单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2024-08-08 |
A census of the lung: CellCards from LungMAP
2022-01-10, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.11.007
PMID:34936882
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和遗传谱系追踪等技术的新数据，创建了一个全面的肺细胞普查，包括细胞类型的身份、功能、标记、发育谱系、异质性、再生潜力、疾病关联和关键实验工具。 | 首次利用最新的单细胞RNA测序技术，对肺细胞进行全面普查，提供了详细的细胞类型信息和功能属性。 | NA | 旨在通过创建一个全面的肺细胞普查，促进呼吸健康的研究和支持。 | 人类肺部的细胞类型及其功能和属性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1042 | 2024-08-08 |
Ubiquitin-conjugating enzyme V variant 1 enables cellular responses toward fibroblast growth factor signaling in endothelium
2022-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100808RRR
PMID:34921695
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研究论文 | 本文探讨了泛素结合酶V变体1（UBE2V1）在调节内皮细胞中成纤维细胞生长因子信号传导的作用 | 首次详细研究了UBE2V1在血管生成中的作用，特别是在成纤维细胞生长因子2诱导的血管生成中的关键作用 | 主要集中在体外和体内实验，可能需要更多临床数据支持 | 阐明UBE2V1在调节内皮细胞行为和血管生成中的作用 | 内皮细胞（ECs）和人类脐静脉内皮细胞（HUVECs） | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 多种细胞类型，特别是内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1043 | 2024-08-08 |
Cytokine and Nitric Oxide-Dependent Gene Regulation in Islet Endocrine and Nonendocrine Cells
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab063
PMID:34927076
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研究论文 | 本文探讨了细胞因子及一氧化氮在胰岛内分泌和非内分泌细胞中的基因调控作用 | 提出细胞因子信号在生理上有保护β细胞免受多种环境压力的作用，并通过单细胞RNA测序验证了这一假设 | NA | 研究细胞因子和一氧化氮在胰岛内分泌细胞中的保护作用及其机制 | 小鼠胰岛细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰岛细胞在18小时细胞因子暴露后的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1044 | 2024-08-08 |
LRRK2 correlates with macrophage infiltration in pan-cancer
2022-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.11.037
PMID:34929286
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研究论文 | 本文探讨了LRRK2在泛癌水平上的致癌作用，并通过单细胞RNA测序和体外实验验证了其与生存事件的相关性 | 首次在泛癌水平上研究LRRK2对肿瘤微环境中巨噬细胞招募的影响，并提供了基于干扰LRRK2表达和活性的治疗策略 | NA | 研究LRRK2在泛癌中的作用及其对患者生存概率的影响 | LRRK2在不同癌症类型中的作用及其对巨噬细胞功能的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1045 | 2024-08-08 |
Sequencing of a Chinese tetralogy of Fallot cohort reveals clustering mutations in myogenic heart progenitors
2022-01-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.152198
PMID:34905512
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research paper | 本研究对146个非综合征性TOF的中国父-母-子三联体进行了全基因组测序分析，并与欧洲队列数据进行比较，揭示了TOF发病机制中的基因突变热点。 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据，发现了与TOF相关的候选基因在心肌前体细胞中的表达富集，以及在心肌细胞分化轨迹中的特定基因共表达模块。 | NA | 揭示法洛四联症（TOF）的遗传机制及其对早期心脏发育的影响。 | 146个非综合征性TOF的中国父-母-子三联体。 | digital pathology | 先天性心脏病 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 146个非综合征性TOF的中国父-母-子三联体 | NA | NA | NA | NA |
| 1046 | 2024-08-08 |
Tumor immune microenvironment lncRNAs
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab504
PMID:34891154
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综述 | 本文综述了长非编码RNA（lncRNA）在肿瘤免疫微环境（TIME）中的细胞类型特异性表达及其调控功能，并强调了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究这些特异性功能中的作用 | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在解决细胞类型特异性lncRNA功能发现中的潜力 | 目前大多数lncRNA研究依赖于批量RNA测序数据，这限制了对细胞类型特异性lncRNA功能的发现 | 探讨lncRNA在肿瘤和免疫细胞中的特异性表达，并总结其在细胞类型层面的调控功能 | 肿瘤免疫微环境中的长非编码RNA（lncRNA） | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1047 | 2024-08-08 |
scIAE: an integrative autoencoder-based ensemble classification framework for single-cell RNA-seq data
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab508
PMID:34913057
