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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2024-08-08 |
Serglycin Is Involved in Adipose Tissue Inflammation in Obesity
2022-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100231
PMID:34872979
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研究论文 | 本研究探讨了serglycin在饮食诱导的肥胖相关脂肪组织炎症中的作用 | 首次揭示了serglycin在调节肥胖诱导的脂肪炎症中的作用 | NA | 研究serglycin表达对饮食诱导的脂肪组织炎症的影响 | serglycin在肥胖条件下对脂肪组织炎症的影响 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用C57BL/6J遗传背景的小鼠进行8周高脂高蔗糖饮食实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1062 | 2024-08-08 |
GNN-based embedding for clustering scRNA-seq data
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab787
PMID:34850828
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图神经网络（GNN）的嵌入方法graph-sc，用于聚类单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | graph-sc方法利用图自编码器网络为scRNA-seq细胞数据创建嵌入，相比其他竞争技术在各种数据集上表现更优，且具有更高的计算效率和稳定性 | 尽管在多个数据集上表现良好，但并没有一种方法能在所有分析的数据集上始终表现最佳 | 开发一种新的聚类方法，用于预测细胞类别分配和推断细胞身份 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 图神经网络（GNN） | 图自编码器网络 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及模拟和真实scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1063 | 2024-08-08 |
Enhancing biological signals and detection rates in single-cell RNA-seq experiments with cDNA library equalization
2022-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1071
PMID:34850101
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研究论文 | 本文研究了在单细胞RNA测序实验中，通过等量化cDNA文库浓度来提高基因检测率和增强生物信号的方法 | 提出了在单细胞实验中不一致执行的cDNA文库浓度等量化步骤，以改善基因检测率、增强生物信号并减少技术伪影 | NA | 评估等量化步骤对不同单细胞RNA测序协议的影响 | 单细胞RNA测序数据中的基因检测率和生物信号 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 实验中使用了不同等量化步骤的体外实验样本，具体数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1064 | 2024-08-08 |
High-Throughput Functional Screening of Antigen-Specific T Cells Based on Droplet Microfluidics at a Single-Cell Level
2022-01-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c03678
PMID:34852202
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研究论文 | 本文介绍了一种基于液滴微流控平台的高通量功能性筛选肿瘤抗原特异性T细胞的方法 | 开发了一种新的液滴微流控平台，用于高通量功能性筛选和分离肿瘤抗原特异性T细胞 | NA | 旨在提高基于T细胞的癌症免疫疗法的效率 | 肿瘤抗原特异性T细胞 | 数字病理学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 荧光信号 | 单个细胞水平 | NA | NA | NA | NA |
| 1065 | 2024-08-08 |
Deep learning-based advances and applications for single-cell RNA-sequencing data analysis
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab473
PMID:34849562
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研究论文 | 本文总结了基于深度学习的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法及其应用，并探讨了深度学习技术在scRNA-seq数据分析中的未来展望和挑战 | 深度学习技术能够克服scRNA-seq数据在上游和下游分析中的独特挑战 | NA | 旨在支持深度学习工具在生物医学领域的应用，并帮助生物学家和生物信息学家探索这一快速发展的领域 | 单细胞RNA测序数据分析 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度学习 | scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1066 | 2024-08-08 |
SC-MEB: spatial clustering with hidden Markov random field using empirical Bayes
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab466
PMID:34849574
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SC-MEB的经验贝叶斯方法，用于空间聚类分析，利用隐马尔可夫随机场进行空间转录组数据分析 | SC-MEB不仅计算效率高且可扩展到大规模样本，还能选择平滑参数和聚类数量，优于现有的方法如BayesSpace | NA | 通过空间转录组数据识别细胞集群，以扩展对细胞类型和状态如何受微环境调控的理解 | 人类背外侧前额叶皮质组织和老鼠下丘脑前区的空间转录组数据，以及结直肠癌和COVID-19患者的结肠数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 隐马尔可夫随机场 | 转录组数据 | 大规模样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1067 | 2024-08-08 |
Expression Atlas update: gene and protein expression in multiple species
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1030
PMID:34850121
