单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-08-08 |
Pathogenic TNF-α drives peripheral nerve inflammation in an Aire-deficient model of autoimmunity
2022-01-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2114406119
PMID:35058362
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研究论文 | 本文研究了在自身免疫调节因子（Aire）缺陷的小鼠模型中，病理性TNF-α如何驱动外周神经炎症，并探讨了其对自身免疫性脱髓鞘的影响。 | 通过单细胞RNA测序和细胞间配体-受体相互作用的分析，揭示了巨噬细胞介导的TNF-α信号轴在自身免疫性脱髓鞘中的作用机制。 | NA | 探索在自身免疫性神经炎症中，免疫细胞从修复状态转变为炎症状态的分子机制，并寻找新的治疗靶点。 | Aire缺陷小鼠模型的坐骨神经，以及其中的多种髓样、先天淋巴样和淋巴样细胞类型。 | 自身免疫疾病 | 自身免疫性神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Aire缺陷小鼠模型的坐骨神经样本 |
| 982 | 2024-08-08 |
Statistics or biology: the zero-inflation controversy about scRNA-seq data
2022-01-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02601-5
PMID:35063006
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据中大量零值的来源和处理方式，并评估了非生物学零值对数据分析的影响 | 介绍了五种在计算基准测试中添加非生物学零值的机制，并讨论了非生物学零值的开放性问题 | NA | 解决关于单细胞RNA测序数据中零值处理的争议 | 单细胞RNA测序数据中的零值 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 测序数据 | NA |
| 983 | 2024-08-08 |
Coal dust exposure triggers heterogeneity of transcriptional profiles in mouse pneumoconiosis and Vitamin D remedies
2022-01-20, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-022-00449-y
PMID:35057792
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研究论文 | 本研究主要探讨了可吸入大小的煤尘颗粒（CDP）在老鼠中的肺毒性，使用无偏差的单细胞RNA测序技术，并分析了煤尘颗粒对肺部稳态的影响。 | 这是首次在老鼠中重建煤尘肺病的病理进展和转录组模式的研究。 | NA | 研究煤尘颗粒对肺部稳态的影响及其分子变化。 | 老鼠的肺部组织和细胞。 | 数字病理学 | 尘肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 老鼠样本 |
| 984 | 2024-08-08 |
Investigation of fiber utilization in the rumen of dairy cows based on metagenome-assembled genomes and single-cell RNA sequencing
2022-01-20, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-021-01211-w
PMID:35057854
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研究论文 | 本研究通过宏基因组组装基因组和单细胞RNA测序技术，探讨了奶牛瘤胃中纤维利用的相关微生物和细胞亚型 | 首次通过宏基因组组装基因组和单细胞RNA测序技术，揭示了瘤胃中纤维消化、VFA吸收和代谢的关键微生物基因组和上皮细胞亚型 | NA | 研究奶牛瘤胃中纤维消化和VFA吸收代谢的微生物和细胞机制 | 奶牛瘤胃中的微生物和上皮细胞 | NA | NA | 宏基因组组装基因组、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组 | 52头处于泌乳中期的奶牛，20,728个瘤胃上皮细胞 |
| 985 | 2024-08-08 |
Interpreting success or failure of peanut oral immunotherapy
2022-01-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI155255
PMID:35040441
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和配对的T细胞受体α/β测序，研究了与花生口服免疫疗法（OIT）结果相关的花生反应性CD4+ Th细胞表型和基因特征 | 首次描述了与OIT结果相关的花生反应性CD4+ Th细胞的特定亚群和基因特征 | 并非所有患者都对OIT有反应，且治疗停止后可能重新对花生产生敏感 | 旨在识别影响并预测OIT结果的生物标志物 | 花生反应性CD4+ Th细胞表型和基因特征 | NA | 食物过敏 | 单细胞RNA测序，T细胞受体α/β测序 | NA | 基因 | NA |
| 986 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of early chick hypothalamic development reveals that hypothalamic cells are induced from prethalamic-like progenitors
2022-01-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110251
PMID:35045288
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和杂交链反应技术，分析了早期小鸡下丘脑发育的多个阶段，揭示了下丘脑细胞从类似前下丘脑的前体细胞中诱导出来的过程 | 本研究首次详细描述了小鸡下丘脑发育的组织结构，并识别了多个先前未被表征的下丘脑诱导、区域化和神经发生的候选调控因子 | NA | 阐明新生下丘脑的组织结构，并识别可能控制其诱导和后续发育的分子机制 | 早期小鸡下丘脑的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）和杂交链反应（HCR） | NA | RNA序列数据 | 多个早期下丘脑发育阶段的小鸡样本 |
| 987 | 2024-08-08 |
Molecular Landscape of the Coagulome of Oral Squamous Cell Carcinoma
2022-Jan-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14020460
PMID:35053621
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研究论文 | 研究口腔鳞状细胞癌（OSCC）的凝血组及其与肿瘤微环境（TME）的关联 | 发现OSCC中F3和PLAU的mRNA表达水平最高，并观察到单细胞水平上的凝血和纤维蛋白溶解亚群共存现象 | 需要进一步研究凝血过程对肿瘤适应性免疫反应的潜在负面调节作用 | 探讨OSCC的凝血组及其与肿瘤微环境的联系 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）的凝血组 | NA | 口腔鳞状细胞癌 | bulk tumor DNA/RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | DNA/RNA | 使用The Cancer Genome Atlas的数据和OSCC细胞培养数据 |
| 988 | 2024-08-08 |
Utilizing Shared Big Data to Identify Liver Cancer Dedifferentiation Markers
2022-Jan-14, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI210862
PMID:35062095
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据，重新分析大数据以识别肝癌干细胞的去分化标志物 | 首次在大数据重新分析中识别出肝癌干细胞的去分化因子Msh Homeobox 2，并发现其在肝癌干细胞中显著上调 | NA | 通过重新分析大数据，探索和识别肝癌干细胞的去分化标志物 | 肝癌干细胞和健康肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 989 | 2024-08-08 |
Restoring FAS Expression via Lipid-Encapsulated FAS DNA Nanoparticle Delivery Is Sufficient to Suppress Colon Tumor Growth In Vivo
2022-Jan-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14020361
PMID:35053524
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研究论文 | 本研究通过脂质包裹的FAS DNA纳米粒子递送恢复FAS表达，以抑制体内结肠肿瘤生长 | 设计并合成了密码子使用优化的鼠和人FAS cDNA，并将其封装到阳离子脂质中形成纳米粒子，用于体内外抑制结肠肿瘤生长 | NA | 探讨恢复FAS表达是否足以抑制结直肠癌的发展 | 结直肠癌患者的结肠肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及鼠和人的结肠肿瘤细胞 |
| 990 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas reveals shared and distinct immune responses and metabolism during SARS-CoV-2 and HIV-1 infections
2022-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.01.10.475725
PMID:35043114
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法，比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫反应和代谢差异 | 首次系统比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染的单细胞转录组数据，揭示了两种病毒感染的共同和独特免疫反应及代谢特征 | NA | 理解SARS-CoV-2和HIV-1感染的相似性和差异性，为疾病进展和疫苗及疗法开发提供依据 | SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 94,442个PBMCs样本，来自7名COVID-19患者和9名HIV-1患者 |
| 991 | 2024-08-08 |
Expression of Lineage Transcription Factors Identifies Differences in Transition States of Induced Human Oligodendrocyte Differentiation
2022-01-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11020241
PMID:35053357
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研究论文 | 本文通过定量图像分析和单细胞转录组学方法，比较了不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 研究发现，与单独使用SOX10相比，SOX10与OLIG2和NKX6.2的组合能增加iOLs的数量并促进更复杂的形态和更高的髓鞘标记基因表达水平 | NA | 研究不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 人源诱导少突胶质细胞的分化过程 | 细胞生物学 | NA | 定量图像分析、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 992 | 2024-08-08 |
Towards Tabula Gallus
2022-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23020613
PMID:35054796
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研究论文 | Tabula Gallus项目旨在创建鸡体和鸡胚中每种细胞类型的地图 | 该项目将生成单细胞转录组数据的综合目录，并提供研究该物种生物学的工具，类似于其他正在进行的细胞图谱项目 | NA | 研究鸡和其他鸟类的基本科学，并最终增进对人类健康和疾病的理解 | 鸡体和鸡胚中的每种细胞类型 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 993 | 2024-08-08 |
Combination of ultrasound-based mechanical disruption of tumor with immune checkpoint blockade modifies tumor microenvironment and augments systemic antitumor immunity
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003717
PMID:35039461
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研究论文 | 本文研究了超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤微环境和系统性抗肿瘤免疫的影响。 | 验证了新型高强度聚焦超声（M-HIFU）在增强抗肿瘤免疫中的作用，并探讨了与免疫检查点抑制剂（anti-PD-L1）联合使用的潜力。 | 研究主要在鼠类模型中进行，需要进一步的人体临床试验验证其效果。 | 探索通过超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗来增强系统性抗肿瘤免疫和抑制肿瘤生长的机制。 | 鼠类乳腺癌模型，包括三阴性（E0771）和人ErbB-2（HER2）表达（MM3MG-HER2）肿瘤。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 高强度聚焦超声（HIFU） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用C57BL/6或BALB/c小鼠进行实验 |
| 994 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Computational Analysis Tools: Application in Cancer Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1896-7_23
PMID:35044670
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其在癌症研究中的应用，介绍了最新的scRNA-seq技术和平台，以及相关的计算分析工具 | scRNA-seq技术为研究人员提供了发现新生物学现象和理解组织复杂性的独特机会 | NA | 介绍scRNA-seq技术及其在癌症研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术和计算分析工具 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 995 | 2024-08-08 |
GRNUlar: A Deep Learning Framework for Recovering Single-Cell Gene Regulatory Networks
2022-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0437
PMID:35050715
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研究论文 | 提出了一种名为GRNUlar的深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中恢复基因调控网络 | 开发了一个多任务学习框架来捕捉转录因子与它们调控的基因之间的复杂依赖关系，并设计了一种展开算法技术来捕捉真实世界中基因调控网络的稀疏性 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中监督学习基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA测序数据 | NA |
| 996 | 2024-08-08 |
A spatial and cellular distribution of rabies virus infection in the mouse brain revealed by fMOST and single-cell RNA sequencing
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.700
PMID:35051311
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研究论文 | 本研究利用荧光微光学断层成像（fMOST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，揭示了狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 首次通过fMOST和scRNA-seq技术全面绘制了典型神经亲和性病毒在小鼠大脑中的空间和细胞感染图谱 | NA | 探索狂犬病毒在小鼠大脑中的感染分布及其发病机制 | 狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 数字病理学 | 狂犬病 | 荧光微光学断层成像（fMOST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像，RNA序列 | 小鼠样本 |
| 997 | 2024-08-08 |
Macrophages-aPKCɩ-CCL5 Feedback Loop Modulates the Progression and Chemoresistance in Cholangiocarcinoma
2022-Jan-15, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-02235-8
PMID:35033156
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞与aPKCɩ-CCL5反馈环在胆管癌进展和化学抗性中的作用 | 首次揭示了巨噬细胞-aPKCɩ-CCL5反馈环在胆管癌中的作用，并提出了一种新的治疗策略 | NA | 研究巨噬细胞与胆管癌细胞之间的相互作用及其在肿瘤进展和化学抗性中的机制 | 胆管癌中的巨噬细胞、aPKCɩ和CCL5 | 数字病理学 | 胆管癌 | 10x Genomics单细胞测序技术 | NA | 组织样本 | 70个人类胆管癌组织样本 |
| 998 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell RNA sequencing analysis reveals distinct cellular and transcriptional modules associated with survival in lung cancer
2022-01-14, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00824-9
PMID:35027529
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和公共批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌和鳞状细胞癌中与生存率相关的细胞和转录模块 | 本研究首次建立了包含52个单细胞RNA测序和2342个公共批量RNA测序的多组学图谱，揭示了肺腺癌和鳞状细胞癌中特定的基因扩增、细胞组成和表达模块 | NA | 研究肺腺癌和鳞状细胞癌的细胞和转录特征，以及这些特征与患者生存率的关系 | 肺腺癌和鳞状细胞癌的细胞组成和转录模块 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 52个单细胞RNA测序样本和2342个公共批量RNA测序样本 |
| 999 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of human iPSC differentiation dynamics reveal a core molecular network of Parkinson's disease
2022-01-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02973-7
PMID:35027645
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析人类诱导多能干细胞（hiPSCs）分化为多巴胺能神经元（mDA）的过程，揭示了帕金森病（PD）的核心分子网络 | 首次通过单细胞RNA测序和基因表达分析，揭示了与帕金森病相关的核心分子网络，并展示了这些基因在mDA神经元分化过程中的差异表达 | NA | 探究帕金森病的疾病机制，并寻找可能的治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）分化为多巴胺能神经元（mDA）的过程及其与帕金森病相关的基因表达 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（RNAseq） | NA | 基因表达数据 | 包含PINK1-ILE368ASN突变和对照细胞系的多个样本 |
| 1000 | 2024-08-08 |
baredSC: Bayesian approach to retrieve expression distribution of single-cell data
2022-Jan-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04507-8
PMID:35021985
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研究论文 | 本文介绍了一种名为baredSC的新工具，用于通过贝叶斯方法从单细胞RNA测序数据中推断内在表达分布 | baredSC能够处理多模态情况下的稀疏数据，并揭示基因表达的复杂分布 | NA | 开发一种新工具以从单细胞RNA测序数据中检索感兴趣基因的表达分布 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达分布 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 模拟数据和两个真实生物数据集 |