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研究论文 | 本文提出了一种基于集成学习的自编码器框架scIAE，用于单细胞RNA测序数据的分类 | scIAE框架通过集成多个随机投影和综合可分解的自编码器，有效处理了单细胞基因表达数据的高维度和稀疏性问题 | NA | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据的细胞类型识别和疾病状态预测的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1048 | 2024-08-08 |
Reinvestigation of Classic T Cell Subsets and Identification of Novel Cell Subpopulations by Single-Cell RNA Sequencing
2022-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100581
PMID:34911770
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术重新评估经典T细胞亚群，并识别出新的细胞亚群 | 发现并命名了一种新型T细胞亚群——IFN信号相关基因高表达T细胞（ISAG T细胞），并证明了ISAGs是该细胞亚群的主要贡献者 | NA | 探索单细胞RNA测序聚类群体与细胞表面标记定义的经典T细胞亚群之间的关系 | 人类外周血单个核细胞（PBMCs）中的T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 62,235个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 1049 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals abnormal fluctuations in human eight-cell embryos associated with blastocyst formation failure
2022-01-04, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaab069
PMID:34904654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类八细胞胚胎的基因表达，特别是那些未能形成囊胚的胚胎 | 首次揭示了人类八细胞胚胎中与囊胚形成失败相关的异常基因表达模式 | 研究样本量较小，且依赖于数据库中的共享数据 | 探究人类早期胚胎发育中导致发育停滞的分子机制 | 人类八细胞胚胎及其发育潜力 | NA | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 1050 | 2024-08-08 |
Advances in single-cell sequencing and its application to musculoskeletal system research
2022-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13161
PMID:34888976
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肌肉骨骼系统研究中的应用及其最新进展 | 单细胞测序技术能够分析单个细胞的异质性，推动了多组学研究的发展 | 文章讨论了单细胞测序技术面临的挑战和未来发展潜力 | 探讨单细胞测序技术在肌肉骨骼医学中的应用前景 | 肌肉骨骼系统的细胞或组织异质性研究 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1051 | 2024-08-08 |
CAMML: Multi-Label Immune Cell-Typing and Stemness Analysis for Single-Cell RNA-sequencing
2022, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:34890149
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CAMML的新型单细胞RNA测序细胞类型分类方法，该方法利用细胞类型特异性加权基因集对每个细胞进行评分，支持单标签和多标签分类 | CAMML方法能够处理免疫微环境中细胞类型重叠的问题，支持多标签分类，相较于现有方法具有更强的适应性和鲁棒性 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序细胞类型分类方法，以解决细胞类型重叠和数据稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1052 | 2024-08-08 |
Identifying Cell Type-Specific Chemokine Correlates with Hierarchical Signal Extraction from Single-Cell Transcriptomes
2022, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:34890154
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研究论文 | 本文通过结合信号提取神经网络架构和公理化特征归因，基于单细胞基因表达谱对组织样本进行分类 | 提出的方法不仅可解释，而且对噪声具有鲁棒性，仅需要5%的基因和23%的细胞即可在模拟组织样本中以超过70%的准确率区分信号与噪声 | NA | 旨在识别与特定标签相关的细胞和基因子集 | 单细胞转录组数据中的细胞类型特异性趋化因子相关性 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 在模拟组织样本中需要5%的基因和23%的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1053 | 2024-08-08 |
CloudPred: Predicting Patient Phenotypes From Single-cell RNA-seq
2022, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:34890161
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研究论文 | 本文开发了一种可解释的机器学习算法CloudPred，用于从单细胞RNA测序数据中预测个体的疾病表型 | CloudPred通过一种新颖的端到端可微学习算法，结合生物学上合理的细胞类型混合模型，自动推断对表型重要的细胞亚群，无需先验注释 | NA | 开发一种新的机器学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中预测临床表型并识别相关细胞 | 单细胞RNA测序数据和疾病表型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 可微学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 142名狼疮患者和对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 1054 | 2024-08-08 |
A Compass to Guide Insights into TH17 Cellular Metabolism and Autoimmunity
2022, Immunometabolism
DOI:10.20900/immunometab20220001
PMID:34900348