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研究论文 | 本文介绍了EMBL-EBI表达图谱数据库的更新，该数据库整合了来自超过4500个表达研究的数据，涵盖超过65种不同物种，旨在帮助研究人员了解基因或蛋白质在不同组织、条件下的表达情况 | 表达图谱数据库通过专家审核和标准化分析流程，提供了易于可视化的数据，并区分了批量表达图谱和单细胞表达图谱 | NA | 旨在提供一个全面的基因和蛋白质表达数据库，帮助研究人员探索基因或蛋白质在不同条件下的表达模式 | 基因和蛋白质在不同物种、组织和条件下的表达情况 | NA | NA | RNA测序，蛋白质组学 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | 超过4500个表达研究，涉及超过65种不同物种 | NA | NA | NA | NA |
| 1068 | 2024-08-08 |
Gene family evolution underlies cell-type diversification in the hypothalamus of teleosts
2022-01, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-021-01580-3
PMID:34824389
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了斑马鱼和墨西哥四须鲃的视丘细胞类型多样性，发现大多数细胞类型在两种鱼类中共享，并探讨了基因家族进化和旁系同源基因表达变化对细胞多样性的影响。 | 首次揭示了斑马鱼和墨西哥四须鲃视丘细胞类型多样性的共享性，并探讨了基因家族进化和旁系同源基因表达变化对细胞多样性的贡献。 | 研究仅限于斑马鱼和墨西哥四须鲃两种鱼类，可能无法完全代表所有硬骨鱼类的细胞类型多样性。 | 探究硬骨鱼类视丘细胞类型多样性及其进化机制。 | 斑马鱼和墨西哥四须鲃的视丘细胞。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约130,000个视丘细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1069 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Multicellular Ecosystem of Nucleus Pulposus during Degeneration Progression
2022-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202103631
PMID:34825784
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了人类椎间盘软骨核（NP）在退变过程中的多细胞生态系统 | 发现了六种新型人类NP细胞（NPCs）群体，并探索了它们在不同退变阶段的潜在功能差异，以及NP中免疫细胞的新类型 | NA | 揭示椎间盘软骨核（NP）退变过程中的分子复杂性和细胞异质性 | 人类椎间盘软骨核（NP）细胞及其在退变过程中的变化 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个NP组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1070 | 2024-08-08 |
Functional heterogeneity of immune defenses in molluscan oysters Crassostrea hongkongensis revealed by high-throughput single-cell transcriptome
2022-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2021.11.027
PMID:34843943
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术揭示了香港牡蛎Crassostrea hongkongensis免疫细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细描绘了香港牡蛎免疫细胞的多样性和功能异质性 | NA | 探究香港牡蛎免疫细胞的功能异质性及其在免疫防御中的作用 | 香港牡蛎Crassostrea hongkongensis的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 十三种亚群的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1071 | 2024-08-08 |
BNT162b2 vaccine induces divergent B cell responses to SARS-CoV-2 S1 and S2
2022-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-01088-9
PMID:34848871
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研究论文 | 研究BNT162b2疫苗接种后对SARS-CoV-2 S1和S2蛋白的B细胞反应 | 首次整合B细胞受体分析和单细胞转录组学，研究疫苗接种前后的B细胞反应 | NA | 探讨BNT162b2疫苗接种后对SARS-CoV-2刺突蛋白抗体的生成及其对新变种的保护程度 | BNT162b2疫苗接种后的B细胞反应 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | B细胞受体数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1072 | 2024-08-08 |
Pathogenic Mechanisms Underlying Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-01-24, Annual review of pathology
|
综述 | 本文综述了特发性肺纤维化（IPF）的发病机制，涉及细胞类型和信号通路的复杂相互作用 | 近期单细胞RNA测序研究揭示了一种具有异常基底细胞特征的新型AEC，可能干扰正常的上皮修复并促进促纤维化表型 | NA | 探讨IPF的发病机制，利用新型生物信息学工具发现疾病通路、细胞特异性机制和细胞间相互作用 | 特发性肺纤维化的发病机制 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1073 | 2024-08-08 |
Peanut oral immunotherapy differentially suppresses clonally distinct subsets of T helper cells
2022-01-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI150634
PMID:34813505
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和配对的T细胞受体α/β测序，评估了12名花生过敏患者在口服免疫治疗（OIT）过程中CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞的转录组 | 本研究首次揭示了OIT过程中不同临床反应与花生反应性CD4+ T细胞的预先存在特征以及Th2细胞亚群的抑制之间的关系 | 本研究仅涉及12名患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨口服免疫治疗（OIT）对花生过敏患者临床结果的免疫学基础 | 花生过敏患者的CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序，T细胞受体α/β测序 | NA | 转录组数据 | 12名花生过敏患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1074 | 2024-08-08 |
Macrophage-Targeted Therapy Unlocks Antitumoral Cross-talk between IFNγ-Secreting Lymphocytes and IL12-Producing Dendritic Cells
2022-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0326
PMID:34795032
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研究论文 | 本研究评估了使用BLZ945（一种小分子CSF1R抑制剂）治疗的小鼠肺肿瘤免疫微环境，通过单细胞RNA测序和机制验证方法，揭示了CSF1R靶向治疗如何重塑CSF1R细胞景观并激活抗肿瘤细胞间的交叉对话。 | 首次展示了CSF1R靶向治疗不仅通过细胞耗竭，而是通过重塑CSF1R细胞景观来激活抗肿瘤细胞间的交叉对话，包括IFNγ产生的自然杀伤细胞和T细胞以及IL12产生的树突状细胞。 | 研究主要在动物模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探讨CSF1R抑制剂在肺肿瘤免疫治疗中的作用机制。 | 小鼠肺肿瘤中的免疫细胞，特别是CSF1R细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 免疫学 | 肺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1075 | 2024-08-08 |
Early lung carcinogenesis and tumor microenvironment observed by single-cell transcriptome analysis
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101277
PMID:34800916
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究了从不吸烟患者的肺磨玻璃结节（GGN）和正常肺组织中观察到的早期肺癌发生和肿瘤微环境 | 首次揭示了肺癌细胞中与小泡处理和表面活性物质稳态相关的基因集富集，以及肿瘤微环境中免疫细胞的特定变化 | 研究样本仅来自6名从不吸烟的患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期肺癌发生过程中癌细胞特异性标志物和肿瘤微环境的变化 | 从不吸烟患者的肺磨玻璃结节和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11个肺磨玻璃结节和正常肺组织样本，来自6名从不吸烟患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1076 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of Bisphenol A exposure reveals the key roles of the testicular microenvironment in male reproduction
2022-Jan, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112449
PMID:34808557
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了双酚A暴露对睾丸微环境的影响及其在男性生殖中的关键作用 | 首次系统分析了青春期人类睾丸中细胞类型组成的显著变化，并构建了青少年睾丸中生殖细胞与体细胞之间的细胞间通信网络 | NA | 揭示双酚A在支持细胞和男性生殖中的生殖毒性和分子机制 | 人类睾丸中的生殖细胞和体细胞 | NA | 非阻塞性无精症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1077 | 2024-08-08 |
Establishment of Trophoblast-Like Tissue Model from Human Pluripotent Stem Cells in Three-Dimensional Culture System
2022-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202100031
PMID:34813178
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研究论文 | 本文报道了从人多能干细胞（hPSCs）在三维（3D）培养系统中生成滋养层样组织模型的方法 | 该研究首次成功在体外建立了从hPSCs到3D滋养层样组织模型，这一模型能够展示微绒毛结构并分泌人胎盘特异性激素 | NA | 旨在深入理解人类早期胎盘发育的机制，并探索其在发育生物学和妊娠障碍研究中的应用潜力 | 人多能干细胞（hPSCs）及其在三维培养系统中的滋养层样组织模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D培养系统 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1078 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals How the Aryl Hydrocarbon Receptor Shapes Cellular Differentiation Potency in the Mouse Colon
2022-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-21-0378
PMID:34815312
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和高级分析策略，探讨了芳香烃受体（Ahr）在调节小鼠结肠隐窝稳态中的作用 | 本研究首次揭示了Ahr缺失对隐窝相关上皮细胞类型和亚型的促进作用，以及对单细胞熵和RNA速度长度的影响 | NA | 探讨Ahr在调节结肠隐窝稳态中的作用 | 小鼠结肠隐窝中的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 野生型和肠道特异性Ahr敲除小鼠的结肠隐窝 | NA | NA | NA | NA |
| 1079 | 2024-08-08 |
Stem cell aging in the skeletal muscle: The importance of communication
2022-01, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2021.101528
PMID:34818593
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综述 | 本文综述了骨骼肌中卫星细胞功能衰退的分子过程及其在衰老中的作用 | 强调了单细胞测序技术在研究骨骼肌衰老中的新兴应用，特别是在卫星细胞群体异质性和与微环境中其他细胞类型的分子相互作用方面 | 文中提到的许多外在因素仍未明确 | 探讨卫星细胞在衰老过程中的功能衰退机制及其与环境的相互作用 | 骨骼肌中的卫星细胞及其在衰老中的功能衰退 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1080 | 2024-08-08 |
bollito: a flexible pipeline for comprehensive single-cell RNA-seq analyses
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab758
PMID:34788788
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研究论文 | bollito是一个用于全面分析单细胞RNA-seq数据的自动化、灵活且可并行化的计算管道 | bollito整合了超过30种最先进的工具，涵盖了从质量控制到RNA速度分析的多个单细胞分析任务，并且其模块化设计使得易于集成其他软件包以扩展功能 | NA | 开发一个全面的单细胞RNA-seq数据分析管道 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |