照的T细胞衍生的外泌体蛋白。 | NA | 系统性红斑狼疮 | MACSPlex外泌体分析和蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | T细胞特异性ECP转基因小鼠（每组5只），老年T细胞特异性ECP转基因小鼠（每组3只），接受转移外泌体的小鼠（每组3只） |
| 1157 | 2024-08-08 |
High-dimensional and single-cell transcriptome analysis of the tumor microenvironment in angioimmunoblastic T cell lymphoma (AITL)
2022-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01321-2
PMID:34230608
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞转录组分析技术，探讨了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）肿瘤微环境（TME）中的细胞组成和特征 | 首次详细描述了AITL TME中B细胞和CD8+ T细胞的特定表型和功能状态，揭示了非恶性细胞在AITL生物学中的重要作用 | NA | 深入理解AITL肿瘤微环境中非恶性细胞的作用和特征 | AITL肿瘤微环境中的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 质谱流式细胞术，单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
| 1158 | 2024-08-08 |
Unsupervised Cluster Analysis and Gene Marker Extraction of scRNA-seq Data Based On Non-Negative Matrix Factorization
2022-01, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3091506
PMID:34156956
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研究论文 | 本文提出了一种基于非负矩阵分解的多子空间细胞相似性学习框架MscNMF，用于无监督的scRNA-seq数据分析，包括数据分解、相似性学习和相似性融合三个部分 | MscNMF能够学习不同子空间的基因特征和细胞特征，通过多子空间突出细胞间的相关性和异质性，消除低维特征空间中的冗余信息和噪声，并合理计算细胞类型数量和非负矩阵分解的秩 | NA | 解决scRNA-seq数据中细胞异质性的识别问题 | scRNA-seq数据中的基因表达水平和细胞特征 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 |
| 1159 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the M2 Macrophages and Exhausted T Cells and Intratumoral Heterogeneity in Triple-Negative Breast Cancer
2022, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了三阴性乳腺癌中的M2巨噬细胞和耗竭T细胞以及肿瘤内异质性 | 发现了在三阴性乳腺癌患者中极化的M2巨噬细胞和耗竭的CD8+ T细胞，并识别出潜在的免疫治疗靶点 | NA | 分析肿瘤微环境中的T细胞和巨噬细胞，以识别具有治疗潜力的靶点 | 三阴性乳腺癌患者的单细胞序列数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自GSE118389数据集的三阴性乳腺癌患者样本 |
| 1160 | 2024-08-09 |
Pseudo Heparin Resistance After Pulmonary Endarterectomy: Role of Thrombus Production of Factor VIII
2022, Seminars in thoracic and cardiovascular surgery
IF:2.6Q2
DOI:10.1053/j.semtcvs.2021.03.042
PMID:33984481
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研究论文 | 本文研究了肺动脉内膜切除术后伪肝素抵抗现象，并评估了因子VIII的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析肺动脉内膜切除术标本中的因子VIII基因表达 | 样本量较小，仅包括13名患者和5个标本 | 探讨肺动脉内膜切除术后伪肝素抵抗的原因及其对术后肝素化的影响 | 肺动脉内膜切除术后的患者及其血液样本 | 数字病理学 | 肺高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 13名患者和5个标本 |