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和代谢图谱数据，探讨了TH17细胞代谢及其在自身免疫和慢性炎症中的作用 | 本文首次强调了多胺途径在调节TH17/Treg细胞功能中的关键作用，并提出其作为治疗靶点的潜力 | NA | 研究TH17细胞代谢及其在自身免疫疾病中的作用 | TH17细胞和Treg细胞的代谢差异 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 代谢图谱数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1055 | 2024-08-08 |
Spatial genomics enables multi-modal study of clonal heterogeneity in tissues
2022-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04217-4
PMID:34912115
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研究论文 | 本文开发了一种名为slide-DNA-seq的方法，用于从完整组织切片中捕获空间解析的DNA序列，并展示了该方法在保留局部肿瘤结构和发现不同肿瘤克隆及其拷贝数变异方面的应用 | 开发了一种新的空间基因组学方法slide-DNA-seq，能够准确测量基因组序列的空间位置及其表型输出，为研究细胞内和细胞外因素对基因表达和细胞表型的贡献提供了多功能平台 | NA | 研究细胞内和细胞外因素如何影响基因表达、蛋白质丰度和其他细胞表型 | 肿瘤克隆及其拷贝数变异，以及它们与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | NA | slide-DNA-seq | NA | 基因组序列 | 包括小鼠转移模型和人类原发性癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1056 | 2024-08-08 |
Hubness reduction improves clustering and trajectory inference in single-cell transcriptomic data
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab795
PMID:34871374
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序（scRNAseq）数据中的中心性现象，并探讨了减少中心性对聚类、轨迹推断和可视化的影响 | 本文首次探讨了通过直接修正中心性来避免剧烈降维，从而保留更多信息的可能性 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的中心性现象及其对数据分析的影响 | 单细胞RNA测序数据中的中心性现象 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1057 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing demonstrates complex resistance landscape in CLL and MCL treated with BTK and BCL2 inhibitors
2022-01-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021006211
PMID:34861696
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研究论文 | 本研究通过单细胞DNA测序分析了慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）患者在接受Bruton酪氨酸激酶（BTK）抑制剂和B细胞淋巴瘤2（BCL2）抑制剂治疗后产生的抗药性基因组景观 | 首次报道了BCL2抗药性突变在套细胞淋巴瘤（MCL）患者中的出现，并揭示了CLL和MCL在靶向治疗下的复杂克隆抗药性机制 | 研究样本仅限于8名患者，可能不足以全面代表所有CLL和MCL患者的抗药性情况 | 探究CLL和MCL患者在接受BTK和BCL2抑制剂治疗后的基因组抗药性机制 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞DNA测序 | NA | DNA | 8名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1058 | 2024-08-08 |
Matrix factorization for biomedical link prediction and scRNA-seq data imputation: an empirical survey
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab479
PMID:34864871
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综述 | 本文综述了矩阵分解方法在生物医学链接预测和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据插补中的应用 | 本文系统地比较了15个真实数据集上的代表性矩阵分解方法，并提供了选择不同生物医学矩阵完成任务的矩阵分解方法的一般指南 | NA | 评估矩阵分解方法在不同场景下的性能，并为生物医学链接预测和scRNA-seq数据插补提供改进方向 | 生物医学链接预测和单细胞RNA测序数据插补 | 生物信息学 | NA | 矩阵分解 | 矩阵分解方法 | 生物医学数据，单细胞RNA测序数据 | 15个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1059 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mouse left ventricle reveals cellular diversity and intercommunication
2022-01-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠左心室的细胞景观，揭示了细胞多样性和细胞间通信网络 | 首次详细描述了小鼠左心室的单细胞转录组特征，并揭示了细胞亚型及其潜在功能 | NA | 探索小鼠左心室的细胞多样性和细胞间通信，寻找心血管疾病的治疗靶点 | 小鼠左心室的细胞景观 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入 (tSNE) | 转录组数据 | 小鼠左心室的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1060 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing for Everybody
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1944-5_15
PMID:34870822
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研究论文 | 本文描述了Smart-seq2协议，用于单细胞全长mRNA测序，适用于多种细胞类型，且成本相对较低 | 介绍了Smart-seq2协议，该协议易于优化并适用于标准分子生物学实验室 | NA | 帮助新手研究人员选择最佳的单细胞测序协议 | 单细胞全长mRNA测序协议 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | mRNA序列 | 多